More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3487 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009505  BOV_0453  amidophosphoribosyltransferase  65.12 
 
 		 509 aa  635    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0446  amidophosphoribosyltransferase  66.53 
 
 		 485 aa  635    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3501  amidophosphoribosyltransferase  72.69 
 
 		 509 aa  700    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2017  amidophosphoribosyltransferase  69.01 
 
 		 504 aa  642    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2599  amidophosphoribosyltransferase  72.69 
 
 		 499 aa  707    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0391838  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0413  amidophosphoribosyltransferase  72.3 
 
 		 491 aa  707    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.577853 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0404  amidophosphoribosyltransferase  64.33 
 
 		 488 aa  647    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305555  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3787  amidophosphoribosyltransferase  69.63 
 
 		 510 aa  672    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2452  amidophosphoribosyltransferase  74.16 
 
 		 514 aa  684    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2282  amidophosphoribosyltransferase  71.26 
 
 		 503 aa  706    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.235461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0560  amidophosphoribosyltransferase  65.32 
 
 		 496 aa  663    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.605887  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1042  amidophosphoribosyltransferase  63.84 
 
 		 496 aa  648    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.236184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3932  amidophosphoribosyltransferase  75.7 
 
 		 491 aa  727    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.961822  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2997  amidophosphoribosyltransferase  72.9 
 
 		 514 aa  706    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.807987  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2293  amidophosphoribosyltransferase  68.33 
 
 		 504 aa  660    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1541  amidophosphoribosyltransferase  64.5 
 
 		 502 aa  647    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2311  amidophosphoribosyltransferase  73.54 
 
 		 501 aa  728    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.672659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0578  amidophosphoribosyltransferase  62.82 
 
 		 486 aa  639    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0983  amidophosphoribosyltransferase  65.34 
 
 		 490 aa  640    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.592161  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1187  amidophosphoribosyltransferase  61.68 
 
 		 496 aa  637    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.44974 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4629  amidophosphoribosyltransferase  71.85 
 
 		 500 aa  703    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.691036  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2502  amidophosphoribosyltransferase  67.99 
 
 		 500 aa  675    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4300  amidophosphoribosyltransferase  75.7 
 
 		 491 aa  727    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.182299  normal  0.0484415 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2400  amidophosphoribosyltransferase  72.69 
 
 		 514 aa  737    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.453817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3894  amidophosphoribosyltransferase  74.35 
 
 		 491 aa  713    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4407  amidophosphoribosyltransferase  73.63 
 
 		 491 aa  721    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0486  amidophosphoribosyltransferase  63.02 
 
 		 496 aa  637    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.937235  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1499  amidophosphoribosyltransferase  61.34 
 
 		 529 aa  638    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.338535  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3487  amidophosphoribosyltransferase  100 
 
 		 503 aa  1027    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.746658  normal  0.621078 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0405  amidophosphoribosyltransferase  65.01 
 
 		 493 aa  632  1e-180  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0727  amidophosphoribosyltransferase  62.53 
 
 		 496 aa  634  1e-180  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1763  amidophosphoribosyltransferase  62.71 
 
 		 496 aa  620  1e-176  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.644721  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2878  amidophosphoribosyltransferase  64.45 
 
 		 517 aa  616  1e-175  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.116336 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1205  amidophosphoribosyltransferase  59.75 
 
 		 493 aa  580  1e-164  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1062  amidophosphoribosyltransferase  59.1 
 
 		 486 aa  571  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.739126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1707  amidophosphoribosyltransferase  58.85 
 
 		 497 aa  566  1e-160  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0317953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3939  amidophosphoribosyltransferase  59.83 
 
 		 499 aa  565  1e-160  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2454  amidophosphoribosyltransferase  58.55 
 
 		 487 aa  559  1e-158  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1117  amidophosphoribosyltransferase  58.55 
 
 		 487 aa  561  1e-158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.981489  normal  0.353735 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2132  amidophosphoribosyltransferase  59.02 
 
 		 508 aa  554  1e-156  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.864953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2702  amidophosphoribosyltransferase  57.33 
 
 		 475 aa  535  1e-151  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0265  amidophosphoribosyltransferase  57.77 
 
 		 476 aa  532  1e-150  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1153  amidophosphoribosyltransferase  55.22 
 
 		 474 aa  534  1e-150  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1939  amidophosphoribosyltransferase  56.12 
 
 		 466 aa  530  1e-149  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1636  amidophosphoribosyltransferase  55.9 
 
 		 467 aa  525  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1891  amidophosphoribosyltransferase  53.68 
 
 		 477 aa  521  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2329  amidophosphoribosyltransferase  54.11 
 
 		 477 aa  524  1e-147  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.64237  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1326  amidophosphoribosyltransferase  54.39 
 
 		 468 aa  520  1e-146  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1722  amidophosphoribosyltransferase  55.53 
 
 		 481 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.56305  normal  0.196104 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2064  amidophosphoribosyltransferase  55.53 
 
 		 475 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2068  amidophosphoribosyltransferase  53.01 
 
 		 474 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.286768  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4354  amidophosphoribosyltransferase  56.57 
 
 		 484 aa  498  1e-140  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.463043 
 
 
-
 
NC_002978  WD1109  amidophosphoribosyltransferase  53.06 
 
 		 461 aa  499  1e-140  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4206  amidophosphoribosyltransferase  55.58 
 
 		 485 aa  496  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.975393  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4361  amidophosphoribosyltransferase  55.58 
 
 		 485 aa  496  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4338  amidophosphoribosyltransferase  55.58 
 
 		 485 aa  496  1e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1136  amidophosphoribosyltransferase  54.61 
 
 		 470 aa  481  1e-135  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0139  amidophosphoribosyltransferase  49.89 
 
 		 462 aa  479  1e-134  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4621  amidophosphoribosyltransferase  50.86 
 
 		 482 aa  479  1e-134  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.059877  normal  0.48412 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1475  amidophosphoribosyltransferase  51.64 
 
 		 472 aa  480  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1032  amidophosphoribosyltransferase  52.71 
 
 		 495 aa  474  1e-132  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0260  amidophosphoribosyltransferase  52.17 
 
 		 470 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0327  amidophosphoribosyltransferase  50.43 
 
 		 471 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0282  amidophosphoribosyltransferase  50.43 
 
 		 471 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0267  amidophosphoribosyltransferase  50.43 
 
 		 471 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0270  amidophosphoribosyltransferase  50.43 
 
 		 471 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0295  amidophosphoribosyltransferase  50.43 
 
 		 471 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.312701  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4979  amidophosphoribosyltransferase  50.43 
 
 		 471 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0368  amidophosphoribosyltransferase  50.43 
 
 		 471 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0321  amidophosphoribosyltransferase  48.57 
 
 		 461 aa  462  1e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0324  amidophosphoribosyltransferase  50.22 
 
 		 471 aa  464  1e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0090  amidophosphoribosyltransferase  50.33 
 
 		 462 aa  462  1e-129  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0276  amidophosphoribosyltransferase  50.22 
 
 		 471 aa  464  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0878  glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase  49.89 
 
 		 503 aa  462  1e-129  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141495  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0341  amidophosphoribosyltransferase  50.22 
 
 		 471 aa  464  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22120  amidophosphoribosyltransferase  50.44 
 
 		 480 aa  460  9.999999999999999e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.357347  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0274  amidophosphoribosyltransferase  49.78 
 
 		 471 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1102  amidophosphoribosyltransferase  51.3 
 
 		 466 aa  457  1e-127  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5556  amidophosphoribosyltransferase  53.17 
 
 		 511 aa  458  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2807  amidophosphoribosyltransferase  49.01 
 
 		 462 aa  457  1e-127  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1871  amidophosphoribosyltransferase  49.45 
 
 		 451 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.10696  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0051  amidophosphoribosyltransferase  47.7 
 
 		 479 aa  452  1.0000000000000001e-126  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1632  amidophosphoribosyltransferase  49.78 
 
 		 469 aa  452  1.0000000000000001e-126  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2109  amidophosphoribosyltransferase  47.16 
 
 		 475 aa  449  1e-125  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2307  amidophosphoribosyltransferase  46.84 
 
 		 467 aa  451  1e-125  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1618  amidophosphoribosyltransferase  47.94 
 
 		 506 aa  451  1e-125  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0007  amidophosphoribosyltransferase  50.89 
 
 		 487 aa  451  1e-125  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0398  amidophosphoribosyltransferase  49.78 
 
 		 480 aa  450  1e-125  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0026  amidophosphoribosyltransferase  45.77 
 
 		 484 aa  445  1.0000000000000001e-124  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0522  amidophosphoribosyltransferase  48.02 
 
 		 465 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0141  amidophosphoribosyltransferase  50.87 
 
 		 484 aa  446  1.0000000000000001e-124  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1778  hypothetical protein  48.16 
 
 		 475 aa  446  1.0000000000000001e-124  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000929805  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1448  amidophosphoribosyltransferase  47.52 
 
 		 474 aa  442  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4217  amidophosphoribosyltransferase  48.93 
 
 		 494 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4178  amidophosphoribosyltransferase  48.93 
 
 		 494 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3212  amidophosphoribosyltransferase  47.9 
 
 		 463 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.903412  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3699  amidophosphoribosyltransferase  47.54 
 
 		 493 aa  438  9.999999999999999e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.549743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0299  amidophosphoribosyltransferase  48.78 
 
 		 446 aa  439  9.999999999999999e-123  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1249  amidophosphoribosyltransferase  48.3 
 
 		 488 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.917797  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2365  amidophosphoribosyltransferase  48.57 
 
 		 474 aa  436  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>