More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3939 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2454  amidophosphoribosyltransferase  84.36 
 
 		 487 aa  852    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1707  amidophosphoribosyltransferase  81.57 
 
 		 497 aa  824    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0317953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2132  amidophosphoribosyltransferase  81.19 
 
 		 508 aa  810    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.864953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1062  amidophosphoribosyltransferase  84.33 
 
 		 486 aa  854    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.739126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3939  amidophosphoribosyltransferase  100 
 
 		 499 aa  1023    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1117  amidophosphoribosyltransferase  84.36 
 
 		 487 aa  853    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.981489  normal  0.353735 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0404  amidophosphoribosyltransferase  59.25 
 
 		 488 aa  599  1e-170  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305555  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1541  amidophosphoribosyltransferase  60.84 
 
 		 502 aa  599  1e-170  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0405  amidophosphoribosyltransferase  60.76 
 
 		 493 aa  591  1e-167  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0983  amidophosphoribosyltransferase  62.37 
 
 		 490 aa  590  1e-167  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.592161  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0578  amidophosphoribosyltransferase  60.54 
 
 		 486 aa  589  1e-167  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1763  amidophosphoribosyltransferase  61.57 
 
 		 496 aa  585  1e-166  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.644721  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2878  amidophosphoribosyltransferase  59.75 
 
 		 517 aa  577  1.0000000000000001e-163  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.116336 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3487  amidophosphoribosyltransferase  59.83 
 
 		 503 aa  565  1e-160  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.746658  normal  0.621078 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4407  amidophosphoribosyltransferase  60.17 
 
 		 491 aa  566  1e-160  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3894  amidophosphoribosyltransferase  60.17 
 
 		 491 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4300  amidophosphoribosyltransferase  59.74 
 
 		 491 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.182299  normal  0.0484415 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3932  amidophosphoribosyltransferase  59.74 
 
 		 491 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.961822  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2599  amidophosphoribosyltransferase  59.96 
 
 		 499 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0391838  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4629  amidophosphoribosyltransferase  59.83 
 
 		 500 aa  560  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.691036  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2311  amidophosphoribosyltransferase  59.79 
 
 		 501 aa  555  1e-157  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.672659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2997  amidophosphoribosyltransferase  58.58 
 
 		 514 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.807987  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1042  amidophosphoribosyltransferase  57.26 
 
 		 496 aa  551  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.236184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0413  amidophosphoribosyltransferase  58.89 
 
 		 491 aa  547  1e-154  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.577853 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3787  amidophosphoribosyltransferase  58.12 
 
 		 510 aa  545  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2400  amidophosphoribosyltransferase  56.2 
 
 		 514 aa  547  1e-154  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.453817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3501  amidophosphoribosyltransferase  57.51 
 
 		 509 aa  547  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1499  amidophosphoribosyltransferase  56.75 
 
 		 529 aa  543  1e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.338535  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1187  amidophosphoribosyltransferase  56 
 
 		 496 aa  543  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.44974 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2502  amidophosphoribosyltransferase  57.82 
 
 		 500 aa  543  1e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2282  amidophosphoribosyltransferase  57.26 
 
 		 503 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.235461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0727  amidophosphoribosyltransferase  56.54 
 
 		 496 aa  538  9.999999999999999e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2452  amidophosphoribosyltransferase  58.72 
 
 		 514 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0560  amidophosphoribosyltransferase  56.33 
 
 		 496 aa  535  1e-151  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.605887  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2017  amidophosphoribosyltransferase  56.54 
 
 		 504 aa  518  1e-146  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2293  amidophosphoribosyltransferase  56.12 
 
 		 504 aa  519  1e-146  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0486  amidophosphoribosyltransferase  54.43 
 
 		 496 aa  519  1e-146  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.937235  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0265  amidophosphoribosyltransferase  54.86 
 
 		 476 aa  512  1e-144  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0446  amidophosphoribosyltransferase  56.75 
 
 		 485 aa  510  1e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0453  amidophosphoribosyltransferase  56.25 
 
 		 509 aa  509  1e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2702  amidophosphoribosyltransferase  53.48 
 
 		 475 aa  501  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1722  amidophosphoribosyltransferase  52.99 
 
 		 481 aa  496  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.56305  normal  0.196104 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2064  amidophosphoribosyltransferase  52.99 
 
 		 475 aa  495  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1205  amidophosphoribosyltransferase  53.63 
 
 		 493 aa  496  1e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1326  amidophosphoribosyltransferase  52.21 
 
 		 468 aa  493  9.999999999999999e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1891  amidophosphoribosyltransferase  52.72 
 
 		 477 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1153  amidophosphoribosyltransferase  52.23 
 
 		 474 aa  491  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2329  amidophosphoribosyltransferase  52.29 
 
 		 477 aa  489  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.64237  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1939  amidophosphoribosyltransferase  52.17 
 
 		 466 aa  491  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1636  amidophosphoribosyltransferase  52.28 
 
 		 467 aa  486  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2068  amidophosphoribosyltransferase  50.76 
 
 		 474 aa  488  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.286768  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4621  amidophosphoribosyltransferase  51.17 
 
 		 482 aa  475  1e-133  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.059877  normal  0.48412 
 
 
-
 
NC_002978  WD1109  amidophosphoribosyltransferase  51.18 
 
 		 461 aa  474  1e-132  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1871  amidophosphoribosyltransferase  50.11 
 
 		 451 aa  473  1e-132  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.10696  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0139  amidophosphoribosyltransferase  48.29 
 
 		 462 aa  474  1e-132  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4338  amidophosphoribosyltransferase  52.85 
 
 		 485 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4361  amidophosphoribosyltransferase  52.85 
 
 		 485 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4206  amidophosphoribosyltransferase  52.74 
 
 		 485 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.975393  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4354  amidophosphoribosyltransferase  53.36 
 
 		 484 aa  468  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.463043 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0878  glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase  49.04 
 
 		 503 aa  458  1e-127  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141495  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0321  amidophosphoribosyltransferase  49.02 
 
 		 461 aa  456  1e-127  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1032  amidophosphoribosyltransferase  48.92 
 
 		 495 aa  453  1.0000000000000001e-126  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22120  amidophosphoribosyltransferase  49.36 
 
 		 480 aa  451  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.357347  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4979  amidophosphoribosyltransferase  48.6 
 
 		 471 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0324  amidophosphoribosyltransferase  48.6 
 
 		 471 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0282  amidophosphoribosyltransferase  48.6 
 
 		 471 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0267  amidophosphoribosyltransferase  48.6 
 
 		 471 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0270  amidophosphoribosyltransferase  48.6 
 
 		 471 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0090  amidophosphoribosyltransferase  47.96 
 
 		 462 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0295  amidophosphoribosyltransferase  48.6 
 
 		 471 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.312701  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0276  amidophosphoribosyltransferase  48.38 
 
 		 471 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0368  amidophosphoribosyltransferase  48.6 
 
 		 471 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0327  amidophosphoribosyltransferase  48.6 
 
 		 471 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0341  amidophosphoribosyltransferase  48.38 
 
 		 471 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0274  amidophosphoribosyltransferase  48.16 
 
 		 471 aa  443  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1136  amidophosphoribosyltransferase  49.89 
 
 		 470 aa  443  1e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1102  amidophosphoribosyltransferase  49.79 
 
 		 466 aa  445  1e-123  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0260  amidophosphoribosyltransferase  49.46 
 
 		 470 aa  443  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1475  amidophosphoribosyltransferase  46 
 
 		 472 aa  444  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0522  amidophosphoribosyltransferase  45.79 
 
 		 465 aa  442  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5556  amidophosphoribosyltransferase  52.06 
 
 		 511 aa  440  9.999999999999999e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1618  amidophosphoribosyltransferase  47.01 
 
 		 506 aa  438  9.999999999999999e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0299  amidophosphoribosyltransferase  45.15 
 
 		 446 aa  439  9.999999999999999e-123  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1137  amidophosphoribosyltransferase  46.81 
 
 		 445 aa  436  1e-121  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0174  amidophosphoribosyltransferase  47.58 
 
 		 445 aa  434  1e-120  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.838457  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0194  amidophosphoribosyltransferase  47.52 
 
 		 463 aa  433  1e-120  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0142686  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0724  amidophosphoribosyltransferase  47.46 
 
 		 500 aa  434  1e-120  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00225283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1249  amidophosphoribosyltransferase  47.76 
 
 		 488 aa  435  1e-120  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.917797  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1359  amidophosphoribosyltransferase  45.93 
 
 		 454 aa  429  1e-119  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3212  amidophosphoribosyltransferase  46.96 
 
 		 463 aa  427  1e-118  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.903412  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1448  amidophosphoribosyltransferase  46.65 
 
 		 474 aa  427  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4318  amidophosphoribosyltransferase  46.84 
 
 		 496 aa  428  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1778  hypothetical protein  44.78 
 
 		 475 aa  426  1e-118  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000929805  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01750  amidophosphoribosyltransferase  48.06 
 
 		 482 aa  427  1e-118  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.674101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2807  amidophosphoribosyltransferase  45.93 
 
 		 462 aa  426  1e-118  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0026  amidophosphoribosyltransferase  44.21 
 
 		 484 aa  425  1e-117  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1632  amidophosphoribosyltransferase  47.96 
 
 		 469 aa  424  1e-117  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2365  amidophosphoribosyltransferase  46.92 
 
 		 474 aa  422  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0674  amidophosphoribosyltransferase  46.84 
 
 		 473 aa  424  1e-117  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0051  amidophosphoribosyltransferase  45.44 
 
 		 479 aa  422  1e-117  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>