More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1871 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1871  amidophosphoribosyltransferase  100 
 
 
451 aa  930    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.10696  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0174  amidophosphoribosyltransferase  61.04 
 
 
445 aa  579  1e-164  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.838457  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0299  amidophosphoribosyltransferase  58.88 
 
 
446 aa  553  1e-156  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1359  amidophosphoribosyltransferase  56.73 
 
 
454 aa  530  1e-149  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2068  amidophosphoribosyltransferase  54.85 
 
 
474 aa  527  1e-148  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.286768  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1636  amidophosphoribosyltransferase  54.61 
 
 
467 aa  523  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1137  amidophosphoribosyltransferase  56.53 
 
 
445 aa  523  1e-147  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2702  amidophosphoribosyltransferase  55.26 
 
 
475 aa  525  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1326  amidophosphoribosyltransferase  53.85 
 
 
468 aa  518  1e-146  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2329  amidophosphoribosyltransferase  52.88 
 
 
477 aa  519  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.64237  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0845  amidophosphoribosyltransferase  57.66 
 
 
445 aa  516  1.0000000000000001e-145  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4621  amidophosphoribosyltransferase  54.47 
 
 
482 aa  515  1.0000000000000001e-145  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.059877  normal  0.48412 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1891  amidophosphoribosyltransferase  52.65 
 
 
477 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0189  amidophosphoribosyltransferase  54.73 
 
 
445 aa  513  1e-144  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0206  amidophosphoribosyltransferase  54.73 
 
 
445 aa  513  1e-144  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1939  amidophosphoribosyltransferase  53.26 
 
 
466 aa  513  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1153  amidophosphoribosyltransferase  52.9 
 
 
474 aa  513  1e-144  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0227  amidophosphoribosyltransferase  54.73 
 
 
445 aa  513  1e-144  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1408  amidophosphoribosyltransferase  54.61 
 
 
446 aa  503  1e-141  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1102  amidophosphoribosyltransferase  52.95 
 
 
466 aa  486  1e-136  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0404  amidophosphoribosyltransferase  51.97 
 
 
488 aa  483  1e-135  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305555  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1541  amidophosphoribosyltransferase  52.32 
 
 
502 aa  481  1e-134  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267372  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0274  amidophosphoribosyltransferase  50.66 
 
 
471 aa  476  1e-133  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2132  amidophosphoribosyltransferase  50.98 
 
 
508 aa  476  1e-133  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.864953  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0341  amidophosphoribosyltransferase  50.22 
 
 
471 aa  471  1e-132  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2599  amidophosphoribosyltransferase  51.32 
 
 
499 aa  474  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0391838  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0276  amidophosphoribosyltransferase  50.66 
 
 
471 aa  471  1e-132  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1136  amidophosphoribosyltransferase  49.02 
 
 
470 aa  474  1e-132  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0983  amidophosphoribosyltransferase  52.2 
 
 
490 aa  474  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.592161  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3939  amidophosphoribosyltransferase  50.11 
 
 
499 aa  473  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0324  amidophosphoribosyltransferase  50.22 
 
 
471 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0282  amidophosphoribosyltransferase  50.22 
 
 
471 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0267  amidophosphoribosyltransferase  50.22 
 
 
471 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0270  amidophosphoribosyltransferase  50.22 
 
 
471 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0260  amidophosphoribosyltransferase  49.12 
 
 
470 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2878  amidophosphoribosyltransferase  50.55 
 
 
517 aa  471  1.0000000000000001e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.116336 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2454  amidophosphoribosyltransferase  49.89 
 
 
487 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0295  amidophosphoribosyltransferase  50.22 
 
 
471 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.312701  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0327  amidophosphoribosyltransferase  50.22 
 
 
471 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4979  amidophosphoribosyltransferase  50.22 
 
 
471 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1117  amidophosphoribosyltransferase  49.89 
 
 
487 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.981489  normal  0.353735 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0265  amidophosphoribosyltransferase  48.01 
 
 
476 aa  468  1.0000000000000001e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0368  amidophosphoribosyltransferase  50.22 
 
 
471 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2807  amidophosphoribosyltransferase  52.03 
 
 
462 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4629  amidophosphoribosyltransferase  50.44 
 
 
500 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.691036  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0334  amidophosphoribosyltransferase  52.58 
 
 
462 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.708549  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0405  amidophosphoribosyltransferase  49.02 
 
 
493 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1707  amidophosphoribosyltransferase  49.35 
 
 
497 aa  467  9.999999999999999e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0317953  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1032  amidophosphoribosyltransferase  49.45 
 
 
495 aa  468  9.999999999999999e-131  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0878  glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase  49.56 
 
 
503 aa  467  9.999999999999999e-131  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141495  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2365  amidophosphoribosyltransferase  49.78 
 
 
474 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3894  amidophosphoribosyltransferase  50.66 
 
 
491 aa  462  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1062  amidophosphoribosyltransferase  49.35 
 
 
486 aa  461  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.739126  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4300  amidophosphoribosyltransferase  51.32 
 
 
491 aa  462  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.182299  normal  0.0484415 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3932  amidophosphoribosyltransferase  51.32 
 
 
491 aa  462  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.961822  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2400  amidophosphoribosyltransferase  49.67 
 
 
514 aa  464  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.453817  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1722  amidophosphoribosyltransferase  49.44 
 
 
481 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.56305  normal  0.196104 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4571  amidophosphoribosyltransferase  48.78 
 
 
468 aa  459  9.999999999999999e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.470676  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2064  amidophosphoribosyltransferase  49.44 
 
 
475 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4407  amidophosphoribosyltransferase  51.32 
 
 
491 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0321  amidophosphoribosyltransferase  49.67 
 
 
461 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1632  amidophosphoribosyltransferase  49.21 
 
 
469 aa  457  1e-127  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2307  amidophosphoribosyltransferase  50.78 
 
 
467 aa  456  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2502  amidophosphoribosyltransferase  50.34 
 
 
500 aa  455  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1778  hypothetical protein  48 
 
 
475 aa  457  1e-127  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000929805  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22120  amidophosphoribosyltransferase  48.67 
 
 
480 aa  457  1e-127  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.357347  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2072  amidophosphoribosyltransferase  48.02 
 
 
506 aa  456  1e-127  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4354  amidophosphoribosyltransferase  47.96 
 
 
484 aa  458  1e-127  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.463043 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3212  amidophosphoribosyltransferase  50.56 
 
 
463 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.903412  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0578  amidophosphoribosyltransferase  50.22 
 
 
486 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01750  amidophosphoribosyltransferase  49.67 
 
 
482 aa  452  1.0000000000000001e-126  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.674101  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4206  amidophosphoribosyltransferase  48.38 
 
 
485 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.975393  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4338  amidophosphoribosyltransferase  47.55 
 
 
485 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1147  amidophosphoribosyltransferase  48.46 
 
 
478 aa  452  1.0000000000000001e-126  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.218005  normal  0.314166 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4361  amidophosphoribosyltransferase  47.55 
 
 
485 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3343  amidophosphoribosyltransferase  50.11 
 
 
502 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3487  amidophosphoribosyltransferase  49.45 
 
 
503 aa  453  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.746658  normal  0.621078 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1052  amidophosphoribosyltransferase  49.55 
 
 
491 aa  449  1e-125  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0900198 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1475  amidophosphoribosyltransferase  49.67 
 
 
472 aa  450  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1763  amidophosphoribosyltransferase  50 
 
 
496 aa  450  1e-125  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.644721  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0560  amidophosphoribosyltransferase  50.76 
 
 
496 aa  449  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.605887  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1249  amidophosphoribosyltransferase  50 
 
 
488 aa  450  1e-125  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.917797  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3699  amidophosphoribosyltransferase  50 
 
 
493 aa  450  1e-125  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.549743  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2047  amidophosphoribosyltransferase  48.89 
 
 
465 aa  445  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.330153 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5556  amidophosphoribosyltransferase  49 
 
 
511 aa  445  1.0000000000000001e-124  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0007  amidophosphoribosyltransferase  50 
 
 
487 aa  446  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30048  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0727  amidophosphoribosyltransferase  50.11 
 
 
496 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06050  amidophosphoribosyltransferase  47.7 
 
 
518 aa  442  1e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.203247  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3637  amidophosphoribosyltransferase  47.33 
 
 
499 aa  441  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.811729 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2997  amidophosphoribosyltransferase  47.68 
 
 
514 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.807987  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1618  amidophosphoribosyltransferase  47.99 
 
 
506 aa  443  1e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0486  amidophosphoribosyltransferase  51.43 
 
 
496 aa  443  1e-123  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.937235  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1415  amidophosphoribosyltransferase  47.23 
 
 
472 aa  439  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1042  amidophosphoribosyltransferase  50.55 
 
 
496 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.236184  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0398  amidophosphoribosyltransferase  50.22 
 
 
480 aa  439  9.999999999999999e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0724  amidophosphoribosyltransferase  47.9 
 
 
500 aa  438  9.999999999999999e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00225283  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3396  amidophosphoribosyltransferase  47.56 
 
 
492 aa  440  9.999999999999999e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1499  amidophosphoribosyltransferase  49.35 
 
 
529 aa  440  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.338535  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3743  amidophosphoribosyltransferase  47.99 
 
 
466 aa  441  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189021 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3735  amidophosphoribosyltransferase  46.7 
 
 
558 aa  439  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>