More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1618 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_0324  amidophosphoribosyltransferase  68.87 
 
 
471 aa  677    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0026  amidophosphoribosyltransferase  71.91 
 
 
484 aa  726    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0282  amidophosphoribosyltransferase  68.44 
 
 
471 aa  676    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0267  amidophosphoribosyltransferase  68.44 
 
 
471 aa  676    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0270  amidophosphoribosyltransferase  68.44 
 
 
471 aa  676    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4979  amidophosphoribosyltransferase  68.44 
 
 
471 aa  673    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1032  amidophosphoribosyltransferase  68.02 
 
 
495 aa  675    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0295  amidophosphoribosyltransferase  68.44 
 
 
471 aa  676    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.312701  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0878  glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase  70.36 
 
 
503 aa  694    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141495  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0327  amidophosphoribosyltransferase  68.44 
 
 
471 aa  676    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0274  amidophosphoribosyltransferase  67.59 
 
 
471 aa  663    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0368  amidophosphoribosyltransferase  68.66 
 
 
471 aa  675    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0276  amidophosphoribosyltransferase  67.8 
 
 
471 aa  670    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1618  amidophosphoribosyltransferase  100 
 
 
506 aa  1051    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0051  amidophosphoribosyltransferase  74.68 
 
 
479 aa  746    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0341  amidophosphoribosyltransferase  68.44 
 
 
471 aa  672    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1152  amidophosphoribosyltransferase  61.44 
 
 
494 aa  604  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0260  amidophosphoribosyltransferase  60.68 
 
 
470 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1130  amidophosphoribosyltransferase  61.44 
 
 
494 aa  604  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0141  amidophosphoribosyltransferase  62.45 
 
 
484 aa  599  1e-170  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1136  amidophosphoribosyltransferase  61.35 
 
 
470 aa  593  1e-168  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0655  amidophosphoribosyltransferase  60.68 
 
 
494 aa  592  1e-168  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0724  amidophosphoribosyltransferase  60.38 
 
 
536 aa  593  1e-168  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0398  amidophosphoribosyltransferase  53.74 
 
 
480 aa  499  1e-140  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2702  amidophosphoribosyltransferase  52.81 
 
 
475 aa  497  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1939  amidophosphoribosyltransferase  52.02 
 
 
466 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1636  amidophosphoribosyltransferase  51.35 
 
 
467 aa  488  1e-137  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2599  amidophosphoribosyltransferase  51.08 
 
 
499 aa  483  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0391838  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1891  amidophosphoribosyltransferase  50.45 
 
 
477 aa  482  1e-135  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2329  amidophosphoribosyltransferase  50.22 
 
 
477 aa  482  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.64237  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2068  amidophosphoribosyltransferase  50.22 
 
 
474 aa  479  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.286768  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1326  amidophosphoribosyltransferase  49.23 
 
 
468 aa  481  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1153  amidophosphoribosyltransferase  50.45 
 
 
474 aa  478  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3932  amidophosphoribosyltransferase  50.65 
 
 
491 aa  477  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.961822  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4300  amidophosphoribosyltransferase  50.65 
 
 
491 aa  477  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.182299  normal  0.0484415 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4407  amidophosphoribosyltransferase  50.32 
 
 
491 aa  476  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2997  amidophosphoribosyltransferase  49.67 
 
 
514 aa  477  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.807987  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4629  amidophosphoribosyltransferase  50.87 
 
 
500 aa  478  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.691036  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3894  amidophosphoribosyltransferase  49.57 
 
 
491 aa  473  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1475  amidophosphoribosyltransferase  51.23 
 
 
472 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1778  hypothetical protein  51.43 
 
 
475 aa  471  1.0000000000000001e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000929805  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1102  amidophosphoribosyltransferase  52.31 
 
 
466 aa  468  9.999999999999999e-131  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2400  amidophosphoribosyltransferase  46.15 
 
 
514 aa  468  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.453817  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3501  amidophosphoribosyltransferase  48.37 
 
 
509 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2109  amidophosphoribosyltransferase  47.61 
 
 
475 aa  462  1e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2365  amidophosphoribosyltransferase  51.01 
 
 
474 aa  458  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1722  amidophosphoribosyltransferase  49.12 
 
 
481 aa  458  9.999999999999999e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.56305  normal  0.196104 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4621  amidophosphoribosyltransferase  46.31 
 
 
482 aa  456  1e-127  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.059877  normal  0.48412 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2064  amidophosphoribosyltransferase  49.12 
 
 
475 aa  458  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1249  amidophosphoribosyltransferase  50.22 
 
 
488 aa  456  1e-127  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.917797  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1147  amidophosphoribosyltransferase  49.56 
 
 
478 aa  456  1e-127  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.218005  normal  0.314166 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1448  amidophosphoribosyltransferase  48.14 
 
 
474 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2452  amidophosphoribosyltransferase  48.81 
 
 
514 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0265  amidophosphoribosyltransferase  47.84 
 
 
476 aa  454  1.0000000000000001e-126  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1632  amidophosphoribosyltransferase  48.99 
 
 
469 aa  453  1.0000000000000001e-126  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0321  amidophosphoribosyltransferase  46.56 
 
 
461 aa  450  1e-125  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2311  amidophosphoribosyltransferase  49.35 
 
 
501 aa  451  1e-125  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.672659  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3487  amidophosphoribosyltransferase  47.94 
 
 
503 aa  451  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.746658  normal  0.621078 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3787  amidophosphoribosyltransferase  48.83 
 
 
510 aa  451  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2017  amidophosphoribosyltransferase  48.39 
 
 
504 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2282  amidophosphoribosyltransferase  47.33 
 
 
503 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.235461  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2878  amidophosphoribosyltransferase  46.67 
 
 
517 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.116336 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0674  amidophosphoribosyltransferase  47.67 
 
 
473 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0672  amidophosphoribosyltransferase  47.45 
 
 
473 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1187  amidophosphoribosyltransferase  46.09 
 
 
496 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.44974 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1871  amidophosphoribosyltransferase  47.99 
 
 
451 aa  443  1e-123  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.10696  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0413  amidophosphoribosyltransferase  49.78 
 
 
491 aa  442  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.577853 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0560  amidophosphoribosyltransferase  48.23 
 
 
496 aa  442  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.605887  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2807  amidophosphoribosyltransferase  47.87 
 
 
462 aa  442  1e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3212  amidophosphoribosyltransferase  47.33 
 
 
463 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.903412  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4354  amidophosphoribosyltransferase  47.71 
 
 
484 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.463043 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0727  amidophosphoribosyltransferase  47.42 
 
 
496 aa  438  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1042  amidophosphoribosyltransferase  45.89 
 
 
496 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.236184  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0405  amidophosphoribosyltransferase  45.02 
 
 
493 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3939  amidophosphoribosyltransferase  47.01 
 
 
499 aa  438  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2184  amidophosphoribosyltransferase  48.57 
 
 
487 aa  436  1e-121  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22120  amidophosphoribosyltransferase  46.8 
 
 
480 aa  437  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.357347  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0228  amidophosphoribosyltransferase  44.91 
 
 
470 aa  436  1e-121  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000396195  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2502  amidophosphoribosyltransferase  46.68 
 
 
500 aa  436  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0404  amidophosphoribosyltransferase  46.97 
 
 
488 aa  438  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305555  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1707  amidophosphoribosyltransferase  45.49 
 
 
497 aa  438  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0317953  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2293  amidophosphoribosyltransferase  45.57 
 
 
504 aa  436  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0063  amidophosphoribosyltransferase  48.9 
 
 
472 aa  436  1e-121  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1205  amidophosphoribosyltransferase  47.31 
 
 
493 aa  435  1e-121  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0007  amidophosphoribosyltransferase  49.22 
 
 
487 aa  437  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30048  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2072  amidophosphoribosyltransferase  48.92 
 
 
506 aa  436  1e-121  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0292  amidophosphoribosyltransferase  47.66 
 
 
459 aa  437  1e-121  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.95663  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0309  amidophosphoribosyltransferase  50.66 
 
 
473 aa  434  1e-120  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0033  amidophosphoribosyltransferase  48.81 
 
 
497 aa  435  1e-120  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1499  amidophosphoribosyltransferase  45.62 
 
 
529 aa  434  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.338535  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0983  amidophosphoribosyltransferase  45.63 
 
 
490 aa  432  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.592161  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1062  amidophosphoribosyltransferase  46.47 
 
 
486 aa  432  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.739126  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0731  amidophosphoribosyltransferase  45.7 
 
 
478 aa  434  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4571  amidophosphoribosyltransferase  46.41 
 
 
468 aa  434  1e-120  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.470676  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2307  amidophosphoribosyltransferase  46.21 
 
 
467 aa  431  1e-119  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1523  amidophosphoribosyltransferase  47.2 
 
 
459 aa  429  1e-119  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0119394  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2047  amidophosphoribosyltransferase  48 
 
 
465 aa  431  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.330153 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4318  amidophosphoribosyltransferase  47.03 
 
 
496 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0486  amidophosphoribosyltransferase  49.35 
 
 
496 aa  430  1e-119  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.937235  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3044  amidophosphoribosyltransferase  47.55 
 
 
478 aa  430  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>