More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0983 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_4300  amidophosphoribosyltransferase  65.61 
 
 
491 aa  634    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.182299  normal  0.0484415 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0578  amidophosphoribosyltransferase  65.82 
 
 
486 aa  645    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2997  amidophosphoribosyltransferase  65.96 
 
 
514 aa  637    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.807987  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1541  amidophosphoribosyltransferase  65.26 
 
 
502 aa  651    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267372  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3932  amidophosphoribosyltransferase  65.61 
 
 
491 aa  634    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.961822  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2502  amidophosphoribosyltransferase  63.51 
 
 
500 aa  638    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0983  amidophosphoribosyltransferase  100 
 
 
490 aa  1002    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.592161  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3487  amidophosphoribosyltransferase  65.34 
 
 
503 aa  640    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.746658  normal  0.621078 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3894  amidophosphoribosyltransferase  67.9 
 
 
491 aa  638    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4407  amidophosphoribosyltransferase  66.59 
 
 
491 aa  633  1e-180  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3501  amidophosphoribosyltransferase  65.12 
 
 
509 aa  632  1e-180  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2599  amidophosphoribosyltransferase  65.89 
 
 
499 aa  629  1e-179  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0391838  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0404  amidophosphoribosyltransferase  63.14 
 
 
488 aa  630  1e-179  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305555  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0405  amidophosphoribosyltransferase  60.98 
 
 
493 aa  627  1e-178  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4629  amidophosphoribosyltransferase  66.52 
 
 
500 aa  626  1e-178  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.691036  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2400  amidophosphoribosyltransferase  63.3 
 
 
514 aa  627  1e-178  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.453817  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1042  amidophosphoribosyltransferase  62.1 
 
 
496 aa  622  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.236184  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1763  amidophosphoribosyltransferase  62.82 
 
 
496 aa  622  1e-177  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.644721  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2311  amidophosphoribosyltransferase  66.53 
 
 
501 aa  624  1e-177  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.672659  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1499  amidophosphoribosyltransferase  62.24 
 
 
529 aa  615  1e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.338535  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1187  amidophosphoribosyltransferase  61.68 
 
 
496 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.44974 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2282  amidophosphoribosyltransferase  63.56 
 
 
503 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.235461  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3787  amidophosphoribosyltransferase  64.06 
 
 
510 aa  612  9.999999999999999e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0413  amidophosphoribosyltransferase  65.68 
 
 
491 aa  614  9.999999999999999e-175  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.577853 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0560  amidophosphoribosyltransferase  61.71 
 
 
496 aa  610  1e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.605887  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2452  amidophosphoribosyltransferase  65.75 
 
 
514 aa  608  1e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2878  amidophosphoribosyltransferase  58.97 
 
 
517 aa  609  1e-173  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.116336 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0727  amidophosphoribosyltransferase  61.33 
 
 
496 aa  602  1.0000000000000001e-171  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0486  amidophosphoribosyltransferase  60.67 
 
 
496 aa  597  1e-169  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.937235  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2293  amidophosphoribosyltransferase  61.76 
 
 
504 aa  589  1e-167  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3939  amidophosphoribosyltransferase  62.37 
 
 
499 aa  590  1e-167  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0453  amidophosphoribosyltransferase  61.34 
 
 
509 aa  585  1e-166  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1062  amidophosphoribosyltransferase  60.99 
 
 
486 aa  587  1e-166  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.739126  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0446  amidophosphoribosyltransferase  61.86 
 
 
485 aa  583  1.0000000000000001e-165  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1707  amidophosphoribosyltransferase  60.43 
 
 
497 aa  584  1.0000000000000001e-165  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0317953  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2454  amidophosphoribosyltransferase  60.86 
 
 
487 aa  579  1e-164  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1117  amidophosphoribosyltransferase  60.86 
 
 
487 aa  580  1e-164  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.981489  normal  0.353735 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2017  amidophosphoribosyltransferase  61.64 
 
 
504 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2132  amidophosphoribosyltransferase  60.6 
 
 
508 aa  576  1.0000000000000001e-163  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.864953  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0265  amidophosphoribosyltransferase  56.16 
 
 
476 aa  560  1e-158  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1205  amidophosphoribosyltransferase  56.26 
 
 
493 aa  551  1e-156  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1939  amidophosphoribosyltransferase  57.24 
 
 
466 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1326  amidophosphoribosyltransferase  53.95 
 
 
468 aa  535  1e-151  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1636  amidophosphoribosyltransferase  56.35 
 
 
467 aa  532  1e-150  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1722  amidophosphoribosyltransferase  54.85 
 
 
481 aa  532  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.56305  normal  0.196104 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1153  amidophosphoribosyltransferase  55.65 
 
 
474 aa  533  1e-150  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2064  amidophosphoribosyltransferase  54.85 
 
 
475 aa  533  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1891  amidophosphoribosyltransferase  54.42 
 
 
477 aa  527  1e-148  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2329  amidophosphoribosyltransferase  54.2 
 
 
477 aa  527  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.64237  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2068  amidophosphoribosyltransferase  52.88 
 
 
474 aa  522  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.286768  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2702  amidophosphoribosyltransferase  54.53 
 
 
475 aa  520  1e-146  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0139  amidophosphoribosyltransferase  52.63 
 
 
462 aa  512  1e-144  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4621  amidophosphoribosyltransferase  51.67 
 
 
482 aa  505  9.999999999999999e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.059877  normal  0.48412 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4338  amidophosphoribosyltransferase  53.62 
 
 
485 aa  489  1e-137  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0090  amidophosphoribosyltransferase  51.43 
 
 
462 aa  489  1e-137  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4206  amidophosphoribosyltransferase  53.19 
 
 
485 aa  489  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.975393  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4361  amidophosphoribosyltransferase  53.62 
 
 
485 aa  489  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1109  amidophosphoribosyltransferase  50.87 
 
 
461 aa  487  1e-136  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1032  amidophosphoribosyltransferase  50.65 
 
 
495 aa  486  1e-136  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4354  amidophosphoribosyltransferase  52.69 
 
 
484 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.463043 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1102  amidophosphoribosyltransferase  52.16 
 
 
466 aa  480  1e-134  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1778  hypothetical protein  48.95 
 
 
475 aa  480  1e-134  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000929805  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0878  glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase  49.57 
 
 
503 aa  476  1e-133  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141495  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1871  amidophosphoribosyltransferase  52.2 
 
 
451 aa  474  1e-132  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.10696  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4979  amidophosphoribosyltransferase  49.45 
 
 
471 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0274  amidophosphoribosyltransferase  49.23 
 
 
471 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0368  amidophosphoribosyltransferase  49.45 
 
 
471 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22120  amidophosphoribosyltransferase  50.33 
 
 
480 aa  466  9.999999999999999e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.357347  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1475  amidophosphoribosyltransferase  49.45 
 
 
472 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1249  amidophosphoribosyltransferase  49.67 
 
 
488 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.917797  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0324  amidophosphoribosyltransferase  49.45 
 
 
471 aa  464  1e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1448  amidophosphoribosyltransferase  47.75 
 
 
474 aa  464  1e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0282  amidophosphoribosyltransferase  49.45 
 
 
471 aa  464  1e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0267  amidophosphoribosyltransferase  49.45 
 
 
471 aa  464  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0270  amidophosphoribosyltransferase  49.45 
 
 
471 aa  464  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0276  amidophosphoribosyltransferase  49.45 
 
 
471 aa  464  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0321  amidophosphoribosyltransferase  48.34 
 
 
461 aa  463  1e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0295  amidophosphoribosyltransferase  49.45 
 
 
471 aa  464  1e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.312701  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0341  amidophosphoribosyltransferase  49.23 
 
 
471 aa  462  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0327  amidophosphoribosyltransferase  49.45 
 
 
471 aa  464  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5556  amidophosphoribosyltransferase  52.41 
 
 
511 aa  461  9.999999999999999e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0007  amidophosphoribosyltransferase  48.92 
 
 
487 aa  458  1e-127  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30048  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1136  amidophosphoribosyltransferase  49.56 
 
 
470 aa  457  1e-127  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0260  amidophosphoribosyltransferase  49.34 
 
 
470 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0398  amidophosphoribosyltransferase  50.22 
 
 
480 aa  454  1.0000000000000001e-126  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1415  amidophosphoribosyltransferase  49.13 
 
 
472 aa  449  1e-125  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1196  amidophosphoribosyltransferase  49.23 
 
 
472 aa  451  1e-125  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2184  amidophosphoribosyltransferase  46.04 
 
 
487 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0141  amidophosphoribosyltransferase  49.35 
 
 
484 aa  446  1.0000000000000001e-124  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1632  amidophosphoribosyltransferase  48.68 
 
 
469 aa  446  1.0000000000000001e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4178  amidophosphoribosyltransferase  48.72 
 
 
494 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1222  amidophosphoribosyltransferase  49.23 
 
 
472 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.433131  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4217  amidophosphoribosyltransferase  48.72 
 
 
494 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0299  amidophosphoribosyltransferase  50.12 
 
 
446 aa  446  1.0000000000000001e-124  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2109  amidophosphoribosyltransferase  45.53 
 
 
475 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0026  amidophosphoribosyltransferase  45.43 
 
 
484 aa  443  1e-123  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2365  amidophosphoribosyltransferase  47.93 
 
 
474 aa  444  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1152  amidophosphoribosyltransferase  46.64 
 
 
494 aa  442  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1130  amidophosphoribosyltransferase  46.64 
 
 
494 aa  442  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4318  amidophosphoribosyltransferase  47.76 
 
 
496 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>