More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3743 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4571  amidophosphoribosyltransferase  68.98 
 
 		 468 aa  667    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.470676  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1511  amidophosphoribosyltransferase  94.84 
 
 		 466 aa  912    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.409813  normal  0.0292739 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3743  amidophosphoribosyltransferase  100 
 
 		 466 aa  954    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189021 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1766  amidophosphoribosyltransferase  79.83 
 
 		 488 aa  764    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0501857 
 
 
-
 
NC_002936  DET1415  amidophosphoribosyltransferase  58.42 
 
 		 472 aa  539  9.999999999999999e-153  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1222  amidophosphoribosyltransferase  57.77 
 
 		 472 aa  538  9.999999999999999e-153  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.433131  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1196  amidophosphoribosyltransferase  57.11 
 
 		 472 aa  535  1e-151  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1632  amidophosphoribosyltransferase  58.63 
 
 		 469 aa  526  1e-148  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0004  amidophosphoribosyltransferase  53.15 
 
 		 493 aa  513  1e-144  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.645305  normal  0.0907172 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3699  amidophosphoribosyltransferase  54.73 
 
 		 493 aa  512  1e-144  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.549743  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3396  amidophosphoribosyltransferase  55.14 
 
 		 492 aa  509  1e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2407  amidophosphoribosyltransferase  51.47 
 
 		 487 aa  505  9.999999999999999e-143  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.848054  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0731  amidophosphoribosyltransferase  55.09 
 
 		 478 aa  504  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2072  amidophosphoribosyltransferase  54.37 
 
 		 506 aa  502  1e-141  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3588  amidophosphoribosyltransferase  53.7 
 
 		 503 aa  501  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.51846 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1249  amidophosphoribosyltransferase  52.97 
 
 		 488 aa  497  1e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.917797  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4178  amidophosphoribosyltransferase  53.61 
 
 		 494 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2365  amidophosphoribosyltransferase  56.07 
 
 		 474 aa  498  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4318  amidophosphoribosyltransferase  52.63 
 
 		 496 aa  495  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4217  amidophosphoribosyltransferase  53.61 
 
 		 494 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3089  amidophosphoribosyltransferase  51.58 
 
 		 515 aa  493  9.999999999999999e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1475  amidophosphoribosyltransferase  54.63 
 
 		 472 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3474  amidophosphoribosyltransferase  51.52 
 
 		 563 aa  493  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0094  amidophosphoribosyltransferase  54.25 
 
 		 544 aa  491  9.999999999999999e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3735  amidophosphoribosyltransferase  50.74 
 
 		 558 aa  494  9.999999999999999e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2908  amidophosphoribosyltransferase  51.79 
 
 		 515 aa  491  1e-137  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.60952  normal  0.814875 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3637  amidophosphoribosyltransferase  53.71 
 
 		 499 aa  490  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.811729 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34090  amidophosphoribosyltransferase  51.41 
 
 		 515 aa  490  1e-137  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.163094 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7210  amidophosphoribosyltransferase  53.59 
 
 		 623 aa  490  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3343  amidophosphoribosyltransferase  53.55 
 
 		 502 aa  491  1e-137  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8991  amidophosphoribosyltransferase  53.64 
 
 		 478 aa  491  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3516  amidophosphoribosyltransferase  51.87 
 
 		 517 aa  488  1e-137  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4387  amidophosphoribosyltransferase  52.52 
 
 		 500 aa  486  1e-136  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4316  amidophosphoribosyltransferase  52.42 
 
 		 514 aa  487  1e-136  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2747  amidophosphoribosyltransferase  52.89 
 
 		 484 aa  484  1e-135  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2047  amidophosphoribosyltransferase  55.03 
 
 		 465 aa  483  1e-135  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.330153 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0296  amidophosphoribosyltransferase  52.2 
 
 		 505 aa  481  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2329  amidophosphoribosyltransferase  52 
 
 		 477 aa  478  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.64237  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0004  amidophosphoribosyltransferase  51.85 
 
 		 501 aa  478  1e-134  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2352  amidophosphoribosyltransferase  49.27 
 
 		 513 aa  480  1e-134  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.10246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04200  amidophosphoribosyltransferase  51.32 
 
 		 496 aa  479  1e-134  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.289108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1778  hypothetical protein  51.2 
 
 		 475 aa  480  1e-134  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000929805  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1891  amidophosphoribosyltransferase  51.78 
 
 		 477 aa  477  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5114  amidophosphoribosyltransferase  50.32 
 
 		 510 aa  475  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0638191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1634  amidophosphoribosyltransferase  49.79 
 
 		 511 aa  473  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08960  amidophosphoribosyltransferase  50.63 
 
 		 496 aa  474  1e-132  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6142  amidophosphoribosyltransferase  52 
 
 		 519 aa  473  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1939  amidophosphoribosyltransferase  52.21 
 
 		 466 aa  474  1e-132  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06050  amidophosphoribosyltransferase  51.75 
 
 		 518 aa  473  1e-132  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.203247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4621  amidophosphoribosyltransferase  50.64 
 
 		 482 aa  471  1e-132  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.059877  normal  0.48412 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0154  amidophosphoribosyltransferase  52.21 
 
 		 526 aa  471  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.66132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4758  amidophosphoribosyltransferase  52.11 
 
 		 512 aa  474  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0300  amidophosphoribosyltransferase  52.55 
 
 		 498 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10823  amidophosphoribosyltransferase  49.89 
 
 		 527 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.230334 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2702  amidophosphoribosyltransferase  52.53 
 
 		 475 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3576  amidophosphoribosyltransferase  50.11 
 
 		 517 aa  470  1.0000000000000001e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.538903  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6859  amidophosphoribosyltransferase  51.55 
 
 		 525 aa  468  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0309  amidophosphoribosyltransferase  54.97 
 
 		 473 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1636  amidophosphoribosyltransferase  51.43 
 
 		 467 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5049  amidophosphoribosyltransferase  50.42 
 
 		 534 aa  468  9.999999999999999e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2068  amidophosphoribosyltransferase  50 
 
 		 474 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.286768  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0163  amidophosphoribosyltransferase  51.97 
 
 		 526 aa  466  9.999999999999999e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124827  hitchhiker  0.000251042 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0948  amidophosphoribosyltransferase  50.43 
 
 		 525 aa  465  9.999999999999999e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4041  amidophosphoribosyltransferase  47.65 
 
 		 514 aa  466  9.999999999999999e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.181918  normal  0.175272 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0724  amidophosphoribosyltransferase  50 
 
 		 500 aa  462  1e-129  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00225283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4924  amidophosphoribosyltransferase  49.68 
 
 		 511 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2184  amidophosphoribosyltransferase  48.37 
 
 		 487 aa  463  1e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4541  amidophosphoribosyltransferase  49.68 
 
 		 511 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0997  amidophosphoribosyltransferase  52.53 
 
 		 482 aa  464  1e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.421996  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37880  amidophosphoribosyltransferase  51.2 
 
 		 512 aa  464  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.458178 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4628  amidophosphoribosyltransferase  49.68 
 
 		 511 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0260  amidophosphoribosyltransferase  50.22 
 
 		 470 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0824  amidophosphoribosyltransferase  52.43 
 
 		 488 aa  459  9.999999999999999e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18600  amidophosphoribosyltransferase  50.87 
 
 		 537 aa  457  1e-127  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1153  amidophosphoribosyltransferase  50.55 
 
 		 474 aa  455  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1136  amidophosphoribosyltransferase  51.22 
 
 		 470 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1147  amidophosphoribosyltransferase  47.28 
 
 		 478 aa  452  1.0000000000000001e-126  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.218005  normal  0.314166 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01750  amidophosphoribosyltransferase  49.47 
 
 		 482 aa  451  1e-125  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.674101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1326  amidophosphoribosyltransferase  49.34 
 
 		 468 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0033  amidophosphoribosyltransferase  48.79 
 
 		 497 aa  446  1.0000000000000001e-124  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2109  amidophosphoribosyltransferase  47.35 
 
 		 475 aa  444  1e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0522  amidophosphoribosyltransferase  46.49 
 
 		 465 aa  442  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0674  amidophosphoribosyltransferase  47.37 
 
 		 473 aa  441  1e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22120  amidophosphoribosyltransferase  48.89 
 
 		 480 aa  444  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.357347  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1448  amidophosphoribosyltransferase  49.78 
 
 		 474 aa  443  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0468  amidophosphoribosyltransferase  49.56 
 
 		 456 aa  438  9.999999999999999e-123  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.350158  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0405  amidophosphoribosyltransferase  49.24 
 
 		 493 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0292  amidophosphoribosyltransferase  48.67 
 
 		 459 aa  438  9.999999999999999e-123  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.95663  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1871  amidophosphoribosyltransferase  47.99 
 
 		 451 aa  441  9.999999999999999e-123  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.10696  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0396  amidophosphoribosyltransferase  49 
 
 		 459 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0672  amidophosphoribosyltransferase  47.15 
 
 		 473 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0878  glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase  46.97 
 
 		 503 aa  438  1e-121  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141495  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0398  amidophosphoribosyltransferase  50.33 
 
 		 480 aa  438  1e-121  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1523  amidophosphoribosyltransferase  49.22 
 
 		 459 aa  438  1e-121  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0119394  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0228  amidophosphoribosyltransferase  45.71 
 
 		 470 aa  435  1e-121  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000396195  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0063  amidophosphoribosyltransferase  48.38 
 
 		 472 aa  437  1e-121  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1541  amidophosphoribosyltransferase  46.48 
 
 		 502 aa  436  1e-121  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0007  amidophosphoribosyltransferase  49.13 
 
 		 487 aa  437  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0265  amidophosphoribosyltransferase  47.98 
 
 		 476 aa  435  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0439  amidophosphoribosyltransferase  48.56 
 
 		 459 aa  434  1e-120  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>