More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3044 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3044  amidophosphoribosyltransferase  100 
 
 
478 aa  982    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1249  amidophosphoribosyltransferase  57.33 
 
 
488 aa  537  1e-151  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.917797  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2184  amidophosphoribosyltransferase  56.59 
 
 
487 aa  509  1e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1448  amidophosphoribosyltransferase  53.9 
 
 
474 aa  496  1e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0522  amidophosphoribosyltransferase  55 
 
 
465 aa  492  9.999999999999999e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1778  hypothetical protein  50.76 
 
 
475 aa  480  1e-134  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000929805  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1475  amidophosphoribosyltransferase  53.71 
 
 
472 aa  476  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1153  amidophosphoribosyltransferase  52.03 
 
 
474 aa  475  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2365  amidophosphoribosyltransferase  50.64 
 
 
474 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2109  amidophosphoribosyltransferase  50.54 
 
 
475 aa  466  9.999999999999999e-131  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0674  amidophosphoribosyltransferase  50.84 
 
 
473 aa  463  1e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0672  amidophosphoribosyltransferase  50.84 
 
 
473 aa  463  1e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1636  amidophosphoribosyltransferase  50.77 
 
 
467 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1326  amidophosphoribosyltransferase  48.16 
 
 
468 aa  459  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2047  amidophosphoribosyltransferase  52.25 
 
 
465 aa  461  9.999999999999999e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.330153 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1891  amidophosphoribosyltransferase  48.07 
 
 
477 aa  455  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1939  amidophosphoribosyltransferase  50.11 
 
 
466 aa  457  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0274  amidophosphoribosyltransferase  51.2 
 
 
471 aa  457  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4979  amidophosphoribosyltransferase  51.42 
 
 
471 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2068  amidophosphoribosyltransferase  48.07 
 
 
474 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.286768  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0368  amidophosphoribosyltransferase  51.2 
 
 
471 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0327  amidophosphoribosyltransferase  51.42 
 
 
471 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0282  amidophosphoribosyltransferase  51.42 
 
 
471 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0267  amidophosphoribosyltransferase  51.42 
 
 
471 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0270  amidophosphoribosyltransferase  51.42 
 
 
471 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0295  amidophosphoribosyltransferase  51.42 
 
 
471 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.312701  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2329  amidophosphoribosyltransferase  47.85 
 
 
477 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.64237  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1722  amidophosphoribosyltransferase  48.02 
 
 
481 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.56305  normal  0.196104 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0276  amidophosphoribosyltransferase  51.2 
 
 
471 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2064  amidophosphoribosyltransferase  48.02 
 
 
475 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0265  amidophosphoribosyltransferase  49.36 
 
 
476 aa  453  1.0000000000000001e-126  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0292  amidophosphoribosyltransferase  50.33 
 
 
459 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.95663  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0260  amidophosphoribosyltransferase  49.02 
 
 
470 aa  449  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0324  amidophosphoribosyltransferase  50.98 
 
 
471 aa  451  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0341  amidophosphoribosyltransferase  50.98 
 
 
471 aa  449  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4338  amidophosphoribosyltransferase  48.2 
 
 
485 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4361  amidophosphoribosyltransferase  48.2 
 
 
485 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0731  amidophosphoribosyltransferase  49.89 
 
 
478 aa  449  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0321  amidophosphoribosyltransferase  48.9 
 
 
461 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2702  amidophosphoribosyltransferase  49.34 
 
 
475 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4354  amidophosphoribosyltransferase  48.52 
 
 
484 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.463043 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4206  amidophosphoribosyltransferase  47.57 
 
 
485 aa  445  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.975393  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1632  amidophosphoribosyltransferase  49.67 
 
 
469 aa  444  1e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3343  amidophosphoribosyltransferase  51.1 
 
 
502 aa  444  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1136  amidophosphoribosyltransferase  48.36 
 
 
470 aa  442  1e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1102  amidophosphoribosyltransferase  50.32 
 
 
466 aa  443  1e-123  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0004  amidophosphoribosyltransferase  48.3 
 
 
493 aa  438  9.999999999999999e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.645305  normal  0.0907172 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0396  amidophosphoribosyltransferase  49.89 
 
 
459 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4621  amidophosphoribosyltransferase  46.62 
 
 
482 aa  436  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.059877  normal  0.48412 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1523  amidophosphoribosyltransferase  49.89 
 
 
459 aa  437  1e-121  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0119394  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04200  amidophosphoribosyltransferase  49.13 
 
 
496 aa  438  1e-121  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.289108  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0439  amidophosphoribosyltransferase  48.37 
 
 
459 aa  432  1e-120  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0398  amidophosphoribosyltransferase  47.14 
 
 
480 aa  434  1e-120  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4318  amidophosphoribosyltransferase  48.39 
 
 
496 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3637  amidophosphoribosyltransferase  48.28 
 
 
499 aa  429  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.811729 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4178  amidophosphoribosyltransferase  47.99 
 
 
494 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0228  amidophosphoribosyltransferase  47.83 
 
 
470 aa  431  1e-119  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000396195  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4217  amidophosphoribosyltransferase  47.99 
 
 
494 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1618  amidophosphoribosyltransferase  47.55 
 
 
506 aa  430  1e-119  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0051  amidophosphoribosyltransferase  49.13 
 
 
479 aa  429  1e-119  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8991  amidophosphoribosyltransferase  49.78 
 
 
478 aa  430  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3588  amidophosphoribosyltransferase  49.57 
 
 
503 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.51846 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0724  amidophosphoribosyltransferase  48.16 
 
 
500 aa  427  1e-118  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00225283  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1147  amidophosphoribosyltransferase  47.41 
 
 
478 aa  427  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.218005  normal  0.314166 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3699  amidophosphoribosyltransferase  48.91 
 
 
493 aa  426  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.549743  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0007  amidophosphoribosyltransferase  48.13 
 
 
487 aa  426  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30048  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0309  amidophosphoribosyltransferase  51.97 
 
 
473 aa  427  1e-118  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3396  amidophosphoribosyltransferase  48.07 
 
 
492 aa  427  1e-118  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0468  amidophosphoribosyltransferase  48.34 
 
 
456 aa  426  1e-118  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.350158  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0026  amidophosphoribosyltransferase  45.67 
 
 
484 aa  423  1e-117  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3498  amidophosphoribosyltransferase  47.67 
 
 
477 aa  425  1e-117  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.349457  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1707  amidophosphoribosyltransferase  46.14 
 
 
497 aa  422  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0317953  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2179  amidophosphoribosyltransferase  47.93 
 
 
462 aa  424  1e-117  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1389  amidophosphoribosyltransferase  48.39 
 
 
479 aa  423  1e-117  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.254172  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0230  amidophosphoribosyltransferase  48.31 
 
 
463 aa  423  1e-117  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0884272  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1032  amidophosphoribosyltransferase  47.07 
 
 
495 aa  420  1e-116  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0760  amidophosphoribosyltransferase  47.22 
 
 
454 aa  419  1e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3212  amidophosphoribosyltransferase  47.37 
 
 
463 aa  421  1e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.903412  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1871  amidophosphoribosyltransferase  47.15 
 
 
451 aa  419  1e-116  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.10696  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0878  glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase  47.51 
 
 
503 aa  419  1e-116  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141495  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22120  amidophosphoribosyltransferase  47.84 
 
 
480 aa  421  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.357347  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4571  amidophosphoribosyltransferase  45.16 
 
 
468 aa  419  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.470676  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3474  amidophosphoribosyltransferase  47.66 
 
 
563 aa  417  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0063  amidophosphoribosyltransferase  47.98 
 
 
472 aa  416  9.999999999999999e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2807  amidophosphoribosyltransferase  47.8 
 
 
462 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1415  amidophosphoribosyltransferase  46.71 
 
 
472 aa  412  1e-114  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1196  amidophosphoribosyltransferase  47.14 
 
 
472 aa  413  1e-114  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0033  amidophosphoribosyltransferase  45.63 
 
 
497 aa  413  1e-114  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2747  amidophosphoribosyltransferase  46.04 
 
 
484 aa  413  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37880  amidophosphoribosyltransferase  45.02 
 
 
512 aa  412  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.458178 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08960  amidophosphoribosyltransferase  45 
 
 
496 aa  413  1e-114  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0334  amidophosphoribosyltransferase  47.02 
 
 
462 aa  412  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.708549  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3743  amidophosphoribosyltransferase  46.7 
 
 
466 aa  413  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189021 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0983  amidophosphoribosyltransferase  45.36 
 
 
490 aa  412  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.592161  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3735  amidophosphoribosyltransferase  46.75 
 
 
558 aa  414  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1511  amidophosphoribosyltransferase  46.7 
 
 
466 aa  414  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.409813  normal  0.0292739 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3939  amidophosphoribosyltransferase  46.96 
 
 
499 aa  415  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06050  amidophosphoribosyltransferase  46.44 
 
 
518 aa  411  1e-113  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.203247  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3932  amidophosphoribosyltransferase  48.07 
 
 
491 aa  410  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.961822  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0997  amidophosphoribosyltransferase  46.52 
 
 
482 aa  411  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.421996  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>