43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2161 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2161  hypothetical protein  100 
 
 		 368 aa  776    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2598  glutamate synthase large subunit  79.08 
 
 		 368 aa  630  1e-179  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1155  putative glutamate synthase, large subunit (domain 1)  60.87 
 
 		 368 aa  498  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.321075  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0385  glutamate synthase (NADPH)  40.54 
 
 		 376 aa  279  7e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2274  glutamate synthase (NADPH)  41.83 
 
 		 376 aa  275  7e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1725  glutamate synthase (NADPH)  39.39 
 
 		 376 aa  274  2.0000000000000002e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.886544 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2387  glutamate synthase (NADPH)  40.29 
 
 		 375 aa  268  1e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1372  glutamate synthase (NADPH)  39.28 
 
 		 376 aa  266  5e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.244449  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1375  hypothetical protein  38.57 
 
 		 376 aa  256  4e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.157806  normal  0.645032 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0104  hypothetical protein  39.03 
 
 		 375 aa  248  9e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.765688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2136  glutamine amidotransferase, class-II  28.44 
 
 		 382 aa  98.6  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1293  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  26.38 
 
 		 368 aa  87.8  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303282 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0545  glutamine amidotransferase class-II  27.25 
 
 		 369 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00405824 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1815  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  25.71 
 
 		 364 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0334  glutamine amidotransferase, class-II  24.16 
 
 		 350 aa  79.7  0.00000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892096  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2361  glutamine amidotransferase class-II  27.18 
 
 		 364 aa  79.3  0.00000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.595667  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0197  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  26.47 
 
 		 363 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.480827  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16310  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  30.62 
 
 		 355 aa  78.6  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000470863  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1130  glutamine amidotransferase, class II  27.83 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_948  glutamine amidotransferase, class II  28.57 
 
 		 376 aa  77  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.155092  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1236  hypothetical protein  27.03 
 
 		 339 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1300  glutamine amidotransferase class-II  24.9 
 
 		 361 aa  76.3  0.0000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2026  glutamine amidotransferase, class-II  25.99 
 
 		 359 aa  75.9  0.0000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.805771  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0959  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  28.02 
 
 		 376 aa  74.7  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315043  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1338  glutamine amidotransferase, class-II  28.51 
 
 		 364 aa  74.3  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.845818 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0213  glutamine amidotransferase, class-II  25.3 
 
 		 378 aa  73.9  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1753  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  27.14 
 
 		 373 aa  73.2  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.150521 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2710  glutamine amidotransferase class-II  24.93 
 
 		 350 aa  72.8  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1078  glutamine amidotransferase class-II  24.89 
 
 		 363 aa  70.5  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.46258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0869  glutamine amidotransferase class-II  24.89 
 
 		 363 aa  70.1  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0521916  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1598  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  24.08 
 
 		 363 aa  70.1  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2491  glutamine amidotransferase, class-II  27.03 
 
 		 371 aa  69.3  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1092  glutamine amidotransferase class-II  23.64 
 
 		 363 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0780  glutamine amidotransferase, class-II  23.17 
 
 		 350 aa  67.8  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0619068  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0025  glutamine amidotransferase class-II  26.54 
 
 		 365 aa  67.4  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0665  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  24.39 
 
 		 350 aa  66.2  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0522  glutamine amidotransferase, class-II  26.07 
 
 		 395 aa  65.9  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0536  glutamine amidotransferase class-II  26.07 
 
 		 372 aa  65.9  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1690  glutamine amidotransferase, class-II  25.51 
 
 		 349 aa  62.8  0.000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.491949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0558  glutamine amidotransferase, class-II  23.08 
 
 		 374 aa  62  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0030  glutamate synthase alpha subunit  24.65 
 
 		 670 aa  53.1  0.000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  26.29 
 
 		 553 aa  47  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0729  glutamate synthase (ferredoxin)  26.24 
 
 		 1507 aa  43.1  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>