More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0665 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0665  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  100 
 
 		 350 aa  723    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2710  glutamine amidotransferase class-II  70.49 
 
 		 350 aa  547  1e-154  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0780  glutamine amidotransferase, class-II  66.48 
 
 		 350 aa  521  1e-147  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0619068  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1690  glutamine amidotransferase, class-II  66.48 
 
 		 349 aa  498  1e-140  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.491949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2136  glutamine amidotransferase, class-II  65.62 
 
 		 382 aa  497  1e-139  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0334  glutamine amidotransferase, class-II  60.52 
 
 		 350 aa  458  9.999999999999999e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892096  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1300  glutamine amidotransferase class-II  55.1 
 
 		 361 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16310  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  53.62 
 
 		 355 aa  406  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000470863  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0522  glutamine amidotransferase, class-II  55.01 
 
 		 395 aa  401  1e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1293  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  52.15 
 
 		 368 aa  399  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303282 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1078  glutamine amidotransferase class-II  53.02 
 
 		 363 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.46258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0536  glutamine amidotransferase class-II  55.01 
 
 		 372 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1598  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  52.47 
 
 		 363 aa  397  1e-109  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1092  glutamine amidotransferase class-II  53.3 
 
 		 363 aa  397  1e-109  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2361  glutamine amidotransferase class-II  53.06 
 
 		 364 aa  397  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.595667  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1815  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  51.16 
 
 		 364 aa  391  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0869  glutamine amidotransferase class-II  51.65 
 
 		 363 aa  390  1e-107  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0521916  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0545  glutamine amidotransferase class-II  50.87 
 
 		 369 aa  389  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00405824 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1753  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  50.71 
 
 		 373 aa  387  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.150521 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0025  glutamine amidotransferase class-II  51.86 
 
 		 365 aa  381  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0558  glutamine amidotransferase, class-II  50.29 
 
 		 374 aa  380  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2026  glutamine amidotransferase, class-II  49.86 
 
 		 359 aa  376  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.805771  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2491  glutamine amidotransferase, class-II  48.58 
 
 		 371 aa  373  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1130  glutamine amidotransferase, class II  50.43 
 
 		 376 aa  372  1e-102  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0959  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  48.99 
 
 		 376 aa  363  2e-99  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315043  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1338  glutamine amidotransferase, class-II  48.84 
 
 		 364 aa  363  2e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.845818 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_948  glutamine amidotransferase, class II  48.41 
 
 		 376 aa  362  5.0000000000000005e-99  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.155092  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1236  hypothetical protein  51.05 
 
 		 339 aa  360  3e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0213  glutamine amidotransferase, class-II  47.85 
 
 		 378 aa  347  2e-94  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0197  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  46.82 
 
 		 363 aa  338  5.9999999999999996e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.480827  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1885  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  31.47 
 
 		 646 aa  165  1.0000000000000001e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.273779  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1740  glutamate synthase alpha subunit domain protein  31.55 
 
 		 659 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.627915  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0030  glutamate synthase alpha subunit  31.59 
 
 		 670 aa  141  1.9999999999999998e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1812  glutamate synthase alpha subunit  28.29 
 
 		 568 aa  118  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000275446 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  27.51 
 
 		 553 aa  107  4e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0830  glutamate synthase alpha subunit  27.4 
 
 		 568 aa  104  2e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.990819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1607  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  30.34 
 
 		 572 aa  100  5e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1575  glutamine amidotransferase class-II  26.26 
 
 		 316 aa  85.9  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6575  glutamine amidotransferase class-II  27.56 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0505165 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1938  glutamine amidotransferase class-II  25.7 
 
 		 311 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.210707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1656  glutamine amidotransferase class-II  25.35 
 
 		 311 aa  83.2  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.670859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4695  glutamine amidotransferase class-II  26.35 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.903048 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5749  amidophosphoribosyltransferase  26.7 
 
 		 301 aa  80.9  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1942  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  23.85 
 
 		 297 aa  76.3  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.738445 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4810  glutamine amidotransferase class-II  25.79 
 
 		 297 aa  76.3  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.917981  hitchhiker  0.00206329 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2499  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  24 
 
 		 305 aa  75.9  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0705172  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3524  glutamine amidotransferase class-II  26.99 
 
 		 302 aa  75.9  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0234475 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2598  glutamate synthase large subunit  25.78 
 
 		 368 aa  73.9  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1346  glutamine amidotransferase, class-II  23.34 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3291  glutamine amidotransferase class-II  25.21 
 
 		 301 aa  72  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1870  putative glutamine amidotransferase  26.07 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117624  normal  0.828633 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6008  glutamine amidotransferase class-II  25.5 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362161  decreased coverage  0.00354269 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5638  glutamine amidotransferase class-II  25.57 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.52916  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2583  glutamine amidotransferase, class-II protein  24.85 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0230258  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0729  glutamate synthase (ferredoxin)  27.89 
 
 		 1507 aa  67.8  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0484  Glutamate synthase (ferredoxin)  23.96 
 
 		 1505 aa  67  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3450  glutamate synthase-related protein  27.4 
 
 		 1510 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2274  glutamine amidotransferase, class-II  24.25 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0107042 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1138  glutamine amidotransferase, class-II  26.57 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.16804 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1640  Glutamate synthase (ferredoxin)  25.85 
 
 		 1519 aa  66.2  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0608399  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2161  hypothetical protein  24.39 
 
 		 368 aa  66.2  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1703  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.44 
 
 		 1518 aa  65.9  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.625118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2248  glutamine amidotransferase class-II  24.42 
 
 		 301 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280725 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0457  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  24.76 
 
 		 298 aa  65.5  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.598323  normal  0.402222 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3467  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  24.71 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.836717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0393  glutamate synthase (ferredoxin)  26.84 
 
 		 1507 aa  65.1  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5919  glutamine amidotransferase class-II  21.97 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1802  glutamate synthase (ferredoxin)  29.03 
 
 		 1498 aa  63.9  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0512049  normal  0.419037 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1725  glutamate synthase (NADPH)  22.59 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.886544 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2944  glutamate synthase, large subunit  25.79 
 
 		 1513 aa  63.5  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0007  amidophosphoribosyltransferase  26.34 
 
 		 487 aa  63.2  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1299  glutamine amidotransferase, class-II  24.5 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0375941  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1155  putative glutamate synthase, large subunit (domain 1)  24.72 
 
 		 368 aa  62.8  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.321075  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0104  hypothetical protein  25.08 
 
 		 375 aa  62.8  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.765688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2274  glutamate synthase (NADPH)  23.01 
 
 		 376 aa  62.4  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0468  amidophosphoribosyltransferase  24.06 
 
 		 456 aa  62  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.350158  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1699  glutamine amidotransferase class-II  23.03 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0147  glutamate synthase (ferredoxin)  25.23 
 
 		 1510 aa  61.2  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1778  hypothetical protein  28.12 
 
 		 475 aa  60.8  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000929805  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1357  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  34.02 
 
 		 591 aa  60.1  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0672  amidophosphoribosyltransferase  25.5 
 
 		 475 aa  60.1  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.546073  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0396  amidophosphoribosyltransferase  22.27 
 
 		 459 aa  59.7  0.00000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5510  glutamine amidotransferase, class-II  23.14 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.623211  normal  0.154748 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3033  glutamine amidotransferase, class-II  22.75 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0228  amidophosphoribosyltransferase  25.26 
 
 		 478 aa  59.3  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.629689  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1523  amidophosphoribosyltransferase  22.75 
 
 		 459 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0119394  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0439  amidophosphoribosyltransferase  22.27 
 
 		 459 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0167  glutamine amidotransferase class-II  25.73 
 
 		 302 aa  59.3  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0230  amidophosphoribosyltransferase  23.47 
 
 		 463 aa  58.9  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0884272  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0394  amidophosphoribosyltransferase  24.14 
 
 		 470 aa  58.5  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0144451 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2632  glutamine amidotransferase class-II  25 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1680  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  28.99 
 
 		 605 aa  57.8  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.989614  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0488  glutamate synthase (ferredoxin)  25.45 
 
 		 1516 aa  57.8  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4806  glutamine amidotransferase class-II  22.29 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0525  amidophosphoribosyl transferase  23.14 
 
 		 497 aa  57  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0994274  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1632  amidophosphoribosyltransferase  23.96 
 
 		 469 aa  57.4  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2343  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  35.87 
 
 		 614 aa  56.6  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0472138  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0174  amidophosphoribosyltransferase  25.12 
 
 		 445 aa  56.2  0.0000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.838457  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2109  amidophosphoribosyltransferase  25 
 
 		 475 aa  56.2  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0657  glutamate synthase (NADPH) large subunit  24.79 
 
 		 1509 aa  56.2  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0412975  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>