More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0525 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0425  amidophosphoribosyl transferase  84.51 
 
 
497 aa  884    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0289386  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0525  amidophosphoribosyl transferase  100 
 
 
497 aa  1027    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0994274  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1885  amidophosphoribosyltransferase  75.15 
 
 
502 aa  787    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00311978 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1707  amidophosphoribosyltransferase  76.06 
 
 
498 aa  798    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000553486  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2285  amidophosphoribosyltransferase  85.11 
 
 
497 aa  884    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00605191  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1989  amidophosphoribosyltransferase  84.31 
 
 
497 aa  866    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.643804  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1771  amidophosphoribosyltransferase  84.31 
 
 
497 aa  849    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000657758  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2109  amidophosphoribosyltransferase  53.21 
 
 
497 aa  531  1e-150  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0464548  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1326  amidophosphoribosyltransferase  47.45 
 
 
468 aa  438  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2068  amidophosphoribosyltransferase  46.49 
 
 
474 aa  435  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.286768  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2329  amidophosphoribosyltransferase  46.76 
 
 
477 aa  433  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.64237  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1891  amidophosphoribosyltransferase  46.36 
 
 
477 aa  431  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4621  amidophosphoribosyltransferase  47.34 
 
 
482 aa  429  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.059877  normal  0.48412 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2702  amidophosphoribosyltransferase  48.24 
 
 
475 aa  431  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1939  amidophosphoribosyltransferase  46.38 
 
 
466 aa  428  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1636  amidophosphoribosyltransferase  46.79 
 
 
467 aa  424  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1102  amidophosphoribosyltransferase  46.02 
 
 
466 aa  424  1e-117  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2807  amidophosphoribosyltransferase  47.11 
 
 
462 aa  425  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0276  amidophosphoribosyltransferase  45.7 
 
 
471 aa  420  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0327  amidophosphoribosyltransferase  45.49 
 
 
471 aa  421  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0324  amidophosphoribosyltransferase  45.49 
 
 
471 aa  419  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0282  amidophosphoribosyltransferase  45.49 
 
 
471 aa  421  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0267  amidophosphoribosyltransferase  45.49 
 
 
471 aa  421  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0270  amidophosphoribosyltransferase  45.49 
 
 
471 aa  421  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4979  amidophosphoribosyltransferase  45.49 
 
 
471 aa  421  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0295  amidophosphoribosyltransferase  45.49 
 
 
471 aa  421  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.312701  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0368  amidophosphoribosyltransferase  45.49 
 
 
471 aa  420  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0341  amidophosphoribosyltransferase  45.29 
 
 
471 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0274  amidophosphoribosyltransferase  44.47 
 
 
471 aa  412  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0334  amidophosphoribosyltransferase  45.57 
 
 
462 aa  413  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.708549  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0404  amidophosphoribosyltransferase  47.65 
 
 
488 aa  414  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305555  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1153  amidophosphoribosyltransferase  46.28 
 
 
474 aa  414  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0321  amidophosphoribosyltransferase  44.63 
 
 
461 aa  412  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1632  amidophosphoribosyltransferase  45.66 
 
 
469 aa  410  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2307  amidophosphoribosyltransferase  46.82 
 
 
467 aa  410  1e-113  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2878  amidophosphoribosyltransferase  44.18 
 
 
517 aa  407  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.116336 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0265  amidophosphoribosyltransferase  44.92 
 
 
476 aa  406  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2599  amidophosphoribosyltransferase  45.93 
 
 
499 aa  402  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0391838  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0260  amidophosphoribosyltransferase  44.4 
 
 
470 aa  402  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0007  amidophosphoribosyltransferase  47.24 
 
 
487 aa  403  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30048  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3212  amidophosphoribosyltransferase  43.8 
 
 
463 aa  404  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.903412  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1032  amidophosphoribosyltransferase  44.72 
 
 
495 aa  399  9.999999999999999e-111  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4300  amidophosphoribosyltransferase  45.16 
 
 
491 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.182299  normal  0.0484415 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4407  amidophosphoribosyltransferase  45.42 
 
 
491 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1136  amidophosphoribosyltransferase  44.95 
 
 
470 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1618  amidophosphoribosyltransferase  43.18 
 
 
506 aa  400  9.999999999999999e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0051  amidophosphoribosyltransferase  44.26 
 
 
479 aa  401  9.999999999999999e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3932  amidophosphoribosyltransferase  45.16 
 
 
491 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.961822  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0026  amidophosphoribosyltransferase  43.85 
 
 
484 aa  397  1e-109  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1871  amidophosphoribosyltransferase  45.34 
 
 
451 aa  395  1e-109  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.10696  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2047  amidophosphoribosyltransferase  45.9 
 
 
465 aa  396  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.330153 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0405  amidophosphoribosyltransferase  44.06 
 
 
493 aa  395  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4629  amidophosphoribosyltransferase  44.81 
 
 
500 aa  397  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.691036  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3894  amidophosphoribosyltransferase  45.21 
 
 
491 aa  398  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1147  amidophosphoribosyltransferase  44.86 
 
 
478 aa  397  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.218005  normal  0.314166 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2997  amidophosphoribosyltransferase  44.29 
 
 
514 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.807987  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3939  amidophosphoribosyltransferase  43.29 
 
 
499 aa  392  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0578  amidophosphoribosyltransferase  43.6 
 
 
486 aa  389  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2365  amidophosphoribosyltransferase  44.47 
 
 
474 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2400  amidophosphoribosyltransferase  44.54 
 
 
514 aa  392  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.453817  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5556  amidophosphoribosyltransferase  45.76 
 
 
511 aa  391  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3487  amidophosphoribosyltransferase  45.05 
 
 
503 aa  389  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.746658  normal  0.621078 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3501  amidophosphoribosyltransferase  43.06 
 
 
509 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1249  amidophosphoribosyltransferase  44.67 
 
 
488 aa  390  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.917797  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4354  amidophosphoribosyltransferase  44.56 
 
 
484 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.463043 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2454  amidophosphoribosyltransferase  43.41 
 
 
487 aa  386  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0983  amidophosphoribosyltransferase  43.56 
 
 
490 aa  387  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.592161  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22120  amidophosphoribosyltransferase  45.06 
 
 
480 aa  387  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.357347  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1062  amidophosphoribosyltransferase  43.61 
 
 
486 aa  388  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.739126  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1117  amidophosphoribosyltransferase  43.41 
 
 
487 aa  386  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.981489  normal  0.353735 
 
 
-
 
NC_002936  DET1415  amidophosphoribosyltransferase  43.56 
 
 
472 aa  382  1e-105  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1448  amidophosphoribosyltransferase  43.42 
 
 
474 aa  384  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0731  amidophosphoribosyltransferase  43.09 
 
 
478 aa  385  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0878  glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase  42.07 
 
 
503 aa  385  1e-105  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141495  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0139  amidophosphoribosyltransferase  44.54 
 
 
462 aa  384  1e-105  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1707  amidophosphoribosyltransferase  42.83 
 
 
497 aa  385  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0317953  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1541  amidophosphoribosyltransferase  42.89 
 
 
502 aa  382  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267372  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1778  hypothetical protein  42.39 
 
 
475 aa  382  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000929805  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2452  amidophosphoribosyltransferase  43.06 
 
 
514 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2282  amidophosphoribosyltransferase  43.06 
 
 
503 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.235461  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1766  amidophosphoribosyltransferase  42.71 
 
 
488 aa  379  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0501857 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1196  amidophosphoribosyltransferase  43.56 
 
 
472 aa  381  1e-104  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4571  amidophosphoribosyltransferase  45.93 
 
 
468 aa  381  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.470676  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2502  amidophosphoribosyltransferase  42.89 
 
 
500 aa  378  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2311  amidophosphoribosyltransferase  43 
 
 
501 aa  378  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.672659  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2132  amidophosphoribosyltransferase  42.91 
 
 
508 aa  376  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.864953  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2064  amidophosphoribosyltransferase  42.24 
 
 
475 aa  377  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1722  amidophosphoribosyltransferase  42.24 
 
 
481 aa  377  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.56305  normal  0.196104 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4206  amidophosphoribosyltransferase  42.74 
 
 
485 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.975393  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4178  amidophosphoribosyltransferase  44.15 
 
 
494 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4217  amidophosphoribosyltransferase  44.15 
 
 
494 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3699  amidophosphoribosyltransferase  43.56 
 
 
493 aa  377  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.549743  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4338  amidophosphoribosyltransferase  42.54 
 
 
485 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0299  amidophosphoribosyltransferase  42.89 
 
 
446 aa  376  1e-103  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1222  amidophosphoribosyltransferase  42.92 
 
 
472 aa  377  1e-103  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.433131  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4361  amidophosphoribosyltransferase  42.54 
 
 
485 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2017  amidophosphoribosyltransferase  43.58 
 
 
504 aa  372  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0413  amidophosphoribosyltransferase  44.35 
 
 
491 aa  375  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.577853 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1594  amidophosphoribosyltransferase  42.35 
 
 
464 aa  374  1e-102  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0292  amidophosphoribosyltransferase  42.31 
 
 
459 aa  375  1e-102  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.95663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>