More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2109 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2109  amidophosphoribosyltransferase  100 
 
 		 497 aa  1027    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0464548  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0525  amidophosphoribosyl transferase  53.21 
 
 		 497 aa  548  1e-155  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0994274  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0425  amidophosphoribosyl transferase  53.01 
 
 		 497 aa  546  1e-154  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0289386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1885  amidophosphoribosyltransferase  52.71 
 
 		 502 aa  540  9.999999999999999e-153  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00311978 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1707  amidophosphoribosyltransferase  52.41 
 
 		 498 aa  540  9.999999999999999e-153  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000553486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1989  amidophosphoribosyltransferase  52.81 
 
 		 497 aa  533  1e-150  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.643804  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2285  amidophosphoribosyltransferase  52.61 
 
 		 497 aa  526  1e-148  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00605191  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1771  amidophosphoribosyltransferase  52.21 
 
 		 497 aa  515  1.0000000000000001e-145  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000657758  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2329  amidophosphoribosyltransferase  50.21 
 
 		 477 aa  457  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.64237  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1891  amidophosphoribosyltransferase  50.83 
 
 		 477 aa  457  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2702  amidophosphoribosyltransferase  47.8 
 
 		 475 aa  449  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2068  amidophosphoribosyltransferase  49.38 
 
 		 474 aa  449  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.286768  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1153  amidophosphoribosyltransferase  49.48 
 
 		 474 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1326  amidophosphoribosyltransferase  49.48 
 
 		 468 aa  443  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1939  amidophosphoribosyltransferase  48.85 
 
 		 466 aa  438  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0260  amidophosphoribosyltransferase  48.05 
 
 		 470 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1102  amidophosphoribosyltransferase  49.49 
 
 		 466 aa  439  9.999999999999999e-123  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1636  amidophosphoribosyltransferase  49.38 
 
 		 467 aa  435  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4621  amidophosphoribosyltransferase  47.83 
 
 		 482 aa  437  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.059877  normal  0.48412 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1136  amidophosphoribosyltransferase  49.28 
 
 		 470 aa  434  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0334  amidophosphoribosyltransferase  48.35 
 
 		 462 aa  429  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.708549  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2807  amidophosphoribosyltransferase  47.84 
 
 		 462 aa  429  1e-119  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1032  amidophosphoribosyltransferase  44.69 
 
 		 495 aa  427  1e-118  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0405  amidophosphoribosyltransferase  47.64 
 
 		 493 aa  425  1e-118  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0321  amidophosphoribosyltransferase  47.03 
 
 		 461 aa  428  1e-118  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0276  amidophosphoribosyltransferase  45.17 
 
 		 471 aa  423  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0878  glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase  45.19 
 
 		 503 aa  424  1e-117  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141495  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0324  amidophosphoribosyltransferase  44.56 
 
 		 471 aa  419  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4979  amidophosphoribosyltransferase  44.56 
 
 		 471 aa  420  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0282  amidophosphoribosyltransferase  44.56 
 
 		 471 aa  420  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0267  amidophosphoribosyltransferase  44.56 
 
 		 471 aa  420  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0270  amidophosphoribosyltransferase  44.56 
 
 		 471 aa  420  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0295  amidophosphoribosyltransferase  44.56 
 
 		 471 aa  420  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.312701  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0327  amidophosphoribosyltransferase  44.56 
 
 		 471 aa  420  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0404  amidophosphoribosyltransferase  48.97 
 
 		 488 aa  419  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305555  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0368  amidophosphoribosyltransferase  44.56 
 
 		 471 aa  419  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2307  amidophosphoribosyltransferase  47.65 
 
 		 467 aa  421  1e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1632  amidophosphoribosyltransferase  47.53 
 
 		 469 aa  419  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0983  amidophosphoribosyltransferase  48.43 
 
 		 490 aa  420  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.592161  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2878  amidophosphoribosyltransferase  47.43 
 
 		 517 aa  421  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.116336 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0265  amidophosphoribosyltransferase  46.23 
 
 		 476 aa  419  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0274  amidophosphoribosyltransferase  44.97 
 
 		 471 aa  419  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0341  amidophosphoribosyltransferase  44.35 
 
 		 471 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1871  amidophosphoribosyltransferase  44.74 
 
 		 451 aa  412  1e-114  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.10696  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2599  amidophosphoribosyltransferase  48.45 
 
 		 499 aa  414  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0391838  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22120  amidophosphoribosyltransferase  46.78 
 
 		 480 aa  413  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.357347  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0398  amidophosphoribosyltransferase  48.76 
 
 		 480 aa  409  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1062  amidophosphoribosyltransferase  47.26 
 
 		 486 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.739126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1618  amidophosphoribosyltransferase  44.65 
 
 		 506 aa  410  1e-113  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2400  amidophosphoribosyltransferase  47.63 
 
 		 514 aa  409  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.453817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4629  amidophosphoribosyltransferase  47.42 
 
 		 500 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.691036  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1249  amidophosphoribosyltransferase  45.12 
 
 		 488 aa  408  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.917797  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2047  amidophosphoribosyltransferase  46.93 
 
 		 465 aa  407  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.330153 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3939  amidophosphoribosyltransferase  47.53 
 
 		 499 aa  408  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1475  amidophosphoribosyltransferase  44.94 
 
 		 472 aa  402  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3212  amidophosphoribosyltransferase  45.71 
 
 		 463 aa  404  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.903412  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2454  amidophosphoribosyltransferase  46.25 
 
 		 487 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0139  amidophosphoribosyltransferase  43 
 
 		 462 aa  402  1e-111  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1707  amidophosphoribosyltransferase  46 
 
 		 497 aa  403  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0317953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5556  amidophosphoribosyltransferase  47.36 
 
 		 511 aa  404  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3932  amidophosphoribosyltransferase  46.89 
 
 		 491 aa  403  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.961822  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3894  amidophosphoribosyltransferase  47.54 
 
 		 491 aa  405  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1594  amidophosphoribosyltransferase  44.8 
 
 		 464 aa  402  1e-111  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1117  amidophosphoribosyltransferase  46.25 
 
 		 487 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.981489  normal  0.353735 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4300  amidophosphoribosyltransferase  46.89 
 
 		 491 aa  403  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.182299  normal  0.0484415 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4407  amidophosphoribosyltransferase  47.3 
 
 		 491 aa  404  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1722  amidophosphoribosyltransferase  46.27 
 
 		 481 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.56305  normal  0.196104 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3487  amidophosphoribosyltransferase  45.27 
 
 		 503 aa  401  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.746658  normal  0.621078 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0141  amidophosphoribosyltransferase  45.24 
 
 		 484 aa  399  9.999999999999999e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0051  amidophosphoribosyltransferase  42.21 
 
 		 479 aa  402  9.999999999999999e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0007  amidophosphoribosyltransferase  44.79 
 
 		 487 aa  400  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2064  amidophosphoribosyltransferase  46.27 
 
 		 475 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0396  amidophosphoribosyltransferase  45.27 
 
 		 459 aa  397  1e-109  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0439  amidophosphoribosyltransferase  45.06 
 
 		 459 aa  398  1e-109  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1778  hypothetical protein  44.86 
 
 		 475 aa  397  1e-109  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000929805  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2365  amidophosphoribosyltransferase  46.38 
 
 		 474 aa  395  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1523  amidophosphoribosyltransferase  45.27 
 
 		 459 aa  396  1e-109  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0119394  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1448  amidophosphoribosyltransferase  44.35 
 
 		 474 aa  393  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0026  amidophosphoribosyltransferase  42.42 
 
 		 484 aa  392  1e-108  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1042  amidophosphoribosyltransferase  45.7 
 
 		 496 aa  395  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.236184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2997  amidophosphoribosyltransferase  44.88 
 
 		 514 aa  395  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.807987  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0292  amidophosphoribosyltransferase  44.15 
 
 		 459 aa  392  1e-108  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.95663  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3699  amidophosphoribosyltransferase  46.3 
 
 		 493 aa  394  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.549743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0724  amidophosphoribosyltransferase  44.15 
 
 		 536 aa  394  1e-108  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4318  amidophosphoribosyltransferase  46.91 
 
 		 496 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3588  amidophosphoribosyltransferase  46.61 
 
 		 503 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.51846 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1187  amidophosphoribosyltransferase  44.42 
 
 		 496 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.44974 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4361  amidophosphoribosyltransferase  46.06 
 
 		 485 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2132  amidophosphoribosyltransferase  45.78 
 
 		 508 aa  390  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.864953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4338  amidophosphoribosyltransferase  46.34 
 
 		 485 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2109  amidophosphoribosyltransferase  43.09 
 
 		 475 aa  389  1e-107  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4206  amidophosphoribosyltransferase  46.36 
 
 		 485 aa  391  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.975393  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1499  amidophosphoribosyltransferase  45.9 
 
 		 529 aa  389  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.338535  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2179  amidophosphoribosyltransferase  43.67 
 
 		 462 aa  391  1e-107  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1541  amidophosphoribosyltransferase  44.44 
 
 		 502 aa  389  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2017  amidophosphoribosyltransferase  46.52 
 
 		 504 aa  385  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0727  amidophosphoribosyltransferase  44.83 
 
 		 496 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2293  amidophosphoribosyltransferase  47.2 
 
 		 504 aa  387  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0522  amidophosphoribosyltransferase  43.09 
 
 		 465 aa  387  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4217  amidophosphoribosyltransferase  46.36 
 
 		 494 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>