More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1885 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1771  amidophosphoribosyltransferase  79.76 
 
 		 497 aa  797    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000657758  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0425  amidophosphoribosyl transferase  77.2 
 
 		 497 aa  811    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0289386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0525  amidophosphoribosyl transferase  75.15 
 
 		 497 aa  787    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0994274  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2285  amidophosphoribosyltransferase  78.2 
 
 		 497 aa  806    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00605191  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1707  amidophosphoribosyltransferase  83.17 
 
 		 498 aa  874    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000553486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1989  amidophosphoribosyltransferase  79.16 
 
 		 497 aa  804    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.643804  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1885  amidophosphoribosyltransferase  100 
 
 		 502 aa  1040    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00311978 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2109  amidophosphoribosyltransferase  52.71 
 
 		 497 aa  522  1e-147  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0464548  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1102  amidophosphoribosyltransferase  48.23 
 
 		 466 aa  439  9.999999999999999e-123  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1326  amidophosphoribosyltransferase  45.45 
 
 		 468 aa  435  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2068  amidophosphoribosyltransferase  44.76 
 
 		 474 aa  426  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.286768  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2878  amidophosphoribosyltransferase  45.55 
 
 		 517 aa  427  1e-118  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.116336 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1636  amidophosphoribosyltransferase  45.77 
 
 		 467 aa  422  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1939  amidophosphoribosyltransferase  44.74 
 
 		 466 aa  424  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2807  amidophosphoribosyltransferase  45.88 
 
 		 462 aa  424  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2702  amidophosphoribosyltransferase  45.36 
 
 		 475 aa  424  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2329  amidophosphoribosyltransferase  44.88 
 
 		 477 aa  419  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.64237  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1632  amidophosphoribosyltransferase  45.23 
 
 		 469 aa  421  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1891  amidophosphoribosyltransferase  45.29 
 
 		 477 aa  421  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0404  amidophosphoribosyltransferase  45.42 
 
 		 488 aa  421  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305555  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4621  amidophosphoribosyltransferase  43.97 
 
 		 482 aa  418  1e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.059877  normal  0.48412 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0405  amidophosphoribosyltransferase  44.2 
 
 		 493 aa  420  1e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0334  amidophosphoribosyltransferase  44.17 
 
 		 462 aa  414  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.708549  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3212  amidophosphoribosyltransferase  43.29 
 
 		 463 aa  414  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.903412  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2307  amidophosphoribosyltransferase  45.27 
 
 		 467 aa  415  1e-114  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1153  amidophosphoribosyltransferase  45.17 
 
 		 474 aa  410  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2997  amidophosphoribosyltransferase  43.99 
 
 		 514 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.807987  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0321  amidophosphoribosyltransferase  42.39 
 
 		 461 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0324  amidophosphoribosyltransferase  43.47 
 
 		 471 aa  402  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0368  amidophosphoribosyltransferase  43.47 
 
 		 471 aa  402  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4979  amidophosphoribosyltransferase  43.88 
 
 		 471 aa  403  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3501  amidophosphoribosyltransferase  42.97 
 
 		 509 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0282  amidophosphoribosyltransferase  43.47 
 
 		 471 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0267  amidophosphoribosyltransferase  43.47 
 
 		 471 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0270  amidophosphoribosyltransferase  43.47 
 
 		 471 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0276  amidophosphoribosyltransferase  43.67 
 
 		 471 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0327  amidophosphoribosyltransferase  43.47 
 
 		 471 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0295  amidophosphoribosyltransferase  43.47 
 
 		 471 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.312701  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2047  amidophosphoribosyltransferase  44.79 
 
 		 465 aa  399  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.330153 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0341  amidophosphoribosyltransferase  43.27 
 
 		 471 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1415  amidophosphoribosyltransferase  42.91 
 
 		 472 aa  396  1e-109  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2599  amidophosphoribosyltransferase  44.33 
 
 		 499 aa  396  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0391838  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2452  amidophosphoribosyltransferase  43.99 
 
 		 514 aa  398  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2400  amidophosphoribosyltransferase  44.31 
 
 		 514 aa  396  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.453817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0274  amidophosphoribosyltransferase  42.86 
 
 		 471 aa  396  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4407  amidophosphoribosyltransferase  43.12 
 
 		 491 aa  397  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0260  amidophosphoribosyltransferase  43.38 
 
 		 470 aa  396  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3487  amidophosphoribosyltransferase  43.99 
 
 		 503 aa  396  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.746658  normal  0.621078 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0007  amidophosphoribosyltransferase  44.58 
 
 		 487 aa  395  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0265  amidophosphoribosyltransferase  41.62 
 
 		 476 aa  396  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0578  amidophosphoribosyltransferase  41.92 
 
 		 486 aa  392  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1136  amidophosphoribosyltransferase  43.29 
 
 		 470 aa  395  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1196  amidophosphoribosyltransferase  44.15 
 
 		 472 aa  393  1e-108  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4629  amidophosphoribosyltransferase  43.58 
 
 		 500 aa  395  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.691036  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4300  amidophosphoribosyltransferase  43.12 
 
 		 491 aa  395  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.182299  normal  0.0484415 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2365  amidophosphoribosyltransferase  44.04 
 
 		 474 aa  393  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1032  amidophosphoribosyltransferase  44.51 
 
 		 495 aa  393  1e-108  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3932  amidophosphoribosyltransferase  43.12 
 
 		 491 aa  395  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.961822  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2282  amidophosphoribosyltransferase  44.6 
 
 		 503 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.235461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1222  amidophosphoribosyltransferase  43.12 
 
 		 472 aa  394  1e-108  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.433131  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3894  amidophosphoribosyltransferase  43.93 
 
 		 491 aa  394  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0760  amidophosphoribosyltransferase  43.12 
 
 		 454 aa  389  1e-107  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0139  amidophosphoribosyltransferase  44.15 
 
 		 462 aa  389  1e-107  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0983  amidophosphoribosyltransferase  42.07 
 
 		 490 aa  389  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.592161  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3699  amidophosphoribosyltransferase  43.84 
 
 		 493 aa  390  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.549743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4318  amidophosphoribosyltransferase  43.32 
 
 		 496 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1541  amidophosphoribosyltransferase  41.46 
 
 		 502 aa  387  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4178  amidophosphoribosyltransferase  44.44 
 
 		 494 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2502  amidophosphoribosyltransferase  42.46 
 
 		 500 aa  387  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4217  amidophosphoribosyltransferase  44.44 
 
 		 494 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3939  amidophosphoribosyltransferase  41.43 
 
 		 499 aa  386  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4571  amidophosphoribosyltransferase  43.12 
 
 		 468 aa  387  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.470676  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0398  amidophosphoribosyltransferase  41.9 
 
 		 480 aa  385  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22120  amidophosphoribosyltransferase  41.88 
 
 		 480 aa  383  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.357347  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5556  amidophosphoribosyltransferase  43.85 
 
 		 511 aa  384  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3588  amidophosphoribosyltransferase  43.61 
 
 		 503 aa  385  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.51846 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1062  amidophosphoribosyltransferase  41.62 
 
 		 486 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.739126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1475  amidophosphoribosyltransferase  42.66 
 
 		 472 aa  384  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3787  amidophosphoribosyltransferase  43 
 
 		 510 aa  385  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1778  hypothetical protein  41.9 
 
 		 475 aa  384  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000929805  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1766  amidophosphoribosyltransferase  41.57 
 
 		 488 aa  383  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0501857 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2311  amidophosphoribosyltransferase  41.57 
 
 		 501 aa  382  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.672659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1722  amidophosphoribosyltransferase  42.06 
 
 		 481 aa  380  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.56305  normal  0.196104 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3396  amidophosphoribosyltransferase  43.27 
 
 		 492 aa  380  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2454  amidophosphoribosyltransferase  41.27 
 
 		 487 aa  382  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1249  amidophosphoribosyltransferase  43 
 
 		 488 aa  379  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.917797  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0878  glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase  41.5 
 
 		 503 aa  379  1e-104  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141495  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2064  amidophosphoribosyltransferase  42.06 
 
 		 475 aa  380  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0051  amidophosphoribosyltransferase  41.67 
 
 		 479 aa  379  1e-104  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0299  amidophosphoribosyltransferase  43.74 
 
 		 446 aa  379  1e-104  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0292  amidophosphoribosyltransferase  41.53 
 
 		 459 aa  380  1e-104  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.95663  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5114  amidophosphoribosyltransferase  42.54 
 
 		 510 aa  379  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0638191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0731  amidophosphoribosyltransferase  41.19 
 
 		 478 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1117  amidophosphoribosyltransferase  41.27 
 
 		 487 aa  382  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.981489  normal  0.353735 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1634  amidophosphoribosyltransferase  41.83 
 
 		 511 aa  379  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1147  amidophosphoribosyltransferase  41.39 
 
 		 478 aa  378  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.218005  normal  0.314166 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1763  amidophosphoribosyltransferase  41.78 
 
 		 496 aa  378  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.644721  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1448  amidophosphoribosyltransferase  41.6 
 
 		 474 aa  376  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0413  amidophosphoribosyltransferase  42.51 
 
 		 491 aa  377  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.577853 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2293  amidophosphoribosyltransferase  42.25 
 
 		 504 aa  372  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>