More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2499 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2499  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  100 
 
 
305 aa  634    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0705172  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0457  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  60.4 
 
 
298 aa  377  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.598323  normal  0.402222 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0167  glutamine amidotransferase class-II  60.26 
 
 
302 aa  369  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5919  glutamine amidotransferase class-II  59.93 
 
 
302 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1699  glutamine amidotransferase class-II  59.53 
 
 
296 aa  358  8e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3033  glutamine amidotransferase, class-II  55.78 
 
 
302 aa  337  9.999999999999999e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2274  glutamine amidotransferase, class-II  48.67 
 
 
306 aa  299  3e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0107042 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1346  glutamine amidotransferase, class-II  48.33 
 
 
299 aa  296  3e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2583  glutamine amidotransferase, class-II protein  48 
 
 
306 aa  292  4e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0230258  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2248  glutamine amidotransferase class-II  48.5 
 
 
301 aa  290  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.280725 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3467  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  47.49 
 
 
299 aa  281  6.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.836717  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1575  glutamine amidotransferase class-II  47.02 
 
 
316 aa  278  6e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1870  putative glutamine amidotransferase  46.69 
 
 
308 aa  278  9e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117624  normal  0.828633 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4695  glutamine amidotransferase class-II  47 
 
 
299 aa  277  1e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.903048 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1938  glutamine amidotransferase class-II  47.18 
 
 
311 aa  277  1e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.210707  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1656  glutamine amidotransferase class-II  47.18 
 
 
311 aa  276  3e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.670859  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4810  glutamine amidotransferase class-II  47.84 
 
 
297 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.917981  hitchhiker  0.00206329 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3291  glutamine amidotransferase class-II  46.86 
 
 
301 aa  270  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2632  glutamine amidotransferase class-II  44.7 
 
 
299 aa  270  2e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5638  glutamine amidotransferase class-II  44.67 
 
 
301 aa  266  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.52916  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6575  glutamine amidotransferase class-II  43.56 
 
 
302 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0505165 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1942  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  44.55 
 
 
297 aa  260  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.738445 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5749  amidophosphoribosyltransferase  43.71 
 
 
301 aa  259  4e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1138  glutamine amidotransferase, class-II  43.52 
 
 
298 aa  258  9e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.16804 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6008  glutamine amidotransferase class-II  42.72 
 
 
301 aa  253  3e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362161  decreased coverage  0.00354269 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3524  glutamine amidotransferase class-II  41.86 
 
 
302 aa  246  2e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0234475 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5261  glutamine amidotransferase, class-II  42.67 
 
 
298 aa  232  7.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.228434 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4893  glutamine amidotransferase, class-II  42.67 
 
 
298 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4982  glutamine amidotransferase, class-II  42.67 
 
 
298 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4806  glutamine amidotransferase class-II  43.33 
 
 
298 aa  229  4e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1299  glutamine amidotransferase, class-II  42.3 
 
 
302 aa  226  3e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0375941  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5510  glutamine amidotransferase, class-II  41.8 
 
 
302 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.623211  normal  0.154748 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0468  amidophosphoribosyltransferase  31.98 
 
 
456 aa  89.4  6e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.350158  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0439  amidophosphoribosyltransferase  32.62 
 
 
459 aa  87.4  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0396  amidophosphoribosyltransferase  31.58 
 
 
459 aa  85.9  8e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0007  amidophosphoribosyltransferase  34.81 
 
 
487 aa  85.5  9e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30048  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1523  amidophosphoribosyltransferase  32.62 
 
 
459 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0119394  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4178  amidophosphoribosyltransferase  32.14 
 
 
494 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4217  amidophosphoribosyltransferase  32.14 
 
 
494 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2047  amidophosphoribosyltransferase  32.11 
 
 
465 aa  82.8  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.330153 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4318  amidophosphoribosyltransferase  31.09 
 
 
496 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1448  amidophosphoribosyltransferase  31.58 
 
 
474 aa  81.6  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0841  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  33.33 
 
 
608 aa  81.3  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.121546  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4602  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  29.17 
 
 
616 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1632  amidophosphoribosyltransferase  32.8 
 
 
469 aa  80.5  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1487  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  37.68 
 
 
609 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0334  amidophosphoribosyltransferase  33.71 
 
 
462 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.708549  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1766  amidophosphoribosyltransferase  33.53 
 
 
488 aa  80.5  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0501857 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2807  amidophosphoribosyltransferase  34.59 
 
 
462 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2307  amidophosphoribosyltransferase  30.89 
 
 
467 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0292  amidophosphoribosyltransferase  33.16 
 
 
459 aa  80.1  0.00000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.95663  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0428  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  32.9 
 
 
603 aa  80.1  0.00000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4463  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  29.44 
 
 
605 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14983  normal  0.484946 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51890  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  30.34 
 
 
611 aa  79.7  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0230  amidophosphoribosyltransferase  32.28 
 
 
463 aa  79.7  0.00000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0884272  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5117  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  29.59 
 
 
611 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0980  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  33.08 
 
 
599 aa  79.3  0.00000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1147  amidophosphoribosyltransferase  31.58 
 
 
478 aa  79  0.00000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.218005  normal  0.314166 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1309  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  31.1 
 
 
605 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0011  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  30.11 
 
 
609 aa  78.2  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.855162  normal  0.0514603 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1000  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  30.69 
 
 
602 aa  78.6  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0846  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  31.1 
 
 
605 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2865  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  33.33 
 
 
610 aa  78.6  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2453  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  36.36 
 
 
606 aa  79  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.633572  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1327  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  31.1 
 
 
605 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1740  glutamate synthase alpha subunit domain protein  26.89 
 
 
659 aa  78.2  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.627915  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5409  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  30.49 
 
 
611 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.323982  hitchhiker  0.00848262 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2184  amidophosphoribosyltransferase  28.42 
 
 
487 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5291  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  30.49 
 
 
611 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268199  normal  0.456401 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0103  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  32.48 
 
 
609 aa  77.8  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5427  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  27.08 
 
 
611 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.15944  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0118  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  32.3 
 
 
609 aa  78.2  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.101384  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0106  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  35.44 
 
 
604 aa  77.8  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0427631  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0953  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  32.33 
 
 
599 aa  77.4  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.590452  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4741  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  30.77 
 
 
609 aa  77  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0997  amidophosphoribosyltransferase  26.53 
 
 
482 aa  77  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.421996  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3872  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  33.74 
 
 
610 aa  76.6  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1357  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  31.29 
 
 
591 aa  76.6  0.0000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0228  amidophosphoribosyltransferase  32.08 
 
 
478 aa  76.6  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.629689  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16310  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  28 
 
 
355 aa  76.6  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000470863  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1778  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  27.96 
 
 
602 aa  76.3  0.0000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.285931  normal  0.0291099 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0808  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  34.78 
 
 
609 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1389  amidophosphoribosyltransferase  29.94 
 
 
479 aa  76.3  0.0000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.254172  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4125  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  30.77 
 
 
609 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.513895  normal  0.539293 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1419  amidophosphoribosyltransferase  28.42 
 
 
461 aa  76.3  0.0000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0127132  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5726  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  29.8 
 
 
610 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0008  amidophosphoribosyltransferase  32.28 
 
 
467 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6350  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  30.11 
 
 
611 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0025  glutamine amidotransferase class-II  27.72 
 
 
365 aa  76.3  0.0000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2822  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  28.49 
 
 
610 aa  76.3  0.0000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3881  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  33.33 
 
 
610 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1536  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  29.19 
 
 
610 aa  75.9  0.0000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73170  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  30.11 
 
 
611 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.542365  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0992  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  31.58 
 
 
599 aa  75.9  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.237004  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0522  amidophosphoribosyltransferase  29.11 
 
 
465 aa  75.9  0.0000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5595  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  29.59 
 
 
611 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0665  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  24 
 
 
350 aa  75.9  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0507  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  32 
 
 
612 aa  75.9  0.0000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00435471 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5196  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  28.89 
 
 
611 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.118188  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1249  amidophosphoribosyltransferase  27.85 
 
 
488 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.917797  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>