More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1699 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1699  glutamine amidotransferase class-II  100 
 
 		 296 aa  610  9.999999999999999e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0457  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  63.51 
 
 		 298 aa  402  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.598323  normal  0.402222 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5919  glutamine amidotransferase class-II  62.46 
 
 		 302 aa  386  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3033  glutamine amidotransferase, class-II  62 
 
 		 302 aa  376  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0167  glutamine amidotransferase class-II  61.33 
 
 		 302 aa  373  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2499  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  59.53 
 
 		 305 aa  358  8e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0705172  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3467  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  51.34 
 
 		 299 aa  311  7.999999999999999e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.836717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2248  glutamine amidotransferase class-II  52.35 
 
 		 301 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280725 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2274  glutamine amidotransferase, class-II  51.01 
 
 		 306 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0107042 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2583  glutamine amidotransferase, class-II protein  51.01 
 
 		 306 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0230258  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1942  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  50.84 
 
 		 297 aa  301  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.738445 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1575  glutamine amidotransferase class-II  49.33 
 
 		 316 aa  300  2e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4695  glutamine amidotransferase class-II  50 
 
 		 299 aa  300  2e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.903048 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4810  glutamine amidotransferase class-II  50.81 
 
 		 297 aa  299  3e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.917981  hitchhiker  0.00206329 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1656  glutamine amidotransferase class-II  48.33 
 
 		 311 aa  296  4e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.670859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1938  glutamine amidotransferase class-II  48.5 
 
 		 311 aa  295  5e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.210707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1346  glutamine amidotransferase, class-II  47.65 
 
 		 299 aa  291  7e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3291  glutamine amidotransferase class-II  48.99 
 
 		 301 aa  280  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1870  putative glutamine amidotransferase  48.32 
 
 		 308 aa  279  5e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117624  normal  0.828633 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6575  glutamine amidotransferase class-II  45.95 
 
 		 302 aa  275  6e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0505165 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5638  glutamine amidotransferase class-II  45.61 
 
 		 301 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.52916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2632  glutamine amidotransferase class-II  46.82 
 
 		 299 aa  272  6e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5749  amidophosphoribosyltransferase  45.27 
 
 		 301 aa  271  7e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1138  glutamine amidotransferase, class-II  46.82 
 
 		 298 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.16804 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3524  glutamine amidotransferase class-II  43.85 
 
 		 302 aa  268  1e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0234475 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6008  glutamine amidotransferase class-II  44.93 
 
 		 301 aa  263  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362161  decreased coverage  0.00354269 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4806  glutamine amidotransferase class-II  44.05 
 
 		 298 aa  250  2e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1299  glutamine amidotransferase, class-II  44.7 
 
 		 302 aa  242  5e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0375941  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5510  glutamine amidotransferase, class-II  43.05 
 
 		 302 aa  239  5e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.623211  normal  0.154748 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5261  glutamine amidotransferase, class-II  44.19 
 
 		 298 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.228434 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4893  glutamine amidotransferase, class-II  44.19 
 
 		 298 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4982  glutamine amidotransferase, class-II  44.19 
 
 		 298 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1448  amidophosphoribosyltransferase  29.44 
 
 		 474 aa  84.7  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0007  amidophosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 487 aa  83.6  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1249  amidophosphoribosyltransferase  27.04 
 
 		 488 aa  82  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.917797  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0334  amidophosphoribosyltransferase  32.88 
 
 		 462 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.708549  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1778  hypothetical protein  30.3 
 
 		 475 aa  79  0.00000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000929805  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3212  amidophosphoribosyltransferase  32.62 
 
 		 463 aa  79  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.903412  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0085  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  31.65 
 
 		 611 aa  78.6  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.800313  normal  0.506708 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0228  amidophosphoribosyltransferase  29.94 
 
 		 478 aa  78.6  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.629689  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0731  amidophosphoribosyltransferase  33.81 
 
 		 478 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3061  amidophosphoribosyltransferase  29.17 
 
 		 629 aa  77.4  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1632  amidophosphoribosyltransferase  32.7 
 
 		 469 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2184  amidophosphoribosyltransferase  29.56 
 
 		 487 aa  77  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2807  amidophosphoribosyltransferase  35.11 
 
 		 462 aa  77  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4571  amidophosphoribosyltransferase  30.06 
 
 		 468 aa  76.6  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.470676  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0398  amidophosphoribosyltransferase  31.1 
 
 		 480 aa  76.6  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0321  amidophosphoribosyltransferase  33.58 
 
 		 461 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1147  amidophosphoribosyltransferase  31.9 
 
 		 478 aa  76.3  0.0000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.218005  normal  0.314166 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2865  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  30.59 
 
 		 610 aa  76.3  0.0000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2307  amidophosphoribosyltransferase  30.82 
 
 		 467 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0276  amidophosphoribosyltransferase  28.4 
 
 		 471 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  30.03 
 
 		 553 aa  75.9  0.0000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22120  amidophosphoribosyltransferase  31.45 
 
 		 480 aa  75.9  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.357347  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4217  amidophosphoribosyltransferase  33.78 
 
 		 494 aa  75.5  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4178  amidophosphoribosyltransferase  33.78 
 
 		 494 aa  75.5  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0953  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  29.88 
 
 		 599 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.590452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01750  amidophosphoribosyltransferase  31.03 
 
 		 482 aa  75.1  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.674101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0980  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  28.31 
 
 		 599 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1740  glutamate synthase alpha subunit domain protein  24.11 
 
 		 659 aa  74.3  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.627915  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4979  amidophosphoribosyltransferase  27.78 
 
 		 471 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0282  amidophosphoribosyltransferase  27.78 
 
 		 471 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0267  amidophosphoribosyltransferase  27.78 
 
 		 471 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0270  amidophosphoribosyltransferase  27.78 
 
 		 471 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0295  amidophosphoribosyltransferase  27.78 
 
 		 471 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.312701  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0327  amidophosphoribosyltransferase  27.78 
 
 		 471 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0727  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 		 602 aa  74.3  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3872  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  30.05 
 
 		 610 aa  74.7  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2822  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  35.77 
 
 		 610 aa  73.9  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4318  amidophosphoribosyltransferase  30.56 
 
 		 496 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1727  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  30.49 
 
 		 599 aa  73.6  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.20079  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0522  amidophosphoribosyltransferase  29.11 
 
 		 465 aa  73.6  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1326  amidophosphoribosyltransferase  30.91 
 
 		 468 aa  73.2  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2365  amidophosphoribosyltransferase  28.49 
 
 		 474 aa  73.6  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2453  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  35.37 
 
 		 606 aa  73.6  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.633572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0230  amidophosphoribosyltransferase  30.54 
 
 		 463 aa  73.6  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0884272  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0507  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  40.74 
 
 		 612 aa  73.2  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00435471 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1000  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  35.29 
 
 		 602 aa  73.6  0.000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0439  amidophosphoribosyltransferase  29.01 
 
 		 459 aa  72.8  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00831  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  37.89 
 
 		 610 aa  72.8  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1536  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  28.79 
 
 		 610 aa  72.8  0.000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1487  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  34.15 
 
 		 609 aa  72.4  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0841  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  35.16 
 
 		 608 aa  72.4  0.000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.121546  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3499  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  40.74 
 
 		 612 aa  71.6  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2599  amidophosphoribosyltransferase  35 
 
 		 499 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0391838  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0090  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  34.95 
 
 		 609 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0489544  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1475  amidophosphoribosyltransferase  29.45 
 
 		 472 aa  72  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0073  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  34.95 
 
 		 609 aa  72  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.653e-29 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0992  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  29.27 
 
 		 599 aa  72  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.237004  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1778  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  29.14 
 
 		 602 aa  72  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.285931  normal  0.0291099 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0008  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  37.09 
 
 		 607 aa  72  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.666294  normal  0.382171 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0324  amidophosphoribosyltransferase  27.16 
 
 		 471 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0189  amidophosphoribosyltransferase  29.87 
 
 		 445 aa  70.9  0.00000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0394  amidophosphoribosyltransferase  30.56 
 
 		 470 aa  71.2  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0144451 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2179  amidophosphoribosyltransferase  32.17 
 
 		 462 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2095  amidophosphoribosyltransferase  31.25 
 
 		 480 aa  71.2  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.778059 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4629  amidophosphoribosyltransferase  34.29 
 
 		 500 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.691036  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0341  amidophosphoribosyltransferase  27.16 
 
 		 471 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4068  hypothetical protein  32.94 
 
 		 603 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.035977  normal  0.145106 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0227  amidophosphoribosyltransferase  29.87 
 
 		 445 aa  70.9  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>