More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_16310 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_16310  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  100 
 
 		 355 aa  739    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000470863  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2361  glutamine amidotransferase class-II  68.38 
 
 		 364 aa  523  1e-147  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.595667  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1293  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  61.03 
 
 		 368 aa  480  1e-134  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303282 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0558  glutamine amidotransferase, class-II  61.56 
 
 		 374 aa  476  1e-133  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0025  glutamine amidotransferase class-II  62.18 
 
 		 365 aa  466  9.999999999999999e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1753  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  60.94 
 
 		 373 aa  463  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.150521 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2491  glutamine amidotransferase, class-II  58.82 
 
 		 371 aa  456  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1236  hypothetical protein  61.9 
 
 		 339 aa  444  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0522  glutamine amidotransferase, class-II  56.41 
 
 		 395 aa  442  1e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1815  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  55.56 
 
 		 364 aa  443  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0536  glutamine amidotransferase class-II  56.41 
 
 		 372 aa  442  1e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2026  glutamine amidotransferase, class-II  58.4 
 
 		 359 aa  438  9.999999999999999e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.805771  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1130  glutamine amidotransferase, class II  55.43 
 
 		 376 aa  430  1e-119  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_948  glutamine amidotransferase, class II  54.86 
 
 		 376 aa  429  1e-119  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.155092  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0959  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  55.14 
 
 		 376 aa  429  1e-119  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315043  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0545  glutamine amidotransferase class-II  54.8 
 
 		 369 aa  426  1e-118  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00405824 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0197  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  59.54 
 
 		 363 aa  423  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.480827  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1338  glutamine amidotransferase, class-II  54.7 
 
 		 364 aa  422  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.845818 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0665  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  53.62 
 
 		 350 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0213  glutamine amidotransferase, class-II  52.66 
 
 		 378 aa  398  9.999999999999999e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2710  glutamine amidotransferase class-II  48.55 
 
 		 350 aa  383  1e-105  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1690  glutamine amidotransferase, class-II  53.04 
 
 		 349 aa  382  1e-105  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.491949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0780  glutamine amidotransferase, class-II  49.86 
 
 		 350 aa  380  1e-104  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0619068  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1300  glutamine amidotransferase class-II  49.86 
 
 		 361 aa  372  1e-102  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1078  glutamine amidotransferase class-II  48.9 
 
 		 363 aa  371  1e-101  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.46258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1598  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  48.9 
 
 		 363 aa  368  1e-101  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0869  glutamine amidotransferase class-II  47.8 
 
 		 363 aa  360  2e-98  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0521916  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2136  glutamine amidotransferase, class-II  48.28 
 
 		 382 aa  359  3e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1092  glutamine amidotransferase class-II  46.43 
 
 		 363 aa  358  7e-98  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0334  glutamine amidotransferase, class-II  44.35 
 
 		 350 aa  330  2e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892096  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1740  glutamate synthase alpha subunit domain protein  32.59 
 
 		 659 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.627915  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0030  glutamate synthase alpha subunit  35.08 
 
 		 670 aa  169  7e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1885  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  31.67 
 
 		 646 aa  158  1e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.273779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1812  glutamate synthase alpha subunit  29.13 
 
 		 568 aa  119  7.999999999999999e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000275446 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  33.7 
 
 		 553 aa  106  7e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0830  glutamate synthase alpha subunit  33.19 
 
 		 568 aa  100  3e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.990819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1607  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  30.8 
 
 		 572 aa  99.4  9e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2161  hypothetical protein  30.62 
 
 		 368 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0610  Glutamate synthase (ferredoxin)  26.14 
 
 		 1510 aa  76.6  0.0000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2499  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  28 
 
 		 305 aa  76.6  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0705172  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2598  glutamate synthase large subunit  28.08 
 
 		 368 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4695  glutamine amidotransferase class-II  26.89 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.903048 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1575  glutamine amidotransferase class-II  28.04 
 
 		 316 aa  73.2  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1656  glutamine amidotransferase class-II  26.36 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.670859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1942  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  25.33 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.738445 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1938  glutamine amidotransferase class-II  26.64 
 
 		 311 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.210707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4810  glutamine amidotransferase class-II  28.44 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.917981  hitchhiker  0.00206329 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3467  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  27.83 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.836717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1138  glutamine amidotransferase, class-II  27.36 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.16804 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5749  amidophosphoribosyltransferase  28.16 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2583  glutamine amidotransferase, class-II protein  24.9 
 
 		 306 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0230258  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2274  glutamine amidotransferase, class-II  27.57 
 
 		 306 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0107042 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2248  glutamine amidotransferase class-II  24.89 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280725 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6575  glutamine amidotransferase class-II  27.01 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0505165 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1725  glutamate synthase (NADPH)  25.45 
 
 		 376 aa  68.6  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.886544 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1346  glutamine amidotransferase, class-II  24.88 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3524  glutamine amidotransferase class-II  22.62 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0234475 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6008  glutamine amidotransferase class-II  27.67 
 
 		 301 aa  67  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362161  decreased coverage  0.00354269 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0393  glutamate synthase (ferredoxin)  27.09 
 
 		 1507 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3016  Glutamate synthase (ferredoxin)  24.31 
 
 		 1524 aa  65.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1703  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.04 
 
 		 1518 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.625118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4806  glutamine amidotransferase class-II  25 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0385  glutamate synthase (NADPH)  29.91 
 
 		 376 aa  64.7  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5510  glutamine amidotransferase, class-II  24.87 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.623211  normal  0.154748 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1802  glutamate synthase (ferredoxin)  26.73 
 
 		 1498 aa  64.3  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0512049  normal  0.419037 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1155  putative glutamate synthase, large subunit (domain 1)  25.1 
 
 		 368 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.321075  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3291  glutamine amidotransferase class-II  26.96 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1372  glutamate synthase (NADPH)  32.95 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.244449  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2944  glutamate synthase, large subunit  22.31 
 
 		 1513 aa  63.9  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0729  glutamate synthase (ferredoxin)  26.84 
 
 		 1507 aa  63.5  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5638  glutamine amidotransferase class-II  25.59 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.52916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3033  glutamine amidotransferase, class-II  25.68 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1870  putative glutamine amidotransferase  24.64 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117624  normal  0.828633 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5919  glutamine amidotransferase class-II  25 
 
 		 302 aa  62  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5261  glutamine amidotransferase, class-II  21.83 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.228434 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4893  glutamine amidotransferase, class-II  21.83 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1226  Glutamate synthase (ferredoxin)  24.17 
 
 		 1499 aa  60.8  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.27984  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4982  glutamine amidotransferase, class-II  21.83 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0457  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  24.62 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.598323  normal  0.402222 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1299  glutamine amidotransferase, class-II  23.08 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0375941  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2224  Glutamate synthase (ferredoxin)  23.66 
 
 		 1519 aa  60.5  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2683  glutamate synthase subunit alpha  28.06 
 
 		 1481 aa  60.1  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.141774 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0167  glutamine amidotransferase class-II  24.62 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1032  glutamate synthase subunit alpha  25.76 
 
 		 1482 aa  59.7  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.843249 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0104  hypothetical protein  24.5 
 
 		 375 aa  59.3  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.765688  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3450  glutamate synthase-related protein  26.84 
 
 		 1510 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0502  glutamate synthase (ferredoxin)  24.09 
 
 		 1533 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.154267  normal  0.477392 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0672  Glutamate synthase (ferredoxin)  23.53 
 
 		 1534 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1221  glutamate synthase subunit alpha  25.28 
 
 		 1482 aa  58.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.120556 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1325  glutamate synthase subunit alpha  25.95 
 
 		 1482 aa  58.2  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1126  glutamate synthase subunit alpha  25.66 
 
 		 1482 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.052618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0147  glutamate synthase (ferredoxin)  26.32 
 
 		 1510 aa  58.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2872  glutamate synthase subunit alpha  25.95 
 
 		 1482 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0333567 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2954  glutamate synthase subunit alpha  25.95 
 
 		 1482 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.791133  normal  0.168031 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2951  glutamate synthase subunit alpha  25.57 
 
 		 1482 aa  58.2  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3050  glutamate synthase subunit alpha  25.95 
 
 		 1482 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.156524 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0468  amidophosphoribosyltransferase  23.35 
 
 		 456 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.350158  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1013  glutamate synthase subunit alpha  25.66 
 
 		 1482 aa  57.4  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.471869  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0959  Glutamate synthase (ferredoxin)  25.98 
 
 		 1575 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.434425  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1136  glutamate synthase subunit alpha  25.95 
 
 		 1482 aa  57.4  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>