More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0197 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0197  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  100 
 
 		 363 aa  751    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.480827  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1293  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  58.94 
 
 		 368 aa  465  9.999999999999999e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303282 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2361  glutamine amidotransferase class-II  58.4 
 
 		 364 aa  464  1e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.595667  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0558  glutamine amidotransferase, class-II  58.89 
 
 		 374 aa  450  1e-125  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16310  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  59.54 
 
 		 355 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000470863  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0025  glutamine amidotransferase class-II  59.78 
 
 		 365 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2026  glutamine amidotransferase, class-II  53.09 
 
 		 359 aa  412  1e-114  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.805771  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1753  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  53.35 
 
 		 373 aa  412  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.150521 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0522  glutamine amidotransferase, class-II  51.96 
 
 		 395 aa  413  1e-114  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0536  glutamine amidotransferase class-II  51.96 
 
 		 372 aa  412  1e-114  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2491  glutamine amidotransferase, class-II  53.63 
 
 		 371 aa  411  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1236  hypothetical protein  53.85 
 
 		 339 aa  395  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1815  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  51.44 
 
 		 364 aa  393  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1130  glutamine amidotransferase, class II  49.86 
 
 		 376 aa  389  1e-107  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0959  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  50.71 
 
 		 376 aa  388  1e-107  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315043  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_948  glutamine amidotransferase, class II  49.86 
 
 		 376 aa  389  1e-107  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.155092  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0545  glutamine amidotransferase class-II  51.3 
 
 		 369 aa  387  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00405824 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1338  glutamine amidotransferase, class-II  50.86 
 
 		 364 aa  382  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.845818 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0213  glutamine amidotransferase, class-II  48.31 
 
 		 378 aa  378  1e-104  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0665  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  46.82 
 
 		 350 aa  354  1e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1300  glutamine amidotransferase class-II  47.41 
 
 		 361 aa  343  4e-93  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0780  glutamine amidotransferase, class-II  45.93 
 
 		 350 aa  335  1e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0619068  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2710  glutamine amidotransferase class-II  43.02 
 
 		 350 aa  329  6e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2136  glutamine amidotransferase, class-II  45.24 
 
 		 382 aa  322  7e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1690  glutamine amidotransferase, class-II  46.4 
 
 		 349 aa  321  9.999999999999999e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.491949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1078  glutamine amidotransferase class-II  44.57 
 
 		 363 aa  320  3e-86  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.46258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1598  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  44.57 
 
 		 363 aa  317  2e-85  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1092  glutamine amidotransferase class-II  43.48 
 
 		 363 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0869  glutamine amidotransferase class-II  43.48 
 
 		 363 aa  311  1e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0521916  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0334  glutamine amidotransferase, class-II  41.21 
 
 		 350 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892096  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1740  glutamate synthase alpha subunit domain protein  30.66 
 
 		 659 aa  161  1e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.627915  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1885  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  28.73 
 
 		 646 aa  155  1e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.273779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0030  glutamate synthase alpha subunit  30.41 
 
 		 670 aa  153  4e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0830  glutamate synthase alpha subunit  27.43 
 
 		 568 aa  108  1e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.990819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1812  glutamate synthase alpha subunit  26.42 
 
 		 568 aa  106  6e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000275446 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  25.43 
 
 		 553 aa  100  5e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1607  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  24.78 
 
 		 572 aa  93.2  6e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2161  hypothetical protein  26.47 
 
 		 368 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0729  glutamate synthase (ferredoxin)  28.09 
 
 		 1507 aa  74.7  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2944  glutamate synthase, large subunit  22.44 
 
 		 1513 aa  73.6  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3450  glutamate synthase-related protein  30.89 
 
 		 1510 aa  72.8  0.000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2598  glutamate synthase large subunit  24.58 
 
 		 368 aa  71.2  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0147  glutamate synthase (ferredoxin)  30.37 
 
 		 1510 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1656  glutamine amidotransferase class-II  26.72 
 
 		 311 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.670859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1575  glutamine amidotransferase class-II  27.44 
 
 		 316 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1938  glutamine amidotransferase class-II  26.29 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.210707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3524  glutamine amidotransferase class-II  26.82 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0234475 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1942  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  24.53 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.738445 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4810  glutamine amidotransferase class-II  35.14 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.917981  hitchhiker  0.00206329 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1138  glutamine amidotransferase, class-II  26.05 
 
 		 298 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.16804 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0385  glutamate synthase (NADPH)  25.56 
 
 		 376 aa  64.7  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4695  glutamine amidotransferase class-II  23.38 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.903048 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2499  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  25 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0705172  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1870  putative glutamine amidotransferase  25.91 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117624  normal  0.828633 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1155  putative glutamate synthase, large subunit (domain 1)  26.38 
 
 		 368 aa  63.2  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.321075  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2387  glutamate synthase (NADPH)  27.88 
 
 		 375 aa  63.2  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1725  glutamate synthase (NADPH)  22.71 
 
 		 376 aa  63.2  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.886544 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1372  glutamate synthase (NADPH)  26.44 
 
 		 376 aa  62.4  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.244449  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2274  glutamate synthase (NADPH)  25.11 
 
 		 376 aa  62.4  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0104  hypothetical protein  27.32 
 
 		 375 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.765688  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2583  glutamine amidotransferase, class-II protein  24.15 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0230258  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3467  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  22.75 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.836717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1802  glutamate synthase (ferredoxin)  27.27 
 
 		 1498 aa  60.5  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0512049  normal  0.419037 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1375  hypothetical protein  26.13 
 
 		 376 aa  60.5  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.157806  normal  0.645032 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0396  amidophosphoribosyltransferase  22.33 
 
 		 459 aa  60.1  0.00000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0484  Glutamate synthase (ferredoxin)  24.08 
 
 		 1505 aa  59.7  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5919  glutamine amidotransferase class-II  25 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2274  glutamine amidotransferase, class-II  25.81 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0107042 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1346  glutamine amidotransferase, class-II  22.97 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1176  glutamate synthase (NADPH) large subunit  26.61 
 
 		 1479 aa  59.3  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2790  glutamate synthase subunit alpha  27.24 
 
 		 1482 aa  58.9  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0039  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  29.66 
 
 		 610 aa  58.2  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1226  Glutamate synthase (ferredoxin)  27.27 
 
 		 1499 aa  58.5  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.27984  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2632  glutamine amidotransferase class-II  28.89 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1523  amidophosphoribosyltransferase  22.54 
 
 		 459 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0119394  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4806  glutamine amidotransferase class-II  25.96 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0439  amidophosphoribosyltransferase  23.47 
 
 		 459 aa  57.4  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3033  glutamine amidotransferase, class-II  26.74 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1032  glutamate synthase subunit alpha  27.91 
 
 		 1482 aa  57  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.843249 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0657  glutamate synthase (NADPH) large subunit  22.11 
 
 		 1509 aa  57  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0412975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0167  glutamine amidotransferase class-II  24.47 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5749  amidophosphoribosyltransferase  32.26 
 
 		 301 aa  55.8  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1221  glutamate synthase subunit alpha  28.12 
 
 		 1482 aa  55.8  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.120556 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6575  glutamine amidotransferase class-II  33.33 
 
 		 302 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0505165 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1325  glutamate synthase subunit alpha  27.49 
 
 		 1482 aa  55.1  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2805  glutamate synthase (ferredoxin)  25.97 
 
 		 1525 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1126  glutamate synthase subunit alpha  28.24 
 
 		 1482 aa  55.1  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.052618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0468  amidophosphoribosyltransferase  22.79 
 
 		 456 aa  55.1  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.350158  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6008  glutamine amidotransferase class-II  26.38 
 
 		 301 aa  55.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362161  decreased coverage  0.00354269 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1640  Glutamate synthase (ferredoxin)  25.74 
 
 		 1519 aa  55.5  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0608399  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1703  Glutamate synthase (ferredoxin)  26.14 
 
 		 1518 aa  55.5  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.625118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2872  glutamate synthase subunit alpha  27.49 
 
 		 1482 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0333567 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2954  glutamate synthase subunit alpha  27.49 
 
 		 1482 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.791133  normal  0.168031 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0007  glutamate synthase, large subunit  23.91 
 
 		 1495 aa  54.7  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  unclonable  0.000000781352  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3050  glutamate synthase subunit alpha  27.49 
 
 		 1482 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.156524 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1357  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  32.35 
 
 		 591 aa  54.3  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0457  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  24.47 
 
 		 298 aa  54.7  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.598323  normal  0.402222 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0138  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  29.82 
 
 		 612 aa  54.3  0.000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.266568  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1594  amidophosphoribosyltransferase  24.62 
 
 		 464 aa  54.3  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1487  glutamate synthase, large subunit  28.25 
 
 		 1465 aa  54.7  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0194294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>