More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1598 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1598  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  100 
 
 		 363 aa  749    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0869  glutamine amidotransferase class-II  96.42 
 
 		 363 aa  727    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0521916  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1078  glutamine amidotransferase class-II  97.8 
 
 		 363 aa  735    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.46258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1092  glutamine amidotransferase class-II  86.23 
 
 		 363 aa  670    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1300  glutamine amidotransferase class-II  74.24 
 
 		 361 aa  592  1e-168  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0665  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  52.47 
 
 		 350 aa  397  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0780  glutamine amidotransferase, class-II  50.96 
 
 		 350 aa  392  1e-108  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0619068  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1690  glutamine amidotransferase, class-II  52.47 
 
 		 349 aa  391  1e-108  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.491949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2710  glutamine amidotransferase class-II  51.1 
 
 		 350 aa  394  1e-108  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2136  glutamine amidotransferase, class-II  49.72 
 
 		 382 aa  383  1e-105  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0536  glutamine amidotransferase class-II  48.76 
 
 		 372 aa  367  1e-100  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2361  glutamine amidotransferase class-II  49.86 
 
 		 364 aa  365  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.595667  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0025  glutamine amidotransferase class-II  50.41 
 
 		 365 aa  365  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1815  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  48.08 
 
 		 364 aa  366  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0522  glutamine amidotransferase, class-II  48.63 
 
 		 395 aa  367  1e-100  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16310  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  48.9 
 
 		 355 aa  368  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000470863  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2491  glutamine amidotransferase, class-II  47.85 
 
 		 371 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1293  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  45.38 
 
 		 368 aa  355  5.999999999999999e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303282 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1753  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  46.77 
 
 		 373 aa  354  1e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.150521 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0558  glutamine amidotransferase, class-II  47.25 
 
 		 374 aa  349  4e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0545  glutamine amidotransferase class-II  47.78 
 
 		 369 aa  345  7e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00405824 
 
 
-
 
NC_002936  DET1130  glutamine amidotransferase, class II  46.85 
 
 		 376 aa  343  2e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0959  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  46.72 
 
 		 376 aa  344  2e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315043  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_948  glutamine amidotransferase, class II  45.75 
 
 		 376 aa  343  4e-93  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.155092  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1338  glutamine amidotransferase, class-II  46.43 
 
 		 364 aa  340  2e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.845818 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0334  glutamine amidotransferase, class-II  46.15 
 
 		 350 aa  339  5e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892096  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2026  glutamine amidotransferase, class-II  45.5 
 
 		 359 aa  333  3e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.805771  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1236  hypothetical protein  45.76 
 
 		 339 aa  325  9e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0213  glutamine amidotransferase, class-II  41.03 
 
 		 378 aa  318  1e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0197  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  44.57 
 
 		 363 aa  300  4e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.480827  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1740  glutamate synthase alpha subunit domain protein  26.98 
 
 		 659 aa  145  9e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.627915  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1885  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  28.26 
 
 		 646 aa  136  6.0000000000000005e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.273779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0030  glutamate synthase alpha subunit  27.85 
 
 		 670 aa  126  5e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1812  glutamate synthase alpha subunit  28.22 
 
 		 568 aa  92  1e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000275446 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1607  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  26.91 
 
 		 572 aa  87.8  3e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  23.68 
 
 		 553 aa  85.9  9e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0830  glutamate synthase alpha subunit  24.45 
 
 		 568 aa  83.2  0.000000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.990819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1155  putative glutamate synthase, large subunit (domain 1)  23.2 
 
 		 368 aa  74.7  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.321075  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2598  glutamate synthase large subunit  24.39 
 
 		 368 aa  74.3  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2161  hypothetical protein  24.08 
 
 		 368 aa  70.1  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1575  glutamine amidotransferase class-II  23.76 
 
 		 316 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3524  glutamine amidotransferase class-II  24.9 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0234475 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1346  glutamine amidotransferase, class-II  20.51 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1938  glutamine amidotransferase class-II  24.89 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.210707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1656  glutamine amidotransferase class-II  22.97 
 
 		 311 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.670859  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0484  Glutamate synthase (ferredoxin)  22.04 
 
 		 1505 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0385  glutamate synthase (NADPH)  23.61 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1725  glutamate synthase (NADPH)  23.5 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.886544 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2866  ferredoxin-dependent glutamate synthase  24.37 
 
 		 1527 aa  60.8  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2618  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  38.54 
 
 		 608 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120627 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1942  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  24.89 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.738445 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2274  glutamine amidotransferase, class-II  21.77 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0107042 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1350  Glutamate synthase (ferredoxin)  22.64 
 
 		 1527 aa  59.7  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000183365 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4810  glutamine amidotransferase class-II  25 
 
 		 297 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.917981  hitchhiker  0.00206329 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2854  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  37.5 
 
 		 608 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0341  glutamate synthase (NADH) large subunit  26.73 
 
 		 1489 aa  59.3  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3467  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  23.35 
 
 		 299 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.836717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0036  glutamate synthase (ferredoxin)  27.16 
 
 		 1571 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.790561 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4695  glutamine amidotransferase class-II  21.47 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.903048 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2583  glutamine amidotransferase, class-II protein  21.31 
 
 		 306 aa  57  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0230258  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1870  putative glutamine amidotransferase  25.23 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117624  normal  0.828633 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0104  hypothetical protein  24.42 
 
 		 375 aa  57.4  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.765688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2387  glutamate synthase (NADPH)  25.11 
 
 		 375 aa  57  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0393  glutamate synthase (ferredoxin)  25 
 
 		 1507 aa  56.6  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1170  glutamine amidotransferase class-II  26.34 
 
 		 1563 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1372  glutamate synthase (NADPH)  25 
 
 		 376 aa  56.2  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.244449  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0054  glutamate synthase, large subunit  24.31 
 
 		 1583 aa  56.2  0.0000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.673781  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0049  glutamate synthase, large subunit  24.31 
 
 		 1583 aa  56.2  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3031  glutamate synthase (ferredoxin)  27.16 
 
 		 1553 aa  55.8  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1703  Glutamate synthase (ferredoxin)  26.74 
 
 		 1518 aa  55.1  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.625118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2274  glutamate synthase (NADPH)  20.77 
 
 		 376 aa  54.7  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5919  glutamine amidotransferase class-II  20.96 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1802  glutamate synthase (ferredoxin)  27.33 
 
 		 1498 aa  55.1  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0512049  normal  0.419037 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5749  amidophosphoribosyltransferase  24.55 
 
 		 301 aa  54.7  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2499  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  27.88 
 
 		 305 aa  55.1  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0705172  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1699  glutamine amidotransferase class-II  20.12 
 
 		 296 aa  54.7  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2711  glutamate synthase (ferredoxin)  25 
 
 		 1574 aa  54.3  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5510  glutamine amidotransferase, class-II  22.97 
 
 		 302 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.623211  normal  0.154748 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3734  glutamate synthase large subunit  25.39 
 
 		 1573 aa  53.9  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3590  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.37 
 
 		 1572 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.610776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_51214  ferredoxin-dependent glutamate synthase, fusion of large and small subunits  24.58 
 
 		 1591 aa  53.5  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1988  Glutamate synthase (ferredoxin)  25.76 
 
 		 1497 aa  53.5  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3266  glutamate synthase (ferredoxin)  28.37 
 
 		 1572 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.819491  normal  0.0774951 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3654  Glutamate synthase (ferredoxin)  26.21 
 
 		 1558 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1812  glutamate synthase (ferredoxin)  25.93 
 
 		 1564 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0773594 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0657  glutamate synthase (NADPH) large subunit  22.79 
 
 		 1509 aa  53.1  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0412975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1640  Glutamate synthase (ferredoxin)  22.16 
 
 		 1519 aa  53.5  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0608399  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3291  glutamine amidotransferase class-II  21.69 
 
 		 301 aa  53.5  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1117  Glutamate synthase (ferredoxin)  21.7 
 
 		 1468 aa  53.1  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4277  glutamate synthase (ferredoxin)  25 
 
 		 1583 aa  53.1  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2248  glutamine amidotransferase class-II  22.48 
 
 		 301 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280725 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6575  glutamine amidotransferase class-II  24.32 
 
 		 302 aa  53.1  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0505165 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6008  glutamine amidotransferase class-II  24.2 
 
 		 301 aa  53.1  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362161  decreased coverage  0.00354269 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1357  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  29.41 
 
 		 591 aa  52.4  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1371  glutamate synthase (NADH) large subunit  26.39 
 
 		 1578 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.25743 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2683  glutamate synthase subunit alpha  25.11 
 
 		 1481 aa  52.4  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.141774 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0457  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  20.52 
 
 		 298 aa  52.4  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.598323  normal  0.402222 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0791  glutamate synthase (NADH) large subunit  27.65 
 
 		 1580 aa  52.4  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.116614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2744  glutamate synthase (NADH) large subunit  21.79 
 
 		 1574 aa  52.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3643  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  36.47 
 
 		 607 aa  52  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.317971  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>