More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2136 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2136  glutamine amidotransferase, class-II  100 
 
 		 382 aa  785    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1690  glutamine amidotransferase, class-II  72 
 
 		 349 aa  534  1e-151  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.491949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0334  glutamine amidotransferase, class-II  71.84 
 
 		 350 aa  536  1e-151  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892096  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2710  glutamine amidotransferase class-II  69.71 
 
 		 350 aa  525  1e-148  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0780  glutamine amidotransferase, class-II  68.57 
 
 		 350 aa  519  1e-146  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0619068  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0665  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  65.62 
 
 		 350 aa  497  1e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1300  glutamine amidotransferase class-II  51.67 
 
 		 361 aa  395  1e-109  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1598  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  49.72 
 
 		 363 aa  383  1e-105  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1078  glutamine amidotransferase class-II  50 
 
 		 363 aa  383  1e-105  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.46258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0536  glutamine amidotransferase class-II  50.87 
 
 		 372 aa  379  1e-104  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1092  glutamine amidotransferase class-II  50.28 
 
 		 363 aa  379  1e-104  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0522  glutamine amidotransferase, class-II  50.87 
 
 		 395 aa  379  1e-104  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0869  glutamine amidotransferase class-II  48.61 
 
 		 363 aa  375  1e-103  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0521916  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1293  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  47.84 
 
 		 368 aa  361  1e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303282 
 
 
-
 
NC_002936  DET1130  glutamine amidotransferase, class II  47.74 
 
 		 376 aa  359  4e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16310  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  48.28 
 
 		 355 aa  359  4e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000470863  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0545  glutamine amidotransferase class-II  50 
 
 		 369 aa  358  8e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00405824 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0959  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  47.86 
 
 		 376 aa  358  9.999999999999999e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315043  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1815  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  47.84 
 
 		 364 aa  356  3.9999999999999996e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1753  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  46.88 
 
 		 373 aa  354  2e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.150521 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_948  glutamine amidotransferase, class II  46.15 
 
 		 376 aa  352  5e-96  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.155092  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2026  glutamine amidotransferase, class-II  49.28 
 
 		 359 aa  352  5.9999999999999994e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.805771  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2491  glutamine amidotransferase, class-II  46.31 
 
 		 371 aa  348  6e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2361  glutamine amidotransferase class-II  48.98 
 
 		 364 aa  346  4e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.595667  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0025  glutamine amidotransferase class-II  48.41 
 
 		 365 aa  346  4e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0558  glutamine amidotransferase, class-II  45.87 
 
 		 374 aa  346  5e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1236  hypothetical protein  49.7 
 
 		 339 aa  342  9e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1338  glutamine amidotransferase, class-II  49.42 
 
 		 364 aa  339  5.9999999999999996e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.845818 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0213  glutamine amidotransferase, class-II  46.89 
 
 		 378 aa  325  6e-88  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0197  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  45.24 
 
 		 363 aa  305  8.000000000000001e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.480827  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1740  glutamate synthase alpha subunit domain protein  31.38 
 
 		 659 aa  159  7e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.627915  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1885  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  33.14 
 
 		 646 aa  153  4e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.273779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0030  glutamate synthase alpha subunit  32.74 
 
 		 670 aa  145  1e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1812  glutamate synthase alpha subunit  27.75 
 
 		 568 aa  114  3e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000275446 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  32.18 
 
 		 553 aa  108  2e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0830  glutamate synthase alpha subunit  27.01 
 
 		 568 aa  97.8  2e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.990819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2161  hypothetical protein  28.44 
 
 		 368 aa  98.6  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1607  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  31.43 
 
 		 572 aa  93.2  6e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0729  glutamate synthase (ferredoxin)  32.63 
 
 		 1507 aa  85.5  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2944  glutamate synthase, large subunit  28.27 
 
 		 1513 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1640  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.58 
 
 		 1519 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0608399  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0393  glutamate synthase (ferredoxin)  30.37 
 
 		 1507 aa  77  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1155  putative glutamate synthase, large subunit (domain 1)  25.84 
 
 		 368 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.321075  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3450  glutamate synthase-related protein  30.49 
 
 		 1510 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1703  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.32 
 
 		 1518 aa  73.9  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.625118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0385  glutamate synthase (NADPH)  28.65 
 
 		 376 aa  72.8  0.000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1117  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.77 
 
 		 1468 aa  71.6  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2598  glutamate synthase large subunit  25.36 
 
 		 368 aa  72  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1802  glutamate synthase (ferredoxin)  29.33 
 
 		 1498 aa  70.9  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0512049  normal  0.419037 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4806  glutamine amidotransferase class-II  25.8 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0147  glutamate synthase (ferredoxin)  29.84 
 
 		 1510 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6575  glutamine amidotransferase class-II  26.86 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0505165 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3524  glutamine amidotransferase class-II  26.21 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0234475 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1725  glutamate synthase (NADPH)  25.87 
 
 		 376 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.886544 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2274  glutamate synthase (NADPH)  24 
 
 		 376 aa  66.6  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1299  glutamine amidotransferase, class-II  24.41 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0375941  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5510  glutamine amidotransferase, class-II  24.35 
 
 		 302 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.623211  normal  0.154748 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1870  putative glutamine amidotransferase  29.18 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117624  normal  0.828633 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1938  glutamine amidotransferase class-II  23.37 
 
 		 311 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.210707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1575  glutamine amidotransferase class-II  23.08 
 
 		 316 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0230  amidophosphoribosyltransferase  26.32 
 
 		 463 aa  64.3  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0884272  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5261  glutamine amidotransferase, class-II  24.11 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.228434 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1375  hypothetical protein  27.86 
 
 		 376 aa  63.5  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.157806  normal  0.645032 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1656  glutamine amidotransferase class-II  23.08 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.670859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4893  glutamine amidotransferase, class-II  24.11 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4982  glutamine amidotransferase, class-II  24.11 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0104  hypothetical protein  23.95 
 
 		 375 aa  63.5  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.765688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2387  glutamate synthase (NADPH)  25.39 
 
 		 375 aa  63.2  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1988  Glutamate synthase (ferredoxin)  30 
 
 		 1497 aa  62.8  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0610  Glutamate synthase (ferredoxin)  33.16 
 
 		 1510 aa  62  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0008  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  29.03 
 
 		 607 aa  62.4  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.666294  normal  0.382171 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1357  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  25.81 
 
 		 591 aa  61.6  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03319  glutamate synthase subunit alpha  28.36 
 
 		 1462 aa  62  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.645921  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0983  amidophosphoribosyltransferase  25.4 
 
 		 490 aa  61.6  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.592161  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2854  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  27.96 
 
 		 608 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6008  glutamine amidotransferase class-II  25.44 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362161  decreased coverage  0.00354269 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0468  amidophosphoribosyltransferase  24.17 
 
 		 456 aa  60.5  0.00000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.350158  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1346  glutamine amidotransferase, class-II  22.02 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4338  amidophosphoribosyltransferase  24.44 
 
 		 485 aa  59.7  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4206  amidophosphoribosyltransferase  24.44 
 
 		 485 aa  60.1  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.975393  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0834  glutamate synthase subunit alpha  27.78 
 
 		 1482 aa  60.1  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87862  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5919  glutamine amidotransferase class-II  25.26 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4361  amidophosphoribosyltransferase  24.44 
 
 		 485 aa  59.7  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2599  amidophosphoribosyltransferase  26.17 
 
 		 499 aa  59.7  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0391838  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4407  amidophosphoribosyltransferase  27.83 
 
 		 491 aa  59.7  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4629  amidophosphoribosyltransferase  26 
 
 		 500 aa  59.7  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.691036  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3932  amidophosphoribosyltransferase  27.83 
 
 		 491 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.961822  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3291  glutamine amidotransferase class-II  25.88 
 
 		 301 aa  59.3  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2276  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  29.34 
 
 		 607 aa  59.3  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5773  glutamate synthase subunit alpha  28 
 
 		 1481 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1372  glutamate synthase (NADPH)  25.49 
 
 		 376 aa  59.3  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.244449  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2606  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  26.26 
 
 		 608 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.659057  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0208  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  30.17 
 
 		 605 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4300  amidophosphoribosyltransferase  27.83 
 
 		 491 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.182299  normal  0.0484415 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0390  glutamate synthase subunit alpha  29.35 
 
 		 1481 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2499  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  27.27 
 
 		 305 aa  59.3  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0705172  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66570  glutamate synthase subunit alpha  28 
 
 		 1481 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3728  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  29.05 
 
 		 605 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.71832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1110  amidophosphoribosyltransferase  23.04 
 
 		 447 aa  59.3  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0488  glutamate synthase (ferredoxin)  28.64 
 
 		 1516 aa  58.9  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>