More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0545 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0545  glutamine amidotransferase class-II  100 
 
 		 369 aa  767    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00405824 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1815  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  80.06 
 
 		 364 aa  615  1e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1338  glutamine amidotransferase, class-II  80.06 
 
 		 364 aa  617  1e-175  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.845818 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2361  glutamine amidotransferase class-II  59.83 
 
 		 364 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.595667  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2491  glutamine amidotransferase, class-II  59.44 
 
 		 371 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1753  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  59.56 
 
 		 373 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.150521 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16310  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  54.8 
 
 		 355 aa  426  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000470863  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1236  hypothetical protein  60.18 
 
 		 339 aa  420  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0959  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  55.75 
 
 		 376 aa  421  1e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315043  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0025  glutamine amidotransferase class-II  54.2 
 
 		 365 aa  420  1e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0536  glutamine amidotransferase class-II  56.81 
 
 		 372 aa  419  1e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0522  glutamine amidotransferase, class-II  56.81 
 
 		 395 aa  420  1e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1293  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  54.2 
 
 		 368 aa  417  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303282 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0558  glutamine amidotransferase, class-II  51 
 
 		 374 aa  411  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1130  glutamine amidotransferase, class II  54.31 
 
 		 376 aa  410  1e-113  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_948  glutamine amidotransferase, class II  54.31 
 
 		 376 aa  410  1e-113  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.155092  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0665  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  50.87 
 
 		 350 aa  389  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2026  glutamine amidotransferase, class-II  52.17 
 
 		 359 aa  382  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.805771  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2710  glutamine amidotransferase class-II  47.97 
 
 		 350 aa  373  1e-102  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1690  glutamine amidotransferase, class-II  52.16 
 
 		 349 aa  374  1e-102  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.491949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0780  glutamine amidotransferase, class-II  48.84 
 
 		 350 aa  370  1e-101  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0619068  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0213  glutamine amidotransferase, class-II  48.6 
 
 		 378 aa  366  1e-100  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0197  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  51.3 
 
 		 363 aa  363  2e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.480827  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2136  glutamine amidotransferase, class-II  50 
 
 		 382 aa  358  8e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1300  glutamine amidotransferase class-II  46.94 
 
 		 361 aa  353  2e-96  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1078  glutamine amidotransferase class-II  48.61 
 
 		 363 aa  348  7e-95  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.46258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1092  glutamine amidotransferase class-II  47.22 
 
 		 363 aa  345  5e-94  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1598  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  47.78 
 
 		 363 aa  345  7e-94  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0869  glutamine amidotransferase class-II  47.5 
 
 		 363 aa  345  8.999999999999999e-94  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0521916  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0334  glutamine amidotransferase, class-II  44.48 
 
 		 350 aa  322  9.000000000000001e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892096  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1740  glutamate synthase alpha subunit domain protein  31.56 
 
 		 659 aa  158  1e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.627915  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1885  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  30.25 
 
 		 646 aa  144  2e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.273779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0030  glutamate synthase alpha subunit  32.97 
 
 		 670 aa  137  4e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1812  glutamate synthase alpha subunit  31.07 
 
 		 568 aa  100  3e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000275446 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0830  glutamate synthase alpha subunit  32.2 
 
 		 568 aa  94.7  2e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.990819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  26.13 
 
 		 553 aa  91.3  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2161  hypothetical protein  27.25 
 
 		 368 aa  84.7  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1607  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  28.24 
 
 		 572 aa  84  0.000000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2598  glutamate synthase large subunit  26.29 
 
 		 368 aa  80.5  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1656  glutamine amidotransferase class-II  27.33 
 
 		 311 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.670859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1575  glutamine amidotransferase class-II  27.33 
 
 		 316 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1938  glutamine amidotransferase class-II  28 
 
 		 311 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.210707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1346  glutamine amidotransferase, class-II  28.77 
 
 		 299 aa  75.5  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3524  glutamine amidotransferase class-II  26.94 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0234475 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2499  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  28.21 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0705172  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1299  glutamine amidotransferase, class-II  24.05 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0375941  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3467  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  27.01 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.836717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2944  glutamate synthase, large subunit  25.91 
 
 		 1513 aa  70.1  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0729  glutamate synthase (ferredoxin)  30.21 
 
 		 1507 aa  69.7  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4806  glutamine amidotransferase class-II  27.14 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2274  glutamine amidotransferase, class-II  26.55 
 
 		 306 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0107042 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2583  glutamine amidotransferase, class-II protein  26.55 
 
 		 306 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0230258  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1138  glutamine amidotransferase, class-II  28.64 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.16804 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0484  Glutamate synthase (ferredoxin)  25.95 
 
 		 1505 aa  67.4  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5261  glutamine amidotransferase, class-II  24.77 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.228434 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4810  glutamine amidotransferase class-II  31.25 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.917981  hitchhiker  0.00206329 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2248  glutamine amidotransferase class-II  27.01 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280725 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4893  glutamine amidotransferase, class-II  24.77 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4982  glutamine amidotransferase, class-II  24.77 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4695  glutamine amidotransferase class-II  29.44 
 
 		 299 aa  67  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.903048 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2632  glutamine amidotransferase class-II  28 
 
 		 299 aa  67  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1942  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  26.63 
 
 		 297 aa  67  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.738445 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5749  amidophosphoribosyltransferase  26.42 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1802  glutamate synthase (ferredoxin)  27.47 
 
 		 1498 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0512049  normal  0.419037 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1725  glutamate synthase (NADPH)  25.57 
 
 		 376 aa  65.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.886544 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0610  Glutamate synthase (ferredoxin)  25.25 
 
 		 1510 aa  65.1  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0385  glutamate synthase (NADPH)  26.09 
 
 		 376 aa  64.7  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1703  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.93 
 
 		 1518 aa  64.3  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.625118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0393  glutamate synthase (ferredoxin)  28.65 
 
 		 1507 aa  64.3  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3033  glutamine amidotransferase, class-II  26.15 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6008  glutamine amidotransferase class-II  26.85 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362161  decreased coverage  0.00354269 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1870  putative glutamine amidotransferase  27.98 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117624  normal  0.828633 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5919  glutamine amidotransferase class-II  26.83 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2245  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  30.07 
 
 		 607 aa  62.8  0.000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6575  glutamine amidotransferase class-II  26.07 
 
 		 302 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0505165 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3450  glutamate synthase-related protein  31.09 
 
 		 1510 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0147  glutamate synthase (ferredoxin)  28.64 
 
 		 1510 aa  62.8  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0468  amidophosphoribosyltransferase  25 
 
 		 456 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.350158  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0396  amidophosphoribosyltransferase  24.88 
 
 		 459 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0522  amidophosphoribosyltransferase  23.61 
 
 		 465 aa  62  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2284  Glutamate synthase (ferredoxin)  25.84 
 
 		 1486 aa  61.2  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1155  putative glutamate synthase, large subunit (domain 1)  27.54 
 
 		 368 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.321075  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3291  glutamine amidotransferase class-II  26.29 
 
 		 301 aa  62  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2763  glutamate synthase subunit alpha  28.5 
 
 		 1491 aa  60.8  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0439  amidophosphoribosyltransferase  23.94 
 
 		 459 aa  60.5  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5510  glutamine amidotransferase, class-II  23.72 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.623211  normal  0.154748 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5638  glutamine amidotransferase class-II  25.94 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.52916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1523  amidophosphoribosyltransferase  24.88 
 
 		 459 aa  60.5  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0119394  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0657  glutamate synthase (NADPH) large subunit  23.42 
 
 		 1509 aa  60.1  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0412975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0104  hypothetical protein  25.08 
 
 		 375 aa  60.1  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.765688  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2694  Glutamate synthase (NADH)  28.57 
 
 		 1569 aa  59.7  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0039  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25.41 
 
 		 610 aa  59.7  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0398  amidophosphoribosyltransferase  24.88 
 
 		 480 aa  59.7  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2387  glutamate synthase (NADPH)  24.4 
 
 		 375 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2140  glutamate synthase (ferredoxin)  26.13 
 
 		 1510 aa  59.3  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.697929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_51214  ferredoxin-dependent glutamate synthase, fusion of large and small subunits  26.17 
 
 		 1591 aa  58.5  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0457  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  24.62 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.598323  normal  0.402222 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0265  Glutamate synthase (ferredoxin)  24.56 
 
 		 1487 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.316824 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2711  glutamate synthase (ferredoxin)  23.94 
 
 		 1574 aa  58.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3872  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  27.83 
 
 		 610 aa  58.5  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>