50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2598 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2598  glutamate synthase large subunit  100 
 
 		 368 aa  778    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2161  hypothetical protein  79.08 
 
 		 368 aa  630  1e-179  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1155  putative glutamate synthase, large subunit (domain 1)  63.32 
 
 		 368 aa  508  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.321075  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1725  glutamate synthase (NADPH)  39.39 
 
 		 376 aa  267  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.886544 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0385  glutamate synthase (NADPH)  39.25 
 
 		 376 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2274  glutamate synthase (NADPH)  38.55 
 
 		 376 aa  252  9.000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1372  glutamate synthase (NADPH)  37.47 
 
 		 376 aa  250  3e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.244449  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0104  hypothetical protein  39.03 
 
 		 375 aa  247  3e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.765688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1375  hypothetical protein  39.38 
 
 		 376 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.157806  normal  0.645032 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2387  glutamate synthase (NADPH)  37.61 
 
 		 375 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2361  glutamine amidotransferase class-II  27.12 
 
 		 364 aa  82  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.595667  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1293  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  27.3 
 
 		 368 aa  80.9  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303282 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0545  glutamine amidotransferase class-II  26.29 
 
 		 369 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00405824 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1815  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  25.93 
 
 		 364 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1300  glutamine amidotransferase class-II  24.62 
 
 		 361 aa  79  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1753  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  27.84 
 
 		 373 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.150521 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2026  glutamine amidotransferase, class-II  25.44 
 
 		 359 aa  77  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.805771  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1236  hypothetical protein  25.68 
 
 		 339 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0959  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  25.33 
 
 		 376 aa  74.7  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315043  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16310  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  28.08 
 
 		 355 aa  75.1  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000470863  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_948  glutamine amidotransferase, class II  27.75 
 
 		 376 aa  75.1  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.155092  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1130  glutamine amidotransferase, class II  28.33 
 
 		 376 aa  74.3  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1598  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  24.39 
 
 		 363 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0665  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  25.78 
 
 		 350 aa  73.9  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0522  glutamine amidotransferase, class-II  29.41 
 
 		 395 aa  72.8  0.000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0536  glutamine amidotransferase class-II  29.41 
 
 		 372 aa  72.4  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2136  glutamine amidotransferase, class-II  25.36 
 
 		 382 aa  72  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1338  glutamine amidotransferase, class-II  28.7 
 
 		 364 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.845818 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0197  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  24.58 
 
 		 363 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.480827  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0025  glutamine amidotransferase class-II  27.36 
 
 		 365 aa  72  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1078  glutamine amidotransferase class-II  25.45 
 
 		 363 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.46258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1092  glutamine amidotransferase class-II  24.55 
 
 		 363 aa  70.9  0.00000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0869  glutamine amidotransferase class-II  25 
 
 		 363 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0521916  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0334  glutamine amidotransferase, class-II  24.51 
 
 		 350 aa  69.7  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892096  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2491  glutamine amidotransferase, class-II  28.92 
 
 		 371 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2710  glutamine amidotransferase class-II  23.65 
 
 		 350 aa  67  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0780  glutamine amidotransferase, class-II  27.5 
 
 		 350 aa  67  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0619068  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0213  glutamine amidotransferase, class-II  22.27 
 
 		 378 aa  65.1  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1690  glutamine amidotransferase, class-II  27.5 
 
 		 349 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.491949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0558  glutamine amidotransferase, class-II  21.46 
 
 		 374 aa  56.6  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1885  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  24.76 
 
 		 646 aa  48.9  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.273779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0030  glutamate synthase alpha subunit  24.88 
 
 		 670 aa  48.9  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0468  amidophosphoribosyltransferase  32.5 
 
 		 456 aa  45.4  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.350158  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0729  glutamate synthase (ferredoxin)  23.31 
 
 		 1507 aa  45.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3371  amidophosphoribosyltransferase  22.35 
 
 		 508 aa  44.3  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00440111  normal  0.186489 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4769  amidophosphoribosyltransferase  25 
 
 		 502 aa  44.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.573839  normal  0.111826 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1740  glutamate synthase alpha subunit domain protein  24.65 
 
 		 659 aa  43.9  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.627915  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2226  amidophosphoribosyltransferase  28.02 
 
 		 502 aa  43.9  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.467921  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2736  amidophosphoribosyltransferase  28.02 
 
 		 502 aa  43.5  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0393  glutamate synthase (ferredoxin)  24.4 
 
 		 1507 aa  43.1  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>