More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2736 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4381  amidophosphoribosyltransferase  69.63 
 
 
516 aa  679    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.779329  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3371  amidophosphoribosyltransferase  82.47 
 
 
508 aa  851    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00440111  normal  0.186489 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2300  amidophosphoribosyltransferase  66.67 
 
 
511 aa  682    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.990709  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1976  amidophosphoribosyltransferase  67.59 
 
 
511 aa  685    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.399256  normal  0.224002 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3759  amidophosphoribosyltransferase  78.84 
 
 
500 aa  808    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.041178  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1714  amidophosphoribosyltransferase  66.26 
 
 
511 aa  680    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.227459  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3563  amidophosphoribosyltransferase  66.87 
 
 
510 aa  685    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0876  amidophosphoribosyltransferase  64.61 
 
 
505 aa  647    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.602615  normal  0.0457402 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2438  amidophosphoribosyltransferase  66.67 
 
 
511 aa  682    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.107689  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2299  amidophosphoribosyltransferase  67.94 
 
 
508 aa  696    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.725008  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0762  amidophosphoribosyltransferase  66.67 
 
 
511 aa  682    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2151  amidophosphoribosyltransferase  75.59 
 
 
509 aa  781    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.318494 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2118  amidophosphoribosyltransferase  67.07 
 
 
510 aa  686    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.775097  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1906  amidophosphoribosyltransferase  65 
 
 
506 aa  660    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1656  amidophosphoribosyltransferase  66.26 
 
 
511 aa  680    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0686  amidophosphoribosyltransferase  67.91 
 
 
511 aa  682    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.488002  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1806  amidophosphoribosyltransferase  67.41 
 
 
511 aa  680    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.704264  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4769  amidophosphoribosyltransferase  91.83 
 
 
502 aa  957    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.573839  normal  0.111826 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2683  amidophosphoribosyltransferase  78.84 
 
 
501 aa  822    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1692  amidophosphoribosyltransferase  63.03 
 
 
511 aa  642    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.387172 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1607  amidophosphoribosyltransferase  80.2 
 
 
505 aa  841    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2874  amidophosphoribosyltransferase  66.53 
 
 
516 aa  692    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.352356 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2460  amidophosphoribosyltransferase  68.47 
 
 
510 aa  702    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0352966  normal  0.628087 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0536  amidophosphoribosyltransferase  66.26 
 
 
511 aa  680    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1043  amidophosphoribosyltransferase  64.54 
 
 
512 aa  643    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.603388 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4402  amidophosphoribosyltransferase  66.87 
 
 
510 aa  685    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.333421  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1865  amidophosphoribosyltransferase  66.26 
 
 
511 aa  680    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6835  amidophosphoribosyltransferase  68.53 
 
 
516 aa  694    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.661611  normal  0.513568 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3355  amidophosphoribosyltransferase  66.87 
 
 
510 aa  683    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0220372  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3860  amidophosphoribosyltransferase  66.87 
 
 
510 aa  683    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0778  amidophosphoribosyltransferase  65.74 
 
 
512 aa  647    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000128601  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3965  amidophosphoribosyltransferase  66.87 
 
 
510 aa  685    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146016  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4615  amidophosphoribosyltransferase  66.87 
 
 
510 aa  686    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.257725  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1688  amidophosphoribosyltransferase  76.24 
 
 
505 aa  788    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2130  amidophosphoribosyltransferase  67.61 
 
 
511 aa  682    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.176137  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2226  amidophosphoribosyltransferase  99.8 
 
 
502 aa  1027    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.467921  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1552  amidophosphoribosyltransferase  61.32 
 
 
507 aa  636    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27756  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1863  amidophosphoribosyltransferase  83.47 
 
 
501 aa  869    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.308686  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1092  amidophosphoribosyltransferase  77.6 
 
 
509 aa  816    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2736  amidophosphoribosyltransferase  100 
 
 
502 aa  1028    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3056  amidophosphoribosyltransferase  63.02 
 
 
511 aa  631  1e-179  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1908  amidophosphoribosyltransferase  63.43 
 
 
506 aa  613  9.999999999999999e-175  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.60084 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00031  amidophosphoribosyltransferase  60.08 
 
 
486 aa  605  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.486133  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1153  amidophosphoribosyltransferase  58.75 
 
 
506 aa  604  1.0000000000000001e-171  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0456137  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1331  amidophosphoribosyltransferase  58.71 
 
 
485 aa  602  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00031  amidophosphoribosyltransferase  58.92 
 
 
485 aa  602  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.763757  normal  0.837003 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00031  amidophosphoribosyltransferase  59.87 
 
 
486 aa  602  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0004  amidophosphoribosyltransferase  59.58 
 
 
485 aa  598  1e-170  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.970099  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0808  amidophosphoribosyltransferase  57.86 
 
 
503 aa  599  1e-170  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0004  amidophosphoribosyltransferase  59.24 
 
 
486 aa  599  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.259611  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00031  amidophosphoribosyltransferase  59.54 
 
 
486 aa  598  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.242446  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002879  amidophosphoribosyltransferase  58.53 
 
 
504 aa  598  1e-170  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00031  amidophosphoribosyltransferase  61.55 
 
 
485 aa  601  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03095  amidophosphoribosyltransferase  58.93 
 
 
504 aa  597  1e-169  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00031  amidophosphoribosyltransferase  58.32 
 
 
485 aa  597  1e-169  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.495809  hitchhiker  0.00403524 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1671  amidophosphoribosyltransferase  57.81 
 
 
503 aa  596  1e-169  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.735528  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1080  amidophosphoribosyltransferase  58.05 
 
 
504 aa  595  1e-169  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1267  amidophosphoribosyltransferase  59.79 
 
 
506 aa  597  1e-169  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0479924  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1902  amidophosphoribosyltransferase  58.68 
 
 
501 aa  594  1e-168  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0936  amidophosphoribosyltransferase  60.57 
 
 
511 aa  594  1e-168  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0525  amidophosphoribosyltransferase  58.53 
 
 
504 aa  591  1e-168  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00168895  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34150  amidophosphoribosyltransferase  59.5 
 
 
501 aa  591  1e-168  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2000  amidophosphoribosyltransferase  59.09 
 
 
501 aa  590  1e-167  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.604146  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2489  amidophosphoribosyltransferase  59.26 
 
 
502 aa  588  1e-167  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1534  amidophosphoribosyltransferase  59.3 
 
 
501 aa  590  1e-167  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.609043 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1561  amidophosphoribosyltransferase  58.68 
 
 
501 aa  588  1e-167  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.183865  normal  0.29049 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1668  amidophosphoribosyltransferase  58.56 
 
 
502 aa  588  1e-167  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.416229  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1282  amidophosphoribosyltransferase  58.59 
 
 
511 aa  590  1e-167  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.734228  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2711  amidophosphoribosyltransferase  57.63 
 
 
502 aa  590  1e-167  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.966551  normal  0.266296 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1103  amidophosphoribosyltransferase  59.75 
 
 
511 aa  589  1e-167  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0916  amidophosphoribosyltransferase  56.63 
 
 
504 aa  590  1e-167  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.703004  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1242  amidophosphoribosyltransferase  59.03 
 
 
504 aa  588  1e-167  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.520504  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3761  amidophosphoribosyltransferase  59.09 
 
 
501 aa  589  1e-167  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3811  amidophosphoribosyltransferase  58.35 
 
 
502 aa  587  1e-166  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2025  amidophosphoribosyltransferase  56.74 
 
 
501 aa  585  1e-166  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23920  amidophosphoribosyltransferase  56.74 
 
 
501 aa  587  1e-166  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.444651  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2072  amidophosphoribosyltransferase  59.92 
 
 
504 aa  580  1e-164  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.729582  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1798  amidophosphoribosyltransferase  57.35 
 
 
504 aa  579  1e-164  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.449367  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0355  amidophosphoribosyltransferase  59.05 
 
 
505 aa  581  1e-164  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1609  amidophosphoribosyltransferase  56.52 
 
 
505 aa  578  1e-164  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1535  amidophosphoribosyltransferase  59.05 
 
 
505 aa  581  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3328  amidophosphoribosyltransferase  58.25 
 
 
505 aa  578  1e-164  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1426  amidophosphoribosyltransferase  59.05 
 
 
505 aa  581  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1965  amidophosphoribosyltransferase  57.82 
 
 
504 aa  580  1e-164  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.960535  normal  0.602914 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3798  amidophosphoribosyltransferase  57.09 
 
 
505 aa  576  1.0000000000000001e-163  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1621  amidophosphoribosyltransferase  59.09 
 
 
504 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1374  amidophosphoribosyltransferase  57.03 
 
 
505 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1656  amidophosphoribosyltransferase  58.26 
 
 
504 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00921285  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1259  amidophosphoribosyltransferase  56.94 
 
 
503 aa  568  1e-161  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2980  amidophosphoribosyltransferase  59.09 
 
 
504 aa  571  1e-161  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.470057  normal  0.120272 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2570  amidophosphoribosyltransferase  57.03 
 
 
505 aa  569  1e-161  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2146  amidophosphoribosyltransferase  58.06 
 
 
504 aa  569  1e-161  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2302  amidophosphoribosyltransferase  58.26 
 
 
504 aa  570  1e-161  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2713  amidophosphoribosyltransferase  56.58 
 
 
505 aa  567  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0617498  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2861  amidophosphoribosyltransferase  55.84 
 
 
505 aa  567  1e-160  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.272913  normal  0.276647 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2550  amidophosphoribosyltransferase  56.58 
 
 
505 aa  567  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2592  amidophosphoribosyltransferase  56.58 
 
 
505 aa  567  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.210187  normal  0.565897 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2504  amidophosphoribosyltransferase  56.58 
 
 
505 aa  567  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2604  amidophosphoribosyltransferase  56.58 
 
 
505 aa  567  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.841153 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1344  amidophosphoribosyltransferase  55.05 
 
 
505 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0463785  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>