More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1812 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_0830  glutamate synthase alpha subunit  82.39 
 
 		 568 aa  949    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.990819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1812  glutamate synthase alpha subunit  100 
 
 		 568 aa  1142    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000275446 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  59.36 
 
 		 553 aa  642    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1607  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  55.79 
 
 		 572 aa  605  9.999999999999999e-173  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1740  glutamate synthase alpha subunit domain protein  36.03 
 
 		 659 aa  306  7e-82  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.627915  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1885  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  34.06 
 
 		 646 aa  293  4e-78  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.273779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0030  glutamate synthase alpha subunit  33.64 
 
 		 670 aa  282  9e-75  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16290  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  38.15 
 
 		 245 aa  130  6e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.518041  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0025  glutamine amidotransferase class-II  30.17 
 
 		 365 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16310  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  29.13 
 
 		 355 aa  119  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000470863  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0665  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  28.29 
 
 		 350 aa  118  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0522  glutamine amidotransferase, class-II  27.83 
 
 		 395 aa  118  3e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0536  glutamine amidotransferase class-II  27.83 
 
 		 372 aa  117  5e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2357  glutamate synthase alpha subunit domain protein  38.76 
 
 		 250 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800072  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0562  glutamate synthase alpha subunit  37.04 
 
 		 242 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2361  glutamine amidotransferase class-II  28.33 
 
 		 364 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.595667  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1080  glutamate synthase alpha subunit  31.64 
 
 		 263 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0029  glutamate synthase alpha subunit domain protein  35.68 
 
 		 252 aa  114  5e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0540  glutamate synthase alpha subunit  37 
 
 		 245 aa  114  6e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.800593  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2136  glutamine amidotransferase, class-II  27.75 
 
 		 382 aa  114  6e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0526  glutamate synthase alpha subunit  37 
 
 		 245 aa  114  6e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0867  glutamate synthase alpha subunit  31.25 
 
 		 256 aa  113  9e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0287996  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1289  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  35.62 
 
 		 245 aa  112  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000639589 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1692  glutamate synthase alpha subunit  36.65 
 
 		 247 aa  111  3e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.737414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0544  glutamate synthase alpha subunit domain protein  38.38 
 
 		 281 aa  111  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00693523 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2710  glutamine amidotransferase class-II  29.07 
 
 		 350 aa  110  5e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1596  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  30.86 
 
 		 256 aa  110  6e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1690  glutamine amidotransferase, class-II  32.69 
 
 		 349 aa  109  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.491949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1094  glutamate synthase alpha subunit  29.34 
 
 		 256 aa  109  1e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0558  glutamine amidotransferase, class-II  33.81 
 
 		 374 aa  109  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2491  glutamine amidotransferase, class-II  25.78 
 
 		 371 aa  109  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0332  glutamate synthase alpha subunit  34.72 
 
 		 245 aa  108  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.951103  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0201  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  38.41 
 
 		 240 aa  107  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1302  glutamate synthase alpha subunit  28.31 
 
 		 261 aa  107  6e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1753  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  25.99 
 
 		 373 aa  106  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.150521 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1293  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  25.57 
 
 		 368 aa  106  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303282 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0211  glutamate synthase alpha subunit  36.04 
 
 		 264 aa  106  1e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1339  glutamate synthase alpha subunit  39.59 
 
 		 251 aa  106  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.794654 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1816  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  37.95 
 
 		 251 aa  105  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0997673  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0780  glutamine amidotransferase, class-II  33.01 
 
 		 350 aa  105  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0619068  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1338  glutamine amidotransferase, class-II  26.93 
 
 		 364 aa  105  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.845818 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1300  glutamine amidotransferase class-II  26.82 
 
 		 361 aa  103  7e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1235  hypothetical protein  35 
 
 		 248 aa  102  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2490  glutamate synthase alpha subunit  33.82 
 
 		 248 aa  103  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2024  glutamate synthase alpha subunit  37.04 
 
 		 246 aa  102  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0197  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  26 
 
 		 363 aa  101  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.480827  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1236  hypothetical protein  31.28 
 
 		 339 aa  100  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0663  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  35.29 
 
 		 247 aa  100  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.358325 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1815  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  31.55 
 
 		 364 aa  100  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0545  glutamine amidotransferase class-II  31.07 
 
 		 369 aa  100  6e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00405824 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1752  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  39.49 
 
 		 249 aa  100  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.216628 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0334  glutamine amidotransferase, class-II  33.01 
 
 		 350 aa  99.8  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892096  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1092  glutamine amidotransferase class-II  25.14 
 
 		 363 aa  99  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0782  glutamate synthase, alpha subunit-like  33.99 
 
 		 246 aa  97.8  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00542084  normal  0.210269 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2708  glutamate synthase alpha subunit domain protein  34.62 
 
 		 248 aa  93.2  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.414191  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1598  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  28.22 
 
 		 363 aa  92  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0959  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  25.44 
 
 		 376 aa  90.9  5e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315043  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1130  glutamine amidotransferase, class II  28.14 
 
 		 376 aa  90.5  8e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0869  glutamine amidotransferase class-II  26.62 
 
 		 363 aa  90.1  9e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0521916  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1078  glutamine amidotransferase class-II  29.17 
 
 		 363 aa  90.1  9e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.46258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_948  glutamine amidotransferase, class II  25.15 
 
 		 376 aa  88.6  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.155092  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2026  glutamine amidotransferase, class-II  28.77 
 
 		 359 aa  88.6  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.805771  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0956  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  37.1 
 
 		 256 aa  88.2  3e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1127  hypothetical protein  37.35 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000223973  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_945  glutamate synthase-like protein protein, alpha subunit-like protein  32.41 
 
 		 256 aa  83.2  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0213  glutamine amidotransferase, class-II  24.91 
 
 		 378 aa  83.2  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1503  ferredoxin-dependent glutamate synthase  34.18 
 
 		 1530 aa  69.3  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0084  formylmethanofuran dehydrogenase  38.68 
 
 		 425 aa  68.9  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1575  glutamine amidotransferase class-II  28.06 
 
 		 316 aa  67  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1290  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  34.44 
 
 		 301 aa  66.6  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1656  glutamine amidotransferase class-II  28.06 
 
 		 311 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.670859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1665  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  36.62 
 
 		 269 aa  66.2  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.477479  normal  0.947493 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2343  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  29.95 
 
 		 614 aa  66.2  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0472138  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5749  amidophosphoribosyltransferase  30.04 
 
 		 301 aa  65.9  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0495  formylmethanofuran dehydrogenase  37.96 
 
 		 272 aa  65.9  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.943026  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6575  glutamine amidotransferase class-II  29.51 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0505165 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1938  glutamine amidotransferase class-II  27.67 
 
 		 311 aa  64.7  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.210707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2016  glutamate synthase (NADPH)  35.25 
 
 		 1535 aa  64.3  0.000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1078  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.86 
 
 		 1529 aa  63.9  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19531  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.86 
 
 		 1475 aa  63.9  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3061  amidophosphoribosyltransferase  34.29 
 
 		 629 aa  63.9  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1357  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  26.48 
 
 		 591 aa  63.9  0.000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0730  glutamate synthase, large subunit  35.71 
 
 		 1475 aa  63.5  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0878  Glutamate synthase (ferredoxin)  35.71 
 
 		 1475 aa  63.5  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16921  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.37 
 
 		 1524 aa  63.5  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1098  formylmethanofuran dehydrogenase  38.33 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0342  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  39.34 
 
 		 272 aa  63.5  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1699  glutamine amidotransferase class-II  29.57 
 
 		 296 aa  63.5  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1942  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  25.76 
 
 		 297 aa  63.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.738445 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20710  glutamate synthase (NADH) large subunit  32.28 
 
 		 1524 aa  63.5  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.42786 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1468  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.79 
 
 		 1551 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0563  formylmethanofuran dehydrogenase  38.52 
 
 		 289 aa  63.2  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0495  Glutamate synthase (ferredoxin)  37.19 
 
 		 1517 aa  62.8  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2403  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  30.96 
 
 		 268 aa  62.4  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4535  glutamate synthase subunit alpha  37.19 
 
 		 1517 aa  62.8  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16351  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.78 
 
 		 1531 aa  62.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3405  glutamate synthase subunit alpha  37.19 
 
 		 1486 aa  62.8  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1424  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  40.16 
 
 		 272 aa  62.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.176644  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3558  glutamate synthase subunit alpha  37.19 
 
 		 1486 aa  62.4  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0488  glutamate synthase subunit alpha  37.19 
 
 		 1522 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.690727 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>