More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0655 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_1152  amidophosphoribosyltransferase  90.69 
 
 
494 aa  934    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0655  amidophosphoribosyltransferase  100 
 
 
494 aa  1019    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1130  amidophosphoribosyltransferase  90.69 
 
 
494 aa  934    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0878  glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase  63.06 
 
 
503 aa  628  1e-179  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141495  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1032  amidophosphoribosyltransferase  59.62 
 
 
495 aa  607  9.999999999999999e-173  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0026  amidophosphoribosyltransferase  60.25 
 
 
484 aa  604  1.0000000000000001e-171  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1618  amidophosphoribosyltransferase  60.68 
 
 
506 aa  592  1e-168  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0051  amidophosphoribosyltransferase  58.56 
 
 
479 aa  581  1.0000000000000001e-165  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0327  amidophosphoribosyltransferase  58.28 
 
 
471 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0282  amidophosphoribosyltransferase  58.28 
 
 
471 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0267  amidophosphoribosyltransferase  58.28 
 
 
471 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0270  amidophosphoribosyltransferase  58.28 
 
 
471 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0295  amidophosphoribosyltransferase  58.28 
 
 
471 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.312701  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0368  amidophosphoribosyltransferase  58.28 
 
 
471 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0276  amidophosphoribosyltransferase  58.28 
 
 
471 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4979  amidophosphoribosyltransferase  58.28 
 
 
471 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0324  amidophosphoribosyltransferase  58.06 
 
 
471 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0274  amidophosphoribosyltransferase  58.06 
 
 
471 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0341  amidophosphoribosyltransferase  58.06 
 
 
471 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0724  amidophosphoribosyltransferase  55.86 
 
 
536 aa  561  1e-158  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0141  amidophosphoribosyltransferase  59.28 
 
 
484 aa  550  1e-155  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0260  amidophosphoribosyltransferase  55.53 
 
 
470 aa  544  1e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1136  amidophosphoribosyltransferase  54.35 
 
 
470 aa  529  1e-149  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0398  amidophosphoribosyltransferase  47.93 
 
 
480 aa  449  1e-125  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3894  amidophosphoribosyltransferase  48.16 
 
 
491 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4300  amidophosphoribosyltransferase  49.13 
 
 
491 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.182299  normal  0.0484415 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3932  amidophosphoribosyltransferase  49.13 
 
 
491 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.961822  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2400  amidophosphoribosyltransferase  47.3 
 
 
514 aa  443  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.453817  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4407  amidophosphoribosyltransferase  48.91 
 
 
491 aa  443  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2599  amidophosphoribosyltransferase  49.24 
 
 
499 aa  443  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0391838  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1249  amidophosphoribosyltransferase  47.8 
 
 
488 aa  443  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.917797  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1326  amidophosphoribosyltransferase  45.21 
 
 
468 aa  439  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1939  amidophosphoribosyltransferase  46.78 
 
 
466 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4629  amidophosphoribosyltransferase  46.9 
 
 
500 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.691036  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2329  amidophosphoribosyltransferase  45.43 
 
 
477 aa  436  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.64237  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1636  amidophosphoribosyltransferase  46.34 
 
 
467 aa  433  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1102  amidophosphoribosyltransferase  48.26 
 
 
466 aa  433  1e-120  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1778  hypothetical protein  47.7 
 
 
475 aa  433  1e-120  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000929805  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1153  amidophosphoribosyltransferase  44.7 
 
 
474 aa  433  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1891  amidophosphoribosyltransferase  45.21 
 
 
477 aa  434  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2311  amidophosphoribosyltransferase  47.33 
 
 
501 aa  429  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.672659  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2068  amidophosphoribosyltransferase  45.43 
 
 
474 aa  431  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.286768  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3501  amidophosphoribosyltransferase  46.22 
 
 
509 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2997  amidophosphoribosyltransferase  46.01 
 
 
514 aa  428  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.807987  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0983  amidophosphoribosyltransferase  45.77 
 
 
490 aa  430  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.592161  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0321  amidophosphoribosyltransferase  45.23 
 
 
461 aa  431  1e-119  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0522  amidophosphoribosyltransferase  46.94 
 
 
465 aa  430  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2109  amidophosphoribosyltransferase  45.81 
 
 
475 aa  429  1e-119  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1147  amidophosphoribosyltransferase  47.37 
 
 
478 aa  430  1e-119  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.218005  normal  0.314166 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2702  amidophosphoribosyltransferase  44.67 
 
 
475 aa  426  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0674  amidophosphoribosyltransferase  47.37 
 
 
473 aa  427  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0672  amidophosphoribosyltransferase  47.15 
 
 
473 aa  426  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22120  amidophosphoribosyltransferase  46.25 
 
 
480 aa  425  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.357347  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3487  amidophosphoribosyltransferase  46.74 
 
 
503 aa  424  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.746658  normal  0.621078 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1475  amidophosphoribosyltransferase  45.05 
 
 
472 aa  422  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2064  amidophosphoribosyltransferase  45.8 
 
 
475 aa  422  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1722  amidophosphoribosyltransferase  45.8 
 
 
481 aa  422  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.56305  normal  0.196104 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0334  amidophosphoribosyltransferase  46.8 
 
 
462 aa  421  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.708549  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2452  amidophosphoribosyltransferase  46.43 
 
 
514 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2807  amidophosphoribosyltransferase  45.98 
 
 
462 aa  422  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2184  amidophosphoribosyltransferase  45.85 
 
 
487 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0122  amidophosphoribosyltransferase  46.27 
 
 
467 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0033  amidophosphoribosyltransferase  44.37 
 
 
497 aa  412  1e-114  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0404  amidophosphoribosyltransferase  45.58 
 
 
488 aa  413  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305555  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1632  amidophosphoribosyltransferase  46.21 
 
 
469 aa  414  1e-114  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0413  amidophosphoribosyltransferase  46.48 
 
 
491 aa  414  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.577853 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5556  amidophosphoribosyltransferase  46.15 
 
 
511 aa  412  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2365  amidophosphoribosyltransferase  46.34 
 
 
474 aa  414  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2307  amidophosphoribosyltransferase  45.37 
 
 
467 aa  409  1e-113  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2282  amidophosphoribosyltransferase  46.01 
 
 
503 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.235461  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4621  amidophosphoribosyltransferase  41.16 
 
 
482 aa  411  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.059877  normal  0.48412 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1766  amidophosphoribosyltransferase  45.3 
 
 
488 aa  411  1e-113  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0501857 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0007  amidophosphoribosyltransferase  43.62 
 
 
487 aa  410  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30048  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2072  amidophosphoribosyltransferase  44.07 
 
 
506 aa  410  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2878  amidophosphoribosyltransferase  43.23 
 
 
517 aa  406  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.116336 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2502  amidophosphoribosyltransferase  42.98 
 
 
500 aa  406  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1062  amidophosphoribosyltransferase  44.09 
 
 
486 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.739126  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0265  amidophosphoribosyltransferase  43.52 
 
 
476 aa  408  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4361  amidophosphoribosyltransferase  45.18 
 
 
485 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4178  amidophosphoribosyltransferase  44.16 
 
 
494 aa  405  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4217  amidophosphoribosyltransferase  44.16 
 
 
494 aa  405  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0405  amidophosphoribosyltransferase  43.67 
 
 
493 aa  404  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4571  amidophosphoribosyltransferase  43.14 
 
 
468 aa  403  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.470676  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2017  amidophosphoribosyltransferase  45.79 
 
 
504 aa  402  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2454  amidophosphoribosyltransferase  42.47 
 
 
487 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2047  amidophosphoribosyltransferase  44.87 
 
 
465 aa  403  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.330153 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3516  amidophosphoribosyltransferase  43.18 
 
 
517 aa  404  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2132  amidophosphoribosyltransferase  43.58 
 
 
508 aa  403  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.864953  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1707  amidophosphoribosyltransferase  42.21 
 
 
497 aa  402  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0317953  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0228  amidophosphoribosyltransferase  44.37 
 
 
470 aa  402  1e-111  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000396195  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3212  amidophosphoribosyltransferase  44.03 
 
 
463 aa  403  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.903412  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4338  amidophosphoribosyltransferase  45.18 
 
 
485 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3939  amidophosphoribosyltransferase  42.89 
 
 
499 aa  404  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0731  amidophosphoribosyltransferase  43.63 
 
 
478 aa  404  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1117  amidophosphoribosyltransferase  42.47 
 
 
487 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.981489  normal  0.353735 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1187  amidophosphoribosyltransferase  43.1 
 
 
496 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.44974 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1511  amidophosphoribosyltransferase  43.11 
 
 
466 aa  399  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.409813  normal  0.0292739 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4206  amidophosphoribosyltransferase  45.18 
 
 
485 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.975393  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2293  amidophosphoribosyltransferase  45.57 
 
 
504 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4354  amidophosphoribosyltransferase  45.06 
 
 
484 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.463043 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>