More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2502 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_4640  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  61.58 
 
 
608 aa  703    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.972061  normal  0.284789 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0582  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  58.98 
 
 
607 aa  697    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0623132  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4157  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  61.25 
 
 
608 aa  702    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.717296 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2934  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  59.38 
 
 
608 aa  698    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.729718  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0755  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.54 
 
 
607 aa  662    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.255039  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1164  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  99.83 
 
 
603 aa  1212    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.402042  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1517  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  58.39 
 
 
608 aa  691    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0607297 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4166  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  58.72 
 
 
608 aa  704    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2502  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  100 
 
 
603 aa  1215    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0810967  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2418  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  61.84 
 
 
608 aa  728    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316108  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4553  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  59.54 
 
 
608 aa  691    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.365808 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4418  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  57.5 
 
 
607 aa  681    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.442755  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3643  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  58.48 
 
 
607 aa  704    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.317971  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1293  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  71.45 
 
 
606 aa  852    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.921081  normal  0.297971 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3029  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  57 
 
 
607 aa  666    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6177  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  57.31 
 
 
608 aa  659    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0708  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  56.21 
 
 
612 aa  649    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4910  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  54.93 
 
 
608 aa  644    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2854  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  60.2 
 
 
608 aa  701    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1202  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  60.63 
 
 
607 aa  712    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10337  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3186  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  72.35 
 
 
602 aa  857    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2606  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  59.61 
 
 
608 aa  696    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.659057  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1404  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  57.47 
 
 
608 aa  661    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.247017  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0547  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  58.98 
 
 
607 aa  697    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00123836  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2618  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  59.7 
 
 
608 aa  702    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120627 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2171  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.1 
 
 
608 aa  640    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0535933  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2057  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  58.95 
 
 
608 aa  695    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.776595  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1726  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.92 
 
 
608 aa  655    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.487309  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0008  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.04 
 
 
607 aa  646    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.666294  normal  0.382171 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0727  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  69.46 
 
 
602 aa  828    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1366  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  61.02 
 
 
607 aa  698    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1910  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.09 
 
 
608 aa  659    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0701162  normal  0.896342 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3067  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  57.89 
 
 
607 aa  688    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.82118  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1706  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  58.06 
 
 
607 aa  686    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.80157  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2017  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  95.69 
 
 
603 aa  1131    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.851837  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4068  hypothetical protein  57.83 
 
 
603 aa  648    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.035977  normal  0.145106 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4526  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  61.25 
 
 
608 aa  702    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0697657  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5508  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  61.68 
 
 
608 aa  726    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.301702 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5030  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  55.83 
 
 
608 aa  642    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3375  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  61.68 
 
 
608 aa  723    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1826  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  62.17 
 
 
608 aa  723    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0629136  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1801  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  58.1 
 
 
611 aa  656    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.49786 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0619  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  73.55 
 
 
605 aa  889    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247891  normal  0.396011 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2276  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.93 
 
 
607 aa  624  1e-177  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4598  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.63 
 
 
606 aa  612  9.999999999999999e-175  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.510403  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3455  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  52.21 
 
 
610 aa  601  1e-170  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2453  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  53.38 
 
 
606 aa  594  1e-168  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.633572  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2933  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  50.08 
 
 
609 aa  570  1e-161  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.850684  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1805  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  48.85 
 
 
609 aa  555  1e-157  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0121  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  48.28 
 
 
609 aa  558  1e-157  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000396759  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5409  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  49.11 
 
 
611 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.323982  hitchhiker  0.00848262 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2280  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  47.36 
 
 
615 aa  555  1e-156  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0733562 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0073  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  46.83 
 
 
609 aa  553  1e-156  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.653e-29 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0808  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  49.26 
 
 
609 aa  555  1e-156  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0270  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  49.18 
 
 
609 aa  551  1e-155  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5196  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  48.86 
 
 
611 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.118188  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5427  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  48.78 
 
 
611 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.15944  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5291  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  48.78 
 
 
611 aa  548  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268199  normal  0.456401 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1487  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  50.25 
 
 
609 aa  549  1e-155  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3872  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  48.37 
 
 
610 aa  549  1e-155  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1512  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  48.94 
 
 
609 aa  551  1e-155  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0090  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  47.15 
 
 
609 aa  551  1e-155  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0489544  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3881  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  48.2 
 
 
610 aa  551  1e-155  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0104  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  48.69 
 
 
609 aa  547  1e-154  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000521795  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4602  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  48.71 
 
 
616 aa  545  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2580  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  47.79 
 
 
610 aa  547  1e-154  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2865  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  50.24 
 
 
610 aa  543  1e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03613  D-fructose-6-phosphate amidotransferase  48.05 
 
 
609 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4238  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  48.05 
 
 
609 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4097  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  48.05 
 
 
609 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.2941 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03557  hypothetical protein  48.05 
 
 
609 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4244  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  48.05 
 
 
609 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.517855  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4136  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  48.05 
 
 
609 aa  538  9.999999999999999e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0361576  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4265  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  48.05 
 
 
609 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3944  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  48.05 
 
 
609 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0093  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  48.52 
 
 
609 aa  540  9.999999999999999e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4942  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  46.41 
 
 
610 aa  537  1e-151  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5165  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  47.89 
 
 
609 aa  537  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.212663 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2793  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  49.02 
 
 
609 aa  536  1e-151  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4142  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  48.05 
 
 
609 aa  537  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2741  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  48.69 
 
 
611 aa  536  1e-151  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.214537 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4198  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  47.72 
 
 
611 aa  537  1e-151  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4086  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  48.05 
 
 
609 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2822  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  47 
 
 
610 aa  535  1e-151  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4070  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  48.05 
 
 
609 aa  537  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4192  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  48.05 
 
 
609 aa  537  1e-151  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0011  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  47.88 
 
 
609 aa  538  1e-151  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.855162  normal  0.0514603 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4741  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  47.56 
 
 
609 aa  534  1e-150  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4250  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  47.89 
 
 
609 aa  534  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03884  Glucosamine-fructose-6-phosphate aminotransferase  47.22 
 
 
610 aa  532  1e-150  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51890  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  49.51 
 
 
611 aa  532  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1692  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  46.3 
 
 
617 aa  532  1e-150  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001643  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  47 
 
 
610 aa  532  1e-150  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0244363  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4192  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  47.89 
 
 
609 aa  535  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1536  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  47.23 
 
 
610 aa  533  1e-150  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3920  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  47.56 
 
 
609 aa  533  1e-150  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.121785  normal  0.0336662 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4012  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  47.56 
 
 
609 aa  533  1e-150  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0405163  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4125  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  47.56 
 
 
609 aa  533  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.513895  normal  0.539293 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3639  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  48.14 
 
 
609 aa  534  1e-150  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000255668  normal  0.139839 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2397  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  47.24 
 
 
614 aa  530  1e-149  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>