More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2407 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2407  amidophosphoribosyltransferase  100 
 
 
487 aa  1010    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.848054  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1766  amidophosphoribosyltransferase  52.1 
 
 
488 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0501857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3743  amidophosphoribosyltransferase  51.47 
 
 
466 aa  505  9.999999999999999e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189021 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1511  amidophosphoribosyltransferase  50.62 
 
 
466 aa  503  1e-141  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.409813  normal  0.0292739 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4571  amidophosphoribosyltransferase  50.1 
 
 
468 aa  494  9.999999999999999e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.470676  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1249  amidophosphoribosyltransferase  48.36 
 
 
488 aa  442  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.917797  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1632  amidophosphoribosyltransferase  48.21 
 
 
469 aa  436  1e-121  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0004  amidophosphoribosyltransferase  47.3 
 
 
493 aa  428  1e-118  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.645305  normal  0.0907172 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2365  amidophosphoribosyltransferase  46.95 
 
 
474 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1415  amidophosphoribosyltransferase  48.67 
 
 
472 aa  420  1e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1196  amidophosphoribosyltransferase  48.11 
 
 
472 aa  420  1e-116  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1778  hypothetical protein  45.28 
 
 
475 aa  419  1e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000929805  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1136  amidophosphoribosyltransferase  46.09 
 
 
470 aa  419  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2184  amidophosphoribosyltransferase  45.07 
 
 
487 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0260  amidophosphoribosyltransferase  45.89 
 
 
470 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1326  amidophosphoribosyltransferase  45.81 
 
 
468 aa  414  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1222  amidophosphoribosyltransferase  47.44 
 
 
472 aa  412  1e-114  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.433131  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0282  amidophosphoribosyltransferase  44.64 
 
 
471 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0267  amidophosphoribosyltransferase  44.64 
 
 
471 aa  410  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0270  amidophosphoribosyltransferase  44.64 
 
 
471 aa  410  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1939  amidophosphoribosyltransferase  46.67 
 
 
466 aa  411  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0295  amidophosphoribosyltransferase  44.64 
 
 
471 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.312701  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0296  amidophosphoribosyltransferase  46.06 
 
 
505 aa  410  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3699  amidophosphoribosyltransferase  46.15 
 
 
493 aa  411  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.549743  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0327  amidophosphoribosyltransferase  44.64 
 
 
471 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4979  amidophosphoribosyltransferase  44.64 
 
 
471 aa  410  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5114  amidophosphoribosyltransferase  43.72 
 
 
510 aa  410  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0638191  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0324  amidophosphoribosyltransferase  44.42 
 
 
471 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0341  amidophosphoribosyltransferase  44.42 
 
 
471 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3576  amidophosphoribosyltransferase  45.28 
 
 
517 aa  406  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.538903  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0276  amidophosphoribosyltransferase  44.21 
 
 
471 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4621  amidophosphoribosyltransferase  44.89 
 
 
482 aa  405  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.059877  normal  0.48412 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4541  amidophosphoribosyltransferase  43.99 
 
 
511 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3396  amidophosphoribosyltransferase  45.11 
 
 
492 aa  406  1.0000000000000001e-112  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0368  amidophosphoribosyltransferase  44.42 
 
 
471 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3588  amidophosphoribosyltransferase  46.27 
 
 
503 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.51846 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2109  amidophosphoribosyltransferase  43.37 
 
 
475 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4628  amidophosphoribosyltransferase  43.99 
 
 
511 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1475  amidophosphoribosyltransferase  44.54 
 
 
472 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4924  amidophosphoribosyltransferase  43.99 
 
 
511 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4217  amidophosphoribosyltransferase  45.96 
 
 
494 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7210  amidophosphoribosyltransferase  44.68 
 
 
623 aa  405  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4178  amidophosphoribosyltransferase  45.96 
 
 
494 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1634  amidophosphoribosyltransferase  42.89 
 
 
511 aa  404  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4318  amidophosphoribosyltransferase  44.99 
 
 
496 aa  405  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1636  amidophosphoribosyltransferase  45.71 
 
 
467 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3089  amidophosphoribosyltransferase  44.07 
 
 
515 aa  400  9.999999999999999e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2747  amidophosphoribosyltransferase  45.38 
 
 
484 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0004  amidophosphoribosyltransferase  45.3 
 
 
501 aa  400  9.999999999999999e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0094  amidophosphoribosyltransferase  44.47 
 
 
544 aa  400  9.999999999999999e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0274  amidophosphoribosyltransferase  44.42 
 
 
471 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0983  amidophosphoribosyltransferase  46.55 
 
 
490 aa  401  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.592161  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0731  amidophosphoribosyltransferase  42.95 
 
 
478 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1618  amidophosphoribosyltransferase  43.47 
 
 
506 aa  401  9.999999999999999e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3735  amidophosphoribosyltransferase  43.13 
 
 
558 aa  399  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2072  amidophosphoribosyltransferase  45.09 
 
 
506 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8991  amidophosphoribosyltransferase  44.73 
 
 
478 aa  397  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2702  amidophosphoribosyltransferase  44.52 
 
 
475 aa  397  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4407  amidophosphoribosyltransferase  43.04 
 
 
491 aa  395  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3474  amidophosphoribosyltransferase  42.92 
 
 
563 aa  397  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37880  amidophosphoribosyltransferase  44.84 
 
 
512 aa  396  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.458178 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0674  amidophosphoribosyltransferase  43.24 
 
 
473 aa  396  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0672  amidophosphoribosyltransferase  43.03 
 
 
473 aa  395  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0228  amidophosphoribosyltransferase  44.66 
 
 
470 aa  397  1e-109  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000396195  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0878  glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase  43.71 
 
 
503 aa  395  1e-109  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141495  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0824  amidophosphoribosyltransferase  44.56 
 
 
488 aa  396  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0522  amidophosphoribosyltransferase  42.14 
 
 
465 aa  396  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1052  amidophosphoribosyltransferase  45.51 
 
 
491 aa  392  1e-108  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0900198 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5049  amidophosphoribosyltransferase  44.51 
 
 
534 aa  394  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2908  amidophosphoribosyltransferase  43.22 
 
 
515 aa  395  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.60952  normal  0.814875 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3894  amidophosphoribosyltransferase  43.51 
 
 
491 aa  395  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0404  amidophosphoribosyltransferase  43.35 
 
 
488 aa  393  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305555  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2047  amidophosphoribosyltransferase  42.47 
 
 
465 aa  394  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.330153 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4300  amidophosphoribosyltransferase  42.83 
 
 
491 aa  394  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.182299  normal  0.0484415 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22120  amidophosphoribosyltransferase  44.11 
 
 
480 aa  395  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.357347  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0997  amidophosphoribosyltransferase  45.66 
 
 
482 aa  392  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.421996  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3932  amidophosphoribosyltransferase  42.83 
 
 
491 aa  394  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.961822  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0948  amidophosphoribosyltransferase  45.01 
 
 
525 aa  394  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10823  amidophosphoribosyltransferase  43.35 
 
 
527 aa  394  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.230334 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1891  amidophosphoribosyltransferase  43.13 
 
 
477 aa  390  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2352  amidophosphoribosyltransferase  42.86 
 
 
513 aa  391  1e-107  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.10246  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34090  amidophosphoribosyltransferase  42.15 
 
 
515 aa  389  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.163094 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1871  amidophosphoribosyltransferase  42.37 
 
 
451 aa  390  1e-107  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.10696  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2599  amidophosphoribosyltransferase  42.83 
 
 
499 aa  390  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0391838  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4629  amidophosphoribosyltransferase  42 
 
 
500 aa  391  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.691036  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0309  amidophosphoribosyltransferase  45.03 
 
 
473 aa  389  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3516  amidophosphoribosyltransferase  43.13 
 
 
517 aa  389  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1448  amidophosphoribosyltransferase  43.27 
 
 
474 aa  390  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1153  amidophosphoribosyltransferase  42.65 
 
 
474 aa  390  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4316  amidophosphoribosyltransferase  44.09 
 
 
514 aa  389  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6859  amidophosphoribosyltransferase  44.54 
 
 
525 aa  390  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4041  amidophosphoribosyltransferase  43.57 
 
 
514 aa  390  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.181918  normal  0.175272 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3343  amidophosphoribosyltransferase  44.23 
 
 
502 aa  389  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2329  amidophosphoribosyltransferase  43.34 
 
 
477 aa  391  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.64237  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0292  amidophosphoribosyltransferase  43.62 
 
 
459 aa  385  1e-106  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.95663  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0300  amidophosphoribosyltransferase  43.84 
 
 
498 aa  388  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4758  amidophosphoribosyltransferase  42.43 
 
 
512 aa  386  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3044  amidophosphoribosyltransferase  42.24 
 
 
478 aa  388  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2179  amidophosphoribosyltransferase  42.34 
 
 
462 aa  386  1e-106  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2299  amidophosphoribosyltransferase  44.52 
 
 
465 aa  386  1e-106  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.038411 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>