More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1339 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1339  glutamate synthase alpha subunit  100 
 
 
251 aa  490  1e-137  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.794654 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1816  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  69.32 
 
 
251 aa  349  2e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0997673  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0544  glutamate synthase alpha subunit domain protein  65.4 
 
 
281 aa  330  9e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00693523 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2490  glutamate synthase alpha subunit  56.61 
 
 
248 aa  258  5.0000000000000005e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1235  hypothetical protein  54.13 
 
 
248 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0562  glutamate synthase alpha subunit  51.45 
 
 
242 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2024  glutamate synthase alpha subunit  58.02 
 
 
246 aa  253  2.0000000000000002e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1752  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  53.72 
 
 
249 aa  251  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.216628 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16290  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  54.77 
 
 
245 aa  249  3e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.518041  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0029  glutamate synthase alpha subunit domain protein  50 
 
 
252 aa  244  6.999999999999999e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2357  glutamate synthase alpha subunit domain protein  49.39 
 
 
250 aa  241  6e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800072  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0540  glutamate synthase alpha subunit  50.62 
 
 
245 aa  241  1e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.800593  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0526  glutamate synthase alpha subunit  50.62 
 
 
245 aa  241  1e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_945  glutamate synthase-like protein protein, alpha subunit-like protein  49.8 
 
 
256 aa  225  6e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1127  hypothetical protein  49.39 
 
 
256 aa  222  4.9999999999999996e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000223973  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0956  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  48.98 
 
 
256 aa  221  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1289  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  47.93 
 
 
245 aa  220  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000639589 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0782  glutamate synthase, alpha subunit-like  45.9 
 
 
246 aa  216  2e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00542084  normal  0.210269 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2708  glutamate synthase alpha subunit domain protein  48.59 
 
 
248 aa  215  4e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.414191  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0663  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  46.94 
 
 
247 aa  211  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.358325 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0332  glutamate synthase alpha subunit  45.16 
 
 
245 aa  211  1e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.951103  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1080  glutamate synthase alpha subunit  45.16 
 
 
263 aa  210  1e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0867  glutamate synthase alpha subunit  45.16 
 
 
256 aa  209  2e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0287996  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0201  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  45.71 
 
 
240 aa  210  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1596  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  45.16 
 
 
256 aa  209  3e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0211  glutamate synthase alpha subunit  47.2 
 
 
264 aa  208  7e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1302  glutamate synthase alpha subunit  41.83 
 
 
261 aa  207  1e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1692  glutamate synthase alpha subunit  45.27 
 
 
247 aa  206  3e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.737414  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1094  glutamate synthase alpha subunit  41.04 
 
 
256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0030  glutamate synthase alpha subunit  42.44 
 
 
670 aa  147  1.0000000000000001e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1740  glutamate synthase alpha subunit domain protein  39.8 
 
 
659 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.627915  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1885  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  39.56 
 
 
646 aa  120  1.9999999999999998e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.273779  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1812  glutamate synthase alpha subunit  39.59 
 
 
568 aa  106  3e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000275446 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1607  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  41.8 
 
 
572 aa  107  3e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0830  glutamate synthase alpha subunit  37.38 
 
 
568 aa  105  7e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.990819  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  40.22 
 
 
553 aa  95.9  5e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1370  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.7 
 
 
794 aa  89  7e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1723  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.86 
 
 
777 aa  83.6  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3072  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.65 
 
 
1527 aa  83.2  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.191791  hitchhiker  0.00286701 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1982  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.72 
 
 
1521 aa  82.4  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.349695  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1377  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.26 
 
 
793 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.118947  normal  0.859258 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1078  glutamate synthase (NADH) large subunit  32.74 
 
 
1513 aa  80.5  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.706498  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2276  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.75 
 
 
776 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5066  glutamate synthase (NADH) large subunit  29.96 
 
 
1527 aa  75.5  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5154  glutamate synthase (NADH) large subunit  29.96 
 
 
1527 aa  75.5  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.631687 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20710  glutamate synthase (NADH) large subunit  31.72 
 
 
1524 aa  74.7  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.42786 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5445  glutamate synthase (NADH) large subunit  30.11 
 
 
1536 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3022  glutamate synthase (NADH) large subunit  28.7 
 
 
1519 aa  73.2  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5702  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.34 
 
 
1550 aa  72.4  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28040  glutamate synthase (NADH) large subunit  32.55 
 
 
1527 aa  72.4  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.723113  normal  0.697076 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3782  Glutamate synthase (ferredoxin)  33.14 
 
 
1554 aa  72.4  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.376942  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2961  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.99 
 
 
1536 aa  72  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.495295  normal  0.583434 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3016  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.95 
 
 
1524 aa  72  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2389  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.25 
 
 
777 aa  71.2  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1937  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.23 
 
 
1533 aa  70.5  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3060  glutamate synthase (NADH) large subunit  29.86 
 
 
1518 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3593  glutamate synthase (ferredoxin)  28.8 
 
 
1514 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.544233  normal  0.0352812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3044  glutamate synthase (NADH) large subunit  29.86 
 
 
1518 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.417373  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5920  glutamate synthase alpha subunit  29.44 
 
 
232 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.755435  normal  0.413716 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3103  glutamate synthase (NADH) large subunit  29.86 
 
 
1518 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.238876  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13895  ferredoxin-dependent glutamate synthase [NADPH] large subunit gltB  30.14 
 
 
1527 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1458  glutamate synthase  30.37 
 
 
1508 aa  70.5  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0475565  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1219  Glutamate synthase (ferredoxin)  32.57 
 
 
1525 aa  70.1  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.589961  normal  0.962678 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1487  glutamate synthase, large subunit  31.89 
 
 
1465 aa  69.7  0.00000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0194294  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1503  ferredoxin-dependent glutamate synthase  34.23 
 
 
1530 aa  69.3  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0529  Glutamate synthase (ferredoxin)  36.31 
 
 
1474 aa  69.3  0.00000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.41827  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0890  glutamate synthase (ferredoxin)  32.53 
 
 
1536 aa  69.7  0.00000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00390315  decreased coverage  0.000127994 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2600  glutamate synthase, alpha subunit-like  34.68 
 
 
771 aa  69.3  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2822  glutamate synthase (ferredoxin)  28.34 
 
 
1518 aa  69.3  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.857674 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3730  Glutamate synthase (ferredoxin)  32.93 
 
 
1554 aa  68.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1173  glutamate synthase (NADH) large subunit  28 
 
 
1520 aa  68.6  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5693  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.49 
 
 
1512 aa  68.6  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2866  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.33 
 
 
1519 aa  68.2  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.166773  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0107  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.45 
 
 
1535 aa  67.8  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1952  glutamate synthase, large subunit  28.97 
 
 
1530 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00928  glutamate synthase, large subunit  29.91 
 
 
1516 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0458  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  26.76 
 
 
230 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.951315  normal  0.387952 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004466  glutamate synthase [NADPH] large chain  29.91 
 
 
1516 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2500  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  29.44 
 
 
225 aa  67.4  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0493584  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1604  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.59 
 
 
1468 aa  66.2  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2562  glutamate synthase, large subunit  28.5 
 
 
1515 aa  66.2  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1157  glutamate synthase alpha subunit domain protein  29.63 
 
 
381 aa  66.2  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000112739  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16351  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30.3 
 
 
1531 aa  66.2  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16921  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.09 
 
 
1524 aa  65.9  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3166  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.25 
 
 
1516 aa  65.5  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.563815  normal  0.707717 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3213  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.77 
 
 
1542 aa  65.5  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2016  glutamate synthase (NADPH)  31.93 
 
 
1535 aa  65.5  0.0000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1176  glutamate synthase (NADPH) large subunit  33.8 
 
 
1479 aa  65.1  0.0000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1350  Glutamate synthase (ferredoxin)  26.95 
 
 
1527 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000183365 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0168  glutamate synthase alpha subunit  27.27 
 
 
229 aa  64.7  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0118  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.05 
 
 
1537 aa  65.1  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.750611  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1468  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.98 
 
 
1551 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0502  glutamate synthase (ferredoxin)  28.44 
 
 
1533 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.154267  normal  0.477392 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1700  glutamate synthase alpha subunit domain protein  28.3 
 
 
236 aa  64.3  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0383  glutamate synthase alpha subunit domain protein  31.82 
 
 
635 aa  63.9  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3807  Glutamate synthase (ferredoxin)  27.93 
 
 
1502 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.344591  hitchhiker  0.00201054 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0526  Glutamate synthase (ferredoxin)  27.85 
 
 
1548 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.801021  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1078  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.01 
 
 
1529 aa  63.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19531  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.01 
 
 
1475 aa  63.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2949  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.99 
 
 
1501 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341665  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>