96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0663 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0663  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  100 
 
 		 247 aa  502  1e-141  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.358325 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0332  glutamate synthase alpha subunit  69.51 
 
 		 245 aa  350  8.999999999999999e-96  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.951103  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1692  glutamate synthase alpha subunit  63.31 
 
 		 247 aa  330  2e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.737414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2708  glutamate synthase alpha subunit domain protein  65.73 
 
 		 248 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.414191  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0782  glutamate synthase, alpha subunit-like  59.92 
 
 		 246 aa  321  7e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00542084  normal  0.210269 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1596  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  53.36 
 
 		 256 aa  268  4e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0867  glutamate synthase alpha subunit  52.96 
 
 		 256 aa  267  1e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0287996  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1080  glutamate synthase alpha subunit  52.57 
 
 		 263 aa  267  1e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1094  glutamate synthase alpha subunit  51.78 
 
 		 256 aa  263  3e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1302  glutamate synthase alpha subunit  51.78 
 
 		 261 aa  254  9e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0526  glutamate synthase alpha subunit  51.02 
 
 		 245 aa  252  3e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0540  glutamate synthase alpha subunit  51.02 
 
 		 245 aa  252  3e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.800593  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1816  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  45.75 
 
 		 251 aa  224  7e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0997673  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2024  glutamate synthase alpha subunit  46.94 
 
 		 246 aa  222  4e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1235  hypothetical protein  44.9 
 
 		 248 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1752  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  44.9 
 
 		 249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.216628 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0562  glutamate synthase alpha subunit  43.85 
 
 		 242 aa  211  5.999999999999999e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1339  glutamate synthase alpha subunit  46.94 
 
 		 251 aa  211  1e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.794654 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0544  glutamate synthase alpha subunit domain protein  44.36 
 
 		 281 aa  205  5e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00693523 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2490  glutamate synthase alpha subunit  45.9 
 
 		 248 aa  204  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0201  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  44.44 
 
 		 240 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16290  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  41.22 
 
 		 245 aa  196  3e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.518041  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2357  glutamate synthase alpha subunit domain protein  42.57 
 
 		 250 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800072  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0956  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  42.8 
 
 		 256 aa  194  1e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0029  glutamate synthase alpha subunit domain protein  43.32 
 
 		 252 aa  194  1e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0211  glutamate synthase alpha subunit  42.74 
 
 		 264 aa  192  3e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1289  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  39.09 
 
 		 245 aa  189  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000639589 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_945  glutamate synthase-like protein protein, alpha subunit-like protein  40.65 
 
 		 256 aa  189  5e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1127  hypothetical protein  40.65 
 
 		 256 aa  186  3e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000223973  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0030  glutamate synthase alpha subunit  38.31 
 
 		 670 aa  136  3.0000000000000003e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1740  glutamate synthase alpha subunit domain protein  38.27 
 
 		 659 aa  123  2e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.627915  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1885  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  37.31 
 
 		 646 aa  118  9e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.273779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1812  glutamate synthase alpha subunit  35.29 
 
 		 568 aa  100  2e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000275446 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0830  glutamate synthase alpha subunit  37.29 
 
 		 568 aa  99  7e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.990819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  30.58 
 
 		 553 aa  95.9  5e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1607  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  35.75 
 
 		 572 aa  93.6  3e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0102  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.96 
 
 		 777 aa  69.7  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1370  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.8 
 
 		 794 aa  67  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2389  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.68 
 
 		 777 aa  66.6  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0383  glutamate synthase alpha subunit domain protein  29.05 
 
 		 635 aa  62.4  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2276  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.58 
 
 		 776 aa  61.2  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1377  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.62 
 
 		 793 aa  60.8  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.118947  normal  0.859258 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2159  glutamate synthase alpha subunit  30.53 
 
 		 771 aa  60.1  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.681462  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1665  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  26.39 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.477479  normal  0.947493 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1663  formylmethanofuran dehydrogenase  34.01 
 
 		 424 aa  56.6  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1700  glutamate synthase alpha subunit domain protein  27.6 
 
 		 236 aa  55.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2600  glutamate synthase, alpha subunit-like  29.41 
 
 		 771 aa  53.9  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1290  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  30.56 
 
 		 301 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1098  formylmethanofuran dehydrogenase  33.62 
 
 		 257 aa  52.8  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5920  glutamate synthase alpha subunit  24.34 
 
 		 232 aa  52.8  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.755435  normal  0.413716 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2500  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  26.24 
 
 		 225 aa  52.8  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0493584  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2233  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  33.08 
 
 		 304 aa  52.4  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.0399291 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1442  formylmethanofuran dehydrogenase  27.8 
 
 		 294 aa  50.1  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.717791  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3292  glutamate synthase alpha subunit  29.05 
 
 		 228 aa  49.3  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0563  formylmethanofuran dehydrogenase  30.63 
 
 		 289 aa  48.9  0.00008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1723  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.19 
 
 		 777 aa  48.9  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2112  formylmethanofuran dehydrogenase  37.25 
 
 		 254 aa  48.1  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0342  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  32.85 
 
 		 272 aa  48.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1450  formylmethanofuran dehydrogenase  31.29 
 
 		 415 aa  48.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5639  glutamate synthase alpha subunit domain protein  28.08 
 
 		 228 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.55547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1424  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  32.12 
 
 		 272 aa  46.6  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.176644  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1531  formylmethanofuran dehydrogenase  30.61 
 
 		 415 aa  46.6  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000509371 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3213  Glutamate synthase (ferredoxin)  27.04 
 
 		 1542 aa  46.6  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0381  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  30.61 
 
 		 415 aa  46.6  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5750  formyl-methanofuran dehydrogenase  27.59 
 
 		 228 aa  46.2  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1083  glutamate synthase alpha subunit  30.19 
 
 		 320 aa  46.6  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.386486  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1219  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.82 
 
 		 1525 aa  46.2  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.589961  normal  0.962678 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0529  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.56 
 
 		 1474 aa  45.8  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.41827  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4809  glutamate synthase alpha subunit  25.79 
 
 		 229 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.453145  hitchhiker  0.00411559 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0246  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  25.36 
 
 		 266 aa  45.8  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.314224 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0525  tungsten formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C-like  38.33 
 
 		 295 aa  45.8  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.618523  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1069  glutamate synthase alpha subunit  30.19 
 
 		 312 aa  45.4  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6007  glutamate synthase alpha subunit  28.11 
 
 		 228 aa  45.4  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.607641  decreased coverage  0.00322278 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1503  ferredoxin-dependent glutamate synthase  25.14 
 
 		 1530 aa  45.4  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1189  glutamate synthase alpha subunit  30.22 
 
 		 255 aa  45.4  0.0009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0495  formylmethanofuran dehydrogenase  27.56 
 
 		 272 aa  45.1  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.943026  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6576  glutamate synthase alpha subunit domain protein  26.47 
 
 		 228 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.026671 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1939  glutamate synthase alpha subunit domain protein  27.54 
 
 		 229 aa  44.7  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.490233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0618  formylmethanofuran dehydrogenase  27.71 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.031501  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1982  Glutamate synthase (ferredoxin)  27.04 
 
 		 1521 aa  44.3  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.349695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1157  glutamate synthase alpha subunit domain protein  29.32 
 
 		 381 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000112739  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2857  formylmethanofurane dehydrogenase subunit, putative  29.22 
 
 		 270 aa  44.3  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000000505673  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20710  glutamate synthase (NADH) large subunit  26.2 
 
 		 1524 aa  44.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.42786 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1657  glutamate synthase alpha subunit  27.54 
 
 		 229 aa  44.3  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0168  glutamate synthase alpha subunit  24 
 
 		 229 aa  44.3  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0875  formylmethanofuran dehydrogenase  25.95 
 
 		 266 aa  43.5  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.118005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0084  formylmethanofuran dehydrogenase  27.56 
 
 		 425 aa  43.5  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1607  tungsten containing formylmethanofruran dehydrogenase subunit C-related protein  29.46 
 
 		 313 aa  43.5  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0326  glutamate synthase (ferredoxin)  28.3 
 
 		 1533 aa  43.5  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.127491  normal  0.144966 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28040  glutamate synthase (NADH) large subunit  25.62 
 
 		 1527 aa  42.7  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.723113  normal  0.697076 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2217  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.29 
 
 		 1516 aa  42.4  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0878  glutamate synthase alpha subunit  31.03 
 
 		 312 aa  42.4  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.225814  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4805  glutamate synthase alpha subunit domain protein  29.84 
 
 		 247 aa  42  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2016  glutamate synthase (NADPH)  26.97 
 
 		 1535 aa  42.4  0.008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1574  glutamate synthase alpha subunit domain protein  27.54 
 
 		 229 aa  42  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16351  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.01 
 
 		 1531 aa  42  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>