99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1094 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_1094  glutamate synthase alpha subunit  100 
 
 
256 aa  518  1e-146  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1596  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  82.03 
 
 
256 aa  442  1e-123  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1080  glutamate synthase alpha subunit  82.42 
 
 
263 aa  441  1e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0867  glutamate synthase alpha subunit  80.86 
 
 
256 aa  436  1e-121  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0287996  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1302  glutamate synthase alpha subunit  69.92 
 
 
261 aa  362  3e-99  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0663  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  51.78 
 
 
247 aa  263  3e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.358325 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0782  glutamate synthase, alpha subunit-like  51.98 
 
 
246 aa  261  6e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00542084  normal  0.210269 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1692  glutamate synthase alpha subunit  47.24 
 
 
247 aa  259  3e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.737414  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0332  glutamate synthase alpha subunit  49 
 
 
245 aa  252  5.000000000000001e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.951103  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0526  glutamate synthase alpha subunit  47.79 
 
 
245 aa  248  9e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0540  glutamate synthase alpha subunit  47.79 
 
 
245 aa  248  9e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.800593  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2708  glutamate synthase alpha subunit domain protein  45.63 
 
 
248 aa  234  8e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.414191  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1816  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  47.04 
 
 
251 aa  232  6e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0997673  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2024  glutamate synthase alpha subunit  44 
 
 
246 aa  223  3e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2357  glutamate synthase alpha subunit domain protein  45.63 
 
 
250 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800072  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0201  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  46.15 
 
 
240 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1752  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  44.84 
 
 
249 aa  218  1e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.216628 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1235  hypothetical protein  42.13 
 
 
248 aa  210  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0029  glutamate synthase alpha subunit domain protein  47.2 
 
 
252 aa  210  2e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0562  glutamate synthase alpha subunit  46.96 
 
 
242 aa  209  3e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1127  hypothetical protein  46.72 
 
 
256 aa  209  5e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000223973  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_945  glutamate synthase-like protein protein, alpha subunit-like protein  45.42 
 
 
256 aa  206  2e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0956  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  45.83 
 
 
256 aa  205  6e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2490  glutamate synthase alpha subunit  45.2 
 
 
248 aa  202  4e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0211  glutamate synthase alpha subunit  42.86 
 
 
264 aa  199  3e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16290  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  41.5 
 
 
245 aa  198  6e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.518041  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0544  glutamate synthase alpha subunit domain protein  41.15 
 
 
281 aa  198  6e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00693523 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1339  glutamate synthase alpha subunit  41.04 
 
 
251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.794654 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1289  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  38.46 
 
 
245 aa  186  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000639589 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0030  glutamate synthase alpha subunit  32.86 
 
 
670 aa  150  3e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1740  glutamate synthase alpha subunit domain protein  36.55 
 
 
659 aa  119  6e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.627915  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1885  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  35.18 
 
 
646 aa  113  4.0000000000000004e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.273779  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0830  glutamate synthase alpha subunit  29.06 
 
 
568 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.990819  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1812  glutamate synthase alpha subunit  29.34 
 
 
568 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000275446 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  31.6 
 
 
553 aa  107  1e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1607  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  32.34 
 
 
572 aa  100  3e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2600  glutamate synthase, alpha subunit-like  30 
 
 
771 aa  65.9  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2159  glutamate synthase alpha subunit  27.38 
 
 
771 aa  65.5  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.681462  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1723  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.67 
 
 
777 aa  60.5  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2389  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.13 
 
 
777 aa  59.7  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0383  glutamate synthase alpha subunit domain protein  30.87 
 
 
635 aa  59.7  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1157  glutamate synthase alpha subunit domain protein  25.14 
 
 
381 aa  59.3  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000112739  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0102  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.33 
 
 
777 aa  58.9  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2276  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.63 
 
 
776 aa  57.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1377  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.99 
 
 
793 aa  57.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.118947  normal  0.859258 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3292  glutamate synthase alpha subunit  27.7 
 
 
228 aa  57  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0168  glutamate synthase alpha subunit  25.34 
 
 
229 aa  55.8  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1370  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.43 
 
 
794 aa  55.8  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1663  formylmethanofuran dehydrogenase  31.33 
 
 
424 aa  54.7  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6576  glutamate synthase alpha subunit domain protein  25.82 
 
 
228 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.026671 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1442  formylmethanofuran dehydrogenase  32.1 
 
 
294 aa  53.5  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.717791  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5639  glutamate synthase alpha subunit domain protein  24.88 
 
 
228 aa  52.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.55547  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2464  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  28.49 
 
 
281 aa  51.6  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.109296 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0618  formylmethanofuran dehydrogenase  29.33 
 
 
268 aa  52  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.031501  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20710  glutamate synthase (NADH) large subunit  24.59 
 
 
1524 aa  50.8  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.42786 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1345  glutamate synthase, alpha subunit-like  24.7 
 
 
227 aa  50.8  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2112  formylmethanofuran dehydrogenase  33.1 
 
 
254 aa  50.8  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2275  glutamate synthase, alpha subunit, C-terminal  25.59 
 
 
227 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.225316  hitchhiker  0.00959584 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2584  hypothetical protein  24.53 
 
 
227 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0278158  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6007  glutamate synthase alpha subunit  24.53 
 
 
228 aa  48.9  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.607641  decreased coverage  0.00322278 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2857  formylmethanofurane dehydrogenase subunit, putative  29.17 
 
 
270 aa  48.1  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000000505673  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1098  formylmethanofuran dehydrogenase  29.27 
 
 
257 aa  48.1  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1069  glutamate synthase alpha subunit  31.78 
 
 
312 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1700  glutamate synthase alpha subunit domain protein  23.43 
 
 
236 aa  47.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1607  tungsten containing formylmethanofruran dehydrogenase subunit C-related protein  32.71 
 
 
313 aa  47.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5750  formyl-methanofuran dehydrogenase  24.29 
 
 
228 aa  47  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3523  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  25.47 
 
 
242 aa  46.6  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0202692 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4805  glutamate synthase alpha subunit domain protein  25.25 
 
 
247 aa  46.6  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1665  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  27.41 
 
 
269 aa  45.8  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.477479  normal  0.947493 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5511  glutamate synthase alpha subunit  29.59 
 
 
228 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.21487 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0084  formylmethanofuran dehydrogenase  30.89 
 
 
425 aa  45.4  0.0008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1189  glutamate synthase alpha subunit  30.43 
 
 
255 aa  45.4  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0370  formylmethanofuran dehydrogenase  33.83 
 
 
266 aa  45.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1290  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  26.21 
 
 
301 aa  44.7  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4809  glutamate synthase alpha subunit  22.09 
 
 
229 aa  44.7  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.453145  hitchhiker  0.00411559 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5773  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  31.3 
 
 
265 aa  44.7  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14713  normal  0.931253 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1298  glutamate synthase alpha subunit  22.29 
 
 
227 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.186101  normal  0.822119 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1450  formylmethanofuran dehydrogenase  30.6 
 
 
415 aa  45.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2500  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  23.33 
 
 
225 aa  44.3  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0493584  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0342  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  30.91 
 
 
272 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5262  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  28.57 
 
 
238 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.221211 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1424  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  30.91 
 
 
272 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.176644  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1083  glutamate synthase alpha subunit  30.43 
 
 
320 aa  44.7  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.386486  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0495  formylmethanofuran dehydrogenase  28.81 
 
 
272 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.943026  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0201  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  26.35 
 
 
307 aa  43.9  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0127762  normal  0.0655916 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3032  glutamate synthase alpha subunit  24.02 
 
 
228 aa  43.5  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.54309 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4894  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  27.55 
 
 
238 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4983  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  27.55 
 
 
238 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0878  glutamate synthase alpha subunit  30.84 
 
 
312 aa  43.5  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.225814  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0458  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  22.83 
 
 
230 aa  43.9  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.951315  normal  0.387952 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1869  putative glutamate synthase  22.7 
 
 
225 aa  43.1  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.310557  normal  0.791624 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3466  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  31.25 
 
 
224 aa  43.1  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.201288  normal  0.713984 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6507  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  29.36 
 
 
286 aa  42.7  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0305137 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1219  Glutamate synthase (ferredoxin)  22.9 
 
 
1525 aa  43.1  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.589961  normal  0.962678 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0563  formylmethanofuran dehydrogenase  30.18 
 
 
289 aa  42.4  0.006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2249  glutamate synthase alpha subunit  29 
 
 
224 aa  42.4  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.191415 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5920  glutamate synthase alpha subunit  24.42 
 
 
232 aa  42.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.755435  normal  0.413716 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5932  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  24.82 
 
 
274 aa  42.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0388185  normal  0.0470213 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2233  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  28.36 
 
 
304 aa  42  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.0399291 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>