204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1424 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1424  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  100 
 
 		 272 aa  534  1e-151  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.176644  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0342  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  95.59 
 
 		 272 aa  518  1e-146  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0495  formylmethanofuran dehydrogenase  93.75 
 
 		 272 aa  504  9.999999999999999e-143  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.943026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0563  formylmethanofuran dehydrogenase  73.53 
 
 		 289 aa  408  1e-113  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0618  formylmethanofuran dehydrogenase  41.3 
 
 		 268 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.031501  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1442  formylmethanofuran dehydrogenase  45.88 
 
 		 294 aa  195  5.000000000000001e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.717791  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1990  formylmethanofuran dehydrogenase  42.15 
 
 		 266 aa  194  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.114316  normal  0.184502 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0875  formylmethanofuran dehydrogenase  40.61 
 
 		 266 aa  191  1e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.118005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0084  formylmethanofuran dehydrogenase  40.7 
 
 		 425 aa  190  2e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1290  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  41.09 
 
 		 301 aa  186  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1663  formylmethanofuran dehydrogenase  39.93 
 
 		 424 aa  186  4e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1450  formylmethanofuran dehydrogenase  40.65 
 
 		 415 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0370  formylmethanofuran dehydrogenase  38.85 
 
 		 266 aa  180  2e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2233  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  40.87 
 
 		 304 aa  179  4e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.0399291 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0201  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  37.45 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0127762  normal  0.0655916 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1531  formylmethanofuran dehydrogenase  40.29 
 
 		 415 aa  176  3e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000509371 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0381  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  40.65 
 
 		 415 aa  175  7e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1981  formylmethanofuran dehydrogenase  41.15 
 
 		 332 aa  171  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.372116 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0246  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  37.31 
 
 		 266 aa  171  1e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.314224 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1473  formylmethanofuran dehydrogenase  39.02 
 
 		 275 aa  170  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.143119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1098  formylmethanofuran dehydrogenase  39.55 
 
 		 257 aa  170  3e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0283  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  39.27 
 
 		 269 aa  160  3e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.363907  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2112  formylmethanofuran dehydrogenase  37.12 
 
 		 254 aa  152  7e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1189  glutamate synthase alpha subunit  32.94 
 
 		 255 aa  138  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2857  formylmethanofurane dehydrogenase subunit, putative  33.18 
 
 		 270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000000505673  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0575  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  34.08 
 
 		 256 aa  126  3e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00575915  decreased coverage  0.000443842 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5932  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  30.94 
 
 		 274 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0388185  normal  0.0470213 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2464  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  27.65 
 
 		 281 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.109296 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1665  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  31.73 
 
 		 269 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.477479  normal  0.947493 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6507  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  28.77 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0305137 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0022  formylmethanofuran dehydrogenase  30.14 
 
 		 272 aa  106  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3133  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  30.46 
 
 		 281 aa  100  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2626  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  26.03 
 
 		 269 aa  98.2  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2403  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  26.87 
 
 		 268 aa  96.7  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3064  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  27.4 
 
 		 276 aa  97.1  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1775  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  27.65 
 
 		 265 aa  85.9  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  0.875805 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1793  glutamate synthase alpha subunit  27.2 
 
 		 267 aa  83.2  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0607708  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0523  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  29.88 
 
 		 264 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300278  normal  0.650549 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2159  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  27.65 
 
 		 265 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0901303 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1824  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  26.89 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5773  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  26.18 
 
 		 265 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14713  normal  0.931253 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1421  glutamate synthase alpha subunit domain protein  25 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5997  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  27.54 
 
 		 265 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128161  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0830  glutamate synthase alpha subunit  40.98 
 
 		 568 aa  64.3  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.990819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5920  glutamate synthase alpha subunit  31.01 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.755435  normal  0.413716 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3292  glutamate synthase alpha subunit  32.84 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1812  glutamate synthase alpha subunit  40.16 
 
 		 568 aa  62.8  0.000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000275446 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0540  glutamate synthase alpha subunit  28.76 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.800593  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0526  glutamate synthase alpha subunit  28.76 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5639  glutamate synthase alpha subunit domain protein  30.47 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.55547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1083  glutamate synthase alpha subunit  41.24 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.386486  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0211  glutamate synthase alpha subunit  27.39 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6007  glutamate synthase alpha subunit  31.75 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.607641  decreased coverage  0.00322278 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6576  glutamate synthase alpha subunit domain protein  32.35 
 
 		 228 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.026671 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5750  formyl-methanofuran dehydrogenase  30.95 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1700  glutamate synthase alpha subunit domain protein  32.03 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1339  glutamate synthase alpha subunit  27.83 
 
 		 251 aa  57  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.794654 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1869  putative glutamate synthase  31.37 
 
 		 225 aa  57  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.310557  normal  0.791624 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1345  glutamate synthase, alpha subunit-like  27.91 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1885  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  30.06 
 
 		 646 aa  55.5  0.0000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.273779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4805  glutamate synthase alpha subunit domain protein  37.78 
 
 		 247 aa  55.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1816  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  28.1 
 
 		 251 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0997673  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1198  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C (tungsten)  35.2 
 
 		 152 aa  54.7  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0030  glutamate synthase alpha subunit  40.45 
 
 		 670 aa  53.9  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0168  glutamate synthase alpha subunit  27.66 
 
 		 229 aa  53.5  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1954  glutamate synthase subunit alpha  29.73 
 
 		 1487 aa  53.5  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16290  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  31.87 
 
 		 245 aa  52.8  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.518041  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1607  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  37.29 
 
 		 572 aa  52.8  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03077  glutamate synthase, large subunit  29.93 
 
 		 1517 aa  52.4  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.427677  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0495  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.93 
 
 		 1517 aa  52.4  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3508  glutamate synthase subunit alpha  29.93 
 
 		 1517 aa  52.4  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03028  hypothetical protein  29.93 
 
 		 1517 aa  52.4  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.403109  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4535  glutamate synthase subunit alpha  29.93 
 
 		 1517 aa  52.4  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3405  glutamate synthase subunit alpha  29.93 
 
 		 1486 aa  52.4  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0488  glutamate synthase subunit alpha  29.93 
 
 		 1522 aa  52.4  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.690727 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3700  glutamate synthase subunit alpha  29.93 
 
 		 1486 aa  52.4  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3558  glutamate synthase subunit alpha  29.93 
 
 		 1486 aa  52.4  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3523  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  28.12 
 
 		 242 aa  52.4  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0202692 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0201  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  31.69 
 
 		 240 aa  52.4  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2165  glutamate synthase subunit alpha  31.47 
 
 		 1487 aa  51.6  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.409887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3633  glutamate synthase subunit alpha  29.45 
 
 		 1486 aa  51.6  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0544  glutamate synthase alpha subunit domain protein  29.45 
 
 		 281 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00693523 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1874  glutamate synthase subunit alpha  31.47 
 
 		 1487 aa  51.2  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4344  glutamate synthase subunit alpha  27.89 
 
 		 1486 aa  50.8  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0225673 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0466  glutamate synthase subunit alpha  30.53 
 
 		 1485 aa  50.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.820942  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0332  glutamate synthase alpha subunit  33.08 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.951103  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1128  glutamate synthase subunit alpha  30.53 
 
 		 1535 aa  51.2  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1943  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  26.19 
 
 		 227 aa  50.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.513232 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0530  glutamate synthase subunit alpha  30.53 
 
 		 1485 aa  50.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0458  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  28.91 
 
 		 230 aa  50.4  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.951315  normal  0.387952 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1596  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  33.94 
 
 		 256 aa  50.4  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3791  glutamate synthase subunit alpha  28.77 
 
 		 1486 aa  50.4  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00926  glutamate synthase subunit alpha  26.85 
 
 		 1487 aa  50.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1032  glutamate synthase subunit alpha  25.51 
 
 		 1482 aa  50.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.843249 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004468  glutamate synthase [NADPH] large chain  27.88 
 
 		 1487 aa  50.1  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2024  glutamate synthase alpha subunit  28.3 
 
 		 246 aa  50.1  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1289  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  30.26 
 
 		 245 aa  49.7  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000639589 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1137  formyl-methanofuran dehydrogenase subunit C  32.35 
 
 		 229 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.165169 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0878  glutamate synthase alpha subunit  30.41 
 
 		 312 aa  49.7  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.225814  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1221  glutamate synthase subunit alpha  26.36 
 
 		 1482 aa  49.7  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.120556 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>