275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2112 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2112  formylmethanofuran dehydrogenase  100 
 
 		 254 aa  511  1e-144  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1189  glutamate synthase alpha subunit  59.04 
 
 		 255 aa  300  1e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0575  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  49.6 
 
 		 256 aa  217  2e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00575915  decreased coverage  0.000443842 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1098  formylmethanofuran dehydrogenase  46.83 
 
 		 257 aa  200  9.999999999999999e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0495  formylmethanofuran dehydrogenase  37.12 
 
 		 272 aa  158  7e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.943026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0084  formylmethanofuran dehydrogenase  39.27 
 
 		 425 aa  157  2e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0563  formylmethanofuran dehydrogenase  36.43 
 
 		 289 aa  155  7e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0342  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  37.59 
 
 		 272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1290  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  36.74 
 
 		 301 aa  152  5e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1424  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  37.12 
 
 		 272 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.176644  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0283  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  36.43 
 
 		 269 aa  144  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.363907  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0370  formylmethanofuran dehydrogenase  37.11 
 
 		 266 aa  143  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0618  formylmethanofuran dehydrogenase  38.5 
 
 		 268 aa  142  4e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.031501  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1663  formylmethanofuran dehydrogenase  37.16 
 
 		 424 aa  142  7e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2233  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  35.45 
 
 		 304 aa  139  3e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.0399291 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1442  formylmethanofuran dehydrogenase  41.85 
 
 		 294 aa  140  3e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.717791  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0201  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  36.9 
 
 		 307 aa  139  6e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0127762  normal  0.0655916 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1450  formylmethanofuran dehydrogenase  34.35 
 
 		 415 aa  137  2e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1531  formylmethanofuran dehydrogenase  34.09 
 
 		 415 aa  135  8e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000509371 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1473  formylmethanofuran dehydrogenase  35.53 
 
 		 275 aa  132  6.999999999999999e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.143119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0381  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  33.59 
 
 		 415 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1981  formylmethanofuran dehydrogenase  33.2 
 
 		 332 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.372116 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0246  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  32.66 
 
 		 266 aa  125  7e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.314224 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1990  formylmethanofuran dehydrogenase  36.43 
 
 		 266 aa  123  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.114316  normal  0.184502 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0875  formylmethanofuran dehydrogenase  31.11 
 
 		 266 aa  122  6e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.118005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5932  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  31.39 
 
 		 274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0388185  normal  0.0470213 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1665  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  25.91 
 
 		 269 aa  97.4  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.477479  normal  0.947493 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2857  formylmethanofurane dehydrogenase subunit, putative  29.26 
 
 		 270 aa  95.1  8e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000000505673  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2626  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  31.22 
 
 		 269 aa  95.1  9e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1775  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  29.74 
 
 		 265 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  0.875805 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6507  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  29.15 
 
 		 286 aa  93.6  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0305137 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2403  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  30.09 
 
 		 268 aa  92.8  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3064  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  34.21 
 
 		 276 aa  91.7  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0022  formylmethanofuran dehydrogenase  28.12 
 
 		 272 aa  91.7  9e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0523  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  29.26 
 
 		 264 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300278  normal  0.650549 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2464  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  26.96 
 
 		 281 aa  89.4  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.109296 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1824  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  30.11 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2159  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  30.11 
 
 		 265 aa  82  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0901303 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5773  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  32.68 
 
 		 265 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14713  normal  0.931253 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1421  glutamate synthase alpha subunit domain protein  32.45 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5997  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  30.6 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128161  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3133  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  33.54 
 
 		 281 aa  68.6  0.00000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1793  glutamate synthase alpha subunit  32.31 
 
 		 267 aa  67  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0607708  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1812  glutamate synthase alpha subunit  36.5 
 
 		 568 aa  62  0.000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000275446 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0211  glutamate synthase alpha subunit  34.35 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6576  glutamate synthase alpha subunit domain protein  41.84 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.026671 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0867  glutamate synthase alpha subunit  35.42 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0287996  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0544  glutamate synthase alpha subunit domain protein  31.1 
 
 		 281 aa  58.9  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00693523 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0201  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  33.33 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2357  glutamate synthase alpha subunit domain protein  33.33 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800072  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0562  glutamate synthase alpha subunit  33.74 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1607  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  35.59 
 
 		 572 aa  58.2  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2490  glutamate synthase alpha subunit  33.88 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1740  glutamate synthase alpha subunit domain protein  37.17 
 
 		 659 aa  57  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.627915  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1596  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  34.72 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1069  glutamate synthase alpha subunit  34.38 
 
 		 312 aa  57  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1080  glutamate synthase alpha subunit  33.79 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3292  glutamate synthase alpha subunit  39.8 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0029  glutamate synthase alpha subunit domain protein  34.23 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1692  glutamate synthase alpha subunit  35.65 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.737414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0540  glutamate synthase alpha subunit  34.51 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.800593  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  33.58 
 
 		 553 aa  55.5  0.0000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0526  glutamate synthase alpha subunit  34.51 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1752  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  35.78 
 
 		 249 aa  55.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.216628 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5639  glutamate synthase alpha subunit domain protein  39.18 
 
 		 228 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.55547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20710  glutamate synthase (NADH) large subunit  31.28 
 
 		 1524 aa  54.7  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.42786 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1302  glutamate synthase alpha subunit  37.38 
 
 		 261 aa  55.1  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1339  glutamate synthase alpha subunit  37.21 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.794654 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1874  glutamate synthase subunit alpha  35.65 
 
 		 1487 aa  53.9  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2767  glutamate synthase subunit alpha  35.85 
 
 		 1494 aa  53.9  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2016  glutamate synthase (NADPH)  26.98 
 
 		 1535 aa  54.7  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0730  glutamate synthase, large subunit  31.2 
 
 		 1475 aa  53.9  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2165  glutamate synthase subunit alpha  35.65 
 
 		 1487 aa  53.9  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.409887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1083  glutamate synthase alpha subunit  30.3 
 
 		 320 aa  53.9  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.386486  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0878  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.2 
 
 		 1475 aa  53.9  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1607  tungsten containing formylmethanofruran dehydrogenase subunit C-related protein  31.96 
 
 		 313 aa  53.9  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1762  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  44.44 
 
 		 105 aa  53.5  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3176  glutamate synthase (NADH) large subunit  28.11 
 
 		 1546 aa  53.5  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1487  glutamate synthase, large subunit  32.23 
 
 		 1465 aa  53.5  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0194294  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1885  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  29.78 
 
 		 646 aa  53.5  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.273779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2024  glutamate synthase alpha subunit  35.29 
 
 		 246 aa  53.1  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2961  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.43 
 
 		 1536 aa  53.1  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.495295  normal  0.583434 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0107  Glutamate synthase (ferredoxin)  33.08 
 
 		 1535 aa  53.5  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0878  glutamate synthase alpha subunit  36.67 
 
 		 312 aa  53.1  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.225814  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0332  glutamate synthase alpha subunit  33.83 
 
 		 245 aa  53.1  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.951103  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16351  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.45 
 
 		 1531 aa  52.8  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1198  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C (tungsten)  39.39 
 
 		 152 aa  52.4  0.000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5750  formyl-methanofuran dehydrogenase  37.76 
 
 		 228 aa  52.4  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0890  glutamate synthase (ferredoxin)  29.59 
 
 		 1536 aa  52.4  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00390315  decreased coverage  0.000127994 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1869  putative glutamate synthase  37.76 
 
 		 225 aa  52.4  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.310557  normal  0.791624 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16290  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  31.74 
 
 		 245 aa  52  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.518041  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1078  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.68 
 
 		 1529 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6007  glutamate synthase alpha subunit  27.27 
 
 		 228 aa  51.6  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.607641  decreased coverage  0.00322278 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19531  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.68 
 
 		 1475 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0830  glutamate synthase alpha subunit  28.93 
 
 		 568 aa  51.6  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.990819  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1235  hypothetical protein  31.11 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004468  glutamate synthase [NADPH] large chain  29.68 
 
 		 1487 aa  50.4  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3033  glutamate synthase subunit alpha  33.33 
 
 		 1485 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0403  glutamate synthase subunit alpha  35.24 
 
 		 1507 aa  50.8  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0405842 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1094  glutamate synthase alpha subunit  33.1 
 
 		 256 aa  50.8  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>