165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0342 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0342  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  100 
 
 		 272 aa  535  1e-151  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1424  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  95.59 
 
 		 272 aa  518  1e-146  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.176644  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0495  formylmethanofuran dehydrogenase  91.54 
 
 		 272 aa  498  1e-140  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.943026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0563  formylmethanofuran dehydrogenase  72.43 
 
 		 289 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0084  formylmethanofuran dehydrogenase  42.11 
 
 		 425 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1442  formylmethanofuran dehydrogenase  46.27 
 
 		 294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.717791  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1990  formylmethanofuran dehydrogenase  42.91 
 
 		 266 aa  196  3e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.114316  normal  0.184502 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0618  formylmethanofuran dehydrogenase  40.94 
 
 		 268 aa  196  3e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.031501  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1663  formylmethanofuran dehydrogenase  41.37 
 
 		 424 aa  191  1e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0875  formylmethanofuran dehydrogenase  40.61 
 
 		 266 aa  189  4e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.118005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1290  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  41.45 
 
 		 301 aa  188  5.999999999999999e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1450  formylmethanofuran dehydrogenase  40.5 
 
 		 415 aa  181  9.000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2233  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  40 
 
 		 304 aa  180  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.0399291 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0370  formylmethanofuran dehydrogenase  38.85 
 
 		 266 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0201  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  38.2 
 
 		 307 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0127762  normal  0.0655916 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1531  formylmethanofuran dehydrogenase  40.14 
 
 		 415 aa  175  7e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000509371 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1473  formylmethanofuran dehydrogenase  39.43 
 
 		 275 aa  175  9e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.143119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0381  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  40.5 
 
 		 415 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1981  formylmethanofuran dehydrogenase  40.71 
 
 		 332 aa  171  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.372116 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1098  formylmethanofuran dehydrogenase  39.93 
 
 		 257 aa  171  1e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0246  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  36.54 
 
 		 266 aa  169  5e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.314224 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0283  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  39.27 
 
 		 269 aa  162  6e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.363907  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2112  formylmethanofuran dehydrogenase  37.59 
 
 		 254 aa  153  4e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1189  glutamate synthase alpha subunit  32.94 
 
 		 255 aa  137  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2857  formylmethanofurane dehydrogenase subunit, putative  33.65 
 
 		 270 aa  135  8e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000000505673  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5932  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  30.94 
 
 		 274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0388185  normal  0.0470213 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0575  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  34.83 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00575915  decreased coverage  0.000443842 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1665  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  32.69 
 
 		 269 aa  124  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.477479  normal  0.947493 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2464  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  28.41 
 
 		 281 aa  122  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.109296 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6507  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  30.14 
 
 		 286 aa  118  9e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0305137 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0022  formylmethanofuran dehydrogenase  31.1 
 
 		 272 aa  110  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2626  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  27.85 
 
 		 269 aa  103  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3133  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  30.46 
 
 		 281 aa  101  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3064  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  28.02 
 
 		 276 aa  99  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2403  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  27.24 
 
 		 268 aa  97.8  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1775  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  28.41 
 
 		 265 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  0.875805 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1793  glutamate synthase alpha subunit  28.8 
 
 		 267 aa  88.6  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0607708  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0523  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  28.47 
 
 		 264 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300278  normal  0.650549 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2159  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  28.79 
 
 		 265 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0901303 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1824  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  28.03 
 
 		 265 aa  82.4  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5773  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  26.61 
 
 		 265 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14713  normal  0.931253 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1421  glutamate synthase alpha subunit domain protein  25.62 
 
 		 291 aa  75.5  0.0000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5997  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  28.39 
 
 		 265 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128161  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0830  glutamate synthase alpha subunit  40.16 
 
 		 568 aa  65.1  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.990819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1812  glutamate synthase alpha subunit  39.34 
 
 		 568 aa  63.5  0.000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000275446 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5920  glutamate synthase alpha subunit  30.23 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.755435  normal  0.413716 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3292  glutamate synthase alpha subunit  32.54 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0526  glutamate synthase alpha subunit  28.95 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0540  glutamate synthase alpha subunit  28.95 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.800593  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5639  glutamate synthase alpha subunit domain protein  29.69 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.55547  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6576  glutamate synthase alpha subunit domain protein  33.33 
 
 		 228 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.026671 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6007  glutamate synthase alpha subunit  30.95 
 
 		 228 aa  57  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.607641  decreased coverage  0.00322278 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1869  putative glutamate synthase  32.35 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.310557  normal  0.791624 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0211  glutamate synthase alpha subunit  26.96 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5750  formyl-methanofuran dehydrogenase  32.35 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1339  glutamate synthase alpha subunit  26.89 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.794654 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1700  glutamate synthase alpha subunit domain protein  30.47 
 
 		 236 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1198  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C (tungsten)  35.2 
 
 		 152 aa  54.3  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1885  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  29.48 
 
 		 646 aa  54.3  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.273779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4805  glutamate synthase alpha subunit domain protein  36.57 
 
 		 247 aa  53.1  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1345  glutamate synthase, alpha subunit-like  27.13 
 
 		 227 aa  53.1  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1816  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  28.1 
 
 		 251 aa  53.1  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0997673  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0201  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  30.99 
 
 		 240 aa  52.8  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0544  glutamate synthase alpha subunit domain protein  30.67 
 
 		 281 aa  52.8  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00693523 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1954  glutamate synthase subunit alpha  27.95 
 
 		 1487 aa  52.4  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0878  glutamate synthase alpha subunit  32.56 
 
 		 312 aa  52  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.225814  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0030  glutamate synthase alpha subunit  38.2 
 
 		 670 aa  52  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03077  glutamate synthase, large subunit  29.25 
 
 		 1517 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.427677  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0495  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.25 
 
 		 1517 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0168  glutamate synthase alpha subunit  31.03 
 
 		 229 aa  51.2  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0488  glutamate synthase subunit alpha  29.25 
 
 		 1522 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.690727 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3508  glutamate synthase subunit alpha  29.25 
 
 		 1517 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3558  glutamate synthase subunit alpha  29.25 
 
 		 1486 aa  50.8  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1607  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  34.75 
 
 		 572 aa  51.2  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4535  glutamate synthase subunit alpha  29.25 
 
 		 1517 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03028  hypothetical protein  29.25 
 
 		 1517 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.403109  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1221  glutamate synthase subunit alpha  26.36 
 
 		 1482 aa  50.8  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.120556 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3405  glutamate synthase subunit alpha  29.25 
 
 		 1486 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3700  glutamate synthase subunit alpha  29.25 
 
 		 1486 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1083  glutamate synthase alpha subunit  40 
 
 		 320 aa  50.4  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.386486  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3523  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  27.34 
 
 		 242 aa  50.4  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0202692 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1137  formyl-methanofuran dehydrogenase subunit C  33.33 
 
 		 229 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.165169 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1596  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  33.03 
 
 		 256 aa  50.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3633  glutamate synthase subunit alpha  28.77 
 
 		 1486 aa  50.1  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0332  glutamate synthase alpha subunit  32.33 
 
 		 245 aa  49.7  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.951103  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16290  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  31.25 
 
 		 245 aa  49.7  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.518041  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2024  glutamate synthase alpha subunit  28.3 
 
 		 246 aa  48.9  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4344  glutamate synthase subunit alpha  27.21 
 
 		 1486 aa  48.9  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0225673 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1762  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  47.92 
 
 		 105 aa  48.9  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0525  tungsten formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C-like  29.2 
 
 		 295 aa  48.9  0.00009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.618523  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1080  glutamate synthase alpha subunit  32.11 
 
 		 263 aa  48.9  0.00009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1874  glutamate synthase subunit alpha  30.07 
 
 		 1487 aa  48.5  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0663  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  32.85 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.358325 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2165  glutamate synthase subunit alpha  30.07 
 
 		 1487 aa  48.9  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.409887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1032  glutamate synthase subunit alpha  24.7 
 
 		 1482 aa  48.5  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.843249 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1298  glutamate synthase alpha subunit  31.96 
 
 		 227 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.186101  normal  0.822119 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00926  glutamate synthase subunit alpha  25.79 
 
 		 1487 aa  48.1  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3791  glutamate synthase subunit alpha  28.08 
 
 		 1486 aa  48.5  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2708  glutamate synthase alpha subunit domain protein  31.5 
 
 		 248 aa  48.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.414191  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0458  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  28.12 
 
 		 230 aa  47.4  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.951315  normal  0.387952 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>