273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2024 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_2024  glutamate synthase alpha subunit  100 
 
 
246 aa  494  1e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2357  glutamate synthase alpha subunit domain protein  57.96 
 
 
250 aa  307  9e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800072  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0540  glutamate synthase alpha subunit  58.54 
 
 
245 aa  288  5.0000000000000004e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.800593  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0526  glutamate synthase alpha subunit  58.54 
 
 
245 aa  288  5.0000000000000004e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0029  glutamate synthase alpha subunit domain protein  53.47 
 
 
252 aa  280  2e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1752  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  58.94 
 
 
249 aa  271  6e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.216628 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16290  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  54.88 
 
 
245 aa  270  1e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.518041  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0562  glutamate synthase alpha subunit  54.29 
 
 
242 aa  270  2e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1235  hypothetical protein  57.14 
 
 
248 aa  269  2.9999999999999997e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1816  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  55.51 
 
 
251 aa  263  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0997673  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2490  glutamate synthase alpha subunit  56.73 
 
 
248 aa  257  9e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1289  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  53.25 
 
 
245 aa  255  4e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000639589 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_945  glutamate synthase-like protein protein, alpha subunit-like protein  54.32 
 
 
256 aa  254  9e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0544  glutamate synthase alpha subunit domain protein  55.25 
 
 
281 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00693523 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1339  glutamate synthase alpha subunit  58.02 
 
 
251 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.794654 
 
 
-
 
NC_002936  DET1127  hypothetical protein  54.32 
 
 
256 aa  252  4.0000000000000004e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000223973  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0956  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  55.14 
 
 
256 aa  251  5.000000000000001e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0201  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  50.21 
 
 
240 aa  241  7.999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1080  glutamate synthase alpha subunit  46.18 
 
 
263 aa  231  1e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1596  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  45.78 
 
 
256 aa  230  1e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0867  glutamate synthase alpha subunit  45.38 
 
 
256 aa  226  3e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0287996  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1692  glutamate synthase alpha subunit  47.13 
 
 
247 aa  226  4e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.737414  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1094  glutamate synthase alpha subunit  44 
 
 
256 aa  223  3e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0663  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  46.94 
 
 
247 aa  222  4e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.358325 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0782  glutamate synthase, alpha subunit-like  45.9 
 
 
246 aa  221  6e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00542084  normal  0.210269 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0332  glutamate synthase alpha subunit  47.13 
 
 
245 aa  221  7e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.951103  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2708  glutamate synthase alpha subunit domain protein  47.76 
 
 
248 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.414191  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0211  glutamate synthase alpha subunit  47.81 
 
 
264 aa  211  9e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1302  glutamate synthase alpha subunit  44.8 
 
 
261 aa  207  1e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0030  glutamate synthase alpha subunit  41.32 
 
 
670 aa  164  2.0000000000000002e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1740  glutamate synthase alpha subunit domain protein  40.4 
 
 
659 aa  144  1e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.627915  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1885  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  39.49 
 
 
646 aa  135  7.000000000000001e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.273779  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1607  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  39.11 
 
 
572 aa  107  1e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1812  glutamate synthase alpha subunit  37.04 
 
 
568 aa  102  7e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000275446 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0830  glutamate synthase alpha subunit  35.98 
 
 
568 aa  99.4  5e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.990819  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  36.67 
 
 
553 aa  97.1  3e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2600  glutamate synthase, alpha subunit-like  36.59 
 
 
771 aa  92.4  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0458  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  32.58 
 
 
230 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.951315  normal  0.387952 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2159  glutamate synthase alpha subunit  31.22 
 
 
771 aa  83.2  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.681462  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5920  glutamate synthase alpha subunit  34.72 
 
 
232 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.755435  normal  0.413716 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0168  glutamate synthase alpha subunit  33.33 
 
 
229 aa  81.6  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1377  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.43 
 
 
793 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.118947  normal  0.859258 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5639  glutamate synthase alpha subunit domain protein  32.87 
 
 
228 aa  79.7  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.55547  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1137  formyl-methanofuran dehydrogenase subunit C  35 
 
 
229 aa  79  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.165169 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3032  glutamate synthase alpha subunit  30.36 
 
 
228 aa  79  0.00000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.54309 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2500  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  32.54 
 
 
225 aa  78.2  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0493584  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1370  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.87 
 
 
794 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6576  glutamate synthase alpha subunit domain protein  33.64 
 
 
228 aa  76.6  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.026671 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0529  Glutamate synthase (ferredoxin)  34.39 
 
 
1474 aa  76.3  0.0000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.41827  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6007  glutamate synthase alpha subunit  35.8 
 
 
228 aa  74.3  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.607641  decreased coverage  0.00322278 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5262  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  33.49 
 
 
238 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.221211 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2275  glutamate synthase, alpha subunit, C-terminal  31.63 
 
 
227 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.225316  hitchhiker  0.00959584 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4894  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  33.01 
 
 
238 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4983  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  33.01 
 
 
238 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3292  glutamate synthase alpha subunit  33.64 
 
 
228 aa  73.2  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5511  glutamate synthase alpha subunit  31.9 
 
 
228 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.21487 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1943  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  31.28 
 
 
227 aa  72.4  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.513232 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2584  hypothetical protein  31.16 
 
 
227 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0278158  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5750  formyl-methanofuran dehydrogenase  33.71 
 
 
228 aa  72.4  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3466  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  31.56 
 
 
224 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.201288  normal  0.713984 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0383  glutamate synthase alpha subunit domain protein  30.04 
 
 
635 aa  72  0.000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2249  glutamate synthase alpha subunit  31.11 
 
 
224 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.191415 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1345  glutamate synthase, alpha subunit-like  29.44 
 
 
227 aa  70.9  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1157  glutamate synthase alpha subunit domain protein  30.49 
 
 
381 aa  70.5  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000112739  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1869  putative glutamate synthase  28.45 
 
 
225 aa  70.1  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.310557  normal  0.791624 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1939  glutamate synthase alpha subunit domain protein  33.02 
 
 
229 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.490233  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1657  glutamate synthase alpha subunit  33.02 
 
 
229 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0102  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.28 
 
 
777 aa  69.3  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2389  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.73 
 
 
777 aa  68.9  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1982  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.68 
 
 
1521 aa  68.2  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.349695  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1723  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.94 
 
 
777 aa  68.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4809  glutamate synthase alpha subunit  31.73 
 
 
229 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.453145  hitchhiker  0.00411559 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4805  glutamate synthase alpha subunit domain protein  33.33 
 
 
247 aa  67  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0452  glutamate synthase (ferredoxin)  28.87 
 
 
1477 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28040  glutamate synthase (NADH) large subunit  28.02 
 
 
1527 aa  66.6  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.723113  normal  0.697076 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1574  glutamate synthase alpha subunit domain protein  30.36 
 
 
229 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1298  glutamate synthase alpha subunit  30.62 
 
 
227 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.186101  normal  0.822119 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2276  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.33 
 
 
776 aa  66.2  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3044  glutamate synthase (NADH) large subunit  28.7 
 
 
1518 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.417373  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3103  glutamate synthase (NADH) large subunit  28.7 
 
 
1518 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.238876  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3060  glutamate synthase (NADH) large subunit  28.7 
 
 
1518 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0446  glutamate synthase (ferredoxin)  30.16 
 
 
1478 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1665  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  29.95 
 
 
269 aa  65.5  0.0000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.477479  normal  0.947493 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5702  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.18 
 
 
1550 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1173  glutamate synthase (NADH) large subunit  31.02 
 
 
1520 aa  63.9  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2866  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.55 
 
 
1519 aa  63.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.166773  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0535  putative glutamate synthase, large subunit  30.64 
 
 
1478 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.684549  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4791  putative glutamate synthase, large subunit  30.64 
 
 
1478 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.621621  normal  0.701675 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0585  glutamate synthase, large subunit, putative  30.64 
 
 
1478 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4696  glutamate synthase family protein  30.23 
 
 
235 aa  63.2  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.917164 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0586  putative glutamate synthase, large subunit  30.64 
 
 
1478 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0498  glutamate synthase, large subunit  31.07 
 
 
1478 aa  62.4  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0441  glutamate synthase, NADPH, large subunit  31.07 
 
 
1478 aa  62.4  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0437  glutamate synthase, NADPH, large subunit  31.07 
 
 
1478 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0513  putative glutamate synthase, large subunit  31.07 
 
 
1478 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0530  glutamate synthase, large subunit  31.07 
 
 
1478 aa  62.4  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3593  glutamate synthase (ferredoxin)  28.51 
 
 
1514 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.544233  normal  0.0352812 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1176  glutamate synthase (NADPH) large subunit  28.57 
 
 
1479 aa  62.4  0.000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3523  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  32.75 
 
 
242 aa  61.2  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0202692 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3072  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.68 
 
 
1527 aa  61.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.191791  hitchhiker  0.00286701 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>