94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4805 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4805  glutamate synthase alpha subunit domain protein  100 
 
 		 247 aa  499  1e-140  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4894  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  75.32 
 
 		 238 aa  356  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4983  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  75.32 
 
 		 238 aa  356  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5262  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  74.89 
 
 		 238 aa  355  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.221211 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1298  glutamate synthase alpha subunit  77.43 
 
 		 227 aa  353  2e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.186101  normal  0.822119 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5511  glutamate synthase alpha subunit  74.56 
 
 		 228 aa  348  6e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21487 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3466  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  67.12 
 
 		 224 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.201288  normal  0.713984 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2275  glutamate synthase, alpha subunit, C-terminal  63.84 
 
 		 227 aa  291  6e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.225316  hitchhiker  0.00959584 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2249  glutamate synthase alpha subunit  65.32 
 
 		 224 aa  291  8e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191415 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1345  glutamate synthase, alpha subunit-like  65.62 
 
 		 227 aa  290  2e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3523  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  61.69 
 
 		 242 aa  289  3e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0202692 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2584  hypothetical protein  62.95 
 
 		 227 aa  287  9e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0278158  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5639  glutamate synthase alpha subunit domain protein  61.78 
 
 		 228 aa  280  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.55547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4696  glutamate synthase family protein  63 
 
 		 235 aa  278  6e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.917164 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3292  glutamate synthase alpha subunit  63 
 
 		 228 aa  277  9e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0458  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  64 
 
 		 230 aa  277  1e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.951315  normal  0.387952 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1869  putative glutamate synthase  62.9 
 
 		 225 aa  276  2e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.310557  normal  0.791624 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6576  glutamate synthase alpha subunit domain protein  61.23 
 
 		 228 aa  274  9e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.026671 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1943  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  64 
 
 		 227 aa  273  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.513232 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1574  glutamate synthase alpha subunit domain protein  60.35 
 
 		 229 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3032  glutamate synthase alpha subunit  63.23 
 
 		 228 aa  273  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.54309 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5750  formyl-methanofuran dehydrogenase  59.56 
 
 		 228 aa  273  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1939  glutamate synthase alpha subunit domain protein  61.06 
 
 		 229 aa  273  3e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.490233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1657  glutamate synthase alpha subunit  61.06 
 
 		 229 aa  271  5.000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6007  glutamate synthase alpha subunit  60.35 
 
 		 228 aa  270  1e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.607641  decreased coverage  0.00322278 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1137  formyl-methanofuran dehydrogenase subunit C  59.83 
 
 		 229 aa  262  3e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.165169 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0168  glutamate synthase alpha subunit  60.44 
 
 		 229 aa  255  4e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5920  glutamate synthase alpha subunit  56.14 
 
 		 232 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.755435  normal  0.413716 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4809  glutamate synthase alpha subunit  59.56 
 
 		 229 aa  251  7e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.453145  hitchhiker  0.00411559 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2633  glutamate synthase alpha subunit domain protein  59.57 
 
 		 235 aa  244  6.999999999999999e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1700  glutamate synthase alpha subunit domain protein  55.11 
 
 		 236 aa  241  7e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2500  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  54.22 
 
 		 225 aa  240  2e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0493584  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2024  glutamate synthase alpha subunit  33.33 
 
 		 246 aa  67  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0618  formylmethanofuran dehydrogenase  33.33 
 
 		 268 aa  65.9  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.031501  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1752  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  28.57 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.216628 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1289  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  28.22 
 
 		 245 aa  62.4  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000639589 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0540  glutamate synthase alpha subunit  37.89 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.800593  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0526  glutamate synthase alpha subunit  37.89 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0332  glutamate synthase alpha subunit  30.66 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.951103  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1442  formylmethanofuran dehydrogenase  29.06 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.717791  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1235  hypothetical protein  28.66 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0563  formylmethanofuran dehydrogenase  28.26 
 
 		 289 aa  58.9  0.00000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2490  glutamate synthase alpha subunit  28.64 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0782  glutamate synthase, alpha subunit-like  25.81 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00542084  normal  0.210269 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16290  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  27.62 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.518041  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1424  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  37.78 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.176644  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0084  formylmethanofuran dehydrogenase  30 
 
 		 425 aa  54.7  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1816  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  25.49 
 
 		 251 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0997673  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0495  formylmethanofuran dehydrogenase  36.57 
 
 		 272 aa  53.5  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.943026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0211  glutamate synthase alpha subunit  27.1 
 
 		 264 aa  53.5  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0342  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  36.57 
 
 		 272 aa  53.1  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0030  glutamate synthase alpha subunit  26.82 
 
 		 670 aa  53.1  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1740  glutamate synthase alpha subunit domain protein  24.14 
 
 		 659 aa  52.4  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.627915  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1981  formylmethanofuran dehydrogenase  26.53 
 
 		 332 aa  52  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.372116 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0246  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  27.13 
 
 		 266 aa  51.6  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.314224 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1607  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  34.55 
 
 		 572 aa  51.2  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1812  glutamate synthase alpha subunit  27.91 
 
 		 568 aa  51.2  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000275446 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0544  glutamate synthase alpha subunit domain protein  30.05 
 
 		 281 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00693523 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0830  glutamate synthase alpha subunit  27.49 
 
 		 568 aa  50.8  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.990819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1885  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  29.67 
 
 		 646 aa  50.4  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.273779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2233  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  29.44 
 
 		 304 aa  50.1  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.0399291 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1531  formylmethanofuran dehydrogenase  40.62 
 
 		 415 aa  50.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000509371 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1692  glutamate synthase alpha subunit  27.32 
 
 		 247 aa  49.7  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.737414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1663  formylmethanofuran dehydrogenase  32.04 
 
 		 424 aa  49.7  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1083  glutamate synthase alpha subunit  30.48 
 
 		 320 aa  49.3  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.386486  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0875  formylmethanofuran dehydrogenase  29.13 
 
 		 266 aa  49.3  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.118005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0029  glutamate synthase alpha subunit domain protein  25.61 
 
 		 252 aa  48.9  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0381  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  39.06 
 
 		 415 aa  48.9  0.00007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1339  glutamate synthase alpha subunit  28.57 
 
 		 251 aa  48.9  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.794654 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1703  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.45 
 
 		 1518 aa  48.9  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.625118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1802  glutamate synthase (ferredoxin)  31.25 
 
 		 1498 aa  48.1  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0512049  normal  0.419037 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0575  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  36.36 
 
 		 256 aa  48.1  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00575915  decreased coverage  0.000443842 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0956  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  25.55 
 
 		 256 aa  48.1  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2357  glutamate synthase alpha subunit domain protein  25.26 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800072  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1450  formylmethanofuran dehydrogenase  29.1 
 
 		 415 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2857  formylmethanofurane dehydrogenase subunit, putative  28.17 
 
 		 270 aa  47  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000000505673  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1094  glutamate synthase alpha subunit  25.25 
 
 		 256 aa  46.6  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0370  formylmethanofuran dehydrogenase  36.26 
 
 		 266 aa  46.2  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0878  glutamate synthase alpha subunit  25.77 
 
 		 312 aa  45.4  0.0007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.225814  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0201  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  23.08 
 
 		 240 aa  45.4  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2403  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  31.58 
 
 		 268 aa  44.7  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5932  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  30.72 
 
 		 274 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0388185  normal  0.0470213 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1665  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  25.32 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.477479  normal  0.947493 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1990  formylmethanofuran dehydrogenase  34.48 
 
 		 266 aa  45.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.114316  normal  0.184502 
 
 
-
 
NC_002936  DET1127  hypothetical protein  27.12 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000223973  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0562  glutamate synthase alpha subunit  25.54 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1098  formylmethanofuran dehydrogenase  31.37 
 
 		 257 aa  44.7  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_945  glutamate synthase-like protein protein, alpha subunit-like protein  23.24 
 
 		 256 aa  43.9  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  27.52 
 
 		 553 aa  43.1  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1069  glutamate synthase alpha subunit  26.32 
 
 		 312 aa  43.1  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0283  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  35.63 
 
 		 269 aa  42.7  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.363907  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1302  glutamate synthase alpha subunit  23.53 
 
 		 261 aa  42.7  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0663  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  29.84 
 
 		 247 aa  42  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.358325 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1473  formylmethanofuran dehydrogenase  25.19 
 
 		 275 aa  42  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.143119  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>