More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0383 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1723  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  62.3 
 
 
777 aa  640    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0383  glutamate synthase alpha subunit domain protein  100 
 
 
635 aa  1285    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2276  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  58.13 
 
 
776 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1377  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  59.79 
 
 
793 aa  591  1e-167  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.118947  normal  0.859258 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1370  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  56.53 
 
 
794 aa  587  1e-166  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2389  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  54.93 
 
 
777 aa  569  1e-161  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0102  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  56.54 
 
 
777 aa  552  1e-156  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2159  glutamate synthase alpha subunit  42.86 
 
 
771 aa  376  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.681462  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2600  glutamate synthase, alpha subunit-like  43.15 
 
 
771 aa  374  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1157  glutamate synthase alpha subunit domain protein  42.38 
 
 
381 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000112739  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0029  glutamate synthase alpha subunit domain protein  32.13 
 
 
252 aa  109  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0809  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.94 
 
 
1410 aa  97.4  6e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00210  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  34.59 
 
 
612 aa  92.4  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.301732 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1249  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  35.5 
 
 
1073 aa  92  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0309731 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1289  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  34.78 
 
 
245 aa  91.7  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000639589 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0030  glutamate synthase alpha subunit  33.33 
 
 
670 aa  91.3  5e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2357  glutamate synthase alpha subunit domain protein  28.7 
 
 
250 aa  90.5  7e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800072  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0247  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.37 
 
 
600 aa  89  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139263  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0838  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.99 
 
 
1440 aa  88.6  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1235  hypothetical protein  30.4 
 
 
248 aa  88.6  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_131  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase protein  28.37 
 
 
677 aa  88.6  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000174101  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2319  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  34.11 
 
 
578 aa  88.6  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000648814  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1564  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.66 
 
 
891 aa  88.6  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0696  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  31.28 
 
 
577 aa  88.2  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0123  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  28.84 
 
 
643 aa  87.8  6e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0636906  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1954  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  32.23 
 
 
579 aa  87.8  6e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.151886  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0562  glutamate synthase alpha subunit  32.69 
 
 
242 aa  87.8  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0473  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.02 
 
 
996 aa  87  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3616  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.32 
 
 
1421 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3421  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.98 
 
 
1425 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0754  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.44 
 
 
1440 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0038  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  33.18 
 
 
578 aa  85.1  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.093726  normal  0.0842207 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25290  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  31.25 
 
 
612 aa  85.1  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.126958 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1594  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  30.88 
 
 
609 aa  85.1  0.000000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0770  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  29.87 
 
 
546 aa  84.7  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1752  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  30.65 
 
 
249 aa  84.7  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.216628 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0825  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.98 
 
 
1432 aa  84  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00541451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3198  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.98 
 
 
1432 aa  84  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.554904 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1339  glutamate synthase alpha subunit  37.22 
 
 
251 aa  84  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.794654 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16540  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  30 
 
 
612 aa  83.2  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000430303  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0871  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.47 
 
 
1425 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.510403  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0130  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  33.49 
 
 
578 aa  83.2  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000213386  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3493  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.82 
 
 
1425 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2274  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  27.07 
 
 
542 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0531449  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0792  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.44 
 
 
1406 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3298  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.47 
 
 
1432 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2511  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  29 
 
 
672 aa  82  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2167  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  36.09 
 
 
914 aa  81.6  0.00000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2986  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  32.8 
 
 
552 aa  81.6  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144587 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0937  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.05 
 
 
1426 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.137872  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3057  putative oxidoreductase  34.36 
 
 
470 aa  80.5  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0138  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.04 
 
 
663 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3051  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.63 
 
 
1424 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0544  glutamate synthase alpha subunit domain protein  32.38 
 
 
281 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00693523 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0031  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  30.81 
 
 
578 aa  79.3  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.43195 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1932  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.4 
 
 
895 aa  79  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0418716  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0988  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.95 
 
 
1428 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2250  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  30.57 
 
 
617 aa  78.6  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0580  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  28.7 
 
 
653 aa  78.6  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000307705  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0824  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40 
 
 
1126 aa  78.2  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2152  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  37.16 
 
 
571 aa  78.2  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000764519 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2193  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  30.37 
 
 
648 aa  77.8  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.119268  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1304  putative oxidoreductase  31.5 
 
 
468 aa  77  0.0000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0866  hydrogenase subunit, putative  33.77 
 
 
461 aa  77  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1327  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.6 
 
 
1481 aa  77  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0407  putative oxidoreductase  27.59 
 
 
503 aa  75.9  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0863164  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2656  selenate reductase YgfK  27.36 
 
 
991 aa  76.3  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2184  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  30.43 
 
 
541 aa  75.5  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.544077  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0566  glutamate synthase subunit beta  33.85 
 
 
512 aa  75.5  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0211  glutamate synthase alpha subunit  27.34 
 
 
264 aa  75.1  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4019  putative oxidoreductase  32.02 
 
 
448 aa  75.1  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0966  glutamate synthase subunit beta  34.45 
 
 
451 aa  74.7  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1151  putative oxidoreductase  31.5 
 
 
468 aa  74.7  0.000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5234  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  31.08 
 
 
558 aa  73.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.542472  normal  0.83486 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0418  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  30.65 
 
 
653 aa  73.6  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1936  glutamate synthase subunit beta  38.35 
 
 
481 aa  73.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.336215  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_769  hydrogenase subunit  32.45 
 
 
461 aa  73.2  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3004  ferredoxin  27.23 
 
 
493 aa  73.2  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0784  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.46 
 
 
461 aa  72.8  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0201  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  31.15 
 
 
240 aa  73.2  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0344  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  28.11 
 
 
658 aa  72.4  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2024  glutamate synthase alpha subunit  29.34 
 
 
246 aa  72.4  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2825  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  33.78 
 
 
699 aa  71.6  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4152  glutamate synthase subunit beta  33.67 
 
 
477 aa  71.6  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0540  glutamate synthase alpha subunit  32.79 
 
 
245 aa  71.6  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.800593  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1474  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.63 
 
 
784 aa  71.6  0.00000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.293744  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0526  glutamate synthase alpha subunit  32.79 
 
 
245 aa  71.6  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1737  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  27.67 
 
 
654 aa  71.2  0.00000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0256396 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2713  putative oxidoreductase  30.77 
 
 
446 aa  71.6  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754768  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1596  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  29.41 
 
 
256 aa  70.9  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1194  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  30.15 
 
 
1487 aa  70.9  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0366  glutamate synthase subunit beta  28.92 
 
 
489 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635845  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4108  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  25.43 
 
 
543 aa  70.5  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00112813  normal  0.10156 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1661  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  34.81 
 
 
648 aa  70.5  0.00000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.950377  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0542  putative oxidoreductase  31.28 
 
 
455 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0398  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  30.4 
 
 
1385 aa  70.5  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2339  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  30.81 
 
 
482 aa  70.1  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06362  oxidoreductase  27.6 
 
 
1412 aa  70.1  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0423  selenate reductase YgfK  32.41 
 
 
1075 aa  70.1  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1692  glutamate synthase subunit beta  34.08 
 
 
485 aa  69.7  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0179657  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>