More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_0562 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_0562  glutamate synthase alpha subunit  100 
 
 
242 aa  483  1e-135  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2357  glutamate synthase alpha subunit domain protein  62.55 
 
 
250 aa  299  2e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800072  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0029  glutamate synthase alpha subunit domain protein  58.44 
 
 
252 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16290  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  56.15 
 
 
245 aa  276  3e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.518041  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0526  glutamate synthase alpha subunit  57.38 
 
 
245 aa  275  6e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0540  glutamate synthase alpha subunit  57.38 
 
 
245 aa  275  6e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.800593  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1289  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  54.92 
 
 
245 aa  274  1.0000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000639589 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2024  glutamate synthase alpha subunit  54.29 
 
 
246 aa  270  2e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2490  glutamate synthase alpha subunit  54.96 
 
 
248 aa  258  4e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1235  hypothetical protein  52.89 
 
 
248 aa  258  6e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1816  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  52.28 
 
 
251 aa  258  8e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0997673  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1752  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  52.24 
 
 
249 aa  254  8e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.216628 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1339  glutamate synthase alpha subunit  51.45 
 
 
251 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.794654 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0956  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  52.07 
 
 
256 aa  247  1e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0544  glutamate synthase alpha subunit domain protein  48.83 
 
 
281 aa  247  1e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00693523 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0201  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  53.33 
 
 
240 aa  246  3e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_945  glutamate synthase-like protein protein, alpha subunit-like protein  51.65 
 
 
256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1127  hypothetical protein  50.83 
 
 
256 aa  238  5.999999999999999e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000223973  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0782  glutamate synthase, alpha subunit-like  47.08 
 
 
246 aa  235  4e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00542084  normal  0.210269 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1302  glutamate synthase alpha subunit  44.76 
 
 
261 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0663  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  43.85 
 
 
247 aa  211  5.999999999999999e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.358325 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1094  glutamate synthase alpha subunit  46.96 
 
 
256 aa  209  3e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0332  glutamate synthase alpha subunit  42.26 
 
 
245 aa  207  9e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.951103  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1080  glutamate synthase alpha subunit  44.94 
 
 
263 aa  207  1e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1596  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  44.94 
 
 
256 aa  206  2e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0867  glutamate synthase alpha subunit  44.94 
 
 
256 aa  207  2e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0287996  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1692  glutamate synthase alpha subunit  41.42 
 
 
247 aa  203  2e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.737414  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0211  glutamate synthase alpha subunit  42.97 
 
 
264 aa  203  2e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2708  glutamate synthase alpha subunit domain protein  41.25 
 
 
248 aa  198  7.999999999999999e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.414191  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0030  glutamate synthase alpha subunit  41.58 
 
 
670 aa  161  1e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1740  glutamate synthase alpha subunit domain protein  43.37 
 
 
659 aa  141  8e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.627915  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1885  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  39.57 
 
 
646 aa  131  1.0000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.273779  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1607  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  42.13 
 
 
572 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1812  glutamate synthase alpha subunit  37.04 
 
 
568 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000275446 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0830  glutamate synthase alpha subunit  38.14 
 
 
568 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.990819  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  40.88 
 
 
553 aa  106  3e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0383  glutamate synthase alpha subunit domain protein  32.69 
 
 
635 aa  87.8  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1370  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.72 
 
 
794 aa  87.8  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2276  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.05 
 
 
776 aa  85.9  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2389  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.44 
 
 
777 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1723  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.77 
 
 
777 aa  84.3  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0102  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.44 
 
 
777 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1377  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.05 
 
 
793 aa  79  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.118947  normal  0.859258 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3072  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.09 
 
 
1527 aa  74.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.191791  hitchhiker  0.00286701 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1458  glutamate synthase  30.48 
 
 
1508 aa  74.3  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0475565  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20710  glutamate synthase (NADH) large subunit  30.97 
 
 
1524 aa  73.6  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.42786 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1503  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.19 
 
 
1530 aa  72.8  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1982  Glutamate synthase (ferredoxin)  27.04 
 
 
1521 aa  71.2  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.349695  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0890  glutamate synthase (ferredoxin)  30.23 
 
 
1536 aa  70.9  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00390315  decreased coverage  0.000127994 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5693  Glutamate synthase (ferredoxin)  25.65 
 
 
1512 aa  69.3  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0730  glutamate synthase, large subunit  30.39 
 
 
1475 aa  67.8  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0878  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.39 
 
 
1475 aa  67.8  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5702  Glutamate synthase (ferredoxin)  26.32 
 
 
1550 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1686  Glutamate synthase (ferredoxin)  26.29 
 
 
1537 aa  67.8  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000647876 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1691  glutamate synthase (NADH) large subunit  26.29 
 
 
1519 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.103385  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3213  Glutamate synthase (ferredoxin)  27.22 
 
 
1542 aa  66.6  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2961  Glutamate synthase (ferredoxin)  26.58 
 
 
1536 aa  66.6  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.495295  normal  0.583434 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0610  Glutamate synthase (ferredoxin)  27.47 
 
 
1510 aa  66.2  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1700  glutamate synthase alpha subunit domain protein  28.1 
 
 
236 aa  66.2  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1173  glutamate synthase (NADH) large subunit  26.63 
 
 
1520 aa  65.5  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2600  glutamate synthase, alpha subunit-like  27.44 
 
 
771 aa  65.5  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28040  glutamate synthase (NADH) large subunit  27.12 
 
 
1527 aa  65.5  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.723113  normal  0.697076 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1157  glutamate synthase alpha subunit domain protein  28.7 
 
 
381 aa  65.5  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000112739  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1253  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.51 
 
 
1479 aa  64.7  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5066  glutamate synthase (NADH) large subunit  25.45 
 
 
1527 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5154  glutamate synthase (NADH) large subunit  25.45 
 
 
1527 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.631687 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1219  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.68 
 
 
1525 aa  63.9  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.589961  normal  0.962678 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_51965  predicted protein  27.74 
 
 
1562 aa  63.9  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.738666  normal  0.0653658 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3166  Glutamate synthase (ferredoxin)  25.73 
 
 
1516 aa  64.3  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.563815  normal  0.707717 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2949  Glutamate synthase (ferredoxin)  27.57 
 
 
1501 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341665  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0912  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.74 
 
 
1567 aa  63.2  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00362249 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2866  Glutamate synthase (ferredoxin)  26.7 
 
 
1519 aa  63.5  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.166773  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5445  glutamate synthase (NADH) large subunit  25.45 
 
 
1536 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5698  glutamate synthase (ferredoxin)  26.01 
 
 
1514 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.471666 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2217  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.47 
 
 
1516 aa  62  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0842  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.87 
 
 
1560 aa  61.6  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.237024  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3022  glutamate synthase (NADH) large subunit  25.48 
 
 
1519 aa  61.6  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3135  Glutamate synthase (ferredoxin)  27.43 
 
 
1527 aa  61.6  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.815016  normal  0.26832 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1114  glutamate synthase (ferredoxin)  28.89 
 
 
1533 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.82784  normal  0.930552 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5479  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.32 
 
 
1526 aa  60.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3593  glutamate synthase (ferredoxin)  25 
 
 
1514 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.544233  normal  0.0352812 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2822  glutamate synthase (ferredoxin)  24.16 
 
 
1518 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.857674 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0094  glutamate synthase (ferredoxin)  29.94 
 
 
1581 aa  60.1  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000146352  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13895  ferredoxin-dependent glutamate synthase [NADPH] large subunit gltB  28.39 
 
 
1527 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0894  glutamate synthase (ferredoxin)  28.12 
 
 
1528 aa  59.7  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.08401  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16351  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30 
 
 
1531 aa  59.7  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2340  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.27 
 
 
1483 aa  59.7  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3126  glutamate synthase (NADH) large subunit  30.46 
 
 
1600 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2224  Glutamate synthase (ferredoxin)  26.09 
 
 
1519 aa  59.3  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3616  Glutamate synthase (ferredoxin)  27.32 
 
 
1574 aa  59.3  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.103413  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2942  Glutamate synthase (ferredoxin)  25.99 
 
 
1524 aa  58.9  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.290675  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2319  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.5 
 
 
1524 aa  58.5  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.189899 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3044  glutamate synthase (NADH) large subunit  25.14 
 
 
1518 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.417373  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3060  glutamate synthase (NADH) large subunit  25.14 
 
 
1518 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3103  glutamate synthase (NADH) large subunit  25.14 
 
 
1518 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.238876  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3198  Glutamate synthase (ferredoxin)  25.64 
 
 
1518 aa  58.5  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2500  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  25.23 
 
 
225 aa  58.5  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0493584  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87428  glutamate synthase  25.41 
 
 
2126 aa  58.2  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2953  glutamine amidotransferase, class-II  29.14 
 
 
1596 aa  58.5  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.401719  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2112  formylmethanofuran dehydrogenase  33.74 
 
 
254 aa  58.2  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>