More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0201 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0201  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  100 
 
 
240 aa  489  1e-137  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0526  glutamate synthase alpha subunit  54.55 
 
 
245 aa  247  2e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0540  glutamate synthase alpha subunit  54.55 
 
 
245 aa  247  2e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.800593  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0562  glutamate synthase alpha subunit  53.33 
 
 
242 aa  246  3e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2357  glutamate synthase alpha subunit domain protein  51.02 
 
 
250 aa  245  6e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800072  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2024  glutamate synthase alpha subunit  50.21 
 
 
246 aa  241  7e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0867  glutamate synthase alpha subunit  49.39 
 
 
256 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0287996  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1080  glutamate synthase alpha subunit  48.99 
 
 
263 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1596  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  48.58 
 
 
256 aa  231  9e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0029  glutamate synthase alpha subunit domain protein  50.2 
 
 
252 aa  227  1e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1289  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  45.68 
 
 
245 aa  224  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000639589 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0782  glutamate synthase, alpha subunit-like  45.68 
 
 
246 aa  224  1e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00542084  normal  0.210269 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1094  glutamate synthase alpha subunit  46.15 
 
 
256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1235  hypothetical protein  45.68 
 
 
248 aa  216  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1752  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  47.72 
 
 
249 aa  216  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.216628 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2490  glutamate synthase alpha subunit  46.72 
 
 
248 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1302  glutamate synthase alpha subunit  46 
 
 
261 aa  216  4e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1816  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  46.69 
 
 
251 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0997673  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1692  glutamate synthase alpha subunit  45.04 
 
 
247 aa  212  4.9999999999999996e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.737414  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16290  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  45.87 
 
 
245 aa  210  1e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.518041  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1339  glutamate synthase alpha subunit  45.71 
 
 
251 aa  210  2e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.794654 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0544  glutamate synthase alpha subunit domain protein  43.8 
 
 
281 aa  204  9e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00693523 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0663  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  44.44 
 
 
247 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.358325 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_945  glutamate synthase-like protein protein, alpha subunit-like protein  43.8 
 
 
256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0332  glutamate synthase alpha subunit  41.74 
 
 
245 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.951103  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0956  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  46.28 
 
 
256 aa  199  3e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1127  hypothetical protein  43.8 
 
 
256 aa  199  5e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000223973  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2708  glutamate synthase alpha subunit domain protein  42.98 
 
 
248 aa  195  6e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.414191  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0211  glutamate synthase alpha subunit  43.32 
 
 
264 aa  190  2e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0030  glutamate synthase alpha subunit  32.65 
 
 
670 aa  151  1e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1740  glutamate synthase alpha subunit domain protein  43.78 
 
 
659 aa  145  6e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.627915  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1885  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  41.38 
 
 
646 aa  132  6e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.273779  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1607  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  32.47 
 
 
572 aa  117  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1812  glutamate synthase alpha subunit  38.41 
 
 
568 aa  107  1e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000275446 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  35.26 
 
 
553 aa  108  1e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0830  glutamate synthase alpha subunit  38.65 
 
 
568 aa  106  4e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.990819  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1982  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.78 
 
 
1521 aa  76.6  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.349695  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0383  glutamate synthase alpha subunit domain protein  31.15 
 
 
635 aa  73.2  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2600  glutamate synthase, alpha subunit-like  35.26 
 
 
771 aa  72.4  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1370  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.6 
 
 
794 aa  72  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16351  ferredoxin-dependent glutamate synthase  35.26 
 
 
1531 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1503  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30.13 
 
 
1530 aa  70.1  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20710  glutamate synthase (NADH) large subunit  31.87 
 
 
1524 aa  68.9  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.42786 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0890  glutamate synthase (ferredoxin)  31.21 
 
 
1536 aa  68.2  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00390315  decreased coverage  0.000127994 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0730  glutamate synthase, large subunit  29.63 
 
 
1475 aa  68.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0878  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.63 
 
 
1475 aa  68.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1219  Glutamate synthase (ferredoxin)  26.51 
 
 
1525 aa  66.6  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.589961  normal  0.962678 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1482  glutamate synthase, large subunit  31.95 
 
 
1473 aa  64.3  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2389  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.49 
 
 
777 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1078  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.36 
 
 
1529 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1723  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.8 
 
 
777 aa  64.3  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19531  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.36 
 
 
1475 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2016  glutamate synthase (NADPH)  28.84 
 
 
1535 aa  63.5  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3782  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.3 
 
 
1554 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.376942  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0563  formylmethanofuran dehydrogenase  32.54 
 
 
289 aa  63.2  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0326  glutamate synthase (ferredoxin)  30.13 
 
 
1533 aa  62  0.000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.127491  normal  0.144966 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0529  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.71 
 
 
1474 aa  61.6  0.000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.41827  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1098  formylmethanofuran dehydrogenase  35.54 
 
 
257 aa  62  0.000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1458  glutamate synthase  28.21 
 
 
1508 aa  61.2  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0475565  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2159  glutamate synthase alpha subunit  35.94 
 
 
771 aa  61.6  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.681462  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1468  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.58 
 
 
1551 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1157  glutamate synthase alpha subunit domain protein  30 
 
 
381 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000112739  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2961  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.58 
 
 
1536 aa  60.8  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.495295  normal  0.583434 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1665  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  31.45 
 
 
269 aa  59.7  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.477479  normal  0.947493 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2276  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.22 
 
 
776 aa  59.7  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3730  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.17 
 
 
1554 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3213  Glutamate synthase (ferredoxin)  26.56 
 
 
1542 aa  59.7  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2949  Glutamate synthase (ferredoxin)  27.46 
 
 
1501 aa  59.3  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341665  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1189  glutamate synthase alpha subunit  36.8 
 
 
255 aa  59.3  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23581  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.49 
 
 
1527 aa  59.3  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.242858 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2112  formylmethanofuran dehydrogenase  33.33 
 
 
254 aa  58.9  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5702  Glutamate synthase (ferredoxin)  25.13 
 
 
1550 aa  58.9  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0107  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.09 
 
 
1535 aa  58.5  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3072  Glutamate synthase (ferredoxin)  27.59 
 
 
1527 aa  58.5  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.191791  hitchhiker  0.00286701 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5698  glutamate synthase (ferredoxin)  28.8 
 
 
1514 aa  58.5  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.471666 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01631  glutamate synthase subunit alpha  28.96 
 
 
1460 aa  58.2  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28040  glutamate synthase (NADH) large subunit  26.23 
 
 
1527 aa  57.8  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.723113  normal  0.697076 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0653  glutamate synthase  31.97 
 
 
1571 aa  58.2  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.58912  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2217  Glutamate synthase (ferredoxin)  27.97 
 
 
1516 aa  57.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1294  glutamate synthase (ferredoxin)  27.91 
 
 
1562 aa  57.4  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.163498  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3807  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.39 
 
 
1502 aa  56.6  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.344591  hitchhiker  0.00201054 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3748  glutamate synthase subunit alpha  28.83 
 
 
1488 aa  57  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956068  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1957  glutamate synthase subunit alpha  27.5 
 
 
1493 aa  56.6  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0244714  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0145  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.38 
 
 
1533 aa  56.2  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.705237  normal  0.20582 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5693  Glutamate synthase (ferredoxin)  26.7 
 
 
1512 aa  56.6  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0495  formylmethanofuran dehydrogenase  31.85 
 
 
272 aa  55.8  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.943026  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1666  glutamate synthase (ferredoxin)  30.43 
 
 
1512 aa  56.2  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0329464  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0526  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.57 
 
 
1548 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.801021  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3033  glutamate synthase subunit alpha  28.86 
 
 
1485 aa  55.5  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0302  glutamate synthase (NADPH) large subunit  28.85 
 
 
1509 aa  55.5  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.466931 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0585  glutamate synthase, large subunit, putative  30.99 
 
 
1478 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0498  glutamate synthase, large subunit  30.99 
 
 
1478 aa  55.1  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0441  glutamate synthase, NADPH, large subunit  30.99 
 
 
1478 aa  55.5  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0437  glutamate synthase, NADPH, large subunit  30.99 
 
 
1478 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0586  putative glutamate synthase, large subunit  30.99 
 
 
1478 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0513  putative glutamate synthase, large subunit  30.99 
 
 
1478 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0530  glutamate synthase, large subunit  30.99 
 
 
1478 aa  55.1  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1126  glutamate synthase subunit alpha  27.75 
 
 
1482 aa  54.7  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.052618  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3022  glutamate synthase (NADH) large subunit  27.63 
 
 
1519 aa  54.7  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0857  glutamate synthase subunit alpha  26.53 
 
 
1483 aa  54.7  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.245541 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>