More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0029 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0029  glutamate synthase alpha subunit domain protein  100 
 
 
252 aa  490  1e-137  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2357  glutamate synthase alpha subunit domain protein  66.94 
 
 
250 aa  345  4e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800072  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0562  glutamate synthase alpha subunit  58.44 
 
 
242 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2024  glutamate synthase alpha subunit  53.47 
 
 
246 aa  280  2e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1289  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  53.28 
 
 
245 aa  276  3e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000639589 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0540  glutamate synthase alpha subunit  55.92 
 
 
245 aa  260  1e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.800593  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0526  glutamate synthase alpha subunit  55.92 
 
 
245 aa  260  1e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1816  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  52.05 
 
 
251 aa  255  5e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0997673  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16290  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  50.61 
 
 
245 aa  254  7e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.518041  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2490  glutamate synthase alpha subunit  50.61 
 
 
248 aa  247  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1339  glutamate synthase alpha subunit  50 
 
 
251 aa  244  6.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.794654 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0544  glutamate synthase alpha subunit domain protein  46.9 
 
 
281 aa  243  3e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00693523 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1235  hypothetical protein  47.76 
 
 
248 aa  236  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1752  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  48.56 
 
 
249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.216628 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0211  glutamate synthase alpha subunit  49.41 
 
 
264 aa  231  1e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0201  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  50.2 
 
 
240 aa  227  1e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0956  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  49.21 
 
 
256 aa  224  8e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1127  hypothetical protein  48.79 
 
 
256 aa  222  6e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000223973  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_945  glutamate synthase-like protein protein, alpha subunit-like protein  48.02 
 
 
256 aa  221  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1596  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  48 
 
 
256 aa  217  1e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1080  glutamate synthase alpha subunit  47.6 
 
 
263 aa  216  2e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0867  glutamate synthase alpha subunit  48 
 
 
256 aa  217  2e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0287996  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0782  glutamate synthase, alpha subunit-like  43.09 
 
 
246 aa  211  1e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00542084  normal  0.210269 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1094  glutamate synthase alpha subunit  47.2 
 
 
256 aa  210  2e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1302  glutamate synthase alpha subunit  48.43 
 
 
261 aa  206  2e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2708  glutamate synthase alpha subunit domain protein  41.53 
 
 
248 aa  203  3e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.414191  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0332  glutamate synthase alpha subunit  40.41 
 
 
245 aa  202  5e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.951103  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0663  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  43.32 
 
 
247 aa  194  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.358325 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1692  glutamate synthase alpha subunit  39.75 
 
 
247 aa  191  7e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.737414  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0030  glutamate synthase alpha subunit  44.85 
 
 
670 aa  175  6e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1740  glutamate synthase alpha subunit domain protein  40.44 
 
 
659 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.627915  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1885  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  39.59 
 
 
646 aa  137  2e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.273779  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1607  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  42.33 
 
 
572 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1812  glutamate synthase alpha subunit  35.68 
 
 
568 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000275446 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0383  glutamate synthase alpha subunit domain protein  32.13 
 
 
635 aa  110  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0830  glutamate synthase alpha subunit  32.92 
 
 
568 aa  107  1e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.990819  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  37.97 
 
 
553 aa  106  3e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1370  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.55 
 
 
794 aa  100  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2276  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.84 
 
 
776 aa  97.1  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1377  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.23 
 
 
793 aa  97.1  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.118947  normal  0.859258 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1723  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.7 
 
 
777 aa  95.5  8e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2389  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.98 
 
 
777 aa  93.2  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0102  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.43 
 
 
777 aa  86.7  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1982  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.43 
 
 
1521 aa  80.5  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.349695  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1458  glutamate synthase  28.32 
 
 
1508 aa  76.6  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0475565  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2600  glutamate synthase, alpha subunit-like  28.64 
 
 
771 aa  74.7  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20710  glutamate synthase (NADH) large subunit  32.69 
 
 
1524 aa  73.2  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.42786 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0890  glutamate synthase (ferredoxin)  29.8 
 
 
1536 aa  72  0.000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00390315  decreased coverage  0.000127994 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3022  glutamate synthase (NADH) large subunit  25.09 
 
 
1519 aa  71.2  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1157  glutamate synthase alpha subunit domain protein  25 
 
 
381 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000112739  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0730  glutamate synthase, large subunit  29.15 
 
 
1475 aa  71.2  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0878  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.15 
 
 
1475 aa  71.2  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3072  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.29 
 
 
1527 aa  70.5  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.191791  hitchhiker  0.00286701 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2159  glutamate synthase alpha subunit  32.73 
 
 
771 aa  70.1  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.681462  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2866  Glutamate synthase (ferredoxin)  26.6 
 
 
1519 aa  69.7  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.166773  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1503  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.06 
 
 
1530 aa  69.3  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3060  glutamate synthase (NADH) large subunit  29.63 
 
 
1518 aa  68.9  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3044  glutamate synthase (NADH) large subunit  29.63 
 
 
1518 aa  68.9  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.417373  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3103  glutamate synthase (NADH) large subunit  29.63 
 
 
1518 aa  68.9  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.238876  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5693  Glutamate synthase (ferredoxin)  26.56 
 
 
1512 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0107  Glutamate synthase (ferredoxin)  26.19 
 
 
1535 aa  67.4  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2949  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.35 
 
 
1501 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341665  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1078  glutamate synthase (NADH) large subunit  28.04 
 
 
1513 aa  66.6  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.706498  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5698  glutamate synthase (ferredoxin)  30.13 
 
 
1514 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.471666 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0529  Glutamate synthase (ferredoxin)  34.24 
 
 
1474 aa  66.2  0.0000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.41827  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13895  ferredoxin-dependent glutamate synthase [NADPH] large subunit gltB  28.33 
 
 
1527 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2822  glutamate synthase (ferredoxin)  25.39 
 
 
1518 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.857674 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1114  glutamate synthase (ferredoxin)  31.82 
 
 
1533 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.82784  normal  0.930552 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3782  Glutamate synthase (ferredoxin)  32.56 
 
 
1554 aa  65.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.376942  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1468  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.34 
 
 
1551 aa  65.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3748  glutamate synthase subunit alpha  32.57 
 
 
1488 aa  65.1  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956068  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0118  Glutamate synthase (ferredoxin)  27.91 
 
 
1537 aa  64.7  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.750611  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2942  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.22 
 
 
1524 aa  65.1  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.290675  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28040  glutamate synthase (NADH) large subunit  27.41 
 
 
1527 aa  64.7  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.723113  normal  0.697076 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2961  Glutamate synthase (ferredoxin)  33.06 
 
 
1536 aa  65.1  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.495295  normal  0.583434 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3593  glutamate synthase (ferredoxin)  25.91 
 
 
1514 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.544233  normal  0.0352812 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4114  glutamate synthase subunit alpha  29.95 
 
 
1461 aa  64.3  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000785816 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1173  glutamate synthase (NADH) large subunit  24.68 
 
 
1520 aa  63.9  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1219  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.06 
 
 
1525 aa  63.5  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.589961  normal  0.962678 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02910  glutamate synthase (NADH), putative  30.13 
 
 
2135 aa  63.9  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.844202  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3213  Glutamate synthase (ferredoxin)  27.56 
 
 
1542 aa  63.5  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5920  glutamate synthase alpha subunit  24.22 
 
 
232 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.755435  normal  0.413716 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1686  Glutamate synthase (ferredoxin)  26.29 
 
 
1537 aa  63.5  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000647876 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1691  glutamate synthase (NADH) large subunit  30.43 
 
 
1519 aa  63.5  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.103385  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0834  glutamate synthase subunit alpha  29.02 
 
 
1482 aa  63.2  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87862  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3730  Glutamate synthase (ferredoxin)  32.56 
 
 
1554 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_51965  predicted protein  28.42 
 
 
1562 aa  62.4  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.738666  normal  0.0653658 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2165  glutamate synthase subunit alpha  32.67 
 
 
1487 aa  62.8  0.000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.409887  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0393  glutamate synthase (ferredoxin)  29.39 
 
 
1507 aa  62.4  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5479  Glutamate synthase (ferredoxin)  26.09 
 
 
1526 aa  62.4  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1874  glutamate synthase subunit alpha  32.67 
 
 
1487 aa  62  0.000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3450  glutamate synthase-related protein  31.41 
 
 
1510 aa  62  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3167  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.37 
 
 
1573 aa  61.6  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0752017  normal  0.029399 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3166  Glutamate synthase (ferredoxin)  26.6 
 
 
1516 aa  61.6  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.563815  normal  0.707717 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0894  glutamate synthase (ferredoxin)  29.49 
 
 
1528 aa  61.2  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.08401  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0857  glutamate synthase subunit alpha  30.16 
 
 
1483 aa  61.6  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.245541 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3392  glutamate synthase (ferredoxin)  26.83 
 
 
1573 aa  60.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.140054  normal  0.116852 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0403  glutamate synthase subunit alpha  36.51 
 
 
1507 aa  61.2  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0405842 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_56605  predicted protein  28.57 
 
 
1697 aa  61.2  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0809416  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0550  glutamate synthase subunit alpha  31.49 
 
 
1482 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.213876 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>