More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0107 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001305  ANIA_05134  Glutamate synthase Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y8F4]  49.68 
 
 
2126 aa  1437    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03077  glutamate synthase, large subunit  43.92 
 
 
1517 aa  1196    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.427677  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0495  Glutamate synthase (ferredoxin)  43.92 
 
 
1517 aa  1196    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5076  glutamate synthase subunit alpha  42.88 
 
 
1481 aa  1177    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2039  glutamate synthase, large subunit  53.72 
 
 
1542 aa  1616    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545584  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2965  glutamate synthase (large subunit) oxidoreductase protein  52.86 
 
 
1582 aa  1591    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0033  glutamate synthase, large subunit  48.48 
 
 
1495 aa  1425    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.281504  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0761  putative glutamate synthase, ferredoxin-dependent  52.22 
 
 
1535 aa  1586    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4501  glutamate synthase subunit alpha  43.41 
 
 
1486 aa  1188    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0007  glutamate synthase, large subunit  48.54 
 
 
1496 aa  1426    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0054  glutamate synthase, large subunit  53.13 
 
 
1583 aa  1588    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.673781  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1325  glutamate synthase subunit alpha  44.58 
 
 
1482 aa  1209    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5123  glutamate synthase, large subunit  44.25 
 
 
1481 aa  1215    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1056  glutamate synthase subunit alpha  44.02 
 
 
1486 aa  1208    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2395  glutamate synthase (ferredoxin)  51.53 
 
 
1586 aa  1550    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2736  glutamate synthase, large subunit  51.97 
 
 
1581 aa  1561    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02910  glutamate synthase (NADH), putative  48.14 
 
 
2135 aa  1373    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.844202  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0411  glutamate synthase subunit alpha  44.61 
 
 
1481 aa  1223    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1874  glutamate synthase subunit alpha  42.78 
 
 
1487 aa  1185    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0217  glutamate synthase (NADH) large subunit  53.3 
 
 
1544 aa  1592    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1173  glutamate synthase (NADH) large subunit  65.96 
 
 
1520 aa  1981    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1078  ferredoxin-dependent glutamate synthase  42.56 
 
 
1529 aa  1201    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3126  glutamate synthase (NADH) large subunit  52.38 
 
 
1600 aa  1595    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2767  glutamate synthase subunit alpha  45.85 
 
 
1494 aa  1243    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2953  glutamine amidotransferase, class-II  52.75 
 
 
1596 aa  1570    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.401719  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1294  glutamate synthase (ferredoxin)  44.19 
 
 
1562 aa  1254    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.163498  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3718  glutamate synthase, large subunit  51.97 
 
 
1648 aa  1557    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1604  glutamate synthase (ferredoxin)  53.45 
 
 
1554 aa  1603    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.505347  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0413  glutamate synthase subunit alpha  44.32 
 
 
1481 aa  1213    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.359883 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1146  glutamate synthase (NADPH) large subunit  42.85 
 
 
1512 aa  1157    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1482  glutamate synthase, large subunit  40.86 
 
 
1473 aa  1044    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3499  glutamate synthase (NADH) large subunit  51.88 
 
 
1567 aa  1558    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0502  glutamate synthase (ferredoxin)  54.86 
 
 
1533 aa  1660    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.154267  normal  0.477392 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2016  glutamate synthase (NADPH)  42.89 
 
 
1535 aa  1149    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0186  glutamate synthase, large subunit  55.03 
 
 
1533 aa  1684    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0326  glutamate synthase (ferredoxin)  42.76 
 
 
1533 aa  1155    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.127491  normal  0.144966 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1617  glutamate synthase (ferredoxin)  52.61 
 
 
1553 aa  1569    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1957  glutamate synthase subunit alpha  43.03 
 
 
1493 aa  1176    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0244714  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3216  glutamate synthase, large subunit  51.97 
 
 
1567 aa  1561    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1176  glutamate synthase (NADPH) large subunit  39.97 
 
 
1479 aa  1088    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1604  ferredoxin-dependent glutamate synthase  41.22 
 
 
1468 aa  1134    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0890  glutamate synthase (ferredoxin)  44.81 
 
 
1536 aa  1245    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00390315  decreased coverage  0.000127994 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0019  glutamate synthase (NADPH) large subunit  45.21 
 
 
1524 aa  1233    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3014  glutamate synthase, large subunit  52.23 
 
 
1624 aa  1568    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0817  glutamate synthase (NADH) large subunit  57.69 
 
 
1535 aa  1747    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3013  glutamate synthase (NADH) large subunit  67.27 
 
 
1518 aa  2066    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0945186 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4531  glutamate synthase ferredoxin subunit  52.72 
 
 
1579 aa  1573    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.688027  normal  0.696569 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3176  glutamate synthase (NADH) large subunit  54.2 
 
 
1546 aa  1621    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0251  glutamate synthase (NADPH) large subunit  43.05 
 
 
1511 aa  1166    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2933  glutamate synthase (ferredoxin)  51.79 
 
 
1577 aa  1541    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.761272  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2683  glutamate synthase subunit alpha  43.7 
 
 
1481 aa  1189    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.141774 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0761  glutamate synthase ferredoxin subunit  52.47 
 
 
1573 aa  1578    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.220538  normal  0.186889 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0653  glutamate synthase  44.22 
 
 
1571 aa  1263    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.58912  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0791  glutamate synthase (NADH) large subunit  52 
 
 
1580 aa  1550    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.116614  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0365  glutamate synthase (NADH) large subunit  52.1 
 
 
1567 aa  1565    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.512142 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2790  glutamate synthase subunit alpha  43.97 
 
 
1482 aa  1196    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0875  glutamate synthase ferredoxin subunit  52.79 
 
 
1582 aa  1567    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0619471  normal  0.609882 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0615  glutamate synthase subunit alpha  43.91 
 
 
1483 aa  1191    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1138  glutamate synthase (ferredoxin)  51.92 
 
 
1587 aa  1554    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.207382  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2165  glutamate synthase subunit alpha  42.79 
 
 
1487 aa  1175    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.409887  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3263  glutamate synthase (NADH) large subunit  52.26 
 
 
1631 aa  1562    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3680  glutamate synthase (NADH) large subunit  56.39 
 
 
1535 aa  1674    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.117206  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2626  glutamate synthase (ferredoxin)  53 
 
 
1585 aa  1564    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.77642  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2823  glutamate synthase (NADPH) large subunit  44.14 
 
 
1510 aa  1186    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2140  glutamate synthase (ferredoxin)  43.96 
 
 
1510 aa  1196    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.697929  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2705  glutamate synthase (ferredoxin)  52.12 
 
 
1659 aa  1558    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3044  glutamate synthase (NADH) large subunit  62.44 
 
 
1518 aa  1896    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.417373  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5066  glutamate synthase (NADH) large subunit  76.03 
 
 
1527 aa  2379    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0341  glutamate synthase (NADH) large subunit  56.93 
 
 
1489 aa  1629    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3748  glutamate synthase subunit alpha  43.93 
 
 
1488 aa  1217    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956068  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2744  glutamate synthase (NADH) large subunit  52.76 
 
 
1574 aa  1571    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3776  glutamate synthase (NADH) large subunit  52.67 
 
 
1512 aa  1597    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0466  glutamate synthase (ferredoxin)  43.74 
 
 
1546 aa  1230    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.549913  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2872  glutamate synthase subunit alpha  44.57 
 
 
1482 aa  1209    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0333567 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2954  glutamate synthase subunit alpha  44.57 
 
 
1482 aa  1209    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.791133  normal  0.168031 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2763  glutamate synthase subunit alpha  44.76 
 
 
1491 aa  1225    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2951  glutamate synthase subunit alpha  43.84 
 
 
1482 aa  1196    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0302  glutamate synthase (NADPH) large subunit  42.03 
 
 
1509 aa  1068    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.466931 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0321  glutamate synthase (ferredoxin)  51.59 
 
 
1567 aa  1555    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.917459  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66570  glutamate synthase subunit alpha  44.3 
 
 
1481 aa  1212    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1407  glutamate synthase (NADH) large subunit  44.89 
 
 
1489 aa  1301    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0818  glutamate synthase (NADH) large subunit  43.37 
 
 
1506 aa  1248    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1691  glutamate synthase (NADH) large subunit  60.69 
 
 
1519 aa  1804    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.103385  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0402  glutamate synthase (ferredoxin)  52.08 
 
 
1567 aa  1563    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0706  glutamate synthase (NADH) large subunit  52.43 
 
 
1512 aa  1590    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.985465  normal  0.0881297 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3050  glutamate synthase subunit alpha  44.5 
 
 
1482 aa  1209    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.156524 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1078  glutamate synthase (NADH) large subunit  65.69 
 
 
1513 aa  1984    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.706498  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1487  glutamate synthase, large subunit  39.04 
 
 
1465 aa  1046    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0194294  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0741  glutamate synthase (NADH) large subunit  52.34 
 
 
1577 aa  1577    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.704994  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0628  glutamate synthase (NADH) large subunit  54.89 
 
 
1533 aa  1669    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0488  glutamate synthase (ferredoxin)  43.25 
 
 
1516 aa  1144    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3022  glutamate synthase (NADH) large subunit  65.54 
 
 
1519 aa  1984    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0857  glutamate synthase subunit alpha  43.8 
 
 
1483 aa  1191    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.245541 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3103  glutamate synthase (NADH) large subunit  62.44 
 
 
1518 aa  1896    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.238876  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5154  glutamate synthase (NADH) large subunit  76.03 
 
 
1527 aa  2379    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.631687 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1007  glutamate synthase (ferredoxin)  51.46 
 
 
1533 aa  1539    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.465703  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2822  glutamate synthase (ferredoxin)  62.47 
 
 
1518 aa  1902    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.857674 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5698  glutamate synthase (ferredoxin)  75.52 
 
 
1514 aa  2336    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.471666 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0834  glutamate synthase subunit alpha  44.82 
 
 
1482 aa  1207    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87862  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1008  glutamate synthase (NADH) large subunit  51.66 
 
 
1566 aa  1538    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>