110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2708 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2708  glutamate synthase alpha subunit domain protein  100 
 
 
248 aa  494  1e-139  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.414191  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1692  glutamate synthase alpha subunit  65.59 
 
 
247 aa  338  2.9999999999999998e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.737414  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0332  glutamate synthase alpha subunit  67.34 
 
 
245 aa  338  5e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.951103  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0663  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  65.73 
 
 
247 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.358325 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0782  glutamate synthase, alpha subunit-like  61.94 
 
 
246 aa  317  1e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00542084  normal  0.210269 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1302  glutamate synthase alpha subunit  49.6 
 
 
261 aa  249  3e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1080  glutamate synthase alpha subunit  48.41 
 
 
263 aa  246  3e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1596  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  48.02 
 
 
256 aa  244  6.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0867  glutamate synthase alpha subunit  48.02 
 
 
256 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0287996  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1094  glutamate synthase alpha subunit  45.63 
 
 
256 aa  234  8e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2024  glutamate synthase alpha subunit  47.76 
 
 
246 aa  219  1.9999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1339  glutamate synthase alpha subunit  48.59 
 
 
251 aa  215  4e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.794654 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0526  glutamate synthase alpha subunit  45.97 
 
 
245 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0540  glutamate synthase alpha subunit  45.97 
 
 
245 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.800593  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1816  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  45.56 
 
 
251 aa  208  7e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0997673  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2357  glutamate synthase alpha subunit domain protein  43.32 
 
 
250 aa  207  9e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800072  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0029  glutamate synthase alpha subunit domain protein  41.53 
 
 
252 aa  203  3e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0544  glutamate synthase alpha subunit domain protein  45.59 
 
 
281 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00693523 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1752  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  41.63 
 
 
249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.216628 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0562  glutamate synthase alpha subunit  41.25 
 
 
242 aa  198  7.999999999999999e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1235  hypothetical protein  41.7 
 
 
248 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2490  glutamate synthase alpha subunit  42.04 
 
 
248 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0201  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  42.98 
 
 
240 aa  195  6e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16290  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  42.21 
 
 
245 aa  192  4e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.518041  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0956  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  42.86 
 
 
256 aa  189  2e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_945  glutamate synthase-like protein protein, alpha subunit-like protein  42.45 
 
 
256 aa  190  2e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1127  hypothetical protein  42.45 
 
 
256 aa  188  5.999999999999999e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000223973  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1289  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  39.51 
 
 
245 aa  186  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000639589 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0211  glutamate synthase alpha subunit  40.89 
 
 
264 aa  185  7e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0030  glutamate synthase alpha subunit  39.07 
 
 
670 aa  135  9e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1740  glutamate synthase alpha subunit domain protein  37.88 
 
 
659 aa  121  8e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.627915  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1885  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  29.23 
 
 
646 aa  114  1.0000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.273779  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1607  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  40.33 
 
 
572 aa  95.9  6e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1812  glutamate synthase alpha subunit  34.62 
 
 
568 aa  93.2  3e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000275446 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0830  glutamate synthase alpha subunit  35.33 
 
 
568 aa  90.5  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.990819  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  35.64 
 
 
553 aa  88.2  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1982  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.76 
 
 
1521 aa  62  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.349695  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0102  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.15 
 
 
777 aa  59.7  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0525  tungsten formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C-like  49.18 
 
 
295 aa  58.5  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.618523  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20710  glutamate synthase (NADH) large subunit  27.4 
 
 
1524 aa  56.6  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.42786 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2217  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.27 
 
 
1516 aa  54.7  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1370  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.72 
 
 
794 aa  54.3  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2389  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.33 
 
 
777 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1700  glutamate synthase alpha subunit domain protein  28.64 
 
 
236 aa  53.5  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1377  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.04 
 
 
793 aa  53.5  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.118947  normal  0.859258 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1189  glutamate synthase alpha subunit  30.99 
 
 
255 aa  53.1  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1686  Glutamate synthase (ferredoxin)  26.42 
 
 
1537 aa  52.8  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000647876 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0084  formylmethanofuran dehydrogenase  29.23 
 
 
425 aa  52.8  0.000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0563  formylmethanofuran dehydrogenase  29.66 
 
 
289 aa  52.4  0.000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0529  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.97 
 
 
1474 aa  52.4  0.000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.41827  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1137  formyl-methanofuran dehydrogenase subunit C  31.61 
 
 
229 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.165169 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2276  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.73 
 
 
776 aa  51.2  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0383  glutamate synthase alpha subunit domain protein  27.16 
 
 
635 aa  50.4  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1098  formylmethanofuran dehydrogenase  35.92 
 
 
257 aa  51.2  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6007  glutamate synthase alpha subunit  27.88 
 
 
228 aa  50.8  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.607641  decreased coverage  0.00322278 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4696  glutamate synthase family protein  26.07 
 
 
235 aa  50.1  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.917164 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2112  formylmethanofuran dehydrogenase  32.14 
 
 
254 aa  50.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1691  glutamate synthase (NADH) large subunit  26.42 
 
 
1519 aa  49.7  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.103385  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5750  formyl-methanofuran dehydrogenase  26.44 
 
 
228 aa  50.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5932  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  32.58 
 
 
274 aa  49.7  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0388185  normal  0.0470213 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2600  glutamate synthase, alpha subunit-like  30.92 
 
 
771 aa  49.3  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0567  glutamate synthase  25.57 
 
 
1523 aa  48.9  0.00007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11000  glutamate synthase (NADH) large subunit  27.69 
 
 
1550 aa  48.9  0.00008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.542266  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2159  glutamate synthase alpha subunit  29.69 
 
 
771 aa  48.5  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.681462  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0342  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  31.5 
 
 
272 aa  48.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1503  ferredoxin-dependent glutamate synthase  25.43 
 
 
1530 aa  48.5  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0495  formylmethanofuran dehydrogenase  29.92 
 
 
272 aa  46.6  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.943026  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28040  glutamate synthase (NADH) large subunit  25.45 
 
 
1527 aa  46.6  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.723113  normal  0.697076 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1943  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  25.82 
 
 
227 aa  46.6  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.513232 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6576  glutamate synthase alpha subunit domain protein  26.83 
 
 
228 aa  46.2  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.026671 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3292  glutamate synthase alpha subunit  25.99 
 
 
228 aa  46.2  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2942  Glutamate synthase (ferredoxin)  24.22 
 
 
1524 aa  46.2  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.290675  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2233  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  28.46 
 
 
304 aa  46.2  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.0399291 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1176  glutamate synthase (NADPH) large subunit  26.24 
 
 
1479 aa  46.2  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1869  putative glutamate synthase  34.04 
 
 
225 aa  45.8  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.310557  normal  0.791624 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1663  formylmethanofuran dehydrogenase  32.37 
 
 
424 aa  45.8  0.0007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1424  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  31.34 
 
 
272 aa  45.4  0.0007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.176644  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5639  glutamate synthase alpha subunit domain protein  26.83 
 
 
228 aa  45.8  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.55547  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0618  formylmethanofuran dehydrogenase  30.43 
 
 
268 aa  45.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.031501  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3167  ferredoxin-dependent glutamate synthase  24.66 
 
 
1573 aa  45.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0752017  normal  0.029399 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2161  glutamate synthase (ferredoxin)  25.47 
 
 
1519 aa  45.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.706434  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1290  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  30.71 
 
 
301 aa  43.9  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1069  glutamate synthase alpha subunit  32.43 
 
 
312 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3807  Glutamate synthase (ferredoxin)  23.79 
 
 
1502 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.344591  hitchhiker  0.00201054 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0610  Glutamate synthase (ferredoxin)  25 
 
 
1510 aa  44.3  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0890  glutamate synthase (ferredoxin)  27.45 
 
 
1536 aa  43.5  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00390315  decreased coverage  0.000127994 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1487  glutamate synthase, large subunit  26.9 
 
 
1465 aa  43.5  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0194294  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0683  glutamate synthase (ferredoxin)  30.95 
 
 
1580 aa  43.5  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.146525  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5262  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  28.14 
 
 
238 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.221211 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0878  glutamate synthase alpha subunit  26.8 
 
 
312 aa  43.9  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.225814  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4809  glutamate synthase alpha subunit  29.24 
 
 
229 aa  43.5  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.453145  hitchhiker  0.00411559 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4894  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  27.71 
 
 
238 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4983  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  27.71 
 
 
238 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6507  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  31.3 
 
 
286 aa  43.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0305137 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1157  glutamate synthase alpha subunit domain protein  32.67 
 
 
381 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000112739  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1607  tungsten containing formylmethanofruran dehydrogenase subunit C-related protein  26.92 
 
 
313 aa  42.7  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1473  formylmethanofuran dehydrogenase  28.73 
 
 
275 aa  43.1  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.143119  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1939  glutamate synthase alpha subunit domain protein  27.03 
 
 
229 aa  42.7  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.490233  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0145  Glutamate synthase (ferredoxin)  27.69 
 
 
1533 aa  43.1  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.705237  normal  0.20582 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5693  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.48 
 
 
1512 aa  42.7  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>