More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2357 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2357  glutamate synthase alpha subunit domain protein  100 
 
 
250 aa  497  1e-140  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800072  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0029  glutamate synthase alpha subunit domain protein  66.94 
 
 
252 aa  345  4e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2024  glutamate synthase alpha subunit  57.96 
 
 
246 aa  307  9e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0562  glutamate synthase alpha subunit  62.55 
 
 
242 aa  299  2e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1289  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  56.15 
 
 
245 aa  284  8e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000639589 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16290  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  56.33 
 
 
245 aa  274  9e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.518041  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0540  glutamate synthase alpha subunit  57.96 
 
 
245 aa  265  5.999999999999999e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.800593  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0526  glutamate synthase alpha subunit  57.96 
 
 
245 aa  265  5.999999999999999e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2490  glutamate synthase alpha subunit  54.69 
 
 
248 aa  258  5.0000000000000005e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1816  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  51.43 
 
 
251 aa  255  4e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0997673  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0544  glutamate synthase alpha subunit domain protein  48.85 
 
 
281 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00693523 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1235  hypothetical protein  51.84 
 
 
248 aa  252  4.0000000000000004e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1752  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  53.09 
 
 
249 aa  246  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.216628 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0201  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  51.02 
 
 
240 aa  245  6e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0956  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  51 
 
 
256 aa  242  5e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1339  glutamate synthase alpha subunit  49.39 
 
 
251 aa  241  6e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.794654 
 
 
-
 
NC_002936  DET1127  hypothetical protein  50.6 
 
 
256 aa  240  1e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000223973  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_945  glutamate synthase-like protein protein, alpha subunit-like protein  50.2 
 
 
256 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1080  glutamate synthase alpha subunit  45.24 
 
 
263 aa  221  7e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0782  glutamate synthase, alpha subunit-like  44.35 
 
 
246 aa  221  8e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00542084  normal  0.210269 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1094  glutamate synthase alpha subunit  45.63 
 
 
256 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1596  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  44.84 
 
 
256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0867  glutamate synthase alpha subunit  45.24 
 
 
256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0287996  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0211  glutamate synthase alpha subunit  45.28 
 
 
264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0332  glutamate synthase alpha subunit  43.5 
 
 
245 aa  212  5.999999999999999e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.951103  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1302  glutamate synthase alpha subunit  45.28 
 
 
261 aa  209  3e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2708  glutamate synthase alpha subunit domain protein  43.32 
 
 
248 aa  207  9e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.414191  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1692  glutamate synthase alpha subunit  42.68 
 
 
247 aa  205  6e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.737414  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0663  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  42.57 
 
 
247 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.358325 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0030  glutamate synthase alpha subunit  44.19 
 
 
670 aa  171  1e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1740  glutamate synthase alpha subunit domain protein  44.22 
 
 
659 aa  151  8.999999999999999e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.627915  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1885  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  43.46 
 
 
646 aa  142  4e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.273779  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1607  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  40.44 
 
 
572 aa  122  4e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1812  glutamate synthase alpha subunit  38.76 
 
 
568 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000275446 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0830  glutamate synthase alpha subunit  38.25 
 
 
568 aa  112  5e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.990819  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  38.46 
 
 
553 aa  105  6e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1370  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.09 
 
 
794 aa  95.1  8e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0383  glutamate synthase alpha subunit domain protein  28.7 
 
 
635 aa  90.9  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2389  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.51 
 
 
777 aa  87.8  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20710  glutamate synthase (NADH) large subunit  36.48 
 
 
1524 aa  84.7  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.42786 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1377  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.95 
 
 
793 aa  84  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.118947  normal  0.859258 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3072  Glutamate synthase (ferredoxin)  33.14 
 
 
1527 aa  83.6  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.191791  hitchhiker  0.00286701 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5693  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.75 
 
 
1512 aa  82.8  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1982  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.05 
 
 
1521 aa  82.4  0.000000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.349695  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1723  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.37 
 
 
777 aa  82  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2276  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30 
 
 
776 aa  78.6  0.00000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1503  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30.37 
 
 
1530 aa  78.2  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0107  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.47 
 
 
1535 aa  77  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3022  glutamate synthase (NADH) large subunit  29.44 
 
 
1519 aa  76.6  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3044  glutamate synthase (NADH) large subunit  28.51 
 
 
1518 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.417373  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3060  glutamate synthase (NADH) large subunit  28.51 
 
 
1518 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3103  glutamate synthase (NADH) large subunit  28.51 
 
 
1518 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.238876  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0102  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.61 
 
 
777 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3213  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.84 
 
 
1542 aa  75.9  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1458  glutamate synthase  30.81 
 
 
1508 aa  74.7  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0475565  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2942  Glutamate synthase (ferredoxin)  30 
 
 
1524 aa  74.7  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.290675  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2822  glutamate synthase (ferredoxin)  27.66 
 
 
1518 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.857674 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2600  glutamate synthase, alpha subunit-like  29.38 
 
 
771 aa  73.6  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0118  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.36 
 
 
1537 aa  73.2  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.750611  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1173  glutamate synthase (NADH) large subunit  30.37 
 
 
1520 aa  72.8  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3593  glutamate synthase (ferredoxin)  27.66 
 
 
1514 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.544233  normal  0.0352812 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28040  glutamate synthase (NADH) large subunit  32.7 
 
 
1527 aa  72.4  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.723113  normal  0.697076 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2949  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.14 
 
 
1501 aa  72  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341665  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0878  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.21 
 
 
1475 aa  72  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0730  glutamate synthase, large subunit  31.21 
 
 
1475 aa  72  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2866  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.41 
 
 
1519 aa  71.6  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.166773  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1686  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.4 
 
 
1537 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000647876 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2217  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.08 
 
 
1516 aa  70.5  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1157  glutamate synthase alpha subunit domain protein  29.06 
 
 
381 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000112739  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2224  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.14 
 
 
1519 aa  71.2  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1219  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.21 
 
 
1525 aa  70.9  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.589961  normal  0.962678 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1691  glutamate synthase (NADH) large subunit  30.43 
 
 
1519 aa  70.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.103385  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13895  ferredoxin-dependent glutamate synthase [NADPH] large subunit gltB  30.98 
 
 
1527 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5066  glutamate synthase (NADH) large subunit  29.63 
 
 
1527 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1114  glutamate synthase (ferredoxin)  31.45 
 
 
1533 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.82784  normal  0.930552 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1078  glutamate synthase (NADH) large subunit  26.64 
 
 
1513 aa  69.7  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.706498  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5154  glutamate synthase (NADH) large subunit  29.63 
 
 
1527 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.631687 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5445  glutamate synthase (NADH) large subunit  30.82 
 
 
1536 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5698  glutamate synthase (ferredoxin)  31.45 
 
 
1514 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.471666 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3166  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.37 
 
 
1516 aa  69.3  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.563815  normal  0.707717 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0890  glutamate synthase (ferredoxin)  34.97 
 
 
1536 aa  68.6  0.00000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00390315  decreased coverage  0.000127994 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3450  glutamate synthase-related protein  28.85 
 
 
1510 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02910  glutamate synthase (NADH), putative  30.57 
 
 
2135 aa  68.2  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.844202  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0894  glutamate synthase (ferredoxin)  28.71 
 
 
1528 aa  68.6  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.08401  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3807  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.84 
 
 
1502 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.344591  hitchhiker  0.00201054 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2961  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.88 
 
 
1536 aa  67  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.495295  normal  0.583434 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0474  Glutamate synthase (ferredoxin)  27.13 
 
 
1525 aa  66.2  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1253  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.76 
 
 
1479 aa  64.7  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0217  glutamate synthase (NADH) large subunit  30.26 
 
 
1544 aa  65.1  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0393  glutamate synthase (ferredoxin)  28.37 
 
 
1507 aa  65.1  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2159  glutamate synthase alpha subunit  27.65 
 
 
771 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.681462  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2805  glutamate synthase (ferredoxin)  26.91 
 
 
1525 aa  63.9  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0529  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.82 
 
 
1474 aa  63.9  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.41827  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3266  glutamate synthase (ferredoxin)  28.42 
 
 
1572 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.819491  normal  0.0774951 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3590  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.42 
 
 
1572 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.610776  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23581  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.8 
 
 
1527 aa  63.2  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.242858 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0147  glutamate synthase (ferredoxin)  28.29 
 
 
1510 aa  63.5  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3013  glutamate synthase (NADH) large subunit  28.7 
 
 
1518 aa  63.2  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0945186 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2790  glutamate synthase subunit alpha  27.53 
 
 
1482 aa  63.2  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0854  glutamate synthase (ferredoxin)  30.91 
 
 
1540 aa  63.2  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.265918  normal  0.188488 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>