101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1302 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_1302  glutamate synthase alpha subunit  100 
 
 
261 aa  525  1e-148  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1080  glutamate synthase alpha subunit  71.09 
 
 
263 aa  375  1e-103  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1596  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  70.31 
 
 
256 aa  372  1e-102  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0867  glutamate synthase alpha subunit  70.31 
 
 
256 aa  372  1e-102  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0287996  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1094  glutamate synthase alpha subunit  69.92 
 
 
256 aa  362  3e-99  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0332  glutamate synthase alpha subunit  52.19 
 
 
245 aa  270  2e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.951103  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1692  glutamate synthase alpha subunit  50.2 
 
 
247 aa  265  5.999999999999999e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.737414  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0782  glutamate synthase, alpha subunit-like  52.17 
 
 
246 aa  262  4e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00542084  normal  0.210269 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0663  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  51.78 
 
 
247 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.358325 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2708  glutamate synthase alpha subunit domain protein  49.6 
 
 
248 aa  249  3e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.414191  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0526  glutamate synthase alpha subunit  48.41 
 
 
245 aa  240  2e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0540  glutamate synthase alpha subunit  48.41 
 
 
245 aa  240  2e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.800593  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1816  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  45.42 
 
 
251 aa  226  4e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0997673  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1752  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  43.82 
 
 
249 aa  217  1e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.216628 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0201  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  46 
 
 
240 aa  216  4e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0562  glutamate synthase alpha subunit  44.76 
 
 
242 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1235  hypothetical protein  42.52 
 
 
248 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2490  glutamate synthase alpha subunit  44.76 
 
 
248 aa  211  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2357  glutamate synthase alpha subunit domain protein  45.28 
 
 
250 aa  209  4e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800072  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1339  glutamate synthase alpha subunit  41.83 
 
 
251 aa  207  1e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.794654 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2024  glutamate synthase alpha subunit  44.8 
 
 
246 aa  207  1e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0029  glutamate synthase alpha subunit domain protein  48.43 
 
 
252 aa  206  2e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0544  glutamate synthase alpha subunit domain protein  40.3 
 
 
281 aa  206  3e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00693523 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16290  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  42 
 
 
245 aa  203  3e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.518041  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0211  glutamate synthase alpha subunit  42.86 
 
 
264 aa  201  8e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_945  glutamate synthase-like protein protein, alpha subunit-like protein  45.23 
 
 
256 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0956  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  46.06 
 
 
256 aa  198  6e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1127  hypothetical protein  46.12 
 
 
256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000223973  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1289  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  40.56 
 
 
245 aa  195  5.000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000639589 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0030  glutamate synthase alpha subunit  33.1 
 
 
670 aa  157  2e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1740  glutamate synthase alpha subunit domain protein  37.95 
 
 
659 aa  123  3e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.627915  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1885  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  39.44 
 
 
646 aa  120  1.9999999999999998e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.273779  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1812  glutamate synthase alpha subunit  28.31 
 
 
568 aa  107  2e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000275446 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0830  glutamate synthase alpha subunit  26.33 
 
 
568 aa  106  3e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.990819  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  28.57 
 
 
553 aa  101  1e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1607  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  28.02 
 
 
572 aa  94.7  1e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1370  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.91 
 
 
794 aa  66.2  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6576  glutamate synthase alpha subunit domain protein  27.44 
 
 
228 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.026671 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0383  glutamate synthase alpha subunit domain protein  30.53 
 
 
635 aa  65.1  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6007  glutamate synthase alpha subunit  31.72 
 
 
228 aa  63.2  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.607641  decreased coverage  0.00322278 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1723  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.73 
 
 
777 aa  61.6  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1943  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  25.7 
 
 
227 aa  60.8  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.513232 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3292  glutamate synthase alpha subunit  27.91 
 
 
228 aa  60.1  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2600  glutamate synthase, alpha subunit-like  31.06 
 
 
771 aa  60.1  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0102  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.22 
 
 
777 aa  59.7  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2389  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.78 
 
 
777 aa  59.3  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5750  formyl-methanofuran dehydrogenase  28.97 
 
 
228 aa  59.3  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5639  glutamate synthase alpha subunit domain protein  30.56 
 
 
228 aa  59.3  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.55547  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2584  hypothetical protein  25.74 
 
 
227 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0278158  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2275  glutamate synthase, alpha subunit, C-terminal  26.58 
 
 
227 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.225316  hitchhiker  0.00959584 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2159  glutamate synthase alpha subunit  27.75 
 
 
771 aa  57  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.681462  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1700  glutamate synthase alpha subunit domain protein  24.14 
 
 
236 aa  55.8  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3466  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  26.58 
 
 
224 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.201288  normal  0.713984 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2112  formylmethanofuran dehydrogenase  37.38 
 
 
254 aa  55.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0458  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  24.88 
 
 
230 aa  55.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.951315  normal  0.387952 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20710  glutamate synthase (NADH) large subunit  26.49 
 
 
1524 aa  53.9  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.42786 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1657  glutamate synthase alpha subunit  26.34 
 
 
229 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2633  glutamate synthase alpha subunit domain protein  30.91 
 
 
235 aa  53.1  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1939  glutamate synthase alpha subunit domain protein  26.34 
 
 
229 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.490233  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2276  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.49 
 
 
776 aa  52.4  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1157  glutamate synthase alpha subunit domain protein  24.47 
 
 
381 aa  52.4  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000112739  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0525  tungsten formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C-like  38.71 
 
 
295 aa  51.6  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.618523  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1377  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.54 
 
 
793 aa  52  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.118947  normal  0.859258 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0529  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.36 
 
 
1474 aa  52  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.41827  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1487  glutamate synthase, large subunit  27 
 
 
1465 aa  50.8  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0194294  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4809  glutamate synthase alpha subunit  27 
 
 
229 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.453145  hitchhiker  0.00411559 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0168  glutamate synthase alpha subunit  23.83 
 
 
229 aa  50.8  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1574  glutamate synthase alpha subunit domain protein  25.85 
 
 
229 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4696  glutamate synthase family protein  25 
 
 
235 aa  49.7  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.917164 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2249  glutamate synthase alpha subunit  26.21 
 
 
224 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.191415 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1869  putative glutamate synthase  24.53 
 
 
225 aa  48.9  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.310557  normal  0.791624 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2500  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  24.77 
 
 
225 aa  48.1  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0493584  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1442  formylmethanofuran dehydrogenase  31.69 
 
 
294 aa  48.5  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.717791  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0563  formylmethanofuran dehydrogenase  30.91 
 
 
289 aa  47.8  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1663  formylmethanofuran dehydrogenase  27.36 
 
 
424 aa  47.8  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1290  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  26.63 
 
 
301 aa  46.6  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1069  glutamate synthase alpha subunit  31.97 
 
 
312 aa  46.6  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1468  Glutamate synthase (ferredoxin)  25.56 
 
 
1551 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1482  glutamate synthase, large subunit  27.45 
 
 
1473 aa  46.2  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1345  glutamate synthase, alpha subunit-like  23.33 
 
 
227 aa  46.2  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1298  glutamate synthase alpha subunit  27.1 
 
 
227 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.186101  normal  0.822119 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0618  formylmethanofuran dehydrogenase  31.97 
 
 
268 aa  45.4  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.031501  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2464  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  23.66 
 
 
281 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.109296 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1083  glutamate synthase alpha subunit  31.37 
 
 
320 aa  44.3  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.386486  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5920  glutamate synthase alpha subunit  23.93 
 
 
232 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.755435  normal  0.413716 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2233  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  28.89 
 
 
304 aa  44.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.0399291 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1098  formylmethanofuran dehydrogenase  32.26 
 
 
257 aa  43.9  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1189  glutamate synthase alpha subunit  31.87 
 
 
255 aa  43.5  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1607  tungsten containing formylmethanofruran dehydrogenase subunit C-related protein  30.33 
 
 
313 aa  43.9  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0265  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.34 
 
 
1487 aa  43.9  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.316824 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1176  glutamate synthase (NADPH) large subunit  26.29 
 
 
1479 aa  43.1  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5693  Glutamate synthase (ferredoxin)  27.03 
 
 
1512 aa  42.7  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4805  glutamate synthase alpha subunit domain protein  23.53 
 
 
247 aa  42.7  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5511  glutamate synthase alpha subunit  22.71 
 
 
228 aa  42.7  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.21487 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0575  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  29.93 
 
 
256 aa  42.7  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00575915  decreased coverage  0.000443842 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1450  formylmethanofuran dehydrogenase  33.33 
 
 
415 aa  42.7  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3166  Glutamate synthase (ferredoxin)  23.98 
 
 
1516 aa  42.7  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.563815  normal  0.707717 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0878  Glutamate synthase (ferredoxin)  23.95 
 
 
1475 aa  42.7  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0730  glutamate synthase, large subunit  23.95 
 
 
1475 aa  42.7  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1531  formylmethanofuran dehydrogenase  34.48 
 
 
415 aa  42.4  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000509371 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>