84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1607 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1607  tungsten containing formylmethanofruran dehydrogenase subunit C-related protein  100 
 
 		 313 aa  616  1e-175  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1069  glutamate synthase alpha subunit  93.27 
 
 		 312 aa  580  1.0000000000000001e-165  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0878  glutamate synthase alpha subunit  91.99 
 
 		 312 aa  568  1e-161  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.225814  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1083  glutamate synthase alpha subunit  69.97 
 
 		 320 aa  438  9.999999999999999e-123  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.386486  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0525  tungsten formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C-like  46.52 
 
 		 295 aa  231  1e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.618523  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1478  hypothetical protein  38.19 
 
 		 323 aa  160  3e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00968841  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0084  formylmethanofuran dehydrogenase  42.53 
 
 		 425 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6507  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  35.24 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0305137 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2626  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  35.35 
 
 		 269 aa  62  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5932  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  31.58 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0388185  normal  0.0470213 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1442  formylmethanofuran dehydrogenase  34.83 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.717791  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0495  formylmethanofuran dehydrogenase  34.51 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.943026  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3064  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  36.78 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0563  formylmethanofuran dehydrogenase  38.46 
 
 		 289 aa  58.9  0.00000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2464  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  29.73 
 
 		 281 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.109296 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1665  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  28.82 
 
 		 269 aa  58.9  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.477479  normal  0.947493 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0022  formylmethanofuran dehydrogenase  42.86 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1663  formylmethanofuran dehydrogenase  37.5 
 
 		 424 aa  55.5  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0875  formylmethanofuran dehydrogenase  33.94 
 
 		 266 aa  54.3  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.118005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2112  formylmethanofuran dehydrogenase  31.96 
 
 		 254 aa  53.9  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0523  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  33.98 
 
 		 264 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300278  normal  0.650549 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0618  formylmethanofuran dehydrogenase  40.51 
 
 		 268 aa  53.5  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.031501  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0575  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  31.71 
 
 		 256 aa  52.8  0.000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00575915  decreased coverage  0.000443842 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2403  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  34.34 
 
 		 268 aa  52  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1450  formylmethanofuran dehydrogenase  32.26 
 
 		 415 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0867  glutamate synthase alpha subunit  30.89 
 
 		 256 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0287996  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1080  glutamate synthase alpha subunit  36.47 
 
 		 263 aa  50.4  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0540  glutamate synthase alpha subunit  32.63 
 
 		 245 aa  51.2  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.800593  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0526  glutamate synthase alpha subunit  32.63 
 
 		 245 aa  51.2  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1607  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  29.93 
 
 		 572 aa  50.4  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1189  glutamate synthase alpha subunit  23.64 
 
 		 255 aa  49.7  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0211  glutamate synthase alpha subunit  27.93 
 
 		 264 aa  49.7  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5773  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  34.29 
 
 		 265 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14713  normal  0.931253 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2857  formylmethanofurane dehydrogenase subunit, putative  38.1 
 
 		 270 aa  48.5  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000000505673  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2024  glutamate synthase alpha subunit  35.56 
 
 		 246 aa  48.9  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1421  glutamate synthase alpha subunit domain protein  25.19 
 
 		 291 aa  47.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2233  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  34.91 
 
 		 304 aa  47.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.0399291 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0201  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  35.87 
 
 		 240 aa  48.1  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1816  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  34.88 
 
 		 251 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0997673  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1094  glutamate synthase alpha subunit  32.71 
 
 		 256 aa  47.4  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1098  formylmethanofuran dehydrogenase  32.21 
 
 		 257 aa  47.4  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0381  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  31.18 
 
 		 415 aa  47.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1531  formylmethanofuran dehydrogenase  30.11 
 
 		 415 aa  47.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000509371 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1473  formylmethanofuran dehydrogenase  40.54 
 
 		 275 aa  47  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.143119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1981  formylmethanofuran dehydrogenase  38.38 
 
 		 332 aa  47  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.372116 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0201  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  36.56 
 
 		 307 aa  46.6  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0127762  normal  0.0655916 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1596  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  38.46 
 
 		 256 aa  46.2  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0246  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  37.29 
 
 		 266 aa  45.4  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.314224 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5920  glutamate synthase alpha subunit  29.63 
 
 		 232 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.755435  normal  0.413716 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3133  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  28.72 
 
 		 281 aa  45.4  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1298  glutamate synthase alpha subunit  28.4 
 
 		 227 aa  45.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.186101  normal  0.822119 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1692  glutamate synthase alpha subunit  26.19 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.737414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0342  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  30.23 
 
 		 272 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1990  formylmethanofuran dehydrogenase  27.14 
 
 		 266 aa  44.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.114316  normal  0.184502 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6007  glutamate synthase alpha subunit  34.85 
 
 		 228 aa  43.9  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.607641  decreased coverage  0.00322278 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1939  glutamate synthase alpha subunit domain protein  27.5 
 
 		 229 aa  43.9  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.490233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1424  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  36.78 
 
 		 272 aa  44.3  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.176644  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1657  glutamate synthase alpha subunit  27.5 
 
 		 229 aa  43.9  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1345  glutamate synthase, alpha subunit-like  28.4 
 
 		 227 aa  43.9  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5750  formyl-methanofuran dehydrogenase  33.01 
 
 		 228 aa  44.3  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6576  glutamate synthase alpha subunit domain protein  34.85 
 
 		 228 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.026671 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0663  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  29.46 
 
 		 247 aa  43.5  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.358325 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0029  glutamate synthase alpha subunit domain protein  33.72 
 
 		 252 aa  43.9  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1574  glutamate synthase alpha subunit domain protein  27.5 
 
 		 229 aa  43.9  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1752  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  28.68 
 
 		 249 aa  43.9  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.216628 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  30.59 
 
 		 553 aa  43.5  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0782  glutamate synthase, alpha subunit-like  34.09 
 
 		 246 aa  43.9  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00542084  normal  0.210269 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2490  glutamate synthase alpha subunit  28.46 
 
 		 248 aa  43.5  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1302  glutamate synthase alpha subunit  30.33 
 
 		 261 aa  43.9  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1775  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  31.51 
 
 		 265 aa  43.1  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  0.875805 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0332  glutamate synthase alpha subunit  29.55 
 
 		 245 aa  43.5  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.951103  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0370  formylmethanofuran dehydrogenase  28.49 
 
 		 266 aa  43.5  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1235  hypothetical protein  29.46 
 
 		 248 aa  43.5  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16290  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  33.33 
 
 		 245 aa  43.5  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.518041  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0168  glutamate synthase alpha subunit  28.4 
 
 		 229 aa  43.1  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5639  glutamate synthase alpha subunit domain protein  33.33 
 
 		 228 aa  43.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.55547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0544  glutamate synthase alpha subunit domain protein  29.76 
 
 		 281 aa  43.1  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00693523 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1793  glutamate synthase alpha subunit  30.56 
 
 		 267 aa  43.1  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0607708  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2708  glutamate synthase alpha subunit domain protein  26.92 
 
 		 248 aa  42.7  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.414191  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3523  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  26.79 
 
 		 242 aa  42.7  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0202692 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5511  glutamate synthase alpha subunit  22.22 
 
 		 228 aa  42.7  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21487 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0830  glutamate synthase alpha subunit  30.34 
 
 		 568 aa  42.7  0.008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.990819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1812  glutamate synthase alpha subunit  29.41 
 
 		 568 aa  42.4  0.009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000275446 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3032  glutamate synthase alpha subunit  27.16 
 
 		 228 aa  42.4  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.54309 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>