96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1981 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1981  formylmethanofuran dehydrogenase  100 
 
 		 332 aa  674    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.372116 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0618  formylmethanofuran dehydrogenase  58.56 
 
 		 268 aa  330  2e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.031501  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2233  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  54.74 
 
 		 304 aa  323  3e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.0399291 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0875  formylmethanofuran dehydrogenase  58.56 
 
 		 266 aa  322  7e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.118005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0246  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  57.58 
 
 		 266 aa  320  3e-86  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.314224 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0370  formylmethanofuran dehydrogenase  58.17 
 
 		 266 aa  316  4e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1473  formylmethanofuran dehydrogenase  56.77 
 
 		 275 aa  304  1.0000000000000001e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.143119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0201  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  51.54 
 
 		 307 aa  300  3e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0127762  normal  0.0655916 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1990  formylmethanofuran dehydrogenase  50.38 
 
 		 266 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.114316  normal  0.184502 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1442  formylmethanofuran dehydrogenase  45.05 
 
 		 294 aa  181  2e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.717791  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0495  formylmethanofuran dehydrogenase  40.71 
 
 		 272 aa  175  8e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.943026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1424  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  41.15 
 
 		 272 aa  171  1e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.176644  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0342  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  40.71 
 
 		 272 aa  171  1e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0563  formylmethanofuran dehydrogenase  39.82 
 
 		 289 aa  169  5e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1290  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  39.59 
 
 		 301 aa  168  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0084  formylmethanofuran dehydrogenase  41.03 
 
 		 425 aa  167  2e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0283  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  40.69 
 
 		 269 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.363907  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1450  formylmethanofuran dehydrogenase  38.86 
 
 		 415 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1098  formylmethanofuran dehydrogenase  34.2 
 
 		 257 aa  136  4e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1531  formylmethanofuran dehydrogenase  37.91 
 
 		 415 aa  134  3e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000509371 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0381  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  38.39 
 
 		 415 aa  132  9e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2112  formylmethanofuran dehydrogenase  33.2 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1663  formylmethanofuran dehydrogenase  38.16 
 
 		 424 aa  124  2e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1189  glutamate synthase alpha subunit  33.48 
 
 		 255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0575  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  31.4 
 
 		 256 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00575915  decreased coverage  0.000443842 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6507  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  28.82 
 
 		 286 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0305137 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0022  formylmethanofuran dehydrogenase  29.28 
 
 		 272 aa  108  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1665  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  31.75 
 
 		 269 aa  102  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.477479  normal  0.947493 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2857  formylmethanofurane dehydrogenase subunit, putative  30.18 
 
 		 270 aa  99.8  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000000505673  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2626  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  27.52 
 
 		 269 aa  95.1  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5932  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  27.03 
 
 		 274 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0388185  normal  0.0470213 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2464  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  26.58 
 
 		 281 aa  91.3  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.109296 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3133  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  28.65 
 
 		 281 aa  89.4  9e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3064  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  28.92 
 
 		 276 aa  88.2  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2403  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  25.21 
 
 		 268 aa  85.1  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1793  glutamate synthase alpha subunit  28.57 
 
 		 267 aa  81.6  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0607708  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0523  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  28 
 
 		 264 aa  79.3  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300278  normal  0.650549 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1421  glutamate synthase alpha subunit domain protein  28.88 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5773  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  25.88 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14713  normal  0.931253 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5997  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  26.32 
 
 		 265 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128161  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1740  glutamate synthase alpha subunit domain protein  32.9 
 
 		 659 aa  60.5  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.627915  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1775  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  24.09 
 
 		 265 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  0.875805 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1869  putative glutamate synthase  28.79 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.310557  normal  0.791624 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5750  formyl-methanofuran dehydrogenase  27.65 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3292  glutamate synthase alpha subunit  28.12 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6576  glutamate synthase alpha subunit domain protein  29.01 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.026671 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0830  glutamate synthase alpha subunit  29.45 
 
 		 568 aa  56.2  0.0000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.990819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  31.25 
 
 		 553 aa  55.1  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2275  glutamate synthase, alpha subunit, C-terminal  27.45 
 
 		 227 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.225316  hitchhiker  0.00959584 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5639  glutamate synthase alpha subunit domain protein  27.48 
 
 		 228 aa  53.9  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.55547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6007  glutamate synthase alpha subunit  28.24 
 
 		 228 aa  53.5  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.607641  decreased coverage  0.00322278 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2584  hypothetical protein  28.78 
 
 		 227 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0278158  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5920  glutamate synthase alpha subunit  24.86 
 
 		 232 aa  52.8  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.755435  normal  0.413716 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4805  glutamate synthase alpha subunit domain protein  26.53 
 
 		 247 aa  52  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0030  glutamate synthase alpha subunit  31.13 
 
 		 670 aa  52  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1812  glutamate synthase alpha subunit  28.08 
 
 		 568 aa  52  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000275446 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1198  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C (tungsten)  30.82 
 
 		 152 aa  50.4  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1607  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  28.87 
 
 		 572 aa  50.1  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2159  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  24.09 
 
 		 265 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0901303 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0332  glutamate synthase alpha subunit  27.62 
 
 		 245 aa  49.7  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.951103  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1298  glutamate synthase alpha subunit  26.09 
 
 		 227 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.186101  normal  0.822119 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3523  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  28.19 
 
 		 242 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0202692 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1824  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  23.18 
 
 		 265 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1069  glutamate synthase alpha subunit  39.39 
 
 		 312 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3466  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  28.39 
 
 		 224 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.201288  normal  0.713984 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0878  Glutamate synthase (ferredoxin)  27.32 
 
 		 1475 aa  47.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0730  glutamate synthase, large subunit  27.32 
 
 		 1475 aa  47.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5262  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  26.09 
 
 		 238 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.221211 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3032  glutamate synthase alpha subunit  26.52 
 
 		 228 aa  47.4  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.54309 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5511  glutamate synthase alpha subunit  24.67 
 
 		 228 aa  47  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21487 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0029  glutamate synthase alpha subunit domain protein  32.8 
 
 		 252 aa  47  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4983  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  25.36 
 
 		 238 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1607  tungsten containing formylmethanofruran dehydrogenase subunit C-related protein  38.38 
 
 		 313 aa  46.6  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4894  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  25.36 
 
 		 238 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1954  glutamate synthase subunit alpha  25.24 
 
 		 1487 aa  46.6  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2357  glutamate synthase alpha subunit domain protein  39.47 
 
 		 250 aa  46.2  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800072  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1487  glutamate synthase, large subunit  27.78 
 
 		 1465 aa  46.2  0.0008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0194294  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0168  glutamate synthase alpha subunit  26.52 
 
 		 229 aa  45.4  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1345  glutamate synthase, alpha subunit-like  26.45 
 
 		 227 aa  45.4  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0211  glutamate synthase alpha subunit  26.63 
 
 		 264 aa  45.8  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0265  Glutamate synthase (ferredoxin)  25.9 
 
 		 1487 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.316824 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1137  formyl-methanofuran dehydrogenase subunit C  27.59 
 
 		 229 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.165169 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0544  glutamate synthase alpha subunit domain protein  33.71 
 
 		 281 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00693523 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1943  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  24.68 
 
 		 227 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.513232 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1574  glutamate synthase alpha subunit domain protein  31.39 
 
 		 229 aa  44.3  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0525  tungsten formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C-like  29.55 
 
 		 295 aa  44.3  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.618523  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1700  glutamate synthase alpha subunit domain protein  27.69 
 
 		 236 aa  43.9  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1657  glutamate synthase alpha subunit  31.39 
 
 		 229 aa  43.9  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1939  glutamate synthase alpha subunit domain protein  31.39 
 
 		 229 aa  43.9  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.490233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0878  glutamate synthase alpha subunit  29.33 
 
 		 312 aa  43.9  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.225814  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0201  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  27.23 
 
 		 240 aa  43.1  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1468  Glutamate synthase (ferredoxin)  27.27 
 
 		 1551 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1762  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  38.24 
 
 		 105 aa  43.1  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2249  glutamate synthase alpha subunit  25.36 
 
 		 224 aa  42.7  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191415 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4344  glutamate synthase subunit alpha  25.29 
 
 		 1486 aa  42.7  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0225673 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1083  glutamate synthase alpha subunit  36 
 
 		 320 aa  42.7  0.009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.386486  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>