285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6507 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6507  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  100 
 
 		 286 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0305137 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2464  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  57.93 
 
 		 281 aa  321  8e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.109296 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5932  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  44.06 
 
 		 274 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0388185  normal  0.0470213 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2626  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  48.42 
 
 		 269 aa  233  3e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3064  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  42.96 
 
 		 276 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0022  formylmethanofuran dehydrogenase  41.05 
 
 		 272 aa  204  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1665  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  41.61 
 
 		 269 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.477479  normal  0.947493 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3133  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  43.99 
 
 		 281 aa  195  6e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2857  formylmethanofurane dehydrogenase subunit, putative  42.11 
 
 		 270 aa  182  7e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000000505673  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2403  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  39.15 
 
 		 268 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5773  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  40.99 
 
 		 265 aa  168  8e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14713  normal  0.931253 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0523  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  41.84 
 
 		 264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300278  normal  0.650549 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5997  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  43.31 
 
 		 265 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128161  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1775  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  41.28 
 
 		 265 aa  161  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  0.875805 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2159  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  40.36 
 
 		 265 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0901303 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1824  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  41.79 
 
 		 265 aa  144  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1793  glutamate synthase alpha subunit  39.86 
 
 		 267 aa  141  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0607708  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2233  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  33.33 
 
 		 304 aa  122  9e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.0399291 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0495  formylmethanofuran dehydrogenase  29.22 
 
 		 272 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.943026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1098  formylmethanofuran dehydrogenase  38.78 
 
 		 257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0618  formylmethanofuran dehydrogenase  30.63 
 
 		 268 aa  119  6e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.031501  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1531  formylmethanofuran dehydrogenase  32.3 
 
 		 415 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000509371 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0342  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  30.04 
 
 		 272 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0201  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  31.47 
 
 		 307 aa  116  5e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0127762  normal  0.0655916 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1450  formylmethanofuran dehydrogenase  30.53 
 
 		 415 aa  115  6e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0381  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  31.86 
 
 		 415 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1424  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  28.77 
 
 		 272 aa  113  3e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.176644  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0084  formylmethanofuran dehydrogenase  29 
 
 		 425 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1663  formylmethanofuran dehydrogenase  30.6 
 
 		 424 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1981  formylmethanofuran dehydrogenase  28.82 
 
 		 332 aa  110  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.372116 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0563  formylmethanofuran dehydrogenase  27.85 
 
 		 289 aa  109  6e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1290  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  31.53 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0875  formylmethanofuran dehydrogenase  28.12 
 
 		 266 aa  104  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.118005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0246  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  28.57 
 
 		 266 aa  104  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.314224 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0370  formylmethanofuran dehydrogenase  29.6 
 
 		 266 aa  103  4e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1442  formylmethanofuran dehydrogenase  28.64 
 
 		 294 aa  102  8e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.717791  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1473  formylmethanofuran dehydrogenase  29.46 
 
 		 275 aa  102  8e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.143119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1990  formylmethanofuran dehydrogenase  30.66 
 
 		 266 aa  100  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.114316  normal  0.184502 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0283  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  28.38 
 
 		 269 aa  97.8  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.363907  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1421  glutamate synthase alpha subunit domain protein  37.66 
 
 		 291 aa  94.7  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2112  formylmethanofuran dehydrogenase  29.15 
 
 		 254 aa  93.2  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1189  glutamate synthase alpha subunit  32.97 
 
 		 255 aa  91.7  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0575  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  28.51 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00575915  decreased coverage  0.000443842 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0529  Glutamate synthase (ferredoxin)  30 
 
 		 1474 aa  65.1  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.41827  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1069  glutamate synthase alpha subunit  35.24 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1607  tungsten containing formylmethanofruran dehydrogenase subunit C-related protein  35.24 
 
 		 313 aa  62.8  0.000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0830  glutamate synthase alpha subunit  34.03 
 
 		 568 aa  62.4  0.000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.990819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0878  glutamate synthase alpha subunit  33.33 
 
 		 312 aa  62  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.225814  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0730  glutamate synthase, large subunit  30.98 
 
 		 1475 aa  60.8  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0878  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.98 
 
 		 1475 aa  60.8  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1487  glutamate synthase, large subunit  31.97 
 
 		 1465 aa  60.1  0.00000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0194294  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004468  glutamate synthase [NADPH] large chain  35.62 
 
 		 1487 aa  59.7  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00926  glutamate synthase subunit alpha  35.48 
 
 		 1487 aa  58.5  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0890  glutamate synthase (ferredoxin)  30.46 
 
 		 1536 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00390315  decreased coverage  0.000127994 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1812  glutamate synthase alpha subunit  34.06 
 
 		 568 aa  58.9  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000275446 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1117  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.92 
 
 		 1468 aa  57.8  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1874  glutamate synthase subunit alpha  31.41 
 
 		 1487 aa  58.2  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5126  glutamate synthase subunit alpha  28.07 
 
 		 1481 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.979784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1176  glutamate synthase (NADPH) large subunit  29.2 
 
 		 1479 aa  57.8  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2165  glutamate synthase subunit alpha  36.29 
 
 		 1487 aa  57.8  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.409887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1954  glutamate synthase subunit alpha  30.96 
 
 		 1487 aa  57.4  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0653  glutamate synthase  32.26 
 
 		 1571 aa  56.6  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.58912  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0683  glutamate synthase (ferredoxin)  31.41 
 
 		 1580 aa  57  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.146525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0413  glutamate synthase subunit alpha  31.34 
 
 		 1481 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359883 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2140  glutamate synthase (ferredoxin)  31.87 
 
 		 1510 aa  56.6  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.697929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16351  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.41 
 
 		 1531 aa  56.6  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5076  glutamate synthase subunit alpha  28.4 
 
 		 1481 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0657  glutamate synthase (NADPH) large subunit  31.93 
 
 		 1509 aa  56.2  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0412975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3748  glutamate synthase subunit alpha  33.59 
 
 		 1488 aa  56.2  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956068  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0550  glutamate synthase subunit alpha  32.26 
 
 		 1482 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.213876 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1666  glutamate synthase (ferredoxin)  30.32 
 
 		 1512 aa  55.8  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0329464  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4114  glutamate synthase subunit alpha  33.06 
 
 		 1461 aa  55.8  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000785816 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4949  glutamate synthase subunit alpha  28.4 
 
 		 1481 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.772604  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45210  glutamate synthase subunit alpha  33.06 
 
 		 1480 aa  55.8  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2284  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.31 
 
 		 1486 aa  55.8  0.0000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5773  glutamate synthase subunit alpha  33.33 
 
 		 1481 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2683  glutamate synthase subunit alpha  31.34 
 
 		 1481 aa  55.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.141774 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0265  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.94 
 
 		 1487 aa  55.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.316824 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66570  glutamate synthase subunit alpha  33.33 
 
 		 1481 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0403  glutamate synthase subunit alpha  31.51 
 
 		 1507 aa  55.1  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0405842 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1468  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.34 
 
 		 1551 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3791  glutamate synthase subunit alpha  33.86 
 
 		 1486 aa  54.3  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0488  glutamate synthase (ferredoxin)  34.04 
 
 		 1516 aa  54.3  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0390  glutamate synthase subunit alpha  31.45 
 
 		 1481 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5123  glutamate synthase, large subunit  30.6 
 
 		 1481 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1253  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.23 
 
 		 1479 aa  53.9  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1482  glutamate synthase, large subunit  28.57 
 
 		 1473 aa  53.9  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  33.04 
 
 		 553 aa  54.3  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0305  glutamate synthase subunit alpha  31.39 
 
 		 1486 aa  53.5  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.910499  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1078  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.43 
 
 		 1529 aa  53.5  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03319  glutamate synthase subunit alpha  35.48 
 
 		 1462 aa  53.5  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.645921  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0299  glutamate synthase subunit alpha  32.56 
 
 		 1486 aa  53.5  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2951  glutamate synthase subunit alpha  31.34 
 
 		 1482 aa  53.5  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0201  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  30.61 
 
 		 240 aa  53.5  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0834  glutamate synthase subunit alpha  34.68 
 
 		 1482 aa  53.5  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87862  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19531  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.43 
 
 		 1475 aa  53.5  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0857  glutamate synthase subunit alpha  32.09 
 
 		 1483 aa  53.1  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.245541 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0019  glutamate synthase (NADPH) large subunit  29.37 
 
 		 1524 aa  53.1  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_51214  ferredoxin-dependent glutamate synthase, fusion of large and small subunits  26.4 
 
 		 1591 aa  53.1  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2395  glutamate synthase (ferredoxin)  29.3 
 
 		 1586 aa  52.8  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>