165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0022 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0022  formylmethanofuran dehydrogenase  100 
 
 
272 aa  551  1e-156  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1665  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  51.11 
 
 
269 aa  268  1e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.477479  normal  0.947493 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2857  formylmethanofurane dehydrogenase subunit, putative  47.78 
 
 
270 aa  254  7e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000000505673  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6507  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  41.4 
 
 
286 aa  199  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0305137 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2464  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  42.86 
 
 
281 aa  185  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.109296 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5932  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  38.41 
 
 
274 aa  185  8e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0388185  normal  0.0470213 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2626  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  38.38 
 
 
269 aa  178  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2403  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  37.92 
 
 
268 aa  176  3e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3064  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  36.92 
 
 
276 aa  163  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0523  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  37.97 
 
 
264 aa  156  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300278  normal  0.650549 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5997  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  39.39 
 
 
265 aa  148  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128161  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3133  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  37.73 
 
 
281 aa  146  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1775  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  36.98 
 
 
265 aa  142  6e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  0.875805 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5773  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  37.74 
 
 
265 aa  142  9e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14713  normal  0.931253 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1793  glutamate synthase alpha subunit  36.3 
 
 
267 aa  138  7.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0607708  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2159  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  35.47 
 
 
265 aa  126  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0901303 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1824  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  35.47 
 
 
265 aa  124  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317738  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0201  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  34.12 
 
 
307 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0127762  normal  0.0655916 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1098  formylmethanofuran dehydrogenase  34.76 
 
 
257 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0618  formylmethanofuran dehydrogenase  27.8 
 
 
268 aa  112  5e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.031501  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0495  formylmethanofuran dehydrogenase  30.62 
 
 
272 aa  112  5e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.943026  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2233  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  29.15 
 
 
304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.0399291 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1421  glutamate synthase alpha subunit domain protein  28.47 
 
 
291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0342  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  31.1 
 
 
272 aa  110  3e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1981  formylmethanofuran dehydrogenase  29.28 
 
 
332 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.372116 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0875  formylmethanofuran dehydrogenase  26.32 
 
 
266 aa  108  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.118005  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1473  formylmethanofuran dehydrogenase  30.81 
 
 
275 aa  107  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.143119  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0563  formylmethanofuran dehydrogenase  30.14 
 
 
289 aa  107  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1424  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  30.14 
 
 
272 aa  106  4e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.176644  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1663  formylmethanofuran dehydrogenase  28.3 
 
 
424 aa  104  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1290  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  27.8 
 
 
301 aa  103  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1450  formylmethanofuran dehydrogenase  32.14 
 
 
415 aa  103  3e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0381  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  32.7 
 
 
415 aa  103  4e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1442  formylmethanofuran dehydrogenase  26.91 
 
 
294 aa  102  5e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.717791  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1531  formylmethanofuran dehydrogenase  31.75 
 
 
415 aa  101  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000509371 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0084  formylmethanofuran dehydrogenase  32.82 
 
 
425 aa  98.2  1e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0283  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  27.88 
 
 
269 aa  93.2  4e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.363907  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0246  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  26.32 
 
 
266 aa  93.2  4e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.314224 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0370  formylmethanofuran dehydrogenase  26.89 
 
 
266 aa  93.2  4e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2112  formylmethanofuran dehydrogenase  28.12 
 
 
254 aa  91.7  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1189  glutamate synthase alpha subunit  27.2 
 
 
255 aa  91.7  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1990  formylmethanofuran dehydrogenase  26.09 
 
 
266 aa  82.8  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.114316  normal  0.184502 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0575  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  27.41 
 
 
256 aa  68.2  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00575915  decreased coverage  0.000443842 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0830  glutamate synthase alpha subunit  36.22 
 
 
568 aa  65.1  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.990819  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1503  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.37 
 
 
1530 aa  60.8  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1812  glutamate synthase alpha subunit  34.48 
 
 
568 aa  61.2  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000275446 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1982  Glutamate synthase (ferredoxin)  32.37 
 
 
1521 aa  58.5  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.349695  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  33.57 
 
 
553 aa  58.2  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1069  glutamate synthase alpha subunit  42.86 
 
 
312 aa  58.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6576  glutamate synthase alpha subunit domain protein  29.5 
 
 
228 aa  56.6  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.026671 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1117  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.57 
 
 
1468 aa  56.6  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1607  tungsten containing formylmethanofruran dehydrogenase subunit C-related protein  42.86 
 
 
313 aa  56.6  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1885  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  33.33 
 
 
646 aa  56.2  0.0000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.273779  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5750  formyl-methanofuran dehydrogenase  28.12 
 
 
228 aa  55.5  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3292  glutamate synthase alpha subunit  30.22 
 
 
228 aa  55.8  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1607  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  32.28 
 
 
572 aa  55.1  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0030  glutamate synthase alpha subunit  34.45 
 
 
670 aa  55.5  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0326  glutamate synthase (ferredoxin)  29.85 
 
 
1533 aa  54.7  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.127491  normal  0.144966 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20710  glutamate synthase (NADH) large subunit  33.1 
 
 
1524 aa  53.9  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.42786 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1574  glutamate synthase alpha subunit domain protein  27.55 
 
 
229 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4809  glutamate synthase alpha subunit  29.5 
 
 
229 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.453145  hitchhiker  0.00411559 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3022  glutamate synthase (NADH) large subunit  29.71 
 
 
1519 aa  53.1  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1137  formyl-methanofuran dehydrogenase subunit C  29.5 
 
 
229 aa  53.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.165169 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16290  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  29.41 
 
 
245 aa  53.1  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.518041  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1657  glutamate synthase alpha subunit  30.71 
 
 
229 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1939  glutamate synthase alpha subunit domain protein  30.71 
 
 
229 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.490233  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5445  glutamate synthase (NADH) large subunit  32.28 
 
 
1536 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0878  glutamate synthase alpha subunit  40 
 
 
312 aa  52.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.225814  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5066  glutamate synthase (NADH) large subunit  32.28 
 
 
1527 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5154  glutamate synthase (NADH) large subunit  32.28 
 
 
1527 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.631687 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1869  putative glutamate synthase  28.57 
 
 
225 aa  52.4  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.310557  normal  0.791624 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13895  ferredoxin-dependent glutamate synthase [NADPH] large subunit gltB  31.85 
 
 
1527 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4696  glutamate synthase family protein  26.11 
 
 
235 aa  52.4  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.917164 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1198  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C (tungsten)  31.78 
 
 
152 aa  51.2  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5639  glutamate synthase alpha subunit domain protein  28 
 
 
228 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.55547  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1114  glutamate synthase (ferredoxin)  29.3 
 
 
1533 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.82784  normal  0.930552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5702  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.67 
 
 
1550 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2217  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.95 
 
 
1516 aa  50.4  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1487  glutamate synthase, large subunit  30.77 
 
 
1465 aa  50.4  0.00003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0194294  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6007  glutamate synthase alpha subunit  27.34 
 
 
228 aa  50.8  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.607641  decreased coverage  0.00322278 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5698  glutamate synthase (ferredoxin)  30.57 
 
 
1514 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.471666 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1740  glutamate synthase alpha subunit domain protein  30.77 
 
 
659 aa  49.7  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.627915  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2357  glutamate synthase alpha subunit domain protein  30.87 
 
 
250 aa  49.3  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800072  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3466  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  30.7 
 
 
224 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.201288  normal  0.713984 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3523  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  32.76 
 
 
242 aa  49.3  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0202692 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0912  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.63 
 
 
1567 aa  49.7  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00362249 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2949  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.29 
 
 
1501 aa  49.3  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341665  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2161  glutamate synthase (ferredoxin)  25.37 
 
 
1519 aa  49.3  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.706434  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3167  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.37 
 
 
1573 aa  49.3  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0752017  normal  0.029399 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4476  glutamate synthase (ferredoxin)  26.44 
 
 
1485 aa  48.9  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.4617  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2275  glutamate synthase, alpha subunit, C-terminal  30.7 
 
 
227 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.225316  hitchhiker  0.00959584 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0529  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.82 
 
 
1474 aa  48.9  0.00009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.41827  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2584  hypothetical protein  30.7 
 
 
227 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0278158  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0526  Glutamate synthase (ferredoxin)  27.75 
 
 
1548 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.801021  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1289  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  33.1 
 
 
245 aa  48.5  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000639589 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17041  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.89 
 
 
1523 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1943  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  28.23 
 
 
227 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.513232 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1219  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.43 
 
 
1525 aa  48.1  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.589961  normal  0.962678 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1176  glutamate synthase (NADPH) large subunit  29.23 
 
 
1479 aa  48.1  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1339  glutamate synthase alpha subunit  29.53 
 
 
251 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.794654 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>