89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1775 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1775  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  100 
 
 		 265 aa  494  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  0.875805 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2159  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  93.21 
 
 		 265 aa  428  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0901303 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1824  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  93.58 
 
 		 265 aa  427  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0523  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  72.08 
 
 		 264 aa  359  3e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300278  normal  0.650549 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5773  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  67.56 
 
 		 265 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14713  normal  0.931253 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5997  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  69.08 
 
 		 265 aa  299  3e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128161  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2403  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  42.97 
 
 		 268 aa  199  5e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2626  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  42.05 
 
 		 269 aa  176  5e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6507  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  40.93 
 
 		 286 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0305137 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3064  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  44.07 
 
 		 276 aa  169  5e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5932  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  39.18 
 
 		 274 aa  160  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0388185  normal  0.0470213 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1665  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  37.79 
 
 		 269 aa  159  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.477479  normal  0.947493 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2464  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  38.27 
 
 		 281 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.109296 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0022  formylmethanofuran dehydrogenase  36.98 
 
 		 272 aa  148  9e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2857  formylmethanofurane dehydrogenase subunit, putative  37.45 
 
 		 270 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000000505673  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1793  glutamate synthase alpha subunit  41.6 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0607708  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3133  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  38.27 
 
 		 281 aa  126  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1098  formylmethanofuran dehydrogenase  31.88 
 
 		 257 aa  108  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0495  formylmethanofuran dehydrogenase  28.03 
 
 		 272 aa  106  4e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.943026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1290  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  32.55 
 
 		 301 aa  106  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1450  formylmethanofuran dehydrogenase  31.5 
 
 		 415 aa  105  6e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0342  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  28.41 
 
 		 272 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2112  formylmethanofuran dehydrogenase  29.74 
 
 		 254 aa  102  7e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0563  formylmethanofuran dehydrogenase  27.82 
 
 		 289 aa  100  3e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1531  formylmethanofuran dehydrogenase  31.27 
 
 		 415 aa  100  3e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000509371 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0381  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  32 
 
 		 415 aa  99.4  5e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1424  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  27.65 
 
 		 272 aa  99.4  6e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.176644  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1189  glutamate synthase alpha subunit  32.91 
 
 		 255 aa  99  8e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1663  formylmethanofuran dehydrogenase  32.04 
 
 		 424 aa  89.4  5e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0084  formylmethanofuran dehydrogenase  25.84 
 
 		 425 aa  89  8e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1442  formylmethanofuran dehydrogenase  26.89 
 
 		 294 aa  88.6  1e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.717791  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1421  glutamate synthase alpha subunit domain protein  30.6 
 
 		 291 aa  88.6  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0575  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  29.46 
 
 		 256 aa  87.8  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00575915  decreased coverage  0.000443842 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2233  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  31.46 
 
 		 304 aa  87.8  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.0399291 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1473  formylmethanofuran dehydrogenase  30.2 
 
 		 275 aa  86.3  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.143119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0618  formylmethanofuran dehydrogenase  28.44 
 
 		 268 aa  83.6  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.031501  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0283  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  30.69 
 
 		 269 aa  82.8  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.363907  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1990  formylmethanofuran dehydrogenase  29.63 
 
 		 266 aa  81.3  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.114316  normal  0.184502 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0201  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  30.47 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0127762  normal  0.0655916 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0875  formylmethanofuran dehydrogenase  25.11 
 
 		 266 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.118005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1981  formylmethanofuran dehydrogenase  24.09 
 
 		 332 aa  70.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.372116 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0370  formylmethanofuran dehydrogenase  25.69 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0246  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  26.47 
 
 		 266 aa  66.2  0.0000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.314224 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0878  glutamate synthase alpha subunit  36.73 
 
 		 312 aa  52.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.225814  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1069  glutamate synthase alpha subunit  33.63 
 
 		 312 aa  52.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1812  glutamate synthase alpha subunit  34.17 
 
 		 568 aa  51.2  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000275446 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28040  glutamate synthase (NADH) large subunit  32.42 
 
 		 1527 aa  51.2  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.723113  normal  0.697076 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1607  tungsten containing formylmethanofruran dehydrogenase subunit C-related protein  34.23 
 
 		 313 aa  49.7  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0830  glutamate synthase alpha subunit  31.82 
 
 		 568 aa  49.3  0.00007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.990819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0211  glutamate synthase alpha subunit  30.65 
 
 		 264 aa  48.9  0.00009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2500  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  33.64 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0493584  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0890  glutamate synthase (ferredoxin)  28.78 
 
 		 1536 aa  48.1  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00390315  decreased coverage  0.000127994 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3807  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.3 
 
 		 1502 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.344591  hitchhiker  0.00201054 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0653  glutamate synthase  32.8 
 
 		 1571 aa  47  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.58912  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1607  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  32.2 
 
 		 572 aa  47  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1487  glutamate synthase, large subunit  29.75 
 
 		 1465 aa  46.6  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0194294  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6007  glutamate synthase alpha subunit  37.07 
 
 		 228 aa  46.6  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.607641  decreased coverage  0.00322278 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1078  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.4 
 
 		 1529 aa  46.2  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2249  glutamate synthase alpha subunit  35.79 
 
 		 224 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191415 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3466  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  35.35 
 
 		 224 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.201288  normal  0.713984 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19531  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.4 
 
 		 1475 aa  46.2  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1198  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C (tungsten)  45.76 
 
 		 152 aa  46.2  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87428  glutamate synthase  30.33 
 
 		 2126 aa  45.8  0.0008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0529  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.89 
 
 		 1474 aa  45.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.41827  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1345  glutamate synthase, alpha subunit-like  32.14 
 
 		 227 aa  45.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0540  glutamate synthase alpha subunit  29.77 
 
 		 245 aa  45.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.800593  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0526  glutamate synthase alpha subunit  29.77 
 
 		 245 aa  45.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5750  formyl-methanofuran dehydrogenase  36.21 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6576  glutamate synthase alpha subunit domain protein  35.71 
 
 		 228 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.026671 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4805  glutamate synthase alpha subunit domain protein  33.33 
 
 		 247 aa  43.9  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2275  glutamate synthase, alpha subunit, C-terminal  33.61 
 
 		 227 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.225316  hitchhiker  0.00959584 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0029  glutamate synthase alpha subunit domain protein  34.44 
 
 		 252 aa  43.9  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2584  hypothetical protein  32.79 
 
 		 227 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0278158  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1083  glutamate synthase alpha subunit  32.2 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.386486  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1869  putative glutamate synthase  32.76 
 
 		 225 aa  44.3  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.310557  normal  0.791624 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1339  glutamate synthase alpha subunit  32.06 
 
 		 251 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.794654 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1700  glutamate synthase alpha subunit domain protein  32.35 
 
 		 236 aa  43.9  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2357  glutamate synthase alpha subunit domain protein  35.51 
 
 		 250 aa  43.5  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800072  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1816  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  35.79 
 
 		 251 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0997673  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1596  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  28.81 
 
 		 256 aa  42.7  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0033  glutamate synthase, large subunit  28.37 
 
 		 1495 aa  42.4  0.007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.281504  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0007  glutamate synthase, large subunit  28.37 
 
 		 1495 aa  42.4  0.007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  unclonable  0.000000781352  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1298  glutamate synthase alpha subunit  32.32 
 
 		 227 aa  42.7  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.186101  normal  0.822119 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0867  glutamate synthase alpha subunit  28.81 
 
 		 256 aa  42.4  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0287996  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3292  glutamate synthase alpha subunit  35.14 
 
 		 228 aa  42.4  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1080  glutamate synthase alpha subunit  28.81 
 
 		 263 aa  42.4  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0007  glutamate synthase, large subunit  28.37 
 
 		 1496 aa  42.4  0.009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5639  glutamate synthase alpha subunit domain protein  36.21 
 
 		 228 aa  42  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.55547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0201  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  31.58 
 
 		 240 aa  42  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>