172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2626 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2626  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  100 
 
 		 269 aa  522  1e-147  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3064  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  64 
 
 		 276 aa  318  5e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5932  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  53.68 
 
 		 274 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0388185  normal  0.0470213 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3133  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  55.36 
 
 		 281 aa  255  7e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6507  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  47.37 
 
 		 286 aa  226  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0305137 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2464  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  44.09 
 
 		 281 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.109296 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2857  formylmethanofurane dehydrogenase subunit, putative  42.44 
 
 		 270 aa  181  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000000505673  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1665  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  41.26 
 
 		 269 aa  181  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.477479  normal  0.947493 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0022  formylmethanofuran dehydrogenase  38.38 
 
 		 272 aa  178  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2403  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  42.26 
 
 		 268 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0523  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  42.53 
 
 		 264 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300278  normal  0.650549 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5773  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  46.56 
 
 		 265 aa  167  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14713  normal  0.931253 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5997  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  48.28 
 
 		 265 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128161  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1775  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  42.05 
 
 		 265 aa  167  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  0.875805 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1793  glutamate synthase alpha subunit  44.03 
 
 		 267 aa  163  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0607708  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2159  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  43.35 
 
 		 265 aa  159  5e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0901303 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1824  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  42.59 
 
 		 265 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1290  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  33.6 
 
 		 301 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1098  formylmethanofuran dehydrogenase  33.33 
 
 		 257 aa  125  9e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1663  formylmethanofuran dehydrogenase  29.66 
 
 		 424 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0618  formylmethanofuran dehydrogenase  32.88 
 
 		 268 aa  117  3e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.031501  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0875  formylmethanofuran dehydrogenase  31.08 
 
 		 266 aa  117  3e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.118005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2233  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  31.98 
 
 		 304 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.0399291 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0246  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  31.03 
 
 		 266 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.314224 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0084  formylmethanofuran dehydrogenase  27.17 
 
 		 425 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1450  formylmethanofuran dehydrogenase  32.59 
 
 		 415 aa  113  3e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1531  formylmethanofuran dehydrogenase  32.59 
 
 		 415 aa  112  9e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000509371 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0381  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  32.59 
 
 		 415 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1421  glutamate synthase alpha subunit domain protein  30.42 
 
 		 291 aa  108  8.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1442  formylmethanofuran dehydrogenase  32.71 
 
 		 294 aa  106  3e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.717791  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0563  formylmethanofuran dehydrogenase  27.4 
 
 		 289 aa  105  7e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1473  formylmethanofuran dehydrogenase  29.39 
 
 		 275 aa  104  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.143119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0201  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  28.83 
 
 		 307 aa  103  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0127762  normal  0.0655916 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0342  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  27.85 
 
 		 272 aa  103  4e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0370  formylmethanofuran dehydrogenase  29.73 
 
 		 266 aa  102  6e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0495  formylmethanofuran dehydrogenase  27.4 
 
 		 272 aa  102  8e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.943026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0283  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  30.3 
 
 		 269 aa  98.6  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.363907  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1424  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  26.03 
 
 		 272 aa  98.2  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.176644  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1981  formylmethanofuran dehydrogenase  27.52 
 
 		 332 aa  95.5  8e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.372116 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1990  formylmethanofuran dehydrogenase  29.28 
 
 		 266 aa  95.1  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.114316  normal  0.184502 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2112  formylmethanofuran dehydrogenase  31.22 
 
 		 254 aa  95.1  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1189  glutamate synthase alpha subunit  31.73 
 
 		 255 aa  90.5  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0575  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  28.9 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00575915  decreased coverage  0.000443842 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1069  glutamate synthase alpha subunit  36.36 
 
 		 312 aa  66.2  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1607  tungsten containing formylmethanofruran dehydrogenase subunit C-related protein  35.35 
 
 		 313 aa  62  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1083  glutamate synthase alpha subunit  26.44 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.386486  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0878  glutamate synthase alpha subunit  26.34 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.225814  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0529  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.16 
 
 		 1474 aa  57.4  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.41827  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1198  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C (tungsten)  38.76 
 
 		 152 aa  57.4  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0890  glutamate synthase (ferredoxin)  35.04 
 
 		 1536 aa  57.4  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00390315  decreased coverage  0.000127994 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3730  Glutamate synthase (ferredoxin)  33.33 
 
 		 1554 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3782  Glutamate synthase (ferredoxin)  33.85 
 
 		 1554 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.376942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1176  glutamate synthase (NADPH) large subunit  31.67 
 
 		 1479 aa  53.1  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0526  Glutamate synthase (ferredoxin)  32.2 
 
 		 1548 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.801021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0550  glutamate synthase subunit alpha  33.87 
 
 		 1482 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.213876 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0653  glutamate synthase  33.63 
 
 		 1571 aa  52  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.58912  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1487  glutamate synthase, large subunit  30.77 
 
 		 1465 aa  51.6  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0194294  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1468  Glutamate synthase (ferredoxin)  33.06 
 
 		 1551 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0007  glutamate synthase, large subunit  25 
 
 		 1496 aa  51.2  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2165  glutamate synthase subunit alpha  32.54 
 
 		 1487 aa  50.8  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.409887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0033  glutamate synthase, large subunit  25 
 
 		 1495 aa  51.2  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.281504  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1607  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  32.88 
 
 		 572 aa  50.8  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0403  glutamate synthase subunit alpha  32.26 
 
 		 1507 aa  51.2  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0405842 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0007  glutamate synthase, large subunit  25 
 
 		 1495 aa  51.2  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  unclonable  0.000000781352  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1874  glutamate synthase subunit alpha  32.54 
 
 		 1487 aa  50.4  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5076  glutamate synthase subunit alpha  31.45 
 
 		 1481 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3748  glutamate synthase subunit alpha  33.06 
 
 		 1488 aa  50.1  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956068  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4949  glutamate synthase subunit alpha  31.45 
 
 		 1481 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.772604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1294  glutamate synthase (ferredoxin)  32.17 
 
 		 1562 aa  49.7  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.163498  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1982  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.5 
 
 		 1521 aa  49.7  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.349695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00926  glutamate synthase subunit alpha  31.45 
 
 		 1487 aa  49.7  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5126  glutamate synthase subunit alpha  31.45 
 
 		 1481 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.979784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66570  glutamate synthase subunit alpha  30.65 
 
 		 1481 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20710  glutamate synthase (NADH) large subunit  34.19 
 
 		 1524 aa  48.5  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.42786 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87428  glutamate synthase  27.92 
 
 		 2126 aa  48.1  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45210  glutamate synthase subunit alpha  31.45 
 
 		 1480 aa  48.5  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1503  ferredoxin-dependent glutamate synthase  35.04 
 
 		 1530 aa  48.5  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  36.84 
 
 		 553 aa  48.5  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4114  glutamate synthase subunit alpha  30.65 
 
 		 1461 aa  48.1  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000785816 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5773  glutamate synthase subunit alpha  30.65 
 
 		 1481 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0615  glutamate synthase subunit alpha  30.95 
 
 		 1483 aa  47.4  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2951  glutamate synthase subunit alpha  32.26 
 
 		 1482 aa  47.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0390  glutamate synthase subunit alpha  30.65 
 
 		 1481 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1954  glutamate synthase subunit alpha  31.45 
 
 		 1487 aa  47.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0493  glutamate synthase (ferredoxin)  31.65 
 
 		 1499 aa  47.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0506  glutamate synthase (ferredoxin)  31.65 
 
 		 1499 aa  47.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004468  glutamate synthase [NADPH] large chain  31.45 
 
 		 1487 aa  48.1  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1117  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.09 
 
 		 1468 aa  47  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3807  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.14 
 
 		 1502 aa  47.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.344591  hitchhiker  0.00201054 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2822  glutamate synthase (ferredoxin)  30.32 
 
 		 1518 aa  47  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.857674 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0834  glutamate synthase subunit alpha  30.65 
 
 		 1482 aa  47.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87862  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0830  glutamate synthase alpha subunit  31.88 
 
 		 568 aa  47  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.990819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1078  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.6 
 
 		 1529 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0525  tungsten formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C-like  36.36 
 
 		 295 aa  47  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.618523  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19531  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.6 
 
 		 1475 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0413  glutamate synthase subunit alpha  29.03 
 
 		 1481 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359883 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0730  Glutamate synthase (ferredoxin)  27.21 
 
 		 1509 aa  46.2  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000317884 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1812  glutamate synthase alpha subunit  31.69 
 
 		 568 aa  46.2  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000275446 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3198  Glutamate synthase (ferredoxin)  35.2 
 
 		 1518 aa  46.6  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0730  glutamate synthase, large subunit  31.82 
 
 		 1475 aa  46.2  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>