81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1137 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1137  formyl-methanofuran dehydrogenase subunit C  100 
 
 		 229 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.165169 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1943  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  72.49 
 
 		 227 aa  341  5.999999999999999e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.513232 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1939  glutamate synthase alpha subunit domain protein  66.81 
 
 		 229 aa  315  4e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.490233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1574  glutamate synthase alpha subunit domain protein  65.94 
 
 		 229 aa  315  4e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1657  glutamate synthase alpha subunit  66.81 
 
 		 229 aa  314  6e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4696  glutamate synthase family protein  67.56 
 
 		 235 aa  313  1.9999999999999998e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.917164 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4809  glutamate synthase alpha subunit  68.12 
 
 		 229 aa  308  5e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.453145  hitchhiker  0.00411559 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5750  formyl-methanofuran dehydrogenase  63.32 
 
 		 228 aa  295  4e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6007  glutamate synthase alpha subunit  63.76 
 
 		 228 aa  294  7e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.607641  decreased coverage  0.00322278 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1869  putative glutamate synthase  64.16 
 
 		 225 aa  292  2e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.310557  normal  0.791624 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6576  glutamate synthase alpha subunit domain protein  61.57 
 
 		 228 aa  290  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.026671 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5639  glutamate synthase alpha subunit domain protein  62.45 
 
 		 228 aa  289  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.55547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3292  glutamate synthase alpha subunit  60.26 
 
 		 228 aa  285  5.999999999999999e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2633  glutamate synthase alpha subunit domain protein  64.32 
 
 		 235 aa  282  3.0000000000000004e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2584  hypothetical protein  59.39 
 
 		 227 aa  278  4e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0278158  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3466  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  61.57 
 
 		 224 aa  278  4e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.201288  normal  0.713984 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2275  glutamate synthase, alpha subunit, C-terminal  58.95 
 
 		 227 aa  276  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.225316  hitchhiker  0.00959584 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2249  glutamate synthase alpha subunit  60.26 
 
 		 224 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191415 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3032  glutamate synthase alpha subunit  63.16 
 
 		 228 aa  270  9e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.54309 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3523  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  61.4 
 
 		 242 aa  268  4e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0202692 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5511  glutamate synthase alpha subunit  61.54 
 
 		 228 aa  268  5e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21487 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1298  glutamate synthase alpha subunit  63.47 
 
 		 227 aa  268  5e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.186101  normal  0.822119 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0458  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  61.33 
 
 		 230 aa  264  7e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.951315  normal  0.387952 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4894  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  61.9 
 
 		 238 aa  263  1e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4983  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  61.9 
 
 		 238 aa  263  1e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5262  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  61.47 
 
 		 238 aa  263  2e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.221211 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4805  glutamate synthase alpha subunit domain protein  59.83 
 
 		 247 aa  262  3e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1345  glutamate synthase, alpha subunit-like  58.22 
 
 		 227 aa  259  4e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0168  glutamate synthase alpha subunit  58.22 
 
 		 229 aa  247  1e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5920  glutamate synthase alpha subunit  58.15 
 
 		 232 aa  245  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.755435  normal  0.413716 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1700  glutamate synthase alpha subunit domain protein  53.33 
 
 		 236 aa  244  9e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2500  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  54.19 
 
 		 225 aa  238  5e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0493584  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2024  glutamate synthase alpha subunit  35 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16290  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  29.65 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.518041  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1289  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  28.91 
 
 		 245 aa  65.1  0.0000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000639589 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1816  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  27.5 
 
 		 251 aa  58.5  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0997673  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1235  hypothetical protein  30.5 
 
 		 248 aa  58.5  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0332  glutamate synthase alpha subunit  31.28 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.951103  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0544  glutamate synthase alpha subunit domain protein  27.05 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00693523 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1752  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  30.56 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.216628 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1339  glutamate synthase alpha subunit  28.93 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.794654 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1442  formylmethanofuran dehydrogenase  26.53 
 
 		 294 aa  53.9  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.717791  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0540  glutamate synthase alpha subunit  30.21 
 
 		 245 aa  52.8  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.800593  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0526  glutamate synthase alpha subunit  30.21 
 
 		 245 aa  52.8  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0022  formylmethanofuran dehydrogenase  29.5 
 
 		 272 aa  53.1  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0030  glutamate synthase alpha subunit  26.92 
 
 		 670 aa  52.8  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1607  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  29.91 
 
 		 572 aa  52.4  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2708  glutamate synthase alpha subunit domain protein  31.61 
 
 		 248 aa  51.2  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.414191  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0211  glutamate synthase alpha subunit  28.08 
 
 		 264 aa  50.4  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1450  formylmethanofuran dehydrogenase  26.62 
 
 		 415 aa  50.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0342  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  33.33 
 
 		 272 aa  50.1  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1424  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  32.35 
 
 		 272 aa  49.7  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.176644  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0562  glutamate synthase alpha subunit  24.87 
 
 		 242 aa  49.7  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0084  formylmethanofuran dehydrogenase  32.41 
 
 		 425 aa  49.7  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1663  formylmethanofuran dehydrogenase  28.03 
 
 		 424 aa  49.3  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1531  formylmethanofuran dehydrogenase  27.27 
 
 		 415 aa  48.9  0.00007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000509371 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2357  glutamate synthase alpha subunit domain protein  26.77 
 
 		 250 aa  48.5  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800072  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0495  formylmethanofuran dehydrogenase  32 
 
 		 272 aa  48.5  0.00008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.943026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  30.05 
 
 		 553 aa  48.5  0.00009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0782  glutamate synthase, alpha subunit-like  27.93 
 
 		 246 aa  48.1  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00542084  normal  0.210269 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0381  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  26.62 
 
 		 415 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1098  formylmethanofuran dehydrogenase  30.72 
 
 		 257 aa  48.1  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3064  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  33.04 
 
 		 276 aa  47.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1740  glutamate synthase alpha subunit domain protein  25.81 
 
 		 659 aa  47.4  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.627915  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0867  glutamate synthase alpha subunit  28 
 
 		 256 aa  47.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0287996  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0029  glutamate synthase alpha subunit domain protein  26.9 
 
 		 252 aa  47  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0563  formylmethanofuran dehydrogenase  25 
 
 		 289 aa  45.8  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6507  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  37.23 
 
 		 286 aa  45.1  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0305137 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1981  formylmethanofuran dehydrogenase  27.59 
 
 		 332 aa  44.7  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.372116 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0830  glutamate synthase alpha subunit  27.45 
 
 		 568 aa  44.3  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.990819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1290  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  25.93 
 
 		 301 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1885  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  26.57 
 
 		 646 aa  43.5  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.273779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0201  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  27.36 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2857  formylmethanofurane dehydrogenase subunit, putative  30.15 
 
 		 270 aa  43.5  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000000505673  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0618  formylmethanofuran dehydrogenase  25.58 
 
 		 268 aa  43.5  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.031501  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1665  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  26.15 
 
 		 269 aa  42.7  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.477479  normal  0.947493 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5932  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  30.63 
 
 		 274 aa  43.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0388185  normal  0.0470213 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1473  formylmethanofuran dehydrogenase  25.21 
 
 		 275 aa  42.4  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.143119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1812  glutamate synthase alpha subunit  29.52 
 
 		 568 aa  42.4  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000275446 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1189  glutamate synthase alpha subunit  38.1 
 
 		 255 aa  42  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0370  formylmethanofuran dehydrogenase  30.63 
 
 		 266 aa  41.6  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>