167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1189 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1189  glutamate synthase alpha subunit  100 
 
 
255 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2112  formylmethanofuran dehydrogenase  59.04 
 
 
254 aa  300  1e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0575  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  47.64 
 
 
256 aa  205  5e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00575915  decreased coverage  0.000443842 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1098  formylmethanofuran dehydrogenase  41.04 
 
 
257 aa  181  7e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0563  formylmethanofuran dehydrogenase  32.96 
 
 
289 aa  150  2e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0084  formylmethanofuran dehydrogenase  35.42 
 
 
425 aa  146  3e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0495  formylmethanofuran dehydrogenase  32.16 
 
 
272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.943026  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1424  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  32.94 
 
 
272 aa  138  1e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.176644  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0342  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  32.94 
 
 
272 aa  137  1e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1990  formylmethanofuran dehydrogenase  32.84 
 
 
266 aa  132  6e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.114316  normal  0.184502 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0370  formylmethanofuran dehydrogenase  34.4 
 
 
266 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0283  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  37.6 
 
 
269 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.363907  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1473  formylmethanofuran dehydrogenase  33.06 
 
 
275 aa  127  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.143119  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1290  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  33.98 
 
 
301 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0201  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  34.21 
 
 
307 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0127762  normal  0.0655916 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2233  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  33.08 
 
 
304 aa  123  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.0399291 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1663  formylmethanofuran dehydrogenase  36.51 
 
 
424 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1531  formylmethanofuran dehydrogenase  34.57 
 
 
415 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000509371 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1450  formylmethanofuran dehydrogenase  34.2 
 
 
415 aa  119  3e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0875  formylmethanofuran dehydrogenase  30.92 
 
 
266 aa  119  3e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.118005  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0618  formylmethanofuran dehydrogenase  35.14 
 
 
268 aa  118  7e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.031501  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0381  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  33.83 
 
 
415 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1981  formylmethanofuran dehydrogenase  33.48 
 
 
332 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.372116 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1442  formylmethanofuran dehydrogenase  33.91 
 
 
294 aa  108  6e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.717791  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0246  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  29.48 
 
 
266 aa  104  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.314224 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3064  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  39.66 
 
 
276 aa  95.1  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1665  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  30.77 
 
 
269 aa  95.1  9e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.477479  normal  0.947493 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5932  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  29.35 
 
 
274 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0388185  normal  0.0470213 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6507  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  32.97 
 
 
286 aa  92  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0305137 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0022  formylmethanofuran dehydrogenase  27.2 
 
 
272 aa  91.7  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0523  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  33.48 
 
 
264 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300278  normal  0.650549 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2626  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  31.73 
 
 
269 aa  90.5  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1775  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  32.91 
 
 
265 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  0.875805 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2159  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  34.03 
 
 
265 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0901303 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2857  formylmethanofurane dehydrogenase subunit, putative  28.08 
 
 
270 aa  80.9  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000000505673  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2403  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  29.49 
 
 
268 aa  80.1  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2464  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  28.14 
 
 
281 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.109296 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1824  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  32.77 
 
 
265 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317738  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5773  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  31.3 
 
 
265 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14713  normal  0.931253 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5997  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  33.77 
 
 
265 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128161  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3133  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  32.26 
 
 
281 aa  73.2  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1793  glutamate synthase alpha subunit  34.72 
 
 
267 aa  67.4  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0607708  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0830  glutamate synthase alpha subunit  31.72 
 
 
568 aa  60.1  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.990819  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0201  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  36.8 
 
 
240 aa  59.3  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1812  glutamate synthase alpha subunit  32.37 
 
 
568 aa  58.9  0.00000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000275446 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1503  ferredoxin-dependent glutamate synthase  35.61 
 
 
1530 aa  57.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0544  glutamate synthase alpha subunit domain protein  32.89 
 
 
281 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00693523 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1816  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  32.04 
 
 
251 aa  55.8  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0997673  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3167  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.09 
 
 
1573 aa  54.7  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0752017  normal  0.029399 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2395  glutamate synthase (ferredoxin)  34.3 
 
 
1586 aa  54.3  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5639  glutamate synthase alpha subunit domain protein  31.82 
 
 
228 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.55547  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6576  glutamate synthase alpha subunit domain protein  30.91 
 
 
228 aa  53.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.026671 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1607  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  30.07 
 
 
572 aa  53.5  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5750  formyl-methanofuran dehydrogenase  29.32 
 
 
228 aa  53.5  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3292  glutamate synthase alpha subunit  29.77 
 
 
228 aa  53.5  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0029  glutamate synthase alpha subunit domain protein  31.25 
 
 
252 aa  53.1  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2708  glutamate synthase alpha subunit domain protein  30.99 
 
 
248 aa  53.1  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.414191  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6007  glutamate synthase alpha subunit  29.55 
 
 
228 aa  53.1  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.607641  decreased coverage  0.00322278 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16290  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  32.52 
 
 
245 aa  52.8  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.518041  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3392  glutamate synthase (ferredoxin)  33.09 
 
 
1573 aa  52.8  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.140054  normal  0.116852 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5702  Glutamate synthase (ferredoxin)  32.9 
 
 
1550 aa  52.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2942  Glutamate synthase (ferredoxin)  33.33 
 
 
1524 aa  52.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.290675  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1692  glutamate synthase alpha subunit  31.67 
 
 
247 aa  52.8  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.737414  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1869  putative glutamate synthase  33.03 
 
 
225 aa  52.4  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.310557  normal  0.791624 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1982  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.39 
 
 
1521 aa  51.6  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.349695  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1083  glutamate synthase alpha subunit  33 
 
 
320 aa  51.6  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.386486  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1069  glutamate synthase alpha subunit  22.28 
 
 
312 aa  51.6  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0107  Glutamate synthase (ferredoxin)  33.82 
 
 
1535 aa  50.8  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0211  glutamate synthase alpha subunit  31.54 
 
 
264 aa  50.4  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  30.43 
 
 
553 aa  50.8  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2562  glutamate synthase, large subunit  30.39 
 
 
1515 aa  50.1  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0540  glutamate synthase alpha subunit  30.59 
 
 
245 aa  50.1  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.800593  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1289  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  30.5 
 
 
245 aa  49.7  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000639589 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2357  glutamate synthase alpha subunit domain protein  31.03 
 
 
250 aa  49.7  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800072  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2490  glutamate synthase alpha subunit  35.04 
 
 
248 aa  50.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0526  glutamate synthase alpha subunit  30.59 
 
 
245 aa  50.1  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1421  glutamate synthase alpha subunit domain protein  28.35 
 
 
291 aa  49.7  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0878  glutamate synthase alpha subunit  29.25 
 
 
312 aa  49.7  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.225814  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0562  glutamate synthase alpha subunit  32.52 
 
 
242 aa  49.7  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1607  tungsten containing formylmethanofruran dehydrogenase subunit C-related protein  23.64 
 
 
313 aa  49.7  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004466  glutamate synthase [NADPH] large chain  27.49 
 
 
1516 aa  49.3  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0890  glutamate synthase (ferredoxin)  31.88 
 
 
1536 aa  49.3  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00390315  decreased coverage  0.000127994 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00928  glutamate synthase, large subunit  27.49 
 
 
1516 aa  48.9  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0526  Glutamate synthase (ferredoxin)  32.68 
 
 
1548 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.801021  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2140  glutamate synthase (ferredoxin)  31.88 
 
 
1510 aa  48.1  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.697929  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11000  glutamate synthase (NADH) large subunit  30.61 
 
 
1550 aa  48.1  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.542266  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1339  glutamate synthase alpha subunit  30.66 
 
 
251 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.794654 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23581  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.33 
 
 
1527 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.242858 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1117  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.3 
 
 
1468 aa  48.1  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3807  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.06 
 
 
1502 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.344591  hitchhiker  0.00201054 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0332  glutamate synthase alpha subunit  34.35 
 
 
245 aa  47.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.951103  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2961  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.22 
 
 
1536 aa  47.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.495295  normal  0.583434 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1752  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  31.2 
 
 
249 aa  47  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.216628 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1198  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C (tungsten)  35.29 
 
 
152 aa  47  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2340  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.48 
 
 
1483 aa  47  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13895  ferredoxin-dependent glutamate synthase [NADPH] large subunit gltB  36.84 
 
 
1527 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02910  glutamate synthase (NADH), putative  31.21 
 
 
2135 aa  46.2  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.844202  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0782  glutamate synthase, alpha subunit-like  33.33 
 
 
246 aa  45.8  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00542084  normal  0.210269 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0741  glutamate synthase (NADH) large subunit  32.95 
 
 
1577 aa  45.8  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.704994  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0529  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.03 
 
 
1474 aa  46.2  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.41827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>