89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3032 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3032  glutamate synthase alpha subunit  100 
 
 		 228 aa  456  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.54309 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0458  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  76.52 
 
 		 230 aa  351  5e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.951315  normal  0.387952 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0168  glutamate synthase alpha subunit  68 
 
 		 229 aa  293  1e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5920  glutamate synthase alpha subunit  65.52 
 
 		 232 aa  290  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.755435  normal  0.413716 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4809  glutamate synthase alpha subunit  64.76 
 
 		 229 aa  278  4e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.453145  hitchhiker  0.00411559 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1574  glutamate synthase alpha subunit domain protein  62.56 
 
 		 229 aa  277  1e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5511  glutamate synthase alpha subunit  65.07 
 
 		 228 aa  275  5e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21487 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1943  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  63 
 
 		 227 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.513232 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4805  glutamate synthase alpha subunit domain protein  63.23 
 
 		 247 aa  273  2.0000000000000002e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4696  glutamate synthase family protein  63.2 
 
 		 235 aa  272  3e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.917164 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3466  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  62.95 
 
 		 224 aa  271  5.000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.201288  normal  0.713984 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1137  formyl-methanofuran dehydrogenase subunit C  63.16 
 
 		 229 aa  270  9e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.165169 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1657  glutamate synthase alpha subunit  61.67 
 
 		 229 aa  270  1e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1939  glutamate synthase alpha subunit domain protein  61.67 
 
 		 229 aa  270  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.490233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4894  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  62.39 
 
 		 238 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1298  glutamate synthase alpha subunit  62.28 
 
 		 227 aa  270  2e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.186101  normal  0.822119 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4983  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  62.39 
 
 		 238 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5262  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  61.95 
 
 		 238 aa  269  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.221211 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2249  glutamate synthase alpha subunit  61.5 
 
 		 224 aa  260  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191415 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5750  formyl-methanofuran dehydrogenase  60 
 
 		 228 aa  260  1e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3292  glutamate synthase alpha subunit  59.73 
 
 		 228 aa  259  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5639  glutamate synthase alpha subunit domain protein  58.41 
 
 		 228 aa  259  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.55547  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6576  glutamate synthase alpha subunit domain protein  60 
 
 		 228 aa  259  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.026671 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3523  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  61.26 
 
 		 242 aa  257  8e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0202692 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1869  putative glutamate synthase  61.43 
 
 		 225 aa  256  2e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.310557  normal  0.791624 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6007  glutamate synthase alpha subunit  59.56 
 
 		 228 aa  255  3e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.607641  decreased coverage  0.00322278 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2275  glutamate synthase, alpha subunit, C-terminal  58.41 
 
 		 227 aa  255  5e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.225316  hitchhiker  0.00959584 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2584  hypothetical protein  57.96 
 
 		 227 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0278158  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1345  glutamate synthase, alpha subunit-like  55.75 
 
 		 227 aa  244  9.999999999999999e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2633  glutamate synthase alpha subunit domain protein  58.41 
 
 		 235 aa  238  4e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2500  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  53.78 
 
 		 225 aa  234  8e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0493584  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1700  glutamate synthase alpha subunit domain protein  51.09 
 
 		 236 aa  225  4e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2024  glutamate synthase alpha subunit  30.36 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16290  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  26.92 
 
 		 245 aa  69.3  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.518041  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1235  hypothetical protein  29.14 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0544  glutamate synthase alpha subunit domain protein  24.88 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00693523 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0030  glutamate synthase alpha subunit  29.28 
 
 		 670 aa  60.1  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0526  glutamate synthase alpha subunit  29.71 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0540  glutamate synthase alpha subunit  29.71 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.800593  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2490  glutamate synthase alpha subunit  27.01 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1816  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  23.46 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0997673  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0029  glutamate synthase alpha subunit domain protein  28.28 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1289  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  27.32 
 
 		 245 aa  57  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000639589 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1339  glutamate synthase alpha subunit  25 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.794654 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1752  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  27.43 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.216628 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0332  glutamate synthase alpha subunit  26.92 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.951103  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1442  formylmethanofuran dehydrogenase  28.24 
 
 		 294 aa  54.7  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.717791  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2357  glutamate synthase alpha subunit domain protein  28.48 
 
 		 250 aa  53.9  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800072  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1692  glutamate synthase alpha subunit  27.98 
 
 		 247 aa  53.5  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.737414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0618  formylmethanofuran dehydrogenase  28.03 
 
 		 268 aa  53.1  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.031501  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0782  glutamate synthase, alpha subunit-like  24 
 
 		 246 aa  51.2  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00542084  normal  0.210269 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0084  formylmethanofuran dehydrogenase  25 
 
 		 425 aa  51.2  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2233  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  28.03 
 
 		 304 aa  49.7  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.0399291 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3064  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  36.08 
 
 		 276 aa  49.7  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0562  glutamate synthase alpha subunit  22.28 
 
 		 242 aa  48.9  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1607  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  31.82 
 
 		 572 aa  47.8  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1981  formylmethanofuran dehydrogenase  26.11 
 
 		 332 aa  47.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.372116 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1424  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  28.43 
 
 		 272 aa  47  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.176644  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0342  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  29.41 
 
 		 272 aa  47.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5932  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  28.83 
 
 		 274 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0388185  normal  0.0470213 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0563  formylmethanofuran dehydrogenase  22.73 
 
 		 289 aa  47  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0211  glutamate synthase alpha subunit  24.18 
 
 		 264 aa  47.4  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1885  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  28.85 
 
 		 646 aa  47.8  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.273779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1802  glutamate synthase (ferredoxin)  30.43 
 
 		 1498 aa  46.6  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0512049  normal  0.419037 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0246  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  27.91 
 
 		 266 aa  46.6  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.314224 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0495  formylmethanofuran dehydrogenase  24.81 
 
 		 272 aa  46.2  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.943026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1663  formylmethanofuran dehydrogenase  24.82 
 
 		 424 aa  45.8  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1740  glutamate synthase alpha subunit domain protein  25.34 
 
 		 659 aa  45.8  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.627915  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1473  formylmethanofuran dehydrogenase  28.03 
 
 		 275 aa  44.7  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.143119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1531  formylmethanofuran dehydrogenase  25.76 
 
 		 415 aa  45.1  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000509371 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1098  formylmethanofuran dehydrogenase  27.21 
 
 		 257 aa  44.7  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1226  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.47 
 
 		 1499 aa  43.9  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.27984  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1094  glutamate synthase alpha subunit  24.02 
 
 		 256 aa  43.5  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0830  glutamate synthase alpha subunit  27.52 
 
 		 568 aa  44.3  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.990819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0381  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  25 
 
 		 415 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1450  formylmethanofuran dehydrogenase  24.24 
 
 		 415 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2944  glutamate synthase, large subunit  32.74 
 
 		 1513 aa  43.9  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0956  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  23.25 
 
 		 256 aa  43.5  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0201  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  24.54 
 
 		 240 aa  43.1  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0575  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  29.32 
 
 		 256 aa  43.1  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00575915  decreased coverage  0.000443842 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1069  glutamate synthase alpha subunit  27.16 
 
 		 312 aa  42.7  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6507  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  31.52 
 
 		 286 aa  42.7  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0305137 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  35.14 
 
 		 553 aa  42.4  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1607  tungsten containing formylmethanofruran dehydrogenase subunit C-related protein  27.16 
 
 		 313 aa  42.4  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0729  glutamate synthase (ferredoxin)  39.44 
 
 		 1507 aa  42.7  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0370  formylmethanofuran dehydrogenase  23.66 
 
 		 266 aa  42.4  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1302  glutamate synthase alpha subunit  23.5 
 
 		 261 aa  42  0.007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2626  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  30.93 
 
 		 269 aa  42  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1703  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.43 
 
 		 1518 aa  42  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.625118  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>